ID   NHL; MATRIX.
AC   PS51125;
DT   01-JUN-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   NHL repeat profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.4541223; R2=0.0205595; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=270; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=27; N_SCORE=4.0; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: B0=-50; E0=-50; B1=-100; E1=-100; MM=*; II=*;
MA   /I: B1=-85; E0=*; BD=-54;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-41,-8,1,-44,18,5,-9,3,3,5,-23,-38,6,-10,5,-14,3,-43,-36; M0=-7;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-3,8,-12,7,14,1,3,-7,2,-7,-7,4,-37,12,-2,4,4,-38,-43,-6; M0=-5;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-3,-13,-6,14,-18,-24,3,11,-17,-31,-4,-38,11,11,3,-2,11,-42,-3; M0=-6;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-12,1,-53,-46,28,-14,-34,1,-1,11,-5,-41,-8,0,-40,-3,-7,7,-32,-9; M0=-11;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-3,1,-22,-17,22,11,-37,-12,-5,-2,-24,-13,1,6,3,4,-6,-41,-16; M0=-6;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-4,-26,6,-11,-1,16,-1,4,-21,-32,-8,-18,11,4,10,4,7,-43,-5; M0=-4;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,4,-36,-2,20,-19,9,7,9,-3,-23,-8,-2,-28,10,-5,0,-1,4,1; M0=-5;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-17,-41,-7,0,-2,30,-24,-18,-9,-13,-32,-6,9,-19,-25,-3,-26,-37,-43,-36; M0=-12;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='C'; M=2,12,-7,-10,9,7,7,-10,5,-42,4,-11,5,10,7,6,-5,-9,-43,-36; M0=-5;
MA   /I: MM=-1; MI=-106; MD=-40; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-41,4,8,-6,11,5,-23,-4,-7,-3,8,-37,-6,-1,2,9,-6,1,-36; M0=-4;
MA   /I: MM=0; MI=-105; MD=-58; IM=-9; II=-11; DM=-22; DD=-4;
MA   /M: SY='D'; M=3,-40,13,-9,-1,10,-22,-12,6,-12,-31,7,9,6,8,-25,-6,-37,5,-9; M0=-6;
MA   /I: MM=-3; MI=-104; MD=-24; IM=-9; II=-11; DM=-24; DD=-3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-38,-11,-1,-41,24,20,-16,3,-6,-29,-4,-34,-5,-1,-7,-10,-16,-40,-7; M0=-8;
MA   /I: MM=-2; MI=-101; MD=-31; IM=-9; II=-11; DM=-37; DD=-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-22,-36,5,10,-40,-6,25,-37,-6,-37,-3,2,4,30,-19,-11,-7,-33,-38,-31; M0=-13;
MA   /I: MM=0; MI=-100; MD=-110; IM=-9; II=-11; DM=-1; DD=-48;
MA   /M: SY='F'; M=-32,-30,-56,-49,32,-48,-37,0,-45,22,-21,-9,-48,-41,-13,-39,-9,-6,-35,-32; M0=-23;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='N'; M=-4,17,1,-2,-15,-37,-23,-42,-1,-3,-1,19,-38,7,2,7,6,-10,-43,11; M0=-7;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,12,-14,-11,6,4,6,-18,-6,1,5,10,-38,3,6,3,-4,-12,4,16; M0=-4;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='P'; M=-19,-44,-73,-72,-46,-58,-65,-9,-69,-13,-34,-63,41,-65,-67,-52,-46,-12,-61,-59; M0=-41;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-41,-13,-6,-44,-37,26,-11,-8,-5,-32,3,-37,7,10,2,8,3,31,-36; M0=-9;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-44,12,-24,2,31,-28,-47,-8,-46,-37,-27,-23,-24,-9,3,-31,-42,-48,-42; M0=-19;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='V'; M=-22,-44,-76,-73,-46,-75,-73,18,-72,16,0,-71,-71,-69,-73,-68,-49,29,-64,-61; M0=-43;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='C'; M=28,31,-52,-9,-41,-13,-42,-36,-46,-40,-33,-43,-48,-43,-46,-5,10,-7,-45,-3; M0=-23;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-58; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='V'; M=9,2,-53,-47,-3,-45,-34,10,-43,2,8,-42,-46,-39,-41,-36,-7,28,-33,-5; M0=-20;
