ID COX2_TM; MATRIX. AC PS50999; DT 01-JUN-2004 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. DE Cytochrome oxidase subunit II transmembrane region profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=95; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=90; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7467759; R2=0.0142222; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3934.6208496; R2=4.2706046; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=405; H_SCORE=5664; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=264; H_SCORE=5062; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-9; D=-40; I=-40; B1=-400; E1=-400; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='M'; M=-4,-17,-12,-24,-17,-4,-17,-11,6,-13,9,21,-15,-20,-10,-12,-13,-7,5,-23,-7,-14; MA /M: SY='A'; M=7,-11,-14,-14,-9,-16,-10,-17,-9,-15,-9,-8,-8,4,-11,-17,2,0,-9,-29,-18,-11; MA /M: SY='T'; M=-5,-2,-19,-7,-5,-7,-8,-2,-15,-10,-13,-9,4,-16,-6,-8,5,8,-12,-25,-7,-6; MA /M: SY='W'; M=-8,-19,-31,-18,-13,-11,-3,-16,-23,-12,-23,-17,-16,3,-13,-15,-14,-16,-25,25,-4,-12; MA /M: SY='W'; M=-3,-18,-1,-20,-15,-11,-9,-18,-17,-15,-15,-11,-15,-18,-13,-17,-7,-9,-13,5,-6,-14; MA /I: I=-12; MD=-32; MA /M: SY='N'; M=-8,10,-24,7,4,-24,1,0,-23,-2,-22,-11,13,-15,13,-3,2,-8,-25,-26,-15,9; D=-12; MA /I: I=-12; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='L'; M=-8,-21,-17,-25,-18,5,-25,-13,9,-20,16,11,-17,-24,-13,-14,-15,-5,4,-16,0,-16; MA /M: SY='N'; M=-4,1,-22,-4,-10,-12,7,-4,-18,-12,-18,-11,8,-16,-9,-12,5,0,-17,-22,-6,-11; MA /M: SY='F'; M=-11,-26,-19,-31,-22,33,-28,-13,7,-26,20,7,-20,-27,-25,-18,-18,-6,5,-10,11,-22; MA /M: SY='Q'; M=-9,-11,-26,-12,1,-19,-15,-3,-8,-7,2,5,-10,-18,23,-3,-10,-11,-16,-19,-8,12; MA /M: SY='D'; M=-16,30,-24,40,12,-28,-13,-3,-30,-3,-23,-22,14,-7,-2,-9,-3,-9,-26,-35,-17,5; MA /M: SY='P'; M=10,-13,-23,-12,-6,-21,-6,-17,-13,-12,-19,-12,-9,22,-8,-17,7,0,-13,-28,-22,-9; MA /M: SY='A'; M=17,-2,-17,-9,-5,-20,-8,-7,-15,-1,-18,-9,2,-6,-4,-8,7,1,-9,-26,-15,-5; MA /I: I=-10; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='S'; M=5,-3,-16,-5,-8,-21,18,-14,-25,-13,-26,-18,5,-13,-8,-13,24,12,-15,-32,-21,-8; MA /I: I=-11; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='P'; M=-2,-15,-33,-9,3,-24,-13,-17,-19,-10,-22,-17,-15,52,-8,-17,-6,-9,-24,-27,-25,-6; MA /M: SY='I'; M=-8,-18,-21,-22,-17,-2,-28,-18,17,-18,12,10,-15,-22,-11,-16,-12,-3,14,-23,-3,-15; MA /M: SY='M'; M=5,-12,-20,-17,-5,-12,-9,-4,-2,-8,0,19,-12,-15,1,-11,-6,-7,-4,-20,-7,-2; MA /M: SY='E'; M=-10,8,-29,15,37,-29,-19,2,-26,6,-19,-14,0,-3,19,-1,0,-8,-26,-28,-15,28; MA /M: SY='Q'; M=-10,-2,-25,-1,8,-24,-1,-4,-25,2,-18,-9,-3,-15,9,0,-6,-13,-24,-16,-10,8; MA /M: SY='I'; M=-7,-21,-21,-25,-18,-1,-27,-17,18,-20,18,16,-18,-23,-10,-17,-14,-6,12,-23,-4,-15; MA /M: SY='I'; M=-10,-15,-23,-17,-16,-1,-27,-11,12,-16,8,9,-14,-22,-12,-15,-13,-5,9,-19,4,-16; MA /M: SY='Y'; M=-13,-5,-25,-6,-5,0,-18,-3,-12,-11,-8,-8,-4,-19,-9,-9,-9,-8,-13,-6,4,-7; MA /M: SY='F'; M=-15,-28,-21,-33,-24,41,-29,-18,10,-29,27,9,-22,-29,-28,-19,-24,-10,4,-5,16,-24; MA /M: SY='H'; M=-16,-6,-27,-9,-9,-8,-23,49,-10,-14,-9,4,1,-20,-2,-8,-11,-12,-13,-24,14,-8; MA /M: SY='D'; M=-7,22,-24,27,4,-26,-6,3,-24,-7,-21,-18,15,-15,-4,-10,3,-6,-20,-34,-14,-1; MA /M: SY='H'; M=-16,-7,-24,-11,-11,12,-23,23,-10,-16,-2,-1,-2,-23,-10,-10,-12,-9,-12,-16,15,-11; MA /M: SY='V'; M=4,-14,-16,-20,-17,-6,-14,-19,6,-17,0,2,-9,-19,-14,-17,2,6,9,-26,-10,-16; MA /M: SY='L'; M=-9,-23,-14,-29,-21,4,-27,-16,18,-22,27,26,-22,-24,-14,-17,-19,-3,11,-22,-2,-18; MA /M: SY='M'; M=-8,-21,-19,-27,-21,14,-21,-12,10,-18,13,22,-18,-23,-15,-15,-12,-2,7,-15,6,-17; MA /M: SY='I'; M=-9,-27,-23,-33,-26,13,-33,-21,28,-26,20,13,-23,-25,-22,-23,-19,-8,20,-13,9,-26; MA /M: SY='L'; M=-5,-25,-21,-30,-22,6,-23,-19,18,-24,26,19,-23,-25,-18,-20,-20,-8,12,-19,-2,-20; MA /M: SY='V'; M=-3,-22,-11,-29,-23,7,-28,-24,16,-23,11,6,-18,-23,-22,-21,-10,3,18,-22,-3,-23; MA /M: SY='L'; M=0,-24,-20,-29,-22,3,-18,-21,16,-23,17,14,-20,-23,-19,-21,-15,-8,14,-19,-5,-21; MA /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-37,-29,1,-36,-28,42,-27,20,20,-23,-23,-21,-26,-18,-8,32,-22,-2,-28; MA /M: SY='T'; M=-5,-18,-17,-20,-15,0,-23,-20,2,-19,3,-2,-15,-5,-17,-17,-2,8,4,-25,-8,-16; MA /M: SY='V'; M=0,-21,-12,-26,-22,-2,-19,-23,14,-21,6,6,-17,-23,-20,-20,-6,0,18,-25,-9,-22; MA /M: SY='F'; M=-9,-27,-20,-32,-25,19,-27,-23,17,-25,19,10,-23,-23,-25,-21,-17,-6,16,-16,2,-25; MA /M: SY='V'; M=-3,-28,-14,-31,-28,7,-31,-28,27,-22,11,9,-26,-28,-28,-21,-11,1,39,-25,-5,-28; MA /M: SY='M'; M=-2,-15,-15,-20,-14,-2,-12,-14,0,-17,2,7,-11,-19,-10,-15,-3,0,-1,-22,-7,-12; MA /M: SY='Y'; M=-9,-20,-26,-23,-20,10,-17,-8,-3,-16,-1,-2,-19,-24,-15,-15,-13,-3,-6,19,27,-18; MA /M: SY='I'; M=-4,-25,-22,-31,-21,2,-28,-20,25,-22,19,20,-21,-22,-16,-21,-16,-8,18,-20,-3,-20; MA /M: SY='L'; M=-11,-25,-22,-30,-23,16,-23,-18,15,-24,21,15,-21,-25,-20,-20,-19,-7,8,-13,7,-22; MA /M: SY='F'; M=-9,-24,-12,-30,-24,24,-24,-21,8,-24,10,4,-19,-26,-26,-20,-13,-3,10,-14,6,-24; MA /M: SY='Y'; M=-1,-12,-19,-15,-12,-3,-19,-10,-1,-10,-3,-2,-8,-20,-9,-8,-1,2,1,-18,3,-12; MA /M: SY='I'; M=-3,-24,-13,-30,-23,4,-26,-21,15,-22,15,14,-22,-24,-18,-20,-16,-4,12,-12,-2,-21; MA /M: SY='L'; M=-7,-22,-16,-25,-18,2,-27,-20,11,-15,16,9,-20,-24,-16,-12,-16,-4,10,-21,-3,-18; MA /M: SY='Y'; M=-9,-21,-24,-26,-20,12,-25,-14,6,-16,4,3,-17,-23,-16,-13,-12,-2,3,5,15,-19; MA /M: SY='R'; M=-11,4,-23,-1,0,-19,-14,1,-22,10,-20,-12,12,-15,4,22,3,3,-18,-28,-12,0; MA /M: SY='Y'; M=-6,-10,-23,-15,-8,12,-19,-7,-13,1,-11,-7,-7,-19,-10,-3,-6,-4,-10,-6,14,-9; MA /M: SY='R'; M=-11,-7,-22,-11,-8,1,-19,-2,-10,-6,-4,-5,-1,-22,-6,6,-5,-3,-10,-19,2,-8; MA /M: SY='N'; M=-8,0,-22,-4,-3,-12,-15,-2,-13,0,-14,-8,5,-17,0,5,2,2,-11,-22,-2,-3; MA /M: SY='N'; M=-10,3,-23,-3,-3,-11,-14,7,-18,7,-20,-10,12,-18,-1,10,0,-3,-16,-24,-3,-3; MA /I: I=-4; MD=-12; MA /M: SY='R'; M=-5,1,-24,-2,0,-22,-13,-7,-23,16,-22,-12,6,-9,3,20,0,-2,-17,-25,-14,0; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-12; MA /M: SY='N'; M=1,3,-13,0,-4,-13,2,-5,-10,-5,-11,-7,6,-11,-4,-7,3,-1,-8,-19,-11,-4; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-12; MA /M: SY='P'; M=-2,-1,-16,1,3,-15,-8,-8,-12,3,-13,-8,-2,6,-1,-2,0,-1,-10,-16,-11,0; D=-4; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; MA /M: SY='P'; M=-4,-4,-17,-3,-2,-12,-5,-2,-12,-3,-12,-8,-3,11,-4,-6,-2,-3,-12,-14,-7,-4; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-12; MA /M: SY='P'; M=-1,-7,-18,-5,0,-14,-11,-8,-11,5,-12,-7,-7,16,0,-2,-4,-5,-12,-13,-9,-1; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-12; MA /M: SY='Y'; M=-13,0,-27,-2,-1,-6,-18,5,-18,2,-18,-10,4,-10,1,3,-5,-6,-20,-14,8,-2; MA /M: SY='F'; M=-11,-26,-25,-31,-23,11,-27,-21,11,-20,10,8,-23,-25,-19,-18,-19,-7,7,11,6,-21; MA /M: M=-5,-9,-7,-12,-5,-9,-20,-6,-5,-13,0,0,-7,-20,-8,-12,-4,0,-3,-29,-9,-7; MA /M: SY='H'; M=-14,11,-29,15,11,-28,-2,36,-33,-4,-24,-13,11,-14,6,-4,-4,-15,-30,-30,-6,7; MA /M: SY='G'; M=3,3,-20,-2,-9,-21,19,-9,-23,-10,-25,-17,14,-17,-8,-10,12,-2,-18,-28,-19,-9; MA /M: SY='Q'; M=-7,1,-23,-3,5,-24,-18,6,-16,2,-15,-5,4,-13,20,2,3,5,-17,-26,-8,12; MA /M: M=-8,-10,-24,-12,-1,-4,-22,-14,-10,-1,-7,-5,-8,-5,-6,-3,-7,0,-10,-20,-6,-4; MA /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-35,-27,1,-31,-26,35,-28,25,18,-23,-24,-21,-25,-21,-9,24,-21,-3,-26; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40; MA /M: SY='I'; M=-2,-23,-20,-31,-23,4,-28,-23,23,-23,16,13,-19,-21,-18,-22,-12,0,18,-20,-2,-22; MA /M: SY='I'; M=-3,-26,-21,-32,-24,2,-30,-26,27,-24,16,11,-22,-22,-21,-23,-14,-3,23,-17,-3,-24; MA /M: SY='W'; M=-17,-37,-37,-38,-29,6,-23,-29,-10,-20,-14,-14,-36,-30,-21,-19,-34,-24,-16,108,21,-22; MA /M: SY='T'; M=-3,-7,-17,-15,-13,-7,-19,-21,-12,-12,-13,-12,-7,-14,-11,-12,10,35,-6,1,-3,-11; MA /M: SY='I'; M=-1,-23,-20,-29,-25,-4,-24,-27,25,-22,9,8,-19,-21,-21,-23,-9,1,25,-24,-8,-25; MA /M: SY='I'; M=-6,-27,-21,-33,-26,9,-32,-25,28,-26,19,13,-21,-23,-22,-23,-15,-4,23,-19,0,-25; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='A'; M=19,-17,-15,-26,-18,-11,-17,-22,12,-17,1,4,-13,-15,-13,-22,0,0,11,-23,-12,-17; MA /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-34,-25,12,-32,-24,28,-27,27,16,-24,-26,-22,-23,-20,-8,20,-18,2,-25; MA /M: SY='I'; M=-9,-28,-26,-36,-27,1,-36,-27,41,-27,21,20,-21,-21,-19,-26,-18,-6,27,-21,-1,-27; MA /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-22,7,-31,-22,25,-28,39,18,-28,-28,-21,-21,-25,-8,17,-22,-2,-22; MA /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-34,-27,4,-34,-27,34,-26,22,16,-24,-25,-22,-24,-18,-7,29,-22,-2,-27; MA /M: SY='F'; M=-4,-24,-20,-31,-23,22,-22,-21,10,-24,12,7,-18,-23,-23,-20,-14,-5,7,-9,6,-23; MA /M: SY='I'; M=-9,-28,-24,-33,-23,3,-34,-23,32,-27,30,19,-23,-24,-17,-23,-22,-8,19,-21,-1,-22; MA /M: SY='A'; M=34,-12,-12,-19,-13,-18,4,-20,-11,-12,-12,-9,-10,-13,-12,-19,7,-2,-2,-17,-18,-12; MA /M: SY='V'; M=-6,-28,-18,-31,-24,16,-30,-23,20,-24,20,11,-25,-27,-25,-20,-18,-6,21,-16,3,-24; MA /M: SY='P'; M=-11,-22,-35,-16,-7,-11,-23,-18,-11,-14,-17,-12,-21,56,-15,-20,-13,-10,-19,-21,-14,-15; MA /M: SY='S'; M=8,-1,-10,-3,-3,-18,-5,-12,-17,-10,-25,-17,7,-11,-3,-10,35,25,-7,-38,-18,-3; MA /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-34,-25,26,-29,-20,12,-26,21,9,-27,-29,-25,-20,-25,-11,8,9,14,-24; MA /M: SY='R'; M=-7,-4,-26,-5,2,-22,-18,-1,-17,11,-16,-6,-1,-10,8,15,-4,-6,-15,-24,-10,3; MA /M: SY='L'; M=-7,-20,-21,-24,-19,2,-25,-18,15,-22,18,8,-16,-23,-16,-19,-12,1,9,-20,2,-19; MA /M: SY='L'; M=-7,-23,-14,-26,-19,6,-27,-20,12,-25,29,11,-22,-26,-19,-19,-17,1,8,-21,-1,-19; MA /M: SY='Y'; M=-19,-15,-28,-17,-15,20,-27,27,-6,-11,-2,0,-12,-27,-7,-7,-17,-11,-13,11,53,-14; MA /M: SY='L'; M=-7,-12,-22,-14,-10,-5,-21,-8,2,-10,9,6,-10,-21,-8,-7,-12,-6,-2,-21,-1,-10; MA /M: SY='M'; M=-8,-20,-13,-25,-18,2,-25,-12,12,-19,21,22,-19,-24,-11,-16,-17,-4,6,-21,0,-15; MA /M: SY='D'; M=-10,31,-28,44,18,-36,-3,-3,-35,-1,-26,-24,12,-10,2,-10,1,-10,-27,-34,-21,10; MA /M: SY='E'; M=-9,5,-31,14,34,-29,-13,-6,-28,4,-21,-19,-3,12,8,-5,-3,-10,-27,-29,-21,20; MA /M: SY='I'; M=-5,-21,-21,-25,-18,-3,-28,-19,17,-12,7,10,-18,-21,-13,-14,-11,-3,17,-21,-1,-17; MA /M: SY='N'; M=-8,4,-26,0,-2,-17,-15,-6,-13,4,-19,-8,8,-6,-2,0,-2,-6,-15,-27,-12,-3; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=N_Hulo; CC /VERSION=6; DO PDOC00075; //