ID SSB; MATRIX. AC PS50935; DT 01-OCT-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. DE Single-strand binding (SSB) domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=105; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=100; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8648449; R2=0.0204135; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5503.3300781; R2=4.0550160; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=326; H_SCORE=6825; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=228; H_SCORE=6428; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: B0=-50; E0=-50; M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='M'; M=-9,-17,-21,-24,-18,-1,-24,-10,18,-15,17,33,-17,-19,-8,-14,-17,-6,11,-23,-3,-14; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='N'; M=-8,35,-19,16,-2,-19,-2,7,-18,-2,-26,-18,53,-19,-1,-2,9,2,-26,-38,-19,-2; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='K'; M=-9,-3,-23,-5,4,-22,-19,4,-23,16,-19,-7,0,-12,10,15,-3,-4,-18,-24,-8,5; MA /M: SY='V'; M=-4,-28,-9,-31,-28,2,-30,-28,26,-24,15,10,-26,-28,-26,-22,-14,-3,33,-26,-7,-28; MA /M: SY='I'; M=-7,-14,-18,-20,-15,-1,-25,-12,10,-16,3,7,-11,-20,-11,-15,-6,1,9,-22,-2,-14; MA /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-22,8,-30,-21,23,-28,40,18,-28,-28,-21,-21,-25,-9,15,-19,0,-22; MA /M: SY='V'; M=-3,-18,-16,-21,-16,-5,-25,-20,15,-18,5,6,-15,-21,-15,-18,-6,-1,17,-26,-7,-17; MA /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-12,-19,-28,59,-20,-35,-19,-27,-18,-2,-19,-19,-20,1,-17,-25,-20,-28,-19; MA /M: SY='R'; M=-13,0,-24,-6,-4,-12,-16,1,-18,8,-15,-9,9,-20,0,25,-4,-2,-16,-23,-7,-4; MA /M: SY='L'; M=-5,-29,-16,-31,-25,5,-31,-25,26,-26,29,15,-27,-28,-23,-22,-20,-6,25,-23,-4,-25; MA /M: SY='T'; M=7,-9,-11,-15,-14,-15,0,-21,-9,-15,-10,-9,-6,-16,-15,-16,6,12,0,-27,-16,-15; MA /M: SY='R'; M=-5,0,-22,-1,4,-22,-14,-5,-24,13,-21,-12,3,-12,6,17,1,-2,-18,-26,-13,4; MA /M: SY='D'; M=-9,27,-23,37,16,-32,-12,-5,-30,1,-24,-22,10,-11,1,-6,2,-6,-21,-35,-19,8; MA /M: SY='P'; M=-5,-18,-32,-12,-4,-20,-18,-19,-13,-12,-19,-14,-17,51,-11,-17,-8,-8,-18,-27,-22,-11; MA /M: SY='E'; M=-9,4,-26,9,25,-24,-19,-4,-20,6,-16,-12,-2,-8,12,2,-2,-7,-18,-27,-13,18; MA /M: SY='L'; M=-8,-22,-21,-25,-17,4,-27,-16,13,-17,17,13,-19,-22,-13,-12,-17,-7,10,-19,0,-16; MA /M: SY='R'; M=-13,-7,-27,-8,1,-18,-19,-4,-26,27,-20,-9,0,-17,6,43,-7,-7,-17,-21,-9,1; MA /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; MA /M: SY='Y'; M=-12,-13,-24,-15,-9,7,-24,5,-3,-6,-3,1,-12,-20,-2,-6,-11,-6,-7,2,27,-7; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='T'; M=-2,-8,-13,-14,-12,-3,-16,-18,-5,-14,-6,-6,-6,-15,-13,-13,11,26,2,-25,-7,-13; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='P'; M=-5,-3,-28,0,6,-26,-11,-11,-22,1,-25,-16,-2,23,1,-5,1,-3,-22,-29,-20,2; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='N'; M=3,7,-20,4,5,-22,4,-7,-23,-5,-23,-16,12,-13,0,-8,11,0,-19,-30,-19,2; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='G'; M=-3,0,-28,-1,-11,-29,50,-14,-36,-12,-29,-20,7,-18,-13,-14,1,-16,-29,-23,-27,-12; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='K'; M=-5,-2,-22,-7,-4,-18,-17,-9,-8,2,-12,-3,1,-15,0,-1,0,2,-6,-26,-10,-3; MA /M: