ID HTH_APSES; MATRIX. AC PS51299; DT 01-MAR-2007 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE APSES-type HTH DNA-binding domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=110; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=105; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4964111; R2=0.0118627; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8347.8935547; R2=7.6595745; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=591; H_SCORE=12875; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=422; H_SCORE=11580; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='E'; M=-4,-11,-15,-9,10,-17,-17,2,-10,4,-6,-1,-12,3,10,8,-5,-11,-12,-18,-6,9; MA /M: SY='F'; M=-12,-13,-20,-16,-15,28,-22,-14,7,-11,18,-2,-11,-28,-18,-12,-10,-3,9,-8,25,-16; MA /M: SY='T'; M=-1,-9,-26,-13,-7,-5,-13,-11,-4,0,-7,-7,-3,3,2,-4,1,4,-5,-23,-5,-7; MA /M: SY='A'; M=17,2,-21,2,2,-17,-11,-16,-3,0,-6,3,2,-10,6,-9,3,9,1,-38,-19,3; MA /M: SY='T'; M=4,-4,-22,-7,-12,-17,-6,-19,8,-9,-2,-8,-3,-7,-11,-19,3,11,8,-30,-11,-12; MA /M: SY='Y'; M=-14,-18,-28,-12,-12,7,-17,-10,4,-9,15,-3,-23,-15,-10,-4,-14,-7,8,3,31,-12; MA /M: SY='W'; M=-3,-8,-11,-6,-3,-18,2,-23,-13,-5,-14,-14,-12,-6,-4,-8,1,-4,-14,4,-12,-5; MA /M: SY='G'; M=3,0,-21,-2,9,-26,18,-17,-15,6,-15,-9,-1,-1,-3,-13,8,-4,-21,-13,-21,5; MA /M: SY='G'; M=-2,0,-23,1,-13,-9,4,-19,-8,-5,-7,-8,0,-17,-6,4,-1,-7,-6,-18,-8,-12; MA /M: SY='E'; M=1,2,-11,6,16,-27,-16,-7,-9,6,-5,-5,-1,-4,5,-6,-5,-9,-10,-25,-14,12; MA /M: SY='M'; M=-2,-11,-28,-11,-7,-3,-12,-9,4,3,-2,6,-10,-13,-11,-1,-4,-4,5,-18,3,-10; MA /M: SY='Y'; M=-11,-18,-26,-17,-12,19,-21,-10,-2,-5,11,-6,-17,-12,-13,-10,-5,-1,3,-5,21,-14; MA /M: SY='E'; M=0,-3,-14,1,15,-27,-8,-5,-13,7,-7,-7,-8,12,0,-12,0,-3,-17,-22,-14,9; MA /M: SY='C'; M=-4,-12,25,-18,-3,-10,-15,-25,-1,-8,-2,-6,-6,-19,-14,-14,-1,-2,-1,-22,-20,-8; MA /M: SY='Y'; M=-14,-17,-31,-15,-5,9,-23,11,-12,1,4,4,-15,-11,-2,5,-9,-12,-6,-6,19,-5; MA /M: SY='N'; M=5,6,-21,2,2,-19,-4,-14,-5,3,-12,-4,11,-9,5,-8,5,4,-10,-31,-19,1; MA /I: I=-8; MD=-17; MA /M: SY='Y'; M=-5,-14,-12,-11,-6,-1,-16,-13,-7,-2,-4,-10,-15,0,-7,-1,-1,-2,-2,-12,1,-10; D=-8; MA /I: I=-8; MD=-17; MA /M: SY='Q'; M=4,4,-15,-2,9,-24,6,-10,-13,1,-15,-9,8,-5,16,-5,2,-1,-21,-18,-20,12; D=-8; MA /I: I=-8; MD=-17; MA /M: SY='G'; M=-1,-5,-23,-7,-7,-3,1,-3,-6,-5,-5,-10,-4,-3,-2,-7,-1,-6,-9,-13,-7,-7; D=-8; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; MA /M: SY='D'; M=-6,7,-19,12,3,-19,-9,-1,-17,1,-12,-8,4,-3,-3,-3,-5,-9,-16,-13,-7,0; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-17; MA /M: SY='N'; M=-1,9,-24,7,1,-28,6,1,-16,-1,-17,-14,12,6,0,-12,1,-2,-24,-32,-22,0; MA /M: SY='H'; M=-3,-11,-26,-12,-2,-9,-15,3,-1,-3,-6,2,-7,-13,-2,-5,-5,-5,-3,-12,0,-3; MA /M: SY='F'; M=-10,-22,-13,-28,-19,14,-10,-27,5,-13,0,-14,-18,-17,-17,-14,-7,-7,5,13,3,-20; MA /M: SY='I'; M=3,-16,-19,-22,-17,8,-21,-12,26,-14,12,4,-12,-27,-18,-16,-9,0,25,-27,3,-18; MA /M: SY='M'; M=6,-13,-17,-19,-11,-9,-13,-3,13,-2,15,25,-6,-27,-5,-9,-12,4,5,-26,-2,-8; MA /M: SY='R'; M=-18,-24,-22,-14,-11,-2,-17,-15,-25,2,-12,-4,-29,-15,18,56,-14,-29,-10,31,16,-4; MA /M: SY='R'; M=-9,-10,-22,1,-4,-7,-20,-10,-26,7,-9,-4,-14,-13,14,43,-9,-23,-10,-4,4,-1; MA /M: SY='Y'; M=-5,-10,-11,-7,-6,-2,-18,-14,-6,-6,3,-4,-10,-17,-4,-2,-1,1,1,-13,6,-7; MA /M: SY='D'; M=-1,5,-28,8,0,-19,-4,-2,-17,3,-11,-6,3,-2,2,-4,-4,-6,-19,-25,-11,-1; MA /M: SY='D'; M=2,32,-23,44,-2,-31,-9,-17,-17,-3,-9,-16,21,-14,-9,-16,6,6,-10,-45,-16,-6; MA /M: SY='G'; M=0,9,-30,7,-9,-20,16,-8,-12,-5,-14,-14,10,-11,-11,-15,10,2,-17,-24,-16,-12; MA /M: SY='Y'; M=-19,-25,-39,-17,-14,9,-17,-8,-5,-5,11,-1,-27,-22,-7,1,-12,-10,3,34,39,-15; MA /M: SY='I'; M=0,-20,-21,-32,-28,9,-18,-21,43,-17,15,2,-9,-25,-22,-21,-10,1,35,-26,0,-28; MA /M: SY='N'; M=1,18,-18,9,-3,-16,-5,0,-11,-1,-18,-7,33,-17,-1,-5,9,6,-18,-46,-25,-5; MA /M: SY='I'; M=10,-8,-21,-15,-14,-7,1,-19,20,-12,9,8,-4,-19,-9,-20,-3,4,13,-30,-12,-14; MA /M: SY='T'; M=5,-3,-25,-9,-15,-16,-18,-4,-4,-9,-2,-2,4,-2,-2,-24,18,36,4,-41,-5,-10; MA /M: SY='Q'; M=-2,-9,-29,-12,0,-22,5,2,-15,-3,-16,-5,-8,-3,15,-2,-1,-4,-22,-2,-8,4; MA /M: SY='M'; M=-2,-17,-16,-24,-15,-1,-19,7,25,-9,24,28,-9,-30,-16,-15,-16,-1,13,-28,5,-15; MA /M: SY='F'; M=-18,-22,-21,-27,-20,50,-22,-21,3,-10,22,-2,-19,-30,-21,-10,-15,-13,5,13,33,-21; MA /M: SY='K'; M=-1,1,-23,-1,8,-7,-10,-16,-15,23,-15,12,6,-2,0,12,0,-7,-15,-24,-10,3; MA /M: SY='I'; M=6,-10,-5,-18,-18,-1,-18,-24,27,-15,7,2,-3,-30,-18,-17,-5,5,25,-34,-10,-20; MA /M: SY='A'; M=23,-1,-24,-5,-5,-17,-6,-16,3,-3,-6,5,3,-3,2,-15,5,13,6,-46,-27,-5; MA /M: SY='G'; M=-5,-6,-31,-14,-20,10,21,-25,-7,-9,-2,-16,-3,-18,-14,-14,-3,-11,-12,-2,-4,-19; MA /M: SY='P'; M=-6,-14,-25,-16,-9,0,-18,-6,-4,2,0,-4,-10,12,-11,-10,-9,2,-5,-22,3,-12; MA /M: SY='S'; M=0,-6,-22,-3,-4,-9,-8,-16,-6,-3,-9,-12,-8,-12,-9,-11,15,9,-3,-8,-2,-9; MA /M: SY='K'; M=12,-2,-28,-3,3,-15,-2,-19,-12,14,-16,7,-2,-2,4,6,6,0,-8,-27,-19,1; MA /M: SY='T'; M=7,-3,-26,-7,-7,-17,-1,-5,-6,-3,-8,-3,-1,1,-5,-16,11,14,-7,-33,-15,-7; MA /M: SY='Q'; M=0,-4,-13,1,9,-14,-17,-10,-13,4,-2,3,-10,-8,13,10,-6,-6,-10,-19,-2,11; MA /M: SY='R'; M=-3,-3,-16,2,6,-22,-6,-10,-19,6,-15,-10,-4,0,9,18,-2,-15,-16,-16,-14,5; MA /M: SY='E'; M=10,4,-12,10,18,-30,-16,-12,-15,4,-7,-7,-2,-2,12,-11,4,5,-9,-30,-17,17; MA /M: SY='E'; M=3,-1,-19,1,21,-22,-1,-14,-20,20,-16,1,-4,3,5,2,3,-11,-20,-15,-18,15; MA /M: SY='I'; M=-3,-10,-19,-11,-2,-11,-17,-10,6,0,6,6,-7,-14,2,-4,-8,-5,4,-17,0,-1; MA /M: SY='L'; M=-4,-5,-9,-2,-8,5,-16,-12,10,-13,22,10,-13,-24,-12,-10,-10,-1,6,-23,13,-9; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='E'; M=6,9,-5,14,34,-32,-13,-7,-21,14,-12,-5,6,0,11,-10,2,-10,-21,-28,-24,27; MA /M: SY='K'; M=0,5,-22,3,1,-14,-11,-10,-15,17,-14,11,14,-12,1,14,-2,-7,-15,-30,-15,-1; MA /M: SY='E'; M=-1,-4,-10,2,23,-28,-16,-7,-12,9,-8,-10,-10,12,5,-7,-4,-11,-13,-20,-14,16; MA /M: SY='W'; M=-13,-18,-29,-14,-13,-6,-6,-17,0,-9,-2,-14,-23,-4,-11,-6,-10,-10,0,17,12,-16; MA /M: SY='I'; M=-4,-12,-13,-17,-11,10,-21,-7,17,-14,16,6,-9,-26,-12,-14,-12,-2,12,-24,9,-11; MA /M: SY='K'; M=1,-2,-19,3,9,-17,-14,-14,-18,14,-14,0,-5,-2,5,11,5,-3,-11,-21,-10,6; MA /M: SY='G'; M=5,5,-24,6,-3,-22,12,-15,-11,0,-13,-9,3,-14,-7,-5,7,-3,-13,-22,-20,-6; MA /M: SY='A'; M=6,-3,-19,-5,-6,-15,-15,-13,4,-1,-3,3,1,-16,-1,-4,0,6,5,-31,-11,-6; MA /M: SY='H'; M=-10,-19,-14,-21,-6,-4,-25,18,2,-13,4,-1,-14,-8,-5,-10,-11,-8,-1,-21,3,-7; MA /M: SY='E'; M=-4,1,-17,8,22,-25,-12,1,-22,11,-10,-4,-3,1,6,-3,-2,-11,-20,-17,-8,17; MA /M: SY='K'; M=0,-3,-22,-5,-3,-15,-7,-14,-12,7,-12,-1,1,7,0,1,3,5,-12,-28,-11,-4; MA /M: SY='I'; M=6,-14,-21,-19,-20,-2,-11,-19,23,-10,2,0,-9,-27,-17,-7,1,4,22,-25,-5,-21; MA /M: SY='Q'; M=1,-4,-21,1,9,-27,-8,1,-21,2,-16,-12,-8,5,21,10,2,-4,-21,-19,-13,12; MA /M: SY='G'; M=2,5,-29,4,-8,-27,35,-20,-11,-5,-10,-11,0,-11,-13,-17,2,-7,-20,-10,-19,-10; MA /M: SY='G'; M=1,3,-27,-4,0,-25,35,-21,-13,5,-17,-8,6,-4,-8,-13,1,-11,-25,-9,-24,-3; MA /I: I=-6; MD=-13; MA /M: SY='Y'; M=-13,-14,-35,-9,-11,4,-8,5,-2,-8,8,-4,-16,-11,-7,-6,-5,-5,2,7,26,-12; D=-6; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; MA /M: SY='G'; M=-2,-8,-16,-10,-11,-7,9,-12,4,-7,0,-4,-8,-4,-9,-6,-6,-6,-2,-8,-4,-11; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-13; MA /M: SY='R'; M=2,-1,-20,3,5,-14,-11,-12,-17,14,-13,4,-3,0,12,18,-1,-6,-11,-17,-8,6; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-13; MA /M: SY='I'; M=-1,-15,-24,-17,-16,12,-15,-15,19,-12,18,6,-13,-23,-12,-15,-9,0,18,-15,12,-16; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-13; MA /M: SY='Q'; M=9,-2,-25,0,7,-26,0,-11,-17,2,-17,-7,-5,-4,35,15,-4,-5,-20,-14,-16,16; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-13; MA /M: SY='G'; M=0,6,-36,-7,-19,-27,68,-27,-9,-9,-20,-17,12,-13,-19,-20,0,-16,-29,-2,-31,-19; MA /M: SY='T'; M=4,-11,-20,-13,-19,-2,-24,-19,14,-14,9,1,-9,-19,-7,-15,-1,21,21,-29,9,-14; MA /M: SY='W'; M=-50,-50,-20,-40,-10,10,10,-50,-30,-20,-20,-30,-70,-30,-10,0,-30,-50,-30,200,50,-10; MA /M: SY='I'; M=3,-19,-18,-30,-27,4,-18,-20,46,-17,18,11,-8,-34,-23,-20,-12,3,38,-29,0,-27; MA /M: SY='P'; M=-6,-16,-28,-8,8,-33,-8,6,-26,8,-28,-36,-23,83,-2,-10,1,4,-33,-30,-20,-2; MA /M: SY='Y'; M=-24,-24,-39,-14,-14,14,-23,-3,-7,-6,14,-11,-30,4,-8,-1,-16,-8,0,14,43,-15; MA /M: SY='D'; M=1,17,-18,32,21,-37,-12,-9,-28,9,-15,-17,3,13,6,-7,-1,-8,-24,-31,-18,14; MA /M: SY='R'; M=0,-10,-16,-5,-4,-9,-17,-12,-7,-1,-3,1,-13,-15,10,23,-6,-10,0,-17,-2,-1; MA /M: SY='A'; M=31,0,-31,-2,-3,-21,13,-21,-2,-2,-12,3,0,-10,4,-12,11,6,2,-39,-37,-4; MA /M: SY='I'; M=-3,-13,-17,-14,-10,3,-18,-17,11,-1,7,11,-12,-19,-8,6,-10,-6,11,-19,6,-10; MA /M: SY='E'; M=8,-3,-16,-1,12,-15,-12,0,-8,1,-5,-2,-5,-7,2,-12,5,-3,-7,-29,-16,8; MA /M: SY='L'; M=-7,-14,-8,-20,-18,19,-19,-15,29,-19,32,14,-15,-31,-21,-21,-16,0,20,-21,20,-18; MA /M: SY='A'; M=25,-5,7,-7,0,-20,-9,-26,-1,-7,-7,4,-3,-16,2,-12,3,4,7,-43,-41,-2; MA /M: SY='K'; M=1,-1,-18,-2,6,-16,-3,-11,-15,8,-15,-4,1,1,2,5,3,-5,-16,-23,-16,3; MA /M: SY='R'; M=2,-5,-19,1,10,-20,-16,-11,-23,13,-16,0,-8,-1,22,28,-2,-11,-14,-16,-10,13; MA /M: SY='Y'; M=-25,-20,-39,-15,-14,32,-26,-9,-9,-6,18,-11,-19,-20,-10,-7,-11,-8,3,20,48,-15; MA /M: SY='C'; M=-5,2,20,-2,6,-26,-5,-12,-17,-6,-14,-11,7,-12,2,-8,-3,-8,-23,-25,-29,4; MA /M: SY='I'; M=-7,-23,-24,-28,-23,6,-17,-15,29,-13,18,10,-16,-32,-18,-15,-15,-3,24,0,16,-23; MA /M: SY='Y'; M=-10,-16,-29,-14,-8,3,-21,-11,0,-3,8,-6,-15,-4,-7,-12,-5,2,6,-6,19,-9; MA /M: SY='D'; M=-1,10,-17,18,10,-28,-13,-9,-12,0,-6,-13,1,3,7,-9,-6,-5,-14,-29,-12,8; MA /M: SY='W'; M=-17,-23,-16,-21,-11,8,-13,-21,-4,-7,2,-3,-28,-15,-5,9,-16,-19,-4,31,18,-10; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='I'; M=-1,-13,-9,-15,-16,13,-20,-16,28,-19,27,14,-16,-31,-20,-18,-14,3,23,-26,16,-16; MA /M: SY='R'; M=-2,-9,-25,-9,-8,-7,-17,-12,-6,1,-6,0,-3,-14,12,17,-6,-3,0,-17,1,-3; MA /M: SY='P'; M=7,-12,-29,-6,6,-30,-6,-1,-19,6,-23,-23,-18,60,1,-10,2,5,-22,-36,-26,-1; MA /M: SY='L'; M=-9,-11,-2,-14,-12,18,-19,-11,25,-20,38,19,-18,-30,-20,-21,-19,0,14,-21,25,-12; MA /M: SY='F'; M=-12,-20,-18,-31,-25,54,-22,-20,11,-14,24,-3,-12,-33,-24,-15,-10,-8,11,-7,23,-26; MA /M: SY='D'; M=2,5,-22,11,-2,-23,7,-18,-9,-4,-6,-11,-3,-12,-7,-8,1,-6,-9,-20,-13,-5; MA /M: SY='P'; M=-6,-14,-31,-12,-8,4,-17,-1,-7,-5,1,-12,-15,10,-3,-8,-9,-5,-6,-16,6,-10; MA /M: SY='D'; M=4,25,-23,39,-1,-28,-12,-18,-15,-4,-10,-17,13,-16,-6,-11,4,5,-7,-40,-12,-5; MA /M: SY='F'; M=-4,-9,-23,-9,-15,17,-18,-16,0,-6,8,-8,-9,-12,-17,-12,-7,-5,2,-20,5,-18; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='P'; M=-1,2,-29,10,2,-33,-2,1,-18,-2,-16,-19,-6,19,7,-7,-1,-2,-22,-27,-15,1; MA /M: SY='P'; M=3,2,-24,12,5,-29,1,-10,-17,1,-13,-19,-10,22,-5,-12,-1,-3,-18,-27,-17,-1; MA /M: SY='N'; M=-3,-5,-26,-13,-13,1,-6,-5,2,-3,0,2,5,-19,-13,-13,0,2,-2,-24,-3,-14; MA /M: SY='C'; M=-3,-1,22,-3,-6,-19,-21,-24,-5,-12,-3,-11,0,-9,-12,-18,0,10,-2,-36,-19,-9; MA /M: SY='E'; M=1,-6,-26,0,2,-10,-12,-10,-6,0,1,-3,-13,2,-3,-10,-3,-1,-3,-19,1,-2; MA /M: SY='Y'; M=-10,-14,-32,-12,-5,0,-20,10,-9,-2,2,0,-15,5,-1,-7,-7,-2,-8,-16,14,-5; MA /M: SY='P'; M=-6,-13,-26,-4,3,-25,-9,-7,-25,7,-22,-21,-21,42,3,5,-3,-5,-24,-9,-10,-1; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=32(32); /POSITIVE=32(32); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HTH APSES-type; CC /VERSION=5; DR O60158 , BQT4_SCHPO , T; P01129 , CDC10_SCHPO, T; DR Q59X67 , EFG1_CANAL , T; P43064 , EFG1_CANAX , T; DR Q59P39 , EFH1_CANAL , T; P39679 , MBP1_KLULA , T; DR P39678 , MBP1_YEAST , T; P36093 , PHD1_YEAST , T; DR P33520 , RES1_SCHPO , T; P41412 , RES2_SCHPO , T; DR P53438 , SOK2_YEAST , T; B8NBX4 , STUA_ASPFN , T; DR Q4X228 , STUA_ASPFU , T; A8JPF9 , STUA_COLGL , T; DR N1PJ97 , STUA_DOTSN , T; P36011 , STUA_EMENI , T; DR Q6L612 , STUA_FUSOX , T; W7LYY0 , STUA_GIBM7 , T; DR I1S0A8 , STUA_GIBZE , T; A0A0K0QSV4, STUA_HAPC1 , T; DR E5AD52 , STUA_LEPMJ , T; Q1K6U0 , STUA_NEUCR , T; DR B6H2G9 , STUA_PENRW , T; Q0U086 , STUA_PHANO , T; DR G4NF05 , STUA_PYRO7 , T; Q4R1B9 , STUA_PYROR , T; DR Q8NKF5 , STUA_TALMA , T; A0A0D1CVS5, STUA_USTMA , T; DR P25302 , SWI4_YEAST , T; G4NID8 , SWI6_PYRO7 , T; DR Q3S405 , SWI6_PYROR , T; P40489 , XBP1_YEAST , T; 3D 1BM8; 1L3G; 1MB1; 5YBX; 5YC2; 5YCA; 6A6W; PR PRU00630; DO PDOC51299; //