ID PABC; MATRIX. AC PS51309; DT 01-APR-2007 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Poly(A)-binding protein C-terminal (PABC) domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=80; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=80; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2303166; R2=0.0056120; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1118; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=619; N_SCORE=5.7; MODE=1; TEXT='R?'; MA /DEFAULT: M0=-17; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; MA /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; MA /M: SY='Q'; M=-11,-48,10,-4,-7,-15,-29,-5,-26,-1,7,-29,22,60,-2,-5,3,-11,-42,13; MA /M: SY='T'; M=1,-43,-10,-4,-2,17,-37,13,-35,-3,10,-5,-4,-3,-40,-26,32,16,-44,11; MA /M: SY='D'; M=-32,-48,37,-20,-46,-5,-30,-9,34,-11,-34,11,29,27,8,7,1,-38,-52,-38; MA /M: SY='N'; M=14,-43,-2,26,-14,-35,-30,8,-7,-22,-32,32,8,-24,-6,24,0,-13,-46,9; MA /M: SY='Q'; M=7,-44,-7,-26,9,-13,-30,-12,0,-2,-29,27,2,45,6,19,2,-33,-46,-32; MA /M: SY='M'; M=33,-39,-41,-39,0,-36,-37,25,-37,0,51,11,1,-34,-41,15,0,7,-47,-31; MA /M: SY='E'; M=-3,-45,-18,50,-6,-5,-29,-19,-24,-44,-39,36,22,6,-31,35,-4,-39,-51,-38; MA /M: SY='D'; M=-4,-47,65,19,-43,-39,-29,-13,-26,-21,0,-21,-39,41,-32,-7,8,4,-54,-3; MA /M: SY='F'; M=-9,-42,-11,-38,52,-47,-36,-2,-37,46,-14,-6,-50,15,-10,-10,-9,-21,-36,-17; MA /M: SY='A'; M=44,-40,25,-3,-40,-33,-34,-29,4,16,-27,0,-41,19,-31,9,-26,-5,-51,-37; MA /M: SY='K'; M=19,-42,6,-21,-48,-31,-28,-43,40,-44,4,38,-2,22,7,25,8,-39,-52,-39; MA /M: SY='A'; M=29,-43,-2,18,-3,-41,-35,2,19,25,28,-34,-41,18,-28,-30,-30,-12,-45,-31; MA /M: SY='P'; M=-30,-47,-30,-27,-44,-36,17,-41,-9,-46,-37,15,78,5,-35,19,47,-39,-51,0; MA /M: SY='P'; M=-15,-50,20,21,-45,-42,-36,-12,-29,-6,-31,-32,72,31,-36,-28,19,-1,-53,-41; MA /M: SY='E'; M=-31,-52,53,53,-51,-15,-25,-52,0,-49,-42,-20,0,53,-24,12,-29,-49,-50,-2; MA /M: SY='Q'; M=6,-46,25,41,-50,-34,-26,-41,-2,-42,5,28,-36,57,-24,21,-25,-15,-53,-39; MA /M: SY='Q'; M=-7,-51,-27,3,7,-39,52,-46,17,-40,-30,-23,-39,91,-2,-6,-32,-45,-44,-26; MA /M: SY='R'; M=-37,-49,10,-20,-41,-46,-28,-39,60,3,27,-26,-42,-16,62,-33,-33,-38,-47,-34; MA /M: SY='Q'; M=-14,-50,2,8,-52,-14,-22,-46,-13,-42,14,26,-39,82,35,-2,-13,-44,-49,-35; MA /M: SY='I'; M=19,-43,-48,-39,15,-46,-39,40,-39,23,37,-42,-46,31,-40,-34,-30,20,-41,2; MA /M: SY='L'; M=-37,-42,-57,-50,-15,-59,-45,44,-50,65,-3,-53,-53,-44,-49,-47,-32,20,-45,-27; MA /M: SY='G'; M=-8,-48,-35,-39,-55,85,-39,-59,2,-55,-44,-22,-39,16,-38,-21,-38,-53,-45,-47; MA /M: SY='E'; M=-33,-51,20,74,-55,-40,-22,-53,7,-49,-41,37,-33,52,-20,-25,-30,-49,-53,-42; MA /M: SY='R'; M=-15,-46,-38,-10,-28,-46,-30,-4,1,23,42,-12,6,4,43,-31,16,-26,-42,20; MA /M: SY='L'; M=-36,-40,-52,-46,-15,-55,-40,8,-47,73,-3,-49,-52,-41,-46,-18,6,-12,-44,-26; MA /M: SY='Y'; M=-43,-50,-45,-43,62,-50,17,-27,1,-21,20,-41,-53,-36,-32,-39,-37,-31,-8,97; MA /M: SY='P'; M=-34,-53,-31,0,-2,-38,-30,-17,-8,-43,-36,17,85,13,-35,12,-28,-41,-39,34; MA /M: SY='K'; M=-37,-48,-37,-26,-27,-48,-29,-1,62,23,16,-31,-43,-21,34,-36,-32,-29,-37,33; MA /M: SY='V'; M=-29,-43,-56,-52,-24,-59,-58,64,-48,-8,-11,-49,-49,-48,-51,-41,-25,70,-53,-31; MA /M: SY='Q'; M=-31,-48,-24,45,15,-9,36,-36,8,-7,-30,-28,-39,48,4,7,-31,-5,-46,-28; MA /M: SY='E'; M=29,-46,31,35,-52,-35,-29,-46,14,-45,-38,-24,-4,35,27,9,-27,-25,-51,-40; MA /M: SY='H'; M=-33,-45,-35,-6,-31,-46,40,-2,28,29,27,-4,-43,11,19,-5,-8,-1,-49,-29; MA /I: I=-9; MD=-23; MA /M: SY='L'; M=-60,-71,-16,-63,-56,-33,-69,-40,-26,14,-44,-65,1,-65,-66,-62,-20,4,-78,-62; D=-9; MA /I: I=-9; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; MA /M: SY='Q'; M=-59,-76,5,-12,-80,-25,17,-80,12,-77,-66,9,-65,18,-45,-21,-55,-77,-82,-63; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-23; MA /M: SY='N'; M=-16,-46,40,38,25,-39,29,-40,-24,-39,-35,40,-39,26,-30,-25,7,-19,-46,12; MA /M: SY='P'; M=5,-52,-28,25,-50,-39,-35,-3,36,-45,-36,-4,76,8,-25,-11,-28,-38,-49,-44; MA /M: SY='Q'; M=9,-48,36,41,-54,-8,-29,-48,15,-47,-40,-22,9,49,-24,5,9,-43,-52,-41; MA /M: SY='H'; M=-2,-43,-38,-36,39,-43,59,-24,-13,26,-19,7,-47,3,-34,-1,2,-6,-38,24; MA /M: SY='A'; M=73,-35,-40,-34,-42,-25,-43,-33,-35,-37,-33,-34,-38,-32,-40,-4,22,-6,59,-37; MA /M: SY='P'; M=17,-46,-32,-32,9,36,21,-46,20,-45,-37,20,46,-30,-31,5,-29,-42,-43,0; MA /M: SY='K'; M=-35,-50,-27,-14,-50,-42,46,-52,84,-48,-35,-20,-36,24,24,-28,-31,-48,-47,-32; MA /M: SY='I'; M=-35,-47,-57,-54,-20,-61,-55,82,-50,18,-7,-49,-48,-47,-53,-45,-29,34,-47,-29; MA /M: SY='T'; M=3,-34,-32,-34,-38,-38,-41,-25,-31,-33,-30,-22,-33,-34,-38,13,88,14,-59,-37; MA /M: SY='G'; M=-23,-49,-27,22,-54,84,-38,-61,-35,-56,-46,9,-38,-31,-43,-22,-37,-54,-47,-49; MA /M: SY='M'; M=-34,-42,-56,-46,-22,-49,-29,27,-40,11,120,-43,-43,-32,-38,-43,-32,-10,-46,-22; MA /M: SY='L'; M=-38,-42,-57,-49,6,-57,-41,33,-49,67,43,-53,-53,-42,-47,-48,-34,-8,-42,-23; MA /M: SY='L'; M=-35,-41,-51,-46,-17,-53,-42,31,-46,66,-5,-46,-50,-40,-46,-2,7,-9,-45,-27; MA /M: SY='E'; M=-34,-53,69,72,-57,-9,-25,-57,-19,-51,-48,-18,-32,18,-28,-27,-32,-51,-58,-44; MA /M: SY='M'; M=-37,-46,-46,-38,7,-49,23,10,0,34,70,-41,48,-34,-37,-39,-5,-20,-45,-26; MA /M: SY='D'; M=-30,-48,70,26,-54,-14,-29,-51,-26,-52,-47,5,42,-24,-35,30,10,-47,-61,-43; MA /I: I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; MA /M: SY='N'; M=-34,-47,-21,-2,-47,-34,-26,5,8,-43,-34,69,45,37,-6,-22,16,-37,-55,-41; MA /I: I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; MA /M: SY='E'; M=16,-45,27,37,-51,-1,-32,-48,8,-48,-41,-22,27,6,-29,35,6,-41,-53,-42; MA /M: SY='E'; M=-33,-53,50,82,-57,-44,-25,-56,3,-49,-45,-22,-31,28,-23,-27,-32,-50,-55,-43; MA /M: SY='I'; M=-15,-45,-56,-52,-21,-58,-54,72,-49,25,-8,-49,-48,-46,-51,-43,-29,42,-48,-29; MA /M: SY='L'; M=-38,-43,-57,-51,33,-59,-45,46,-50,58,-5,-52,-53,-46,-49,-47,-33,15,-39,-20; MA /M: SY='H'; M=-1,-45,23,44,-44,-35,59,-43,-25,-10,4,34,0,-19,-30,25,-26,-41,-58,-34; MA /M: SY='M'; M=-35,-42,-54,-47,10,-53,-39,16,-44,46,76,-47,-48,-39,-44,-42,6,13,51,-21; MA /M: SY='L'; M=-37,-41,-57,-50,46,-57,-44,20,-50,59,-6,-53,-55,-47,-48,-46,-33,26,-37,-17; MA /M: SY='E'; M=-1,-46,34,57,-46,-38,-29,-44,28,-44,-40,-22,-33,-16,-23,22,9,-15,-50,-4; MA /M: SY='D'; M=-26,-42,60,11,-51,-28,-24,-49,-24,-52,-45,56,-38,-21,-32,51,3,-45,-63,-41; MA /M: SY='E'; M=-9,-52,45,55,-52,-41,29,-45,0,-47,-41,-25,54,-20,-30,-11,-29,-11,-57,-41; MA /M: SY='E'; M=-33,-49,43,56,-16,-39,-25,-51,36,-48,-42,25,-35,34,-18,1,-28,-48,-52,-38; MA /M: SY='E'; M=13,-43,18,42,-38,-14,-32,-31,-27,20,7,-28,-37,19,-33,-6,31,-30,-51,-37; MA /M: SY='L'; M=-40,-42,-57,-50,48,-57,-40,15,-50,66,20,-53,-55,-45,-47,-48,-35,-12,-35,-16; MA /M: SY='N'; M=-14,-46,-2,-2,-45,-37,13,-11,23,-24,-31,54,-42,44,33,-8,-27,-3,-53,-36; MA /M: SY='E'; M=16,-44,37,46,-50,-35,-30,-42,3,-44,-39,-21,-34,26,-27,22,25,-17,-55,-40; MA /M: SY='R'; M=-37,-51,-31,-23,-29,-44,36,-44,53,-39,12,8,-43,9,55,-31,-33,-43,-34,52; MA /M: SY='I'; M=-31,20,-56,-52,2,-58,-52,62,-48,4,-12,-49,-50,-48,-50,-42,-28,59,-46,5; MA /M: SY='D'; M=-5,-47,51,25,-54,-4,-24,-50,12,-50,-41,46,-37,48,-24,-2,-6,-47,-56,-41; MA /M: SY='E'; M=-33,-52,46,84,-55,-44,-25,-54,-16,-49,-45,-23,-30,20,-25,-26,0,-48,-55,-43; MA /M: SY='A'; M=76,14,-39,-35,-48,28,-42,-41,-36,-42,-35,-32,-39,-33,-41,-15,-26,-28,-48,-45; MA /M: SY='M'; M=-32,-42,-50,-47,2,-50,-41,48,-44,36,54,-12,-48,-39,-45,7,-27,25,-46,-26; MA /M: SY='E'; M=6,12,35,66,-53,-22,-28,-50,8,-47,-42,8,-33,19,-25,-23,9,-43,-55,-43; MA /M: SY='V'; M=22,-40,-50,-41,-25,-47,-44,10,-42,42,-11,-46,-49,14,-42,-34,-28,50,-49,-31; MA /M: SY='I'; M=-39,-46,-55,-51,8,-58,-39,57,-48,52,-6,-51,-52,-43,-47,-46,-34,-5,-33,43; MA /M: SY='Q'; M=-12,-49,-27,21,-44,-42,-28,2,37,-9,-29,16,-39,48,43,-27,-4,-34,-48,-35; MA /M: SY='E'; M=-2,-47,-18,64,-5,-8,17,-43,9,-24,-36,-27,-34,6,-4,23,-28,-19,-48,-35; MA /M: SY='H'; M=-2,-45,-26,14,9,-35,63,-39,-4,-38,-33,38,-41,7,-28,25,-27,-9,51,24; MA /M: SY='Q'; M=21,-43,-34,-23,-4,-14,-32,-13,33,0,-27,-27,-39,58,-21,6,13,-17,-45,-32; MA /M: SY='Q'; M=2,37,-10,5,-48,-1,-31,-44,39,-22,-35,3,-4,42,0,11,9,-40,-50,-39; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=54(54); /POSITIVE=54(54); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=1; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=PABC; CC /VERSION=4; DR Q98SP8 , EPABA_XENLA, T; Q6GR16 , EPABB_XENLA, T; DR Q6DEY7 , EPAB_XENTR , T; P51592 , HYD_DROME , T; DR Q9LT82 , MPC_ARATH , T; P61286 , PABP1_BOVIN, T; DR P11940 , PABP1_HUMAN, T; P29341 , PABP1_MOUSE, T; DR Q5R8F7 , PABP1_PONAB, T; Q9EPH8 , PABP1_RAT , T; DR P42731 , PABP2_ARATH, T; O64380 , PABP3_ARATH, T; DR Q9H361 , PABP3_HUMAN, T; O22173 , PABP4_ARATH, T; DR Q13310 , PABP4_HUMAN, T; Q05196 , PABP5_ARATH, T; DR Q9ZQA8 , PABP7_ARATH, T; Q9FXA2 , PABP8_ARATH, T; DR F1QB54 , PABPA_DANRE, T; P20965 , PABPA_XENLA, T; DR Q6IP09 , PABPB_XENLA, T; A1CRM1 , PABP_ASPCL , T; DR Q4WK03 , PABP_ASPFU , T; A2Q848 , PABP_ASPNC , T; DR Q2UK72 , PABP_ASPOR , T; Q0CR95 , PABP_ASPTN , T; DR Q5AI15 , PABP_CANAL , T; Q6FKG4 , PABP_CANGA , T; DR Q2GSX8 , PABP_CHAGB , T; Q1DXH0 , PABP_COCIM , T; DR P0CP47 , PABP_CRYNB , T; P0CP46 , PABP_CRYNJ , T; DR Q6BI95 , PABP_DEBHA , T; P21187 , PABP_DROME , T; DR Q5B630 , PABP_EMENI , T; Q74ZS6 , PABP_EREGS , T; DR Q6CSV3 , PABP_KLULA , T; A5DW14 , PABP_LODEL , T; DR A1D4K4 , PABP_NEOFI , T; Q7S6N6 , PABP_NEUCR , T; DR Q0U1G2 , PABP_PHANO , T; A5DM21 , PABP_PICGU , T; DR A3LXL0 , PABP_PICST , T; A4QUF0 , PABP_PYRO7 , T; DR P31209 , PABP_SCHPO , T; Q4P8R9 , PABP_USTMA , T; DR Q6CDH3 , PABP_YARLI , T; P04147 , PABP_YEAST , T; DR Q54BM2 , PAP1A_DICDI, T; Q1ZXC2 , PAP1B_DICDI, T; DR Q4VXU2 , PAP1L_HUMAN, T; O95071 , UBR5_HUMAN , T; DR Q80TP3 , UBR5_MOUSE , T; Q62671 , UBR5_RAT , T; DR A0A0D1DWZ5, RRM4_USTMA , N; 3D 1G9L; 1I2T; 1IFW; 1JGN; 1JH4; 2RQG; 2RQH; 2X04; 3KTP; 3KTR; 3KUI; 3KUJ; 3D 3KUR; 3KUS; 3KUT; 3NTW; 3PKN; 3PTH; 4IVE; 6R5K; 7BN3; 7PZE; 8BJA; 8C06; 3D 8C07; 8D4X; 8E0Q; 8EWI; 8P82; 8P83; PR PRU00641; DO PDOC51309; //