SY='P'; M=10,-10,-19,-11,-2,-20,-13,-15,-14,-7,-15,-12,-9,12,-7,-12,3,2,-11,-27,-19,-6; MA /M: SY='V'; M=-6,-23,-21,-24,-21,-2,-26,-15,15,-16,4,6,-20,-17,-17,-15,-12,-6,19,-20,0,-21; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='V'; M=9,-18,-5,-23,-19,-6,-18,-22,5,-18,3,0,-17,-21,-18,-19,-1,4,13,-26,-10,-19; MA /M: SY='N'; M=-4,4,-17,0,-1,-18,-12,-7,-16,0,-18,-12,9,-16,-2,3,6,3,-12,-30,-14,-2; MA /M: SY='F'; M=-13,-26,-18,-33,-21,43,-29,-20,6,-26,13,4,-19,-26,-28,-20,-18,-8,3,-5,14,-22; MA /M: SY='T'; M=-2,-7,-14,-11,-9,-11,-13,-13,-9,-9,-10,-5,-2,-15,-6,-5,9,12,-4,-26,-11,-8; MA /M: SY='L'; M=-8,-28,-21,-31,-23,5,-31,-22,27,-27,33,19,-25,-26,-19,-22,-22,-7,19,-22,-2,-22; MA /M: SY='A'; M=34,-10,-14,-16,-5,-20,-3,-18,-9,-8,-10,-9,-10,-12,-8,-17,7,-2,0,-22,-19,-7; MA /M: SY='V'; M=-3,-12,-8,-16,-16,-8,-20,-8,1,-14,-5,-2,-9,-22,-15,-12,0,8,11,-29,-6,-16; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='N'; M=-9,14,-20,7,5,-17,-10,1,-22,1,-23,-15,21,-14,4,2,6,-1,-22,-30,-14,4; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; MA /M: SY='R'; M=-9,1,-24,5,8,-23,-12,-5,-25,8,-22,-16,4,-8,4,19,5,-1,-19,-29,-16,4; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='R'; M=-9,-4,-25,-6,-2,-15,-10,-6,-19,4,-19,-10,3,-9,2,12,-2,-5,-17,-20,-11,-1; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='Y'; M=-12,-18,-26,-22,-16,12,-22,-5,-5,-8,-2,-1,-14,-23,-11,-1,-15,-9,-6,8,19,-14; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='R'; M=-11,-5,-26,-7,0,-15,-15,-5,-17,11,-15,-5,-1,-16,4,17,-7,-7,-14,-20,-6,0; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='D'; M=-9,20,-23,21,14,-25,-6,-1,-26,3,-25,-19,17,-9,3,-3,6,-2,-24,-31,-15,8; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='K'; M=1,1,-20,-1,6,-22,-5,-6,-20,7,-20,-12,5,-8,5,5,4,-3,-16,-24,-15,5; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='B'; M=-4,11,-12,11,7,-14,-5,0,-13,3,-13,-9,9,-6,5,0,3,0,-12,-16,-8,6; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='G'; M=-6,11,-27,14,-1,-31,31,-9,-35,-9,-28,-21,10,-15,-6,-12,2,-12,-28,-27,-24,-4; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='E'; M=-9,5,-26,8,19,-20,-17,1,-22,4,-17,-11,3,-8,13,3,-1,-7,-22,-24,-9,15; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: M=-3,-11,-23,-13,-5,-11,-21,-12,-6,-5,-8,-5,-10,-6,-6,-5,-4,0,-4,-20,-7,-7; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='R'; M=-7,-1,-19,-1,8,-20,-13,-1,-19,9,-16,-9,1,-6,10,14,-1,-5,-17,-21,-11,8; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='E'; M=-2,3,-14,3,11,-15,-9,-1,-11,3,-10,-6,2,-6,10,1,1,-2,-11,-15,-9,10; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='K'; M=-2,-5,-10,-5,0,-7,-11,-5,-3,1,-4,-2,-5,-8,-1,1,-2,0,1,-12,-4,-1; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='T'; M=-1,-4,-9,-6,-3,-6,-11,-9,-5,-5,-6,-5,-4,-5,-4,-6,4,12,-1,-7,-3,-3; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='D'; M=-10,6,-12,11,4,-15,-14,-3,-17,-8,-9,-11,-2,-14,-5,-10,-4,-5,-13,-22,-8,-1; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='W'; M=-16,-23,-29,-26,-16,28,-23,-13,-10,-15,-6,-8,-19,-23,-16,-12,-18,-12,-13,39,25,-14; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='I'; M=-12,-22,-21,-28,-21,10,-30,1,16,-