ID   CUE; MATRIX.
AC   PS51140;
DT   01-JUL-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   CUE domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0788274; R2=0.0083074; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=966; N_SCORE=10.1; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1;  SCORE=846; N_SCORE=9.1; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-31; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-23,-13,24,45,-87,-86,-13,16,-18,-48,28,-29,-84,43,1,31,-30,20,-99,-81;
MA   /M: SY='H'; M=-49,-90,-6,-17,-3,-87,41,-5,-20,9,29,39,11,-1,22,-6,39,-18,-97,-75;
MA   /M: SY='D'; M=-19,-92,47,41,-30,-82,-8,-87,9,-13,16,42,9,28,-30,15,-2,-85,-99,-82;
MA   /M: SY='N'; M=18,-19,6,36,-93,-23,-2,-86,-17,-54,15,40,24,30,-17,26,-2,-28,-99,-85;
MA   /M: SY='M'; M=14,-7,6,27,-82,-45,29,-6,34,11,58,-24,-86,1,-73,-75,-10,9,-97,-78;
MA   /M: SY='V'; M=3,-86,-98,-92,-1,-97,-90,37,-90,45,22,-93,-95,-88,-44,-83,-10,57,-90,2;
MA   /M: SY='H'; M=-27,-7,16,49,-90,-85,61,-41,16,-21,17,-26,-82,39,-7,23,18,-84,-100,-79;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,10,19,-33,-84,-9,-19,-3,-51,-10,-25,-84,57,-15,24,50,-24,-92,21;
MA   /M: SY='L'; M=-80,-87,-102,-96,0,-103,-91,44,-94,67,23,-98,-98,-91,-94,-91,-77,48,-91,-71;
MA   /M: SY='Q'; M=-25,-93,-80,-68,-83,-88,16,-2,58,1,53,-73,-86,73,3,-19,-11,-23,-91,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-23,-93,47,71,-97,-46,-72,-52,4,-55,-86,16,-80,42,-70,28,-1,-88,-100,-86;
MA   /M: SY='M'; M=0,-87,-92,1,-69,-93,-82,16,-37,46,102,-89,-91,-79,-85,-16,-75,14,-93,-74;
MA   /M: SY='F'; M=-21,-88,-104,-99,120,-98,-86,-38,-95,-1,-66,-94,-102,-103,-93,-90,-84,-69,-61,-40;
MA   /M: SY='P'; M=-84,-109,-84,-73,-104,-86,-87,-91,-80,-102,-88,-91,131,-84,-93,-81,-76,-97,-97,-101;
MA   /M: SY='D'; M=-28,-92,63,8,-32,-23,40,-40,-32,-90,-19,47,-84,57,-74,22,15,-88,-103,-80;
MA   /M: SY='V'; M=-24,-7,-98,-92,10,-98,-8,31,-88,46,46,-92,-95,-87,-15,-85,-12,47,40,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-40,-94,72,25,-98,12,24,-97,-73,-97,-90,-19,50,-70,-31,38,12,-92,-105,-87;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-7,22,30,-87,-86,-78,-36,17,-21,-77,10,49,16,-1,5,-31,21,-96,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-24,-92,42,53,-31,12,-13,-89,-16,-57,-85,-2,-28,2,-32,37,3,-22,8,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-90,-12,-1,36,-92,14,33,-17,14,-65,-29,-90,47,-80,-77,4,29,-88,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-90,-101,-96,-67,-102,-97,84,-94,38,-54,-95,-24,-91,-96,-88,-75,37,-93,-75;
MA   /M: SY='R'; M=5,-92,-31,28,-87,-88,-13,-40,30,-2,-15,-74,-86,36,58,-2,3,1,-95,-81;
MA   /M: SY='D'; M=23,30,44,19,-83,-24,-7,-89,-1,-52,-81,-71,-86,38,27,-1,-12,-44,15,40;
MA   /M: SY='C'; M=-12,70,48,-32,-79,-92,32,20,-85,12,-68,-78,-92,-22,-88,-22,-31,52,-104,-80;
MA   /M: SY='L'; M=-45,-11,-101,-94,-21,-102,-87,0,-94,85,0,-99,-100,-89,-92,-92,-79,7,-88,-14;
MA   /M: SY='R'; M=3,-93,-30,42,-5,-88,-77,25,9,-2,-72,-21,-86,37,42,8,-75,-21,-91,-24;
MA   /M: SY='E'; M=43,-89,-5,43,-91,-80,-16,-19,22,-55,-80,19,-82,34,3,14,2,-80,-95,-26;
MA   /I: I=-13; MD=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,21,-82,-85,-82,-88,51,-98,-21,-96,-88,53,-99,2,-8,32,-80,-96,-92,65; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-78,-2,48,10,-91,-2,33,-92,-13,-38,-84,54,-86,-6,22,-20,48,-88,-103,-16; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-77,-95,-6,-40,-12,66,-3,-96,-16,-95,-88,55,-91,-4,1,-18,-80,-45,12,27; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-19,6,71,-65,-30,-76,-71,-90,-15,-93,-14,76,-87,-14,-14,40,-30,-32,-106,-84;
MA   /M: SY='V'; M=-27,-88,-94,-87,-3,-96,-89,37,-19,34,-8,-88,-35,-1,-10,-8,-35,60,-92,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-10,70,80,-101,-27,-72,-99,-66,-95,-90,1,-79,29,-74,-20,-12,-92,-103,-89;
MA   /M: SY='Q'; M=31,-89,-9,5,-85,-45,-10,-5,-74,22,-71,2,24,51,-32,8,20,-39,-96,-82;
MA   /M: SY='T'; M=58,59,-85,-82,-85,-81,-90,-14,-35,-76,-74,-76,-85,-82,-86,-27,71,31,-101,-85;
MA   /M: SY='I'; M=-42,49,-97,-94,12,-98,-6,76,-91,-37,29,-88,-93,-89,-93,-4,-12,41,-90,7;
MA   /M: SY='N'; M=20,-89,53,44,-95,-42,-72,-89,-33,-51,-85,66,-83,30,-75,11,-20,-23,-103,-87;
MA   /M: SY='M'; M=33,-87,-29,-2,-83,-80,-12,-73,1,-17,59,44,-25,-2,16,21,-70,13,-96,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-14,17,-101,-95,-28,-101,-89,53,-94,74,-51,-97,-98,-89,-94,-90,-78,-11,-88,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-48,-12,-95,-89,19,-98,-12,5,-3,72,-10,-31,-96,-84,-30,-38,-12,6,-89,-70;
MA   /I: I=-15; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=4,-8,23,60,-40,-50,-73,-90,13,-54,-9,30,-83,35,1,6,-30,-46,-95,-4; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-23,-92,28,12,-31,39,-78,0,-78,31,44,-3,-89,4,-2,-35,-78,-39,-91,0;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-90,-13,18,-34,6,-77,-39,10,-48,-81,20,-26,18,28,41,20,-22,13,-82;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-91,39,29,-29,-28,46,8,-13,10,15,-21,-30,-22,-79,1,14,-11,-96,-18;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CUE;
CC   /VERSION=3;
PR   PRU00468;
DO   PDOC51140;
//