ID   MULTIHEME_CYTC; MATRIX.
AC   PS51008;
DT   01-AUG-2004 CREATED; 01-AUG-2004 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Multiheme cytochrome c family profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=15; TOPOLOGY=CIRCULAR;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=15;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8475713; R2=0.0151062; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=375; N_SCORE=7.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=275; N_SCORE=6.0; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; E0=0; E1=0; BI=-105; BD=-105; IE=-105; DE=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-3,-2,-70,-4,-1,-19,-18,-10,-15,-2,-14,-9,1,-11,-2,-4,-1,-4,-12,-24,-13,-2;
MA   /I: I0=0; I=-1;
MA   /M: SY='N'; M=-8,0,-70,-1,-2,-16,-12,-80,-16,-1,-15,-10,0,-7,-2,-1,-1,0,-14,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-90,3,5,-24,-5,-30,-20,-3,-20,-13,2,-3,2,-4,2,-5,-18,-28,-17,2;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-70,-8,-1,-19,-17,-30,-8,1,-9,-5,-5,-10,-3,-3,-4,-4,-3,-25,-13,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-2,1,-70,-2,-4,-5,-3,-30,-17,-8,-16,-12,3,-15,-6,0,6,6,-12,-24,-12,-5;
MA   /M: SY='C'; M=*,*,120,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-80,-19,-14,-10,-14,-55,1,-11,-3,-1,-11,-48,-10,-9,-1,1,5,-19,-7,-13;
MA   /M: SY='S'; M=2,8,-80,7,1,-21,0,-58,-20,-6,-20,-15,7,-42,-1,-9,11,7,-15,-29,-14,0;
MA   /M: SY='C'; M=*,*,120,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*;
MA   /M: SY='H'; M=*,*,*,*,*,*,*,120,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*,*;
MA   /M: SY='N'; M=-1,-1,-70,-4,-4,-18,-25,-10,-13,-3,-14,-7,3,-16,-10,-4,3,0,-4,-28,-14,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-70,0,2,-19,-9,-30,-16,-4,-16,-10,-2,-1,-2,-7,-2,-6,-15,-25,-14,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-70,-2,3,-19,-25,-30,-15,-1,-15,-9,-2,-5,2,-4,-3,-5,-15,-23,-8,1;
MA   /M: SY='P'; M=-3,1,-70,2,1,-17,-8,-30,-20,-5,-20,-15,0,3,-6,-9,2,-2,-16,-26,-15,-3;
MA   /I: I0=0; I=-1;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-110,1,6,-20,-10,-30,-19,-1,-18,-11,-1,-4,4,-5,0,-5,-17,-24,-12,4;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /VERSION=2;
DO   PDOC00169;
//