ID   ZF_TFIIS_2; MATRIX.
AC   PS51133;
DT   01-JUN-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger TFIIS-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4266217; R2=0.0051143; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4801.4287109; R2=1.2132797; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1384; H_SCORE=6481; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=992; H_SCORE=6005; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-23; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-17,-49,11,4,-34,0,-14,14,-6,-25,-36,-22,-30,-19,5,33,36,3,-54,6;
MA   /M: SY='D'; M=-2,-52,51,20,-31,-11,-33,-44,13,-21,-8,31,-45,25,-2,0,-3,-41,-12,-6;
MA   /M: SY='W'; M=4,-52,-42,22,17,-52,33,28,13,-6,-30,-28,-48,-35,-1,-31,-3,10,53,6;
MA   /M: SY='K'; M=-26,-54,-32,29,-52,-41,-38,-9,46,-35,-39,11,35,26,8,-15,17,-3,-56,-45;
MA   /M: SY='C'; M=-79,157,-99,-99,-89,-94,-99,-96,-94,-86,-87,-85,-109,-102,-101,-81,-79,-83,-119,-100;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-33,-63,-34,3,-43,6,-43,-51,2,-48,-46,-42,95,-1,2,-16,-23,-34,-54,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=3,-52,4,12,-35,-22,-34,-47,61,-42,-42,31,-44,11,25,-6,-30,-20,-54,-27;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-79,157,-99,-99,-89,-94,-99,-96,-94,-86,-87,-85,-109,-102,-101,-81,-79,-83,-119,-100;
MA   /M: SY='G'; M=-21,-54,1,-32,-57,65,44,-62,31,-58,-47,6,-27,2,-11,3,-22,-57,-56,-45;
MA   /M: SY='H'; M=-30,-32,-28,-16,-4,4,87,-55,16,-51,-41,54,-47,16,-30,31,-28,-54,-61,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-29,-54,29,20,-53,-13,34,-41,27,-41,-7,40,7,-12,36,-6,-9,-44,-60,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-38,-54,10,58,-28,1,-20,-54,37,-52,-22,38,-41,-7,16,-20,-4,-33,-58,-45;
MA   /M: SY='A'; M=57,40,-47,-44,-43,-18,-47,-16,-43,-12,39,-19,-47,-41,-47,-20,30,16,-57,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-49,-48,-34,16,-51,24,1,-41,-11,1,-42,-52,-11,-12,5,19,41,23,53;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-43,-56,-56,-42,79,-55,-35,-34,-48,-29,-33,-52,24,-50,-34,-21,-28,-30,65,78; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-28,-51,-53,-39,62,-54,22,-7,-21,1,37,-22,-55,-35,-11,-24,10,-1,62,36; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-36,-54,-34,18,-50,-47,-9,-3,-26,-11,38,-13,-44,89,-29,-4,30,-32,-54,-38;
MA   /M: SY='M'; M=5,-49,-31,-41,-23,-50,-42,19,4,37,48,-43,-12,4,2,11,-21,-2,-52,-36;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-26,-62,-34,-15,-65,-46,23,-53,-19,-48,-10,-29,-1,113,-2,-28,-40,-55,-52,-38; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-27,-45,-39,0,-41,-16,-44,24,-37,-1,9,-32,-42,16,-43,-7,78,-19,-59,-41;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-59,-41,-29,-54,-16,-32,-59,25,-43,-42,-33,-51,-20,98,-37,-42,-52,-53,-41;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=19,-19,-22,-14,-52,-16,-39,-17,-9,-50,-44,-29,-45,-28,27,73,-23,-26,-59,-45; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=71,-2,-43,-16,-54,18,-46,-33,-18,-39,-41,-37,-45,-36,-32,18,-23,-28,-55,-49; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-45,-59,101,25,-59,-44,-31,-62,-32,-60,-58,-17,-44,-30,-41,-20,-23,-59,-71,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-37,-56,-2,93,-58,-51,-32,-55,-10,-52,-48,9,-35,-15,-30,-32,12,-27,-60,-50;
MA   /M: SY='P'; M=7,-57,-39,1,-59,39,-44,-53,-39,-57,-18,-11,87,-38,-48,13,-20,-52,-56,-55;
MA   /M: SY='M'; M=-19,-50,-44,9,-40,-47,-35,-18,-37,0,98,-40,37,31,-39,13,-1,-31,-54,-37;
MA   /M: SY='T'; M=-11,-42,-39,-39,-43,-45,-45,-4,-35,-11,-34,-29,-41,-38,0,20,87,-12,-62,-42;
MA   /M: SY='V'; M=-37,-48,-53,-47,-31,-59,-50,35,-15,34,-19,-46,-52,-43,22,-30,31,43,-56,-37;
MA   /M: SY='F'; M=-38,-51,-59,-40,96,-59,-41,11,-28,-16,-1,-51,-60,-53,5,-49,-43,-17,-23,39;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,14,-52,-52,51,-55,22,-21,-46,-24,-28,-49,-60,-44,-44,-43,-41,11,-17,101;
MA   /M: SY='V'; M=-14,-11,-33,-2,-14,-52,-44,4,30,-10,-15,-24,-47,-22,12,-16,36,40,-55,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-79,157,-99,-99,-89,-94,-99,-96,-94,-86,-87,-85,-109,-102,-101,-81,-79,-83,-119,-100;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-5,56,-26,-19,-43,-49,-28,-13,14,2,3,-8,1,-19,-9,-8,43,8,-60,-23; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-14,-52,34,24,-54,-20,33,-55,34,-52,-24,47,-44,-3,8,22,-18,-42,-61,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-79,157,-99,-99,-89,-94,-99,-96,-94,-86,-87,-85,-109,-102,-101,-81,-79,-83,-119,-100;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-14,-54,-30,-16,-39,65,-25,-58,31,-45,-27,11,-46,21,-13,-1,-33,-54,-51,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-44,-55,-22,-2,25,-47,99,-51,35,-44,-36,26,-48,-7,-26,-19,-39,-52,-46,44;
MA   /M: SY='R'; M=-24,-55,-29,-15,-34,-49,22,-14,28,-20,-36,8,-48,32,62,-24,10,-14,40,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-50,-65,-50,-2,56,-54,-57,-41,-46,-37,-12,-60,-55,-31,-36,-52,-22,-32,148,17;
MA   /M: SY='R'; M=-24,-52,-36,-8,-51,-48,-36,-15,47,-47,-40,-9,-45,-14,64,6,38,-22,-56,-42;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=TFIIS-type;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00472;
DO   PDOC00383;
//