ID   TRAM; MATRIX.
AC   PS50926;
DT   01-SEP-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   TRAM domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4146850; R2=0.0275585; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1999.7829590; R2=2.1231670; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=225; H_SCORE=2477; N_SCORE=8.6; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=149; H_SCORE=2316; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-30; I=-30; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-8,-28,-6,5,-23,-17,-8,-19,9,-16,-9,-7,2,7,9,-6,-8,-18,-22,-13,4;
MA   /M: M=-2,-14,-21,-15,-8,-11,-18,-16,-7,-2,-8,-5,-10,-11,-7,-1,-3,0,-1,-21,-10,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-22,-12,-4,-5,-22,-3,-7,-1,-5,3,-10,-14,-1,-4,-9,-5,-9,-13,10,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-14,-23,-13,-4,-13,-25,-14,3,-6,-3,-1,-14,-9,-9,-5,-10,-6,7,-27,-11,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-28,-10,-18,-22,50,-17,-34,-16,-25,-17,0,-20,-18,-13,-2,-17,-25,-20,-24,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-22,3,13,-26,-17,-6,-23,15,-22,-12,1,-11,12,11,3,0,-17,-27,-14,12;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-10,-18,-12,-2,-10,-23,-16,-1,-6,-5,-4,-10,-14,-8,-6,-1,9,7,-27,-10,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,-25,-17,-6,-8,-23,-7,3,-7,2,6,-14,-20,2,-4,-12,-9,1,-18,0,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-25,4,14,-21,-19,-7,-20,8,-15,-12,-1,-8,4,10,-2,0,-15,-28,-14,8;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-13,-30,-27,1,-27,-27,25,-23,15,10,-26,-27,-26,-21,-13,-4,33,-25,-8,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-15,-21,-16,-8,-5,-23,-17,2,-11,12,3,-15,-20,-11,-9,-11,1,2,-23,-6,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-16,-33,-27,2,-33,-28,31,-22,12,11,-23,-25,-24,-22,-14,-4,32,-23,-4,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-22,5,18,-20,-18,-8,-16,-3,-11,-11,-2,-10,2,-7,3,5,-11,-30,-14,10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-27,10,12,-27,3,-9,-28,4,-22,-17,1,-12,0,-1,0,-9,-21,-26,-17,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-14,-24,-14,-3,-7,-25,-14,0,-7,6,4,-15,-11,-7,-5,-14,-7,-1,-23,-8,-6;
MA   /I: I=-9; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=1,0,-21,-1,-8,-23,18,-9,-24,-12,-23,-16,5,-16,-9,-12,10,-1,-15,-29,-20,-9; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-26,-3,3,-14,-18,-2,-20,11,-17,-10,-1,-14,1,11,-5,-6,-17,-17,-4,1;
MA   /I: I=-5; MD=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-26,5,5,-22,-5,-1,-25,9,-24,-14,12,-13,5,10,-1,-8,-23,-26,-14,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,0,-26,0,-11,-27,44,-15,-33,-14,-26,-18,5,-17,-14,-16,3,-12,-25,-24,-25,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-24,4,6,-17,-15,-3,-15,-2,-12,-9,0,-14,2,-1,-1,-3,-13,-25,-8,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-17,-21,-19,-20,-11,16,-19,-10,-19,-5,-1,-11,-23,-17,-16,-9,-13,-6,-17,-14,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-19,-25,-19,3,-28,-17,15,-15,6,7,-16,-21,-15,-14,-12,-4,14,-18,1,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=16,-10,-14,-14,-15,-23,29,-19,-24,-16,-18,-14,-4,-17,-14,-19,3,-9,-15,-23,-24,-15;
MA   /I: I=-5; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-28,-5,3,-17,-20,5,-22,17,-16,-8,-2,-14,5,30,-9,-9,-17,-19,-2,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-7,-18,-11,-11,-4,-21,-11,2,-14,0,0,-7,-18,-13,-14,-2,7,5,-24,-3,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-6,10,-22,13,10,-24,-9,-6,-23,0,-19,-15,6,-8,1,-4,2,-4,-20,-28,-17,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=0,4,-14,-1,-5,-12,6,-4,-13,-3,-13,-9,11,-13,-5,-3,3,-3,-12,-18,-11,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-3,-27,-7,-10,-15,15,-8,-20,-8,-17,-10,6,-20,-8,-7,-4,-12,-20,-19,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-25,-11,-5,-6,-19,-3,-12,5,-11,-2,-4,-18,1,9,-8,-6,-11,-16,1,-3;
