ID   CALPONIN_2; MATRIX.
AC   PS51122;
DT   01-JUN-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Calponin-like repeat profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=26;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=24;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1444489; R2=0.0162099; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=485; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=300; N_SCORE=6.0; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-23,-35,-27,0,-32,-21,37,-22,18,29,-22,-22,-16,-22,-18,-8,29,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-26,-7,-5,-25,9,-13,-27,-4,-28,-18,-2,8,-5,3,7,-4,-22,-28,-23,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-18,-23,-15,3,-23,-18,11,-25,31,11,-21,-25,-15,-18,-14,-3,5,-25,-5,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='M'; M=8,-13,-15,-21,-13,-9,-11,-7,4,-10,2,26,-11,-15,-2,-12,0,-1,3,-24,-9,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-15,-25,-20,-18,6,-23,-11,-9,-12,-9,-9,-15,-20,-12,-12,-6,14,-10,29,26,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-4,28,-17,14,0,-20,0,4,-20,-3,-30,-20,45,-17,0,-3,19,6,-24,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,13,-33,-20,-4,-27,38,-27,-7,0,-10,25,24,-7,-10,-23,-20,-10,19;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-17,-27,-20,-23,11,22,-11,-21,-20,-13,-10,-10,-25,-23,-18,-10,-15,-18,-1,10,-23;
MA   /M: SY='A'; M=20,2,15,-1,-8,-25,-9,-18,-21,-12,-17,-17,-5,-17,-12,-20,3,-5,-9,-31,-22,-10;
MA   /M: SY='S'; M=4,12,-13,6,0,-20,0,-4,-20,-7,-30,-20,25,-13,0,-7,31,14,-16,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-24,-2,7,-27,-14,-3,-25,18,-25,-10,3,-12,20,22,7,-1,-20,-26,-13,12;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-15,-28,-15,-20,-21,47,-20,-26,-22,-11,-11,-7,-22,-20,-20,-7,-18,-21,-20,-23,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-14,-23,-21,-8,-12,-20,3,8,-4,8,42,-14,-17,18,-4,-14,-10,-2,-20,-3,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-7,-7,-7,-7,-14,-14,-7,-7,-7,-7,0,-7,-7,-7,14,35,0,-21,-7,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=7,16,-20,3,-7,-22,16,-4,-22,-7,-25,-17,29,-17,-7,-10,8,-4,-22,-30,-22,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-35,-27,67,-30,-10,0,-25,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,15,43,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-13,-14,-11,-6,-18,-18,-3,-16,3,-3,-7,-16,-11,-13,10,26,1,-29,-9,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-12,-32,-10,-10,-27,26,-15,-33,-5,-27,-17,-5,5,-10,3,-5,-15,-27,-22,-25,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-15,20,-28,20,10,-30,-13,30,-27,0,-25,-11,21,-15,20,1,0,-10,-30,-32,-7,14;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-18,-28,-23,0,-31,-25,24,-23,18,11,-20,-22,-20,-21,-11,6,23,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-6,6,-13,-18,7,-23,6,-11,-12,-11,-9,-1,-30,-12,-12,-11,-8,-15,-4,32,-18;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=89(38); /POSITIVE=89(38); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=7;
CC   /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=Calponin-like;
CC   /VERSION=3;
DR   P37801    , CLPH_ONCVO , T; Q2HJ38    , CNN1_BOVIN , T;
DR   P26932    , CNN1_CHICK , T; P51911    , CNN1_HUMAN , T;
DR   P37803    , CNN1_MELGA , T; Q08091    , CNN1_MOUSE , T;
DR   Q9GK38    , CNN1_MUSPF , T; Q08092    , CNN1_PIG   , T;
DR   Q08290    , CNN1_RAT   , T; Q7YRL2    , CNN1_SHEEP , T;
DR   Q3SYU6    , CNN2_BOVIN , T; Q99439    , CNN2_HUMAN , T;
DR   Q08093    , CNN2_MOUSE , T; Q08094    , CNN2_PIG   , T;
DR   Q5RFN6    , CNN2_PONAB , T; Q32L92    , CNN3_BOVIN , T;
DR   Q15417    , CNN3_HUMAN , T; Q9DAW9    , CNN3_MOUSE , T;
DR   P37397    , CNN3_RAT   , T; P14318    , MP20_DROME , T;
DR   Q24799    , MYPH_ECHGR , T; Q5E9F5    , TAGL2_BOVIN, T;
DR   P37802    , TAGL2_HUMAN, T; Q9WVA4    , TAGL2_MOUSE, T;
DR   Q5XFX0    , TAGL2_RAT  , T; Q3ZBY2    , TAGL3_BOVIN, T;
DR   Q9UI15    , TAGL3_HUMAN, T; Q4R5J4    , TAGL3_MACFA, T;
DR   Q9R1Q8    , TAGL3_MOUSE, T; Q5R6R2    , TAGL3_PONAB, T;
DR   P37805    , TAGL3_RAT  , T; Q9TS87    , TAGL_BOVIN , T;
DR   P19966    , TAGL_CHICK , T; Q01995    , TAGL_HUMAN , T;
DR   P37804    , TAGL_MOUSE , T; P31232    , TAGL_RAT   , T;
DR   P37806    , UNC87_CAEEL, T; Q09936    , YSE2_CAEEL , T;
PR   PRU00474;
DO   PDOC00808;
//