ID ITAM_1; MATRIX. AC PS51055; DT 01-JAN-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE ITAM motif mammalian type profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=29; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=27; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9674824; R2=0.0197046; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=337; N_SCORE=8.6; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=195; N_SCORE=5.8000; MODE=1; TEXT='R?'; MA /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='D'; M=-4,18,-25,24,15,-30,-12,-5,-26,2,-23,-19,8,-5,6,-5,4,-3,-21,-32,-18,10; MA /M: SY='R'; M=-6,-8,-26,-8,0,-22,-17,-9,-15,8,-17,-7,-5,-4,6,14,-2,-4,-12,-24,-13,1; MA /M: SY='R'; M=-1,-8,-27,-8,3,-27,-15,-8,-21,11,-21,-10,-6,5,11,12,-3,-7,-18,-23,-16,5; MA /M: SY='R'; M=-3,0,-24,0,2,-21,-14,-7,-19,4,-21,-14,1,1,0,5,2,-1,-16,-26,-12,-1; MA /M: SY='R'; M=-11,-9,-29,-7,0,-18,-11,-9,-16,-1,-9,-7,-8,0,0,2,-10,-10,-18,-22,-11,-2; MA /M: SY='M'; M=-10,-7,-24,-9,-2,-11,-22,0,-2,-6,-2,2,-4,-15,-1,-7,-10,-8,-5,-23,-3,-3; MA /M: SY='P'; M=-7,-6,-32,-1,8,-28,-5,-12,-25,1,-25,-17,-5,26,-1,-6,-5,-11,-26,-27,-23,2; MA /M: SY='N'; M=-9,16,-25,12,11,-27,-10,14,-23,0,-26,-14,22,-6,14,-2,6,-5,-27,-33,-14,11; MA /M: SY='D'; M=-14,25,-30,35,26,-33,-14,-2,-31,1,-26,-24,12,7,4,-7,0,-7,-29,-35,-21,15; MA /M: SY='Q'; M=-7,7,-27,9,2,-31,8,5,-28,-5,-24,-13,7,-12,10,-7,1,-11,-26,-27,-16,5; MA /I: I=-6; MD=-32; MA /M: SY='L'; M=-5,-23,-14,-24,-19,3,-25,-20,19,-21,25,12,-22,-23,-19,-17,-15,0,19,-21,-3,-19; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='E'; M=-9,13,-25,10,23,-28,-15,3,-22,5,-21,-13,15,-9,23,2,5,1,-26,-29,-16,23; MA /M: SY='P'; M=0,-10,-31,-6,3,-29,14,-16,-28,-10,-26,-19,-8,24,-8,-16,-3,-12,-27,-25,-27,-4; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21; MA /M: SY='R'; M=-10,7,-25,4,6,-25,-8,1,-26,12,-25,-14,16,-15,13,21,4,-5,-24,-28,-15,8; MA /M: SY='K'; M=-9,-1,-24,-1,0,-18,-22,-10,-11,6,-8,-5,-5,-15,-2,2,-5,1,-6,-26,-9,-2; MA /M: SY='R'; M=-10,7,-29,12,3,-28,7,-7,-34,7,-25,-18,5,-16,-1,17,-3,-12,-24,-26,-19,-1; MA /M: SY='Q'; M=-10,12,-26,11,15,-28,-15,0,-25,13,-24,-13,13,-11,17,12,3,-2,-24,-29,-15,16; MA /M: SY='R'; M=-13,-1,-17,-1,2,-21,-21,-4,-16,6,-13,-1,-3,-16,9,12,-6,-4,-14,-25,-9,4; MA /M: SY='E'; M=7,13,-22,18,20,-28,-7,-8,-26,-2,-21,-20,3,-7,3,-10,7,-4,-19,-30,-20,11; MA /M: SY='T'; M=-4,-5,-19,-6,8,-17,-21,-10,-8,-4,-6,-2,-7,-12,6,-7,2,10,-5,-27,-11,7; MA /M: SY='Y'; M=-10,-19,-27,-20,-19,23,-26,14,-1,-10,-1,-1,-19,-27,-10,-11,-16,-9,-9,23,66,-19; MA /M: SY='E'; M=0,7,-22,12,17,-19,-12,-2,-22,-3,-21,-18,2,-10,3,-8,10,0,-18,-25,-6,9; MA /M: SY='S'; M=-3,1,-15,2,-6,-22,-2,-2,-21,-8,-19,-13,1,-17,-6,-6,5,1,-11,-31,-14,-7; MA /M: SY='L'; M=-10,-24,-24,-25,-11,2,-31,-19,20,-24,33,14,-23,-23,-14,-19,-23,-10,9,-21,-3,-14; MA /M: SY='N'; M=-7,3,-24,1,2,-21,-11,0,-13,-1,-17,-9,6,-14,0,-5,0,-3,-12,-29,-11,0; MA /M: SY='G'; M=-7,-4,-26,-6,-4,-23,3,3,-24,1,-21,-7,1,-9,0,2,-2,-7,-19,-25,-13,-3; MA /M: SY='R'; M=-10,-2,-25,-5,5,-16,-12,-4,-18,7,-13,-4,2,-16,6,14,-4,-6,-17,-23,-11,4; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=53(43); /POSITIVE=53(43); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=28; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20; CC /AUTHOR=V_Lesaux; CC /TAXO-RANGE=??E?V; /MAX-REPEAT=3; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=ITAM; CC /VERSION=3; DR Q28072 , CD3D_BOVIN , T; P04234 , CD3D_HUMAN , T; DR Q95LI8 , CD3D_MACFA , T; P04235 , CD3D_MOUSE , T; DR Q764N2 , CD3D_PIG , T; P19377 , CD3D_RAT , T; DR P18438 , CD3D_SHEEP , T; Q28073 , CD3E_BOVIN , T; DR P27597 , CD3E_CANLF , T; Q98910 , CD3E_CHICK , T; DR Q5R1Q1 , CD3E_FELCA , T; P07766 , CD3E_HUMAN , T; DR Q95LI5 , CD3E_MACFA , T; P22646 , CD3E_MOUSE , T; DR Q7YRN2 , CD3E_PIG , T; Q9TUF9 , CD3E_RABIT , T; DR P29328 , CD3E_SHEEP , T; Q28074 , CD3G_BOVIN , T; DR P09693 , CD3G_HUMAN , T; Q95LI7 , CD3G_MACFA , T; DR P11942 , CD3G_MOUSE , T; Q5PXD3 , CD3G_PIG , T; DR Q64159 , CD3G_RAT , T; P18439 , CD3G_SHEEP , T; DR P20963 , CD3Z_HUMAN , T; P24161 , CD3Z_MOUSE , T; DR Q9XSJ9 , CD3Z_PIG , T; Q9TUF8 , CD3Z_RABIT , T; DR P29329 , CD3Z_SHEEP , T; P40293 , CD79A_BOVIN, T; DR P0CAN6 , CD79A_CANLF, T; P11912 , CD79A_HUMAN, T; DR P11911 , CD79A_MOUSE, T; P40259 , CD79B_HUMAN, T; DR P15530 , CD79B_MOUSE, T; Q9BDR7 , FCERG_BOVIN, T; DR Q07249 , FCERG_CAVPO, T; P30273 , FCERG_HUMAN, T; DR Q8SPW1 , FCERG_MACFA, T; P20491 , FCERG_MOUSE, T; DR Q9XSZ6 , FCERG_PIG , T; P20411 , FCERG_RAT , T; DR Q8NET5 , NFAM1_HUMAN, T; DR P28728 , GP_HANTB , N; P16493 , GP_HANTH , N; DR P16853 , GP_HANTL , N; P08668 , GP_HANTV , N; DR Q83887 , GP_NYV , N; P27315 , GP_PHV , N; DR P21400 , GP_PUUMG , N; P41265 , GP_PUUMK , N; DR P41266 , GP_PUUMP , N; P27312 , GP_PUUMS , N; DR P33455 , GP_SEOU8 , N; P28729 , GP_SEOUR , N; DR P17880 , GP_SEOUS , N; Q8R4V1 , NFAM1_MOUSE, N; DR O01498 , STAM1_CAEEL, N; Q92783 , STAM1_HUMAN, N; DR P70297 , STAM1_MOUSE, N; O93436 , STAM2_CHICK, N; DR O75886 , STAM2_HUMAN, N; O88811 , STAM2_MOUSE, N; DR Q5XHY7 , STAM2_RAT , N; Q95J79 , TYOBP_BOVIN, N; DR O43914 , TYOBP_HUMAN, N; Q8WNQ8 , TYOBP_MACMU, N; DR O54885 , TYOBP_MOUSE, N; A4F4L0 , TYOBP_PANTR, N; DR Q9TU45 , TYOBP_PIG , N; Q6X9T7 , TYOBP_RAT , N; 3D 1A81; 1CV9; 1TCE; 2K4F; 2OQ1; 3IK5; 3IOZ; 4XZ1; 6JXR; 7FJD; 7FJE; 7FJF; 3D 7Q5T; 7Q5U; 7Q5W; 7XQ8; 8E4C; 8EMA; 8ES7; 8ES8; 8ES9; PR PRU00379; DO PDOC51055; //