ID   ZF_THAP; MATRIX.
AC   PS50950;
DT   01-JAN-2004 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger THAP-type profile
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=82;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=82;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9798009; R2=0.0128936; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=623; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=274; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-16,-30,-12,-5,-24,-13,-19,-16,-3,-22,-13,-14,36,-9,-7,-6,-5,-15,-27,-22,-10;
MA   /I: I=-12; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=0,-4,-20,-8,-6,-15,-2,-7,-19,2,-16,-10,1,-15,-2,6,2,3,-13,-17,-6,-5; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-9,-10,-13,-10,3,-18,3,-10,-7,-9,-5,-2,-18,-8,1,-2,-1,-8,-16,4,-10; D=-12;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=18,-10,17,-17,-12,-19,-11,-20,-16,-10,-17,-13,-8,-18,-12,-15,9,1,-3,-32,-21,-12;
MA   /M: SY='A'; M=17,-20,-15,-27,-20,6,-17,-20,6,-17,1,-1,-18,-20,-20,-20,-4,-3,13,-14,0,-20;
MA   /I: I=-14; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-25,-20,-12,-12,-21,-17,5,-7,-6,-2,-14,8,-10,-10,-9,-7,1,-19,-8,-14; D=-14;
MA   /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-7,10,-17,9,-7,-25,25,-1,-31,-11,-26,-18,15,-18,-9,-12,1,-12,-26,-28,-20,-9; D=-14;
MA   /I: I=-14; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-8,-17,-9,-1,-17,-11,-11,-19,3,-16,-11,-6,-9,-3,1,0,-2,-14,-22,-9,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-2,8,-18,-1,-6,-13,-10,3,-14,-5,-19,-12,18,-18,-4,-3,9,8,-12,-28,-7,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-24,-9,-8,-7,-13,-6,-17,7,-16,-9,3,-20,-5,17,-5,-2,-11,-19,-2,-8;
MA   /M: SY='S'; M=-5,0,-10,0,-6,-9,-14,-4,-17,-8,-19,-14,0,-17,-5,-7,12,11,-11,-22,5,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-7,0,-21,0,-7,-18,-5,-5,-16,-5,-14,-10,0,-17,-8,-3,1,3,-8,-29,-12,-8;
MA   /I: I=-8; MD=-16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-9,-9,-3,-18,-9,0,-17,2,-14,-6,-4,-9,5,12,-5,-8,-13,-19,-10,-1; D=-8;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-19,13,7,-19,-11,9,-17,-3,-13,-10,9,-11,5,-4,0,-2,-16,-24,-8,5; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-16;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-26,-5,2,-24,-10,-8,-21,14,-23,-11,-2,3,6,15,-1,-6,-18,-22,-14,2; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,1,-22,0,-6,-24,19,-10,-27,-4,-25,-17,7,-9,-7,-4,6,-6,-21,-25,-21,-7; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-22,-28,-19,0,-29,-18,18,-15,24,20,-22,-25,-14,-9,-21,-9,14,-21,-3,-18;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-18,-3,-1,-22,-3,5,-22,-4,-24,-13,5,-12,3,-5,17,9,-15,-31,-12,0;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,63,-30,-20,5,-30,20,5,-22,-30,-35,-20,-22,-10,2,3,23,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-19,-26,-24,-19,33,-28,24,-5,-21,0,2,-10,-26,-18,-13,-17,-13,-9,-3,31,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-8,-25,-10,-2,-21,-17,1,-20,13,-18,-8,-4,-10,5,24,-4,-4,-13,-23,-10,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-30,69,-30,-21,4,-29,12,2,-21,-30,-38,-20,-20,-9,5,5,25,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-11,0,-28,1,5,-26,-20,-5,-26,28,-24,-10,-1,-4,4,18,-6,-3,-18,-24,-10,4;
MA   /M: SY='D'; M=-16,21,-4,31,15,-33,-17,-4,-34,0,-25,-22,6,-15,4,-1,-3,-10,-25,-36,-20,9;
MA   /M: SY='P'; M=0,-2,-27,-5,-1,-24,-13,-12,-20,2,-25,-16,2,25,-4,-3,-1,-2,-21,-28,-21,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-28,0,6,-24,-19,-13,-8,-2,-14,-9,-5,2,1,-10,-3,-7,-11,-27,-15,2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-14,-24,-15,-6,-7,-23,-10,-11,8,-3,-1,-10,-20,-1,22,-11,-4,-7,-19,-5,-5;