MA   /I: MM=0; MI=-105; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-4; DD=-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,8,25,-17,-38,-19,-6,-17,-22,-10,-28,16,-39,-21,-26,9,17,-8,-40,-34; M0=-12;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='P'; M=0,3,5,-4,-45,-13,-23,-42,2,-42,-32,6,19,-18,6,17,-1,-18,11,-36; M0=-10;
MA   /I: MM=-3; MI=-23; MD=-116; IM=-6; II=-15; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-41,16,-1,-45,-17,4,-42,9,-9,-3,9,-37,17,-3,3,12,-38,-43,-37; M0=-10;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-29,5,-20,-12,-47,32,-2,-44,-21,-22,-35,15,-40,-9,-6,-18,-29,-40,-46,-39; M0=-20;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-41,7,8,-45,-10,22,-42,-11,-12,-32,17,-37,13,12,-1,6,-38,-43,-37; M0=-11;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='I'; M=-50,-45,-76,-71,3,-73,-64,28,-70,5,-30,-69,-69,-65,-69,-66,-50,25,-56,2; M0=-41;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,11,-53,-47,-2,-15,-34,21,-42,7,-20,-41,-45,-39,-40,-36,-29,17,14,23; M0=-19;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='V'; M=-48,-43,-75,-72,-51,-73,-76,11,-72,-38,-38,-70,-71,-72,-74,-67,-15,37,-69,-64; M0=-50;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='T'; M=21,2,-62,-60,-44,-9,-48,-40,-56,-1,-36,-49,-50,-51,-53,8,24,5,-49,-46; M0=-25;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-51,-72,40,6,-73,-48,5,-73,-47,-72,-66,-34,-54,-40,-58,-17,-52,-68,-74,-62; M0=-44;
MA   /I: MM=-26; MI=-106; MD=-3; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-26,-6,10,-29,10,31,-26,-2,-26,-17,15,-21,-2,12,-10,-11,-22,-27,-21; M0=-9;
MA   /I: MM=-3; MI=-24; MD=-90; IM=-28; II=-2; DM=0; DD=-60;
MA   /M: SY='C'; M=5,15,-5,-21,6,-11,3,-39,-5,-39,-31,6,-38,-20,14,14,5,1,3,7; M0=-8;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='H'; M=-1,12,7,9,-45,11,15,-42,3,-42,-3,12,-10,-18,3,3,-13,-38,7,3; M0=-9;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='N'; M=2,-41,4,-20,-44,-4,-23,-41,-7,-13,-32,34,-38,-19,-5,-3,-3,-14,-43,-7; M0=-12;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='H'; M=-27,9,-13,-20,-7,7,38,-42,-4,-42,-1,13,-9,7,5,-4,-7,-38,-43,-4; M0=-12;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='R'; M=-6,29,-25,-9,-44,-37,-23,-42,-6,-41,-32,-5,-38,7,30,8,-5,-10,8,-36; M0=-16;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='I'; M=-49,-44,-75,-29,-8,-74,-71,27,-71,7,-33,-70,-70,-69,-72,-67,-49,27,-63,-60; M0=-42;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-29,2,-52,-45,5,-45,5,-8,20,-6,-5,-41,-45,25,-40,-3,-3,6,22,-5; M0=-15;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='V'; M=-19,23,-52,-46,-27,-45,-1,17,10,0,-20,-41,-45,2,-40,-36,-17,25,-32,-29; M0=-19;
MA   /I: MM=0; MI=-106; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-21,-49,-74,-70,40,-69,-48,-12,-67,8,-26,-64,-66,-58,-63,-61,-52,-18,-40,19; M0=-40;
MA   /I: MM=0; MI=-105; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-1,-41,21,-4,-44,-2,-4,-42,1,-41,-32,14,-11,-4,-8,12,11,-38,-43,-36; M0=-12;
MA   /I: MM=0; MI=-105; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='P'; M=6,-38,-27,-21,-6,-7,-24,-37,8,-11,0,-2,16,12,-7,7,-2,1,-41,11; M0=-6;
MA   /I: MM=0; MI=-105; MD=-116; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-26,-41,21,13,-2,3,10,-42,-1,-18,-3,9,-8,-7,-17,7,-7,-37,-43,-4; M0=-9;
MA   /I: B0=*; E1=-10;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=NHL;
CC   /VERSION=4;
PR   PRU00504;
DO   PDOC51125;
//