24,13,11,-15,-23,-16,-19,-18,-11,9,-17,8,-21; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='R'; M=-10,5,-26,7,8,-24,-13,-4,-24,7,-23,-15,6,1,6,11,1,-4,-22,-27,-16,5; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='V'; M=0,-25,12,-29,-26,-5,-28,-27,16,-22,6,4,-23,-27,-24,-23,-11,-4,25,-29,-12,-26; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='V'; M=-4,-13,-14,-16,-12,-9,-23,-18,9,-9,-2,1,-11,-20,-12,-8,-4,1,16,-27,-10,-13; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='I'; M=8,-20,-18,-26,-20,-5,-14,-23,13,-20,9,5,-17,-19,-18,-21,-8,-4,13,-20,-9,-20; D=-6; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; MA /M: SY='W'; M=-13,-25,-33,-26,-21,15,-16,-19,-14,-17,-10,-12,-23,-25,-17,-14,-20,-16,-17,60,18,-16; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='G'; M=-6,-3,-29,-3,-9,-27,34,-12,-34,-5,-27,-17,5,-14,-8,0,-1,-13,-27,-23,-23,-10; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='K'; M=-8,3,-23,0,3,-24,-11,-5,-25,19,-24,-12,7,-11,3,18,-3,-7,-20,-26,-14,2; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='L'; M=-2,-13,-22,-16,-5,-13,-21,-11,-2,-8,6,4,-12,-14,4,-5,-9,-3,-6,-22,-9,-2; MA /M: SY='A'; M=31,-10,-14,-17,-10,-15,0,-17,-11,-10,-11,-10,-8,-14,-10,-15,7,-2,-2,-20,-16,-10; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-27,16,31,-24,-17,-3,-24,4,-18,-17,3,-8,10,-1,1,-6,-23,-28,-16,21; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='I'; M=-4,-9,-19,-16,-12,-1,-18,-15,5,-13,-1,1,-4,-19,-12,-13,-4,0,5,-23,-7,-13; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='I'; M=3,-25,-13,-31,-23,0,-25,-24,16,-23,14,9,-23,-24,-20,-22,-15,-7,14,-12,-4,-22; MA /M: SY='A'; M=8,-2,-17,-5,-2,-21,-1,-9,-19,-4,-16,-11,-1,-15,-3,-8,2,-4,-13,-24,-15,-3; MA /I: I=-13; MD=-27; MA /M: SY='E'; M=-9,9,-26,12,18,-29,-15,0,-25,13,-23,-13,7,-6,15,7,1,-5,-23,-28,-15,16; D=-13; MA /I: I=-13; MD=-27; MA /M: SY='Y'; M=-11,-8,-21,-11,-10,10,-19,8,-6,-6,-5,-4,-5,-20,-4,-5,-7,-2,-10,4,34,-10; D=-13; MA /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; MA /M: SY='L'; M=-7,-24,-16,-28,-21,8,-29,-18,17,-24,23,12,-22,-26,-19,-19,-18,-5,14,-19,2,-21; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-27; MA /M: SY='K'; M=-8,-2,-26,-3,3,-23,-13,0,-24,19,-24,-10,3,-12,7,19,-2,-5,-19,-24,-10,4; MA /M: SY='K'; M=-8,-6,-29,-5,5,-25,-20,-13,-21,30,-22,-8,-6,-3,4,16,-10,-9,-14,-22,-12,4; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,69,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,1,-19,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='D'; M=-4,10,-21,13,3,-24,-12,-5,-20,1,-21,-14,6,-13,3,-1,8,3,-12,-31,-14,3; MA /M: SY='R'; M=-8,-11,-25,-12,-3,-14,-18,-8,-10,5,-3,1,-8,-15,2,10,-11,-8,-10,-21,-8,-2; MA /M: SY='I'; M=-4,-28,-17,-32,-26,2,-31,-27,30,-25,20,14,-25,-26,-23,-23,-16,-5,30,-24,-5,-26; MA /M: SY='M'; M=-3,-15,-22,-18,-11,-2,-14,-8,-1,-12,-1,2,-11,-19,-8,-10,-6,-5,-2,-16,2,-10; MA /M: SY='V'; M=-4,-29,-13,-33,-29,1,-31,-29,32,-24,14,12,-26,-27,-27,-23,-14,-4,38,-26,-7,-29; MA /M: SY='E'; M=-6,-1,-24,1,17,-21,-19,-6,-12,-2,-13,-8,-3,-11,10,-6,2,-2,-11,-24,-12,13; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='R'; M=-12,-7,-25,-7,5,-9,-18,-3,-23,11,-18,-11,-1,-14,2,24,-2,-4,-16,-21,-7,2; MA /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22,6,-31,-21,26,-27,35,21,-26,-26,-18,-21,-25,-9,15,-18,0,-21; MA /M: SY='R'; M=-6,-5,-24,-6,2,-22,-15,-1,-18,9,-17,-7,-2,-15,9,14,-1,-4,-13,-23,-9,4; MA /M: SY='T'; M=-7,-7,-18,-12,-7,-8,-19,-7,-7,-8,-7,0,-4,-13,0,-5,2,9,-7,-21,-1,-5; MA /M: SY='R'; M=-11,5,-26,6,4,-21,-8,3,-26,8,-23,-15,9,-16,4,17,1,-5,-22,-24,-8,2; MA /M: SY='K'; M=-4,-1,-22,-2,6,-23,-12,-2,-21,10,-22,-10,4,-12,9,10,7,2,-16,-28,-13,7; MA /M: SY='W'; M=-16,-25,-34,-26,-21,13,-22,-10,-7,-12,-8,-7,-23,-27,-15,-9,-23,-16,-12,51,33,-18; MA /I: I=-8; MD=-17; MA /M: SY='E'; M=-6,1,-21,3,17,-20,-18,-4,-16,3,-13,-9,-3,-6,9,-1,2,3,-14,-24,-10,13; D=-8; MA /I: I=-8; MD=-17; MA /M: SY='D'; M=-4,13,-17,15,3,-20,-1,-4,-21,1,-18,-14,9,-9,0,1,3,-2,-15,-22,-13,1; D=-8; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; MA /M: SY='Q'; M=-8,4,-22,3,11,-24,-12,-1,-20,14,-20,-9,6,-5,17,12,0,-4,-20,-21,-12,13; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-17; MA /M: SY='D'; M=-9,22,-22,29,19,-26,-10,0,-25,1,-21,-18,11,-7,8,-4,5,-3,-22,-29,-14,14; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-17; MA /M: SY='G'; M=-1,-4,-23,-5,-12,-23,45,-13,-29,-13,-23,-15,4,-16,-13,-13,1,-13,-23,-19,-23,-12; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-17; MA /M: SY='N'; M=-6,3,-20,0,5,-17,-14,-4,-12,4,-15,-7,6,-12,5,0,1,1,-11,-24,-11,5; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-17; MA /M: SY='K'; M=-8,0,-25,-2,0,-23,-10,-9,-22,17,-22,-9,4,-11,2,15,-1,-1,-16,-25,-14,0; MA /M: SY='R'; M=-11,-6,-25,-6,2,-18,-20,2,-17,10,-14,-7,-1,-17,6,22,-4,-5,-12,-25,-9,2; MA /M: SY='Y'; M=-7,-6,-22,-9,-7,-2,-18,-1,-11,-2,-13,-7,-2,-17,-1,-3,2,4,-11,-12,14,-5; MA /M: SY='K'; M=-1,-9,-21,-12,-7,-17,-12,-13,-9,4,-13,-4,-5,-16,-3,4,0,-1,-4,-23,-11,-6; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='T'; M=-4,-16,-19,-20,-16,-4,-23,-16,5,-15,3,3,-14,-10,-14,-15,-5,9,6,-18,-1,-16; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-25; MA /M: SY='E'; M=-8,2,-25,5,21,-22,-18,-4,-18,6,-16,-10,-1,-11,10,3,-1,-5,-14,-26,-12,15; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-25; MA /M: SY='I'; M=-7,-29,-15,-34,-28,6,-33,-27,31,-25,19,14,-25,-26,-24,-23,-17,-6,30,-22,-3,-27; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-25; MA /M: SY='V'; M=-7,-11,-21,-14,-8,-10,-23,-4,0,-8,-4,0,-8,-18,-5,-5,-4,1,3,-26,-5,-8; MA /M: SY='A'; M=20,-19,-15,-26,-19,-10,-15,-24,11,-17,2,1,-17,-18,-17,-21,-2,-1,17,-23,-13,-19; MA /M: SY='E'; M=-7,14,-24,19,22,-27,-14,-2,-25,1,-20,-17,8,-9,10,-4,6,0,-22,-32,-17,16; MA /M: SY='N'; M=-7,8,-23,4,6,-22,-8,0,-22,6,-23,-12,15,-14,8,9,5,-1,-20,-29,-15,6; MA /M: SY='I'; M=-8,-26,-18,-32,-25,8,-31,-23,26,-24,15,15,-21,-24,-21,-22,-16,-7,22,-19,0,-25; MA /M: SY='E'; M=-10,0,-27,1,12,-21,-15,0,-16,1,-15,-8,1,-12,9,1,-2,-6,-17,-26,-11,9; MA /M: SY='F'; M=-13,-21,-22,-25,-15,22,-25,-12,0,-18,8,3,-17,-14,-18,-12,-16,-8,-3,-11,7,-16; MA /M: SY='L'; M=-8,-21,-22,-23,-18,3,-24,-18,14,-22,20,10,-19,-20,-16,-18,-17,-8,8,-20,-2,-18; MA /M: SY='D'; M=-3,9,-22,11,7,-24,-2,-6,-24,-4,-20,-16,6,-12,0,-6,7,0,-18,-30,-16,3; MA /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=SSB; CC /VERSION=5; PR PRU00252; DO PDOC00602; //