MA   /I: I=-15; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-15,-7,-18,-10,-5,-21,-3,-15,-1,-2,-3,-10,-23,-7,17,-12,-9,-9,-20,-5,-10; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-28,-4,8,-25,-15,-6,-25,25,-20,-8,-2,-14,13,26,-6,-8,-19,-22,-12,9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-10,-25,-9,-1,-13,-23,-15,-4,2,6,1,-12,-17,-5,-3,-15,-9,-5,-22,-8,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-12,-23,-10,-3,-10,-26,-8,2,-7,6,3,-14,-20,-9,-8,-14,-9,4,-26,-6,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-3,-26,-2,17,-24,-17,-5,-22,14,-15,-10,-4,-11,12,17,-4,-8,-18,-23,-14,13;
MA   /M: SY='N'; M=5,5,-17,-7,-10,3,-8,-7,-12,-11,-13,-12,16,-19,-12,-11,5,-1,-12,-23,-8,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-22,31,-27,-26,-9,-20,-24,-1,-22,0,3,-21,-30,-23,-22,-10,-4,12,-34,-16,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-26,-3,2,-27,0,4,-28,9,-25,-11,6,-15,12,16,2,-7,-24,-25,-13,5;
MA   /I: I=-8; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-23,-10,-6,-13,-10,-3,-19,11,-15,-8,-1,-19,0,32,-6,-8,-12,-16,-5,-6; D=-8;
MA   /I: I=-8; MD=-17;
MA   /M: SY='A'; M=2,-7,-7,-8,-7,-15,-15,-7,-12,-8,-10,-8,-6,-9,-8,-10,2,1,-5,-27,-12,-8; D=-8;
MA   /I: I=-8; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-24,19,7,-25,-5,-6,-24,-3,-18,-17,7,-4,-2,-5,0,-7,-20,-29,-17,2; D=-8;
MA   /I: I=-8; MD=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-11,-16,-10,-2,-11,-15,-11,-2,-4,-4,-2,-11,0,-3,-3,-5,-4,1,-18,-10,-3; D=-8;
MA   /I: I=-8; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-1,6,-10,7,5,-13,-3,-2,-14,0,-15,-11,8,-6,2,1,11,3,-10,-20,-10,3; D=-8;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-22,-21,-25,-20,7,-22,-22,-14,-12,-13,-12,-21,-25,-17,-10,-22,-17,-15,45,9,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-13,-24,-13,-6,-12,-24,-11,4,-9,-2,4,-13,-11,-1,-11,-8,-6,2,-22,-4,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-35,-12,-4,-24,-15,-19,-16,-9,-18,-13,-18,55,-11,-16,-12,-11,-23,-27,-24,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-20,-9,-11,-12,9,-6,-20,-12,-16,-11,2,-17,-11,-11,6,1,-15,-25,-12,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-26,2,10,-26,-16,-9,-26,26,-28,-14,4,-3,6,13,1,-1,-19,-26,-14,8;
MA   /M: SY='H'; M=-11,2,-29,1,-3,-17,1,6,-23,-4,-18,-12,6,-19,0,-5,-7,-13,-24,-10,-1,-2;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-7,-23,-6,-3,-16,-14,0,-16,-7,-15,-10,-5,1,-1,-6,2,-1,-15,-22,-4,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-8,-22,-15,1,-21,-17,-2,-11,-6,-3,-12,-21,-10,-5,-3,-4,3,-21,-6,-13;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-33,-25,8,-32,-23,29,-27,31,21,-26,-26,-21,-22,-23,-9,21,-20,0,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=14,0,-13,-1,-3,-20,-4,-13,-14,-11,-22,-16,4,-11,-4,-14,25,11,-6,-34,-18,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-25,2,6,-19,-21,-9,-17,11,-9,-8,-4,-15,0,13,-8,-4,-11,-26,-11,2;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,11,-25,12,13,-29,-9,-4,-26,9,-23,-15,8,-11,11,5,2,-3,-22,-28,-16,12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,5,-29,12,9,-29,-9,-11,-27,1,-25,-19,-1,15,-2,-4,-2,-6,-24,-29,-21,2;
MA   /M: SY='S'; M=1,8,-21,12,14,-26,-3,-8,-26,0,-25,-19,6,-9,2,-6,15,4,-18,-33,-19,8;
