ID   CRYSTALLIN_BETA_GAMMA; MATRIX.
AC   PS50915;
DT   01-JUL-2003 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Crystallins beta and gamma 'Greek key' motif profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1640513; R2=0.0252941; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=251; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=113; N_SCORE=5.0; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-26,-10,-12,-20,21,-16,-23,-15,-21,-14,-2,-1,-12,-16,0,-10,-20,-24,-22,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-6,-10,-10,-4,-21,-19,1,-16,2,-17,-8,-2,-13,2,3,-1,-1,-12,-28,-10,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-31,-32,-36,-27,2,-26,-26,14,-21,2,6,-28,-24,-19,-22,-23,-15,7,39,8,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-19,-18,-17,-8,-26,-15,12,-13,3,5,-14,-21,-15,-10,-7,3,17,-27,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-27,-18,-31,-23,9,-29,-22,21,-25,27,15,-25,-26,-22,-20,-19,-5,19,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-25,11,31,-23,-17,-1,-24,5,-20,-16,1,-7,13,-1,5,-1,-22,-25,-9,22;
MA   /M: SY='E'; M=-13,10,-28,11,17,-24,-12,13,-27,9,-22,-12,11,-13,9,10,-3,-10,-26,-27,-9,12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-4,-32,3,10,-27,-17,-13,-18,-3,-22,-16,-8,30,-3,-10,-5,-9,-20,-30,-21,1;
MA   /M: SY='N'; M=-11,26,-25,22,7,-25,2,1,-27,-2,-27,-19,28,-15,3,-5,5,-6,-28,-33,-18,5;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-26,-22,-32,-26,52,-19,-14,-4,-23,3,-2,-18,-28,-31,-14,-17,-10,-3,6,26,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-2,-24,-1,5,-25,-4,-6,-22,1,-18,-10,0,-13,12,3,5,0,-19,-26,-15,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-29,-8,-14,-29,61,-18,-38,-18,-29,-20,1,-18,-17,-18,2,-17,-29,-22,-29,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-13,1,-28,1,5,-24,-20,8,-20,16,-18,-6,2,-15,8,16,-9,-11,-17,-25,-6,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-8,7,-11,-2,-24,-16,-6,-19,-7,-15,-6,-7,-15,9,-8,-2,-5,-17,-30,-16,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-20,-22,-23,-18,7,-26,-12,12,-16,5,4,-16,-23,-12,-15,-9,-4,8,-12,13,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-5,-23,-2,6,-15,-20,-13,-8,-9,-9,-9,-7,-2,-4,-12,0,-1,-6,-29,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-15,-31,-23,13,-30,-20,18,-26,29,13,-26,-28,-22,-21,-22,-8,14,-16,5,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-24,4,12,-11,-17,-8,-20,-1,-17,-15,3,-3,-2,0,1,1,-17,-26,-12,4;
MA   /M: SY='E'; M=0,1,-24,6,13,-25,-13,-11,-21,-1,-22,-17,-3,10,0,-7,6,0,-17,-31,-20,5;
MA   /M: SY='G'; M=-6,11,-27,16,1,-29,22,-11,-32,-10,-23,-19,6,-15,-7,-13,0,-11,-25,-28,-22,-3;
MA   /I: I=-15; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-10,-4,5,-16,-14,-6,-14,-7,-12,-8,-3,-14,-1,-10,0,1,-11,-27,-12,2; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-16,-22,-14,-6,-1,-25,-2,-5,-10,-8,-5,-16,-4,-5,-12,-10,-5,-9,-7,20,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-22,3,6,-20,-15,-8,-16,-3,-17,-13,5,3,0,-4,4,6,-15,-30,-16,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-11,-6,-14,-11,-7,-20,-13,-2,-14,8,3,-11,-22,-9,-10,-11,-7,-3,-25,-9,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: M=0,-5,-18,-7,-6,-7,-13,-7,-8,-7,-7,-6,-3,-16,-2,-6,-2,-4,-7,-8,-2,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-1,-15,1,5,-10,-8,0,-9,-2,-7,-3,-2,-8,6,-3,1,-3,-10,-12,-1,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: M=-1,-4,-7,-3,0,-7,-11,-8,-8,-5,-1,-4,-5,-11,-3,-6,-2,-3,-6,-17,-7,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-10,-17,-10,-4,-2,-3,-10,-10,-7,-8,-6,-10,-10,-6,-8,-8,-7,-11,21,1,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-16,-4,-8,-10,6,-9,-10,-8,-10,-6,1,-12,-8,-7,0,-4,-8,-16,-10,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-18,-9,-9,-20,23,-13,-24,-13,-19,-13,-3,-17,-9,-11,1,-9,-19,-21,-16,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-15,-19,-18,-11,8,-12,-13,-12,-13,-10,-8,-11,-8,-15,-13,-8,-7,-12,-3,3,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='N'; M=-6,2,-22,-3,-7,-11,-3,-2,-9,-10,-11,-4,8,-12,-7,-11,-2,-6,-13,-23,-8,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='N'; M=-6,1,-13,0,-1,-5,-7,-2,-4,-7,-2,-3,2,-11,-5,-6,-4,-5,-5,-16,-5,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='B'; M=-2,10,-20,8,-2,-16,-10,-6,-16,-6,-18,-14,10,-16,-3,-7,6,4,-12,-28,-11,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-18,-2,3,-22,-13,-7,-20,6,-22,-12,5,-8,6,3,5,3,-17,-27,-13,4;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,-14,-29,-24,0,-30,-26,22,-22,8,7,-17,-21,-21,-22,-7,6,23,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-4,-12,-6,-5,-23,2,-7,-22,-4,-24,-14,4,-16,0,-2,12,0,-16,-31,-17,-3;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-12,-2,-1,-18,-3,-5,-18,-11,-25,-17,8,-12,-1,-10,34,16,-10,-38,-17,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-9,-31,-25,0,-31,-19,24,-24,19,19,-24,-26,-19,-21,-18,-8,22,-26,-4,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-2,-24,-4,3,-22,-19,-1,-27,28,-23,-10,4,-17,11,39,-8,-9,-21,-21,-7,4;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-21,-25,-21,-4,-28,-22,15,-18,3,3,-24,-1,-22,-18,-13,-5,20,-26,-10,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-19,-23,-21,-15,-5,-27,-12,14,-20,9,7,-15,-17,-10,-17,-11,-6,9,-24,-4,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-19,-8,-7,-19,-1,-14,-22,-4,-20,-14,-6,-14,-8,2,0,-5,-14,-16,-15,-8;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Beta/gamma crystallin 'Greek key';
CC   /VERSION=3;
PR   PRU00028;
DO   PDOC00197;
//