ID   CBM1_2; MATRIX.
AC   PS51164;
DT   01-NOV-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   CBM1 (carbohydrate binding type-1) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5836288; R2=0.0081856; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=845; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=601; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=8,-8,-10,-12,-10,-20,11,-14,-21,-13,-19,-14,-3,-12,-11,-15,5,-4,-13,-26,-20,-11;
MA   /M: SY='C'; M=0,-9,14,-13,-8,-19,-17,-17,-15,-12,-14,-10,-8,-17,-5,-14,4,6,-7,-32,-17,-7;
MA   /M: SY='A'; M=10,-15,-16,-18,-13,-15,-10,-18,1,-12,-6,-2,-12,-18,-8,-14,2,-1,10,-26,-15,-11;
MA   /M: SY='P'; M=5,-5,-24,-5,-1,-25,-3,-14,-20,-2,-23,-14,-3,9,-2,-9,5,0,-16,-27,-20,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-12,-24,-13,-3,-16,-19,-1,-8,-4,-4,0,-10,-9,2,-2,-9,-7,-7,-23,-8,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-30,-40,-30,-25,19,-24,-6,-11,-15,-10,-10,-29,-30,-15,-15,-29,-20,-20,88,52,-20;
MA   /M: SY='G'; M=7,-8,-26,-10,-11,-25,37,-14,-30,-12,-23,-15,-2,-17,-11,-15,1,-13,-22,-19,-20,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-1,-29,-1,18,-38,-19,8,-20,9,-20,-1,-1,-10,55,9,0,-9,-29,-18,-10,37;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-30,-10,-20,-30,69,-20,-40,-20,-30,-20,1,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-6,-24,-11,-4,-16,-21,-11,3,-7,-6,1,-1,-13,2,-8,-3,-2,-3,-26,-10,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,2,-26,-3,-11,-25,39,-11,-30,-13,-26,-16,11,-18,-12,-14,3,-11,-26,-25,-24,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-29,-36,-31,-26,32,-26,-6,-8,-18,-6,-8,-27,-30,-20,-16,-27,-18,-16,71,50,-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,3,-15,-2,-4,-16,-12,-8,-15,-6,-18,-11,7,-9,-2,-7,18,24,-9,-32,-12,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-30,-8,-19,-30,67,-19,-39,-19,-30,-20,1,-20,-19,-19,1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='P'; M=3,-12,-18,-9,-3,-25,-10,-18,-19,-10,-23,-17,-11,32,-9,-17,1,-4,-18,-30,-25,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-1,-14,-9,-7,-13,-16,-17,-13,-4,-13,-9,0,-10,-6,-6,15,36,-5,-28,-11,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=2,-7,12,-13,-8,-19,-16,-16,-15,-11,-15,-10,-6,-18,-5,-12,7,10,-6,-32,-17,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,117,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-39,-30,-30,-9,-9,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=10,-10,-16,-11,-3,-19,-14,-16,-7,-5,-11,-7,-10,-9,-3,-10,2,0,1,-26,-16,-3;
MA   /M: SY='S'; M=12,-3,-15,-4,1,-19,-5,-13,-18,-7,-22,-16,1,-3,-3,-11,20,10,-11,-31,-18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-13,-31,-11,-14,-29,41,-20,-32,-16,-29,-19,-6,8,-17,-19,-2,-16,-27,-23,-29,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-13,-18,-16,-13,8,-16,-4,-6,-13,-5,-6,-9,-20,-11,-13,-1,2,-7,0,18,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-14,-9,-6,-14,-19,-16,-11,1,-14,-8,-3,-13,-5,-3,11,25,-1,-28,-10,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-19,-11,-6,-15,-21,-9,-4,2,-10,-2,-7,-16,-2,-3,-1,4,4,-26,-7,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-8,-22,-9,0,-12,-18,-10,-12,7,-13,-6,-8,-14,-2,0,-3,-3,-5,-19,-3,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-17,-23,-20,-13,-2,-25,-10,8,-15,6,8,-15,-21,-5,-13,-10,-4,4,-14,4,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-6,29,-20,14,-1,-21,4,5,-22,-3,-30,-20,46,-17,-1,-3,13,1,-27,-38,-20,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-11,16,-31,27,17,-33,-12,-5,-29,-2,-26,-22,3,16,2,-10,-1,-9,-27,-33,-21,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-28,-35,-29,-24,27,-26,-3,-7,-16,-6,-6,-26,-29,-17,-15,-26,-16,-15,66,52,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-31,-21,-20,28,-29,16,-2,-10,-1,-1,-20,-29,-9,-10,-20,-11,-11,34,73,-18;
MA   /M: SY='S'; M=6,-4,-15,-4,-3,-14,-4,-2,-19,-10,-25,-16,5,-13,-2,-10,26,11,-11,-27,-7,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-29,0,19,-39,-19,11,-20,9,-20,-1,1,-10,57,9,1,-9,-29,-21,-10,38;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,117,-30,-30,-19,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-47,-28,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-22,-23,-15,-4,-27,-15,14,-16,15,9,-18,-23,-7,-11,-15,-7,10,-20,-1,-12;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CBM1;
CC   /VERSION=3;
PR   PRU00597;
DO   PDOC00486;
//