ID   CYCLOTIDE; MATRIX.
AC   PS51052;
DT   01-DEC-2004 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Cyclotides profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=29;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=27;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1032069; R2=0.0062083; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1428.9858398; R2=1.3886256; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1031; H_SCORE=2861; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=709; H_SCORE=2414; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-11; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-16,-15,-21,-15,1,-25,-20,6,-21,22,6,-16,-21,-15,-15,-7,18,5,-25,-5,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=0,-16,-5,-16,-16,0,-16,-16,16,-11,5,5,-16,-16,-16,-11,-5,0,27,-16,-5,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15,5,-10,-5,-10,29,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-24,-39,-24,-25,-12,29,-25,-31,-20,-25,-20,-18,-25,-20,-20,-18,-25,-30,58,-2,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-19,-30,-24,-25,-16,19,-25,1,-25,-7,-2,-9,-20,-20,-25,-9,-15,-2,-20,-16,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-9,-24,-10,-5,-19,-20,-20,-15,-10,-19,-15,-9,36,-10,-15,6,22,-14,-30,-19,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,8,-25,-8,-14,-11,-18,-8,12,-14,-7,-2,23,-20,-9,-14,-4,-5,-2,-31,-11,-14;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15,5,-10,-5,-10,29,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-11,-26,-5,0,-25,-11,-15,-20,-10,-30,-20,-6,44,-5,-15,13,4,-21,-35,-25,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15,5,-10,-5,-10,29,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=1,0,-19,0,5,-25,-9,-10,-25,18,-30,-15,5,-10,5,8,17,6,-15,-31,-15,5;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-3,-36,-12,-16,-4,-11,-12,-20,-11,-25,-20,6,-25,-11,-11,-17,-16,-30,63,7,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-35,-5,5,-30,-20,-15,-25,18,-30,-15,-11,44,-1,3,-10,-10,-25,-25,-21,-1;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-9,-19,-15,-15,8,-25,-2,-5,-10,-5,-5,-9,-19,-10,-10,2,22,-5,-2,31,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /VERSION=7;
PR   PRU00395;
DO   PDOC51052;
//