MA   /I: I=-9; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-19,-20,-21,-18,-9,-18,-22,8,-13,-1,2,-17,-11,-17,-15,-8,-1,14,-22,-10,-19; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-19,-29,-26,-1,-28,-25,23,-20,7,7,-23,-23,-23,-19,-12,-3,28,-16,-3,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-16,-19,-23,-21,17,-24,-17,11,-19,6,4,-8,-25,-21,-16,-11,-5,10,-17,2,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-23,-12,-27,-23,11,-28,-21,14,-20,7,5,-21,-24,-23,-18,-11,-2,20,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-11,3,-29,6,11,-24,-17,-5,-21,2,-23,-15,2,17,1,-1,-3,-6,-23,-30,-19,4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-19,-4,-12,-12,17,-13,-25,-14,-21,-16,3,-15,-15,-15,-1,-9,-20,-21,-14,-14;
MA   /I: I=-3; MD=-12;
MA   /M: SY='A'; M=7,-1,-18,-3,0,-18,-6,-12,-12,-7,-11,-10,-2,-8,-6,-11,3,2,-8,-25,-15,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-2,-14,-1,3,-11,-9,-5,-7,1,-9,-6,-3,3,1,-2,-2,-3,-7,-12,-6,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-11,-22,-12,-2,-10,-17,-9,-6,-4,4,1,-10,-18,-3,-4,-8,-6,-7,-20,-4,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-22,-31,-19,-10,-13,-25,-20,1,-12,-5,-2,-20,29,-13,-16,-14,-9,-6,-25,-15,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-30,-10,-16,-24,50,-15,-33,-17,-26,-17,-1,-18,-16,-17,-2,-18,-26,-19,-22,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-28,23,26,-31,-14,-3,-28,8,-22,-17,4,-8,11,2,-1,-8,-23,-30,-17,18;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-15,-25,-18,-9,7,-20,-14,-7,-4,-6,-4,-11,-20,-12,-2,-11,-6,-5,-7,3,-10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-21,-16,-23,-21,-4,-25,-22,15,-14,4,5,-20,-22,-20,-13,-9,-2,26,-26,-9,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,4,-25,7,12,-20,-19,-6,-19,6,-15,-11,0,-11,5,4,-2,-1,-15,-26,-10,8;
MA   /M: SY='V'; M=8,-22,-12,-26,-22,-7,-22,-26,16,-15,4,4,-21,-23,-21,-18,-7,-2,25,-26,-11,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-27,-4,9,-23,-21,-4,-21,22,-17,-8,-3,-13,9,24,-6,-5,-15,-23,-10,7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-20,-32,-26,-2,-33,-27,33,-22,13,12,-23,-24,-22,-20,-14,-4,34,-25,-6,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-18,-10,-5,-9,-23,-14,-6,-5,-6,-5,-6,-15,-7,-5,3,17,0,-25,-6,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-27,8,11,-23,-14,-5,-23,10,-19,-13,3,-12,4,8,-2,-7,-18,-26,-13,7;
MA   /M: SY='A'; M=9,-11,-16,-14,-7,-11,-17,-14,-2,-9,-5,-4,-11,-17,-9,-11,-1,-1,4,-23,-8,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-25,-2,4,-21,-15,-4,-21,16,-18,-9,3,-14,5,15,-3,-4,-17,-23,-9,3;
MA   /I: I=-7; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-4,-24,-5,0,-19,-7,-8,-22,2,-21,-14,0,1,-3,5,2,-2,-18,-25,-15,-3; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-9,5,-23,1,-4,-10,-8,1,-18,-3,-18,-10,9,-17,-1,-2,0,-2,-17,-19,-2,-3; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-7,-21,-8,-8,4,-18,0,-8,-9,-11,-8,-5,-18,-8,-10,1,1,-7,-10,17,-10; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=5,-19,-19,-22,-15,-5,-15,-18,4,-16,13,4,-17,-21,-13,-16,-11,-4,3,-16,-6,-14; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-15,-26,-17,-8,7,-26,-7,-3,-8,-2,-2,-11,-20,-10,-1,-12,-6,-4,-10,7,-10;
MA   /M: SY='G'; M=20,-12,-19,-16,-16,-21,27,-20,-19,-16,-15,-12,-7,-17,-16,-19,4,-8,-10,-22,-23,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-26,10,21,-26,-18,-3,-22,10,-19,-13,1,-9,9,5,0,-4,-18,-28,-14,14;
MA   /M: SY='V'; M=2,-21,-20,-23,-16,-6,-19,-21,9,-14,8,4,-19,-17,-16,-14,-11,-6,11,-23,-10,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-22,-20,-25,-19,0,-26,-18,15,-15,11,9,-19,-23,-17,-12,-14,-4,17,-23,-4,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-23,2,7,-20,-13,-11,-18,2,-15,-12,-4,-11,-1,-1,-3,-6,-13,-23,-14,3;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=TRAM;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00208;
DO   PDOC50926;
//