MA   /I: I=-6; MD=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-11,2,18,4,-7,-15,-19,-12,-19,-13,-15,-10,-5,-21,-8,-15,-4,-7,-10,-32,-14,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-23,-36,-26,40,-29,-22,12,-27,14,5,-22,-25,-28,-21,-22,-11,5,11,17,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-15,17,13,-26,-7,-5,-26,4,-22,-14,7,-11,2,-3,0,-7,-21,-30,-17,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-9,-9,-6,-16,-3,-9,-15,-3,-13,-8,-2,-14,0,5,3,-1,-10,-21,-12,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-13;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-15,-8,-5,-2,-13,-8,-7,-9,-8,-7,0,-14,-6,-5,7,8,-6,-20,-2,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=2,-8,-13,-12,-10,-5,-3,-11,-16,-7,-16,-11,-4,-10,-10,-10,0,-5,-13,-7,-4,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-13;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-24,-2,-1,-19,-5,-4,-15,8,-19,-8,8,-7,4,2,-4,-8,-17,-18,-7,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-25,-9,-5,-15,-11,-3,-17,13,-15,-4,3,-18,2,29,-7,-7,-14,-19,-6,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-6,-26,-6,-2,-18,-21,-2,-19,14,-13,-7,-2,-17,2,32,-7,-2,-13,-23,-8,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-24,-12,-5,-13,-22,-8,-15,15,-8,-4,-7,-19,0,28,-9,-1,-8,-19,-4,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-28,-19,8,-29,-20,18,-28,45,18,-28,-28,-19,-19,-26,-5,9,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-6,-26,-9,-3,-17,-22,-7,-11,19,-16,-4,-2,-18,3,17,-9,-8,-7,-19,-3,-1;
MA   /M: SY='P'; M=2,-3,-25,-2,5,-26,-7,-12,-21,1,-22,-13,-5,11,1,-7,2,-2,-18,-27,-20,2;
MA   /M: SY='G'; M=-7,10,-24,7,-4,-23,16,-8,-23,-9,-22,-13,14,-17,-8,-11,2,-7,-19,-30,-21,-6;
MA   /M: SY='A'; M=37,-11,-13,-18,-8,-20,-5,-17,-10,-6,-10,-8,-10,-12,-5,-11,7,-1,-1,-21,-18,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-13,-30,-28,0,-31,-29,29,-21,13,11,-27,-27,-27,-21,-11,1,41,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,0,-11,-10,-6,-16,-18,-14,-13,-15,-13,0,-14,-11,-12,20,32,-4,-31,-11,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-26,-30,-22,-3,-33,-25,28,-20,17,13,-22,-14,-18,-20,-19,-8,19,-22,-5,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-16,-21,-23,-18,32,-23,-3,-7,-14,-3,-4,-7,-26,-20,-3,-10,-7,-5,-7,16,-18;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=44(44); /POSITIVE=44(44); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=2; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=THAP-type;
CC   /VERSION=3;
DR   Q20595    , CTBP1_CAEEL, T; Q27395    , LI15B_CAEEL, T;
DR   P34427    , LIN36_CAEEL, T; O43422    , P52K_HUMAN , T;
DR   Q9CUX1    , P52K_MOUSE , T; Q7M3K2    , PELET_DROME, T;
DR   Q9P2Z0    , THA10_HUMAN, T; Q5NVM3    , THA10_PONAB, T;
DR   A5PKF5    , THA11_BOVIN, T; Q6TGZ4    , THA11_DANRE, T;
DR   Q96EK4    , THA11_HUMAN, T; Q9JJD0    , THA11_MOUSE, T;
DR   Q6IR68    , THA11_XENLA, T; A4IGQ8    , THA11_XENTR, T;
DR   Q3T0G1    , THAP1_BOVIN, T; Q1JPT7    , THAP1_DANRE, T;
DR   Q9NVV9    , THAP1_HUMAN, T; Q4R3Q6    , THAP1_MACFA, T;
DR   Q8CHW1    , THAP1_MOUSE, T; Q5RCE4    , THAP1_PONAB, T;
DR   Q5U208    , THAP1_RAT  , T; B5XCB8    , THAP1_SALSA, T;
DR   Q6DIN8    , THAP1_XENTR, T; Q9H0W7    , THAP2_HUMAN, T;
DR   Q9D305    , THAP2_MOUSE, T; Q0P5B4    , THAP3_BOVIN, T;
DR   Q8WTV1    , THAP3_HUMAN, T; Q8BJ25    , THAP3_MOUSE, T;
DR   Q2TBI2    , THAP4_BOVIN, T; Q8WY91    , THAP4_HUMAN, T;
DR   Q6P3Z3    , THAP4_MOUSE, T; Q642B6    , THAP4_RAT  , T;
DR   Q1RMM0    , THAP5_BOVIN, T; Q5ZHN5    , THAP5_CHICK, T;
DR   Q7Z6K1    , THAP5_HUMAN, T; Q4R7M0    , THAP5_MACFA, T;
DR   Q0IHI7    , THAP5_XENLA, T; Q8TBB0    , THAP6_HUMAN, T;
DR   Q9BT49    , THAP7_HUMAN, T; Q8VCZ3    , THAP7_MOUSE, T;
DR   Q8NA92    , THAP8_HUMAN, T; Q9H5L6    , THAP9_HUMAN, T;
DR   Q5U560    , THP1A_XENLA, T; Q6DDT6    , THP1B_XENLA, T;
DR   Q9LZA5    , NMAT3_ARATH, N; Q9CA78    , NMAT4_ARATH, N;
3D   2D8R; 2JM3; 2JTG; 2KO0; 2L1G; 2LAU; 3KDE; 6P5A; 6PE2;
PR   PRU00309;
DO   PDOC50950;
//