ID   ELK; MATRIX.
AC   PS51213;
DT   01-MAY-2006 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   ELK domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=21;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=19;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8947136; R2=0.0174515; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=739.1777954; R2=0.6222222; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=436; H_SCORE=1010; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=322; H_SCORE=940; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-12,20,-28,31,41,-31,-17,-2,-31,5,-22,-22,6,-4,11,-4,2,-3,-27,-33,-19,26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-21,-26,-15,1,-29,-18,16,-23,32,14,-22,-24,-10,-17,-20,-3,7,-21,-2,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,39,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='H'; M=-13,3,-25,2,1,-17,-19,10,-16,5,-12,-7,5,-19,0,7,-8,-9,-13,-26,-4,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-5,-26,-4,13,-21,-19,12,-18,2,-8,-2,-4,-14,13,8,-7,-10,-18,-24,-7,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-16,-25,-17,-7,-9,-24,-12,-4,9,9,10,-14,-20,-3,10,-19,-10,-5,-20,-5,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,5,-28,2,10,-30,-16,3,-25,22,-24,-8,11,-14,27,25,-3,-8,-25,-24,-12,17;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-30,-3,2,-30,3,-13,-33,32,-30,-13,0,-13,2,17,-7,-13,-23,-20,-15,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,40,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,70,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-23,-4,-3,-25,11,-11,-29,6,-28,-16,4,-14,-1,9,11,-1,-19,-27,-19,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-26,0,0,-29,23,-9,-32,-5,-27,-17,3,-15,1,-2,7,-8,-25,-26,-22,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-9,-13,-9,-1,-7,-24,13,-21,7,-15,-8,-7,-22,0,12,-12,-11,-18,-10,18,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='S'; M=0,-4,-19,-5,-4,-17,5,-13,-14,-13,-14,-11,2,-17,-9,-13,8,0,-8,-31,-18,-6;
MA   /M: SY='D'; M=0,14,-20,17,9,-26,-4,-7,-26,-3,-24,-20,10,-10,0,-5,13,5,-18,-33,-19,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-23,7,-31,-23,25,-29,41,19,-29,-29,-21,-21,-26,-9,17,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-12,-34,-12,-2,-18,-20,-9,-28,28,-24,-12,-7,-18,5,39,-15,-14,-22,11,-3,0;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-1,-23,0,21,-23,-17,-6,-19,4,-12,-10,-3,-9,12,2,2,0,-17,-26,-15,16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-24,-38,-28,39,-34,-24,22,-30,20,11,-22,-26,-29,-24,-22,-10,13,-6,14,-28;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=ELK;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00559;
DO   PDOC51213;
//