ID   Q_MOTIF; MATRIX.
AC   PS51195;
DT   01-MAR-2006 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   DEAD-box RNA helicase Q motif profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=29;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=27;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.3100777; R2=0.0079956; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2591.0996094; R2=0.9042146; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=900; H_SCORE=3405; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=650; H_SCORE=3179; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-17; D=-80; I=-80; B1=-400; E1=-400; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-54,0,3,-1,-28,-12,-24,18,0,28,2,-15,-4,6,14,19,-11,19,-19;
MA   /M: SY='S'; M=8,-52,-7,9,-9,-7,4,-42,15,-37,-2,8,-22,-1,4,44,27,-46,-1,-44;
MA   /M: SY='F'; M=-53,-55,-27,-28,101,-60,-28,-16,-47,-23,-7,-20,-63,-59,-54,-12,-37,-29,71,2;
MA   /M: SY='S'; M=21,-20,31,31,-57,-24,3,-54,14,-25,-31,5,-47,22,-22,38,-4,-43,-63,-38;
MA   /M: SY='E'; M=-19,-30,42,52,-13,-16,9,-56,-6,-32,-25,-2,-30,42,-7,17,-22,-39,-61,-34;
MA   /M: SY='L'; M=-1,16,-30,-44,40,-28,-48,0,-53,46,36,-40,-22,-50,-54,6,-25,-8,-17,6;
MA   /M: SY='G'; M=-14,-27,2,-18,-23,56,-1,-47,-12,-53,-50,36,37,2,-19,5,-29,-38,-59,-32;
MA   /M: SY='L'; M=-35,0,-66,-60,21,-66,-54,37,-59,64,16,-61,-63,-54,-58,-35,-42,16,-52,-33;
MA   /M: SY='P'; M=-28,10,15,-15,-56,-6,42,-41,2,-37,-25,17,50,-13,-21,50,-13,-47,-65,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-61,31,38,-63,-12,-15,-59,11,-60,-23,-2,69,-2,-5,8,-20,-56,-35,-54;
MA   /M: SY='W'; M=4,-58,18,34,-13,-48,19,-30,4,-36,-25,3,-4,8,10,10,4,-33,65,6;
MA   /M: SY='I'; M=-34,-36,-63,-58,-23,-57,-57,54,-56,48,14,-57,-59,-40,-48,-43,11,37,-58,-39;
MA   /M: SY='M'; M=-29,-13,-56,-50,-33,-49,-31,21,-11,48,54,-14,-58,3,-1,-12,-17,12,-56,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-59,5,39,-42,-23,-22,-38,38,-29,-46,14,-48,40,36,5,-21,-44,-60,-48;
MA   /M: SY='A'; M=49,-50,-20,-9,-56,14,-10,-38,-24,-31,-24,46,-50,-3,-13,9,5,-16,-63,-51;
MA   /M: SY='L'; M=-36,24,-67,-61,-28,-68,-57,50,-59,58,20,-62,-62,-55,-59,-55,-42,28,-57,-39;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-56,10,29,-43,-28,-9,-43,36,-33,-27,17,-36,19,28,10,6,-39,-58,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-58,39,44,-58,-19,-2,-57,30,-33,-49,14,-47,15,22,-1,-11,-40,-62,-17;
MA   /I: I=-19; MD=-61;
MA   /M: SY='M'; M=16,-17,-49,-32,-29,-43,-14,-11,7,28,47,8,-55,29,-10,9,-26,-11,-56,-4; D=-19;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='G'; M=-24,-58,-18,-14,-64,76,10,-68,8,-66,-55,35,-51,-25,-27,-4,-44,-63,-61,-55; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-61;
MA   /M: SY='F'; M=-53,-58,-64,-62,82,-64,-40,26,-56,-6,-12,-58,-65,-56,-54,-54,-47,-17,48,80;
MA   /M: SY='T'; M=-31,-54,-10,33,-52,-42,-18,-9,28,-27,-42,1,-26,22,-7,15,46,2,-62,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-27,-9,32,-35,-46,14,-38,46,-35,-44,-7,-47,23,35,-5,20,-14,-60,-36;
MA   /M: SY='P'; M=-22,-15,-52,-41,-56,-39,-50,-44,-46,-4,41,-54,108,-48,-56,-45,-14,-38,-60,-56;
MA   /M: SY='T'; M=-27,-44,-41,-43,-2,-48,-48,-40,-40,-22,-26,-30,-43,-43,-33,27,96,-34,-65,-43;
MA   /M: SY='P'; M=4,-62,-5,30,-62,-41,-14,-54,5,-39,-49,-43,90,-15,-9,0,-16,-41,-61,-56;
MA   /M: SY='I'; M=-42,-55,-66,-63,-22,-69,-67,82,-59,-11,-20,-58,-25,-58,-62,-52,-20,55,-59,-40;
MA   /M: SY='Q'; M=-41,-67,-36,-16,-72,-49,-29,-57,-21,-53,-39,-32,-48,123,-22,-30,-44,-59,-54,-43;
MA   /M: SY='A'; M=38,22,-32,18,-57,-33,-27,-33,26,-45,1,-28,-48,33,10,34,-9,-31,-60,-49;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
PP   /PROMOTED_BY: PS51192;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00552;
DO   PDOC51195;
//