ID   LOLD; MATRIX.
AC   PS51244;
DT   01-AUG-2006 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Lipoprotein release ATP-binding protein lolD family profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=32;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=29;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.0491379; R2=0.0126235; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=792012; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1066; N_SCORE=14.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=432; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-26,-27,-30,-24,13,-34,-9,24,-23,21,13,-23,-26,-16,-20,-23,-10,10,-2,28,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-9,0,-23,0,0,-20,-13,61,-26,-10,-24,-7,10,-16,6,-4,8,-6,-23,-34,6,0;
MA   /M: SY='Z'; M=-14,-8,-26,-9,13,6,-24,-4,-16,-5,-9,-6,-7,-14,12,-4,-7,-10,-19,-12,2,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-24,-40,-30,52,-34,-24,18,-30,14,7,-20,-26,-33,-24,-20,-10,11,-1,19,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-9,0,-24,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,16,44,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-7,-30,-7,-7,-2,-24,72,-19,-10,-13,0,-1,-24,3,-4,-14,-16,-23,-9,41,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-7,-30,-7,-7,-2,-24,71,-19,-10,-13,0,-1,-24,3,-4,-14,-16,-23,-8,42,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-13,20,-23,39,35,-26,-26,-13,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-29,-6,0,-26,-13,-16,-20,-10,-30,-20,-9,54,-6,-16,8,1,-23,-34,-26,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,34,49,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,32;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,55,-30,-20,7,-30,24,7,-24,-30,-33,-20,-24,-10,4,-1,19,-26;
MA   /M: SY='T'; M=1,11,-13,2,-4,-16,-7,-8,-16,-7,-23,-16,21,-13,-4,-7,24,25,-12,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,33,-27,28,17,-26,-26,-23,-24,-21,-7,28,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='M'; M=7,-21,-17,-27,-17,-2,-18,-13,12,-17,22,26,-21,-21,-10,-16,-15,-7,7,-20,-6,-14;
MA   /M: SY='M'; M=11,-20,-20,-30,-20,-7,-20,-18,20,-17,9,21,-16,-16,-11,-21,-9,-6,14,-20,-7,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-16,-13,-23,-13,-12,-8,-20,-2,-16,7,-2,-16,-16,-13,-20,-1,-3,3,-20,-14,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-13,20,-23,39,34,-26,-26,-13,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,23,-20,0,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-11,8,-26,1,-6,-23,13,-2,-29,5,-26,-16,22,-20,-2,19,0,-9,-26,-27,-19,-6;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
PP   /PROMOTED_BY: PS50893;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=V_Lesaux;
CC   /VERSION=3;
DO   PDOC51237;
//