ID CCT; MATRIX. AC PS51017; DT 01-SEP-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE CCT domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1719618; R2=0.0099220; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2482.7265625; R2=2.9572649; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=638; H_SCORE=4369; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=437; H_SCORE=3775; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='R'; M=-19,-8,-30,-7,3,-21,-19,10,-30,25,-20,-10,1,-19,10,58,-9,-11,-22,-22,-7,2; MA /M: SY='E'; M=1,0,-24,1,16,-22,-15,-8,-19,8,-13,-10,-2,-11,4,4,-4,-8,-15,-25,-15,9; MA /M: SY='A'; M=18,2,-18,-2,10,-24,-8,-9,-18,0,-17,-13,1,-9,4,-7,7,-2,-13,-26,-18,7; MA /M: SY='R'; M=5,-8,-20,-11,-2,-16,-13,-11,-18,10,-16,-9,-4,-14,1,13,3,-2,-10,-22,-12,-1; MA /M: SY='I'; M=-6,-26,-18,-28,-22,1,-29,-23,23,-20,22,14,-24,-26,-20,-18,-17,-5,23,-24,-5,-22; MA /M: SY='M'; M=-8,-9,-22,-12,-5,-13,-20,0,-3,-5,1,12,-8,-17,5,-3,-6,-2,-6,-24,-5,-1; MA /M: SY='R'; M=-16,-4,-29,-3,3,-23,-18,-3,-30,31,-23,-12,2,-17,9,53,-7,-9,-20,-22,-11,3; MA /M: SY='Y'; M=-19,-18,-28,-19,-18,31,-29,8,-1,-13,0,-1,-17,-27,-12,-12,-18,-10,-8,18,57,-18; MA /M: SY='R'; M=-15,-9,-28,-10,0,-16,-21,-7,-23,27,-16,-7,-3,-17,4,42,-10,-7,-16,-19,-7,0; MA /M: SY='E'; M=-9,5,-28,11,33,-26,-19,-4,-23,8,-17,-14,-1,-2,12,2,-3,-8,-21,-29,-17,22; MA /M: SY='K'; M=-9,-3,-28,-4,5,-22,-16,-11,-26,36,-24,-9,-2,-12,4,21,-8,-9,-17,-20,-9,5; MA /M: SY='R'; M=-15,-9,-28,-10,-1,-16,-21,-6,-23,29,-18,-5,-4,-18,5,44,-11,-10,-14,-19,-7,0; MA /M: SY='K'; M=-9,0,-26,-2,6,-24,-14,-7,-22,23,-21,-9,3,-14,8,18,-5,-7,-17,-24,-12,6; MA /M: SY='T'; M=-3,1,-20,-3,1,-17,-10,-8,-14,-2,-11,-6,4,-15,1,-1,2,5,-13,-28,-13,1; MA /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10,-2,-17,-21,5,-27,24,-18,-9,-1,-20,8,58,-9,-7,-19,-18,-4,-2; MA /M: SY='R'; M=-11,-2,-5,-7,-5,-17,-18,-4,-18,7,-12,-7,4,-21,-3,8,-7,-7,-15,-29,-12,-5; MA /M: SY='F'; M=-19,-22,-23,-31,-25,57,-26,-13,-2,-24,5,-2,-13,-29,-30,-17,-18,-10,-5,13,29,-25; MA /M: SY='D'; M=-7,9,-25,14,12,-26,1,-6,-26,-4,-20,-17,5,-13,0,-5,2,-7,-21,-30,-19,5; MA /M: SY='K'; M=-10,-5,-22,-6,4,-25,-22,-12,-23,37,-22,-7,-4,-14,5,23,-12,-10,-15,-21,-10,4; MA /M: SY='K'; M=-8,-3,-25,-6,3,-23,-20,-6,-21,21,-18,-7,-2,-13,11,19,-2,3,-15,-22,-9,7; MA /M: SY='I'; M=-8,-27,-20,-33,-27,-5,-30,-25,32,-26,10,11,-20,-17,-21,-26,-16,-9,24,-24,-6,-27; MA /M: SY='R'; M=-14,-11,-27,-12,-2,-18,-20,-5,-23,24,-15,-7,-4,-19,5,51,-10,-8,-14,-21,-10,-2; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='A'; M=15,-3,-20,-5,13,-25,-10,-8,-16,-2,-14,-10,-6,-9,9,-9,4,-3,-12,-24,-17,11; MA /M: SY='C'; M=2,-11,17,-14,-14,-14,-15,-19,-9,-17,-15,-11,-6,-22,-14,-17,14,8,4,-39,-19,-14; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='K'; M=-9,-1,-29,-1,9,-29,-19,-9,-29,45,-28,-10,0,-11,11,31,-9,-10,-20,-20,-10,9; MA /M: SY='A'; M=7,-7,-19,-10,2,-17,-16,-14,-12,2,-7,-6,-7,-12,-1,-2,1,5,-6,-24,-13,0; MA /M: SY='L'; M=-11,-15,-21,-18,-16,2,-24,-10,6,-13,14,5,-10,-26,-13,-5,-15,-4,3,-18,5,-16; MA /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10; MA /M: SY='D'; M=-12,20,-21,31,26,-29,-17,-5,-27,-1,-17,-19,4,-10,4,-9,-3,-9,-22,-34,-18,15; MA /M: SY='Q'; M=-4,-2,-18,-3,1,-23,-14,-7,-19,6,-19,-9,1,-14,9,9,7,4,-13,-28,-13,4; MA /M: SY='R'; M=-18,-10,-29,-11,-1,-19,-20,0,-24,26,-16,-2,-2,-19,11,58,-11,-10,-17,-20,-9,1; MA /M: SY='P'; M=-8,-17,-35,-10,0,-27,-20,-16,-18,-3,-23,-14,-16,57,-3,-10,-9,-9,-24,-27,-24,-5; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,1,-30,29,-20,-10,0,-20,10,68,-10,-10,-20,-19,-9,0; MA /M: SY='V'; M=-2,-22,-16,-26,-23,-3,-26,-22,23,-16,8,12,-18,-24,-19,-16,-10,-3,29,-27,-8,-22; MA /M: SY='K'; M=-13,-2,-30,-3,5,-27,-15,-6,-30,38,-27,-11,3,-14,9,38,-9,-10,-21,-21,-11,6; MA /M: SY='G'; M=1,-12,-28,-12,-20,-27,61,-21,-34,-20,-26,-17,-3,-21,-20,-20,-1,-18,-24,-21,-28,-20; MA /M: SY='R'; M=-15,-7,-27,-7,5,-25,-19,1,-26,21,-20,-8,0,-17,22,47,-5,-7,-22,-21,-11,10; MA /M: SY='F'; M=-19,-26,-20,-36,-28,72,-28,-19,-1,-28,8,-1,-16,-29,-37,-19,-18,-8,-1,6,26,-28; MA /M: SY='V'; M=18,-18,-13,-23,-18,-10,-17,-23,9,-14,0,0,-16,-17,-18,-17,0,3,19,-25,-14,-18; MA /M: SY='R'; M=-11,-4,-27,-4,4,-25,-16,-7,-28,32,-26,-12,1,-14,8,38,-2,-5,-18,-23,-12,4; MA /M: SY='N'; M=0,6,-19,-1,0,-21,-11,-5,-17,3,-20,-11,13,-15,6,5,8,4,-14,-29,-15,2; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=42(42); /POSITIVE=42(42); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CCT; CC /VERSION=5; DR Q9LKL2 , APRR1_ARATH, T; Q9LVG4 , APRR3_ARATH, T; DR Q6LA42 , APRR5_ARATH, T; Q93WK5 , APRR7_ARATH, T; DR Q8L500 , APRR9_ARATH, T; Q9LU68 , CIA2_ARATH , T; DR O82117 , CO3_ORYSJ , T; Q9LUA9 , COL10_ARATH, T; DR O23379 , COL11_ARATH, T; Q9LJ44 , COL12_ARATH, T; DR O82256 , COL13_ARATH, T; O22800 , COL14_ARATH, T; DR Q9C7E8 , COL15_ARATH, T; Q8RWD0 , COL16_ARATH, T; DR O50055 , COL1_ARATH , T; Q96502 , COL2_ARATH , T; DR Q9SK53 , COL3_ARATH , T; Q940T9 , COL4_ARATH , T; DR Q9FHH8 , COL5_ARATH , T; Q8LG76 , COL6_ARATH , T; DR Q9C9A9 , COL7_ARATH , T; Q9M9B3 , COL8_ARATH , T; DR Q9SSE5 , COL9_ARATH , T; Q39057 , CONS_ARATH , T; DR Q6Z433 , GAT17_ORYSJ, T; A2XKR7 , GAT18_ORYSI, T; DR Q10F25 , GAT18_ORYSJ, T; B8AR30 , GAT19_ORYSI, T; DR Q0DNU1 , GAT19_ORYSJ, T; Q5Z4U5 , GAT20_ORYSJ, T; DR Q8GXL7 , GAT24_ARATH, T; Q9LRH6 , GAT25_ARATH, T; DR Q8H1G0 , GAT28_ARATH, T; E5RQA1 , GHD7_ORYSJ , T; DR Q9FDX8 , HD1_ORYSJ , T; Q689G9 , PRR1_ORYSJ , T; DR A2YQ93 , PRR37_ORYSI, T; Q0D3B6 , PRR37_ORYSJ, T; DR A2XFB7 , PRR73_ORYSI, T; Q10N34 , PRR73_ORYSJ, T; DR Q689G6 , PRR95_ORYSJ, T; A0A0Q3PY21, VRN2_BRADI , T; 3D 7C9O; 7CVO; 7CVQ; PR PRU00357; DO PDOC51017; //