ID VPS28_N; MATRIX. AC PS51313; DT 01-MAY-2007 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE VPS28 N-terminal domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=111; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=106; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8351934; R2=0.0125664; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7327.1245117; R2=2.5599415; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=372; H_SCORE=8279; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=213; H_SCORE=7872; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-30; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='S'; M=3,-22,-41,-31,-15,-48,-37,-34,-38,-23,-34,-17,-12,-38,-18,-32,14,3,-29,-66,-52,-15; MA /M: SY='K'; M=-22,-23,-62,-34,-23,-47,-48,-15,-60,3,-59,-42,-7,-25,-2,3,-2,-21,-53,-59,-28,-16; MA /M: SY='S'; M=-12,-30,-47,-34,-41,-22,-30,-34,-43,-38,-35,-36,-29,-49,-34,-45,3,-23,-33,-39,-22,-37; MA /M: SY='N'; M=-30,2,-53,-10,-25,-39,-43,-6,-46,-25,-48,-38,21,-51,-12,-32,-18,-26,-38,-50,-34,-22; MA /M: SY='N'; M=-29,-13,-55,-20,-26,-43,-47,-16,-40,-17,-26,-19,1,-49,-17,-29,-8,-21,-33,-56,-44,-25; MA /M: M=-12,-30,-46,-43,-37,-41,-48,-28,-26,-27,-35,-18,-10,-30,-16,-37,-21,-24,-29,-57,-33,-30; MA /M: SY='K'; M=-19,-19,-61,-30,-16,-51,-47,-31,-44,1,-31,-28,-3,-30,-13,-22,-22,-26,-41,-71,-52,-16; MA /M: SY='L'; M=-40,-73,-34,-78,-71,13,-78,-45,-1,-58,33,13,-62,-69,-48,-58,-53,-40,-15,-32,-4,-61; MA /M: SY='H'; M=-37,-11,-65,-13,-14,-29,-54,21,-56,-30,-51,-38,-7,-51,-12,-31,-18,-31,-44,-38,-12,-15; MA /M: SY='E'; M=-29,-10,-84,-2,37,-73,-44,-23,-71,12,-68,-51,-16,-44,5,11,-23,-33,-51,-69,-63,25; MA /M: SY='E'; M=-29,-6,-87,10,81,-76,-59,-16,-69,5,-67,-46,-19,-41,26,-6,-21,-30,-51,-76,-65,60; MA /M: SY='V'; M=-21,-63,-34,-21,-50,-33,-64,-64,23,-48,-6,5,-58,-58,-46,-56,-33,-6,48,-53,-51,-49; MA /M: SY='E'; M=-22,-15,-73,-12,14,-67,-52,-29,-63,7,-64,-46,-18,-12,-5,-6,-8,-16,-44,-70,-60,5; MA /M: SY='L'; M=-24,-57,-55,-51,-35,-26,-67,-50,-6,-21,23,2,-52,-55,-28,-38,-41,-32,-8,-59,-47,-32; MA /M: M=-13,-45,-47,-39,-34,-4,-53,-32,-38,-32,-37,-30,-42,-50,-30,-31,-11,-25,-30,-27,-11,-31; MA /M: SY='D'; M=-20,1,-57,2,-8,-48,-41,-27,-58,-9,-58,-46,-1,-43,-16,-19,1,-15,-32,-48,-47,-12; MA /M: SY='N'; M=-17,-2,-42,-13,-28,-53,-39,-30,-39,-26,-40,-30,19,-46,-25,-34,1,12,-24,-63,-51,-27; MA /I: I=-13; MD=-27; MA /M: SY='I'; M=-14,-31,-17,-34,-31,-3,-36,-28,12,-26,-5,-5,-26,-31,-26,-30,-3,-10,1,-28,-16,-30; D=-13; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='S'; M=-6,-15,-24,-23,-17,-25,-26,-7,-22,-17,-23,-4,-7,-23,-11,-17,18,13,-18,-37,-25,-15; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-27; MA /M: SY='S'; M=-1,-24,-53,-34,-26,-55,-39,-9,-57,-16,-58,-41,-13,2,-17,-27,9,-8,-46,-69,-45,-23; MA /M: SY='K'; M=0,-39,-55,-47,-27,-51,-35,-33,-42,5,-39,-29,-29,-42,-7,3,-15,-25,-36,-65,-50,-19; MA /M: SY='E'; M=-32,-4,-78,1,39,-64,-54,2,-62,1,-58,-35,-5,-43,17,-16,-21,-30,-47,-65,-51,29; MA /M: SY='R'; M=-26,-31,-62,-37,-5,-60,-57,-21,-63,37,-59,-39,-19,-45,11,45,-25,-30,-53,-72,-52,0; MA /M: SY='E'; M=-27,-9,-74,-4,32,-64,-52,-19,-59,7,-52,-38,-10,-43,20,-9,-14,-26,-44,-67,-56,26; MA /M: M=-17,-36,-48,-22,-29,-41,-57,-32,-17,-19,-23,-20,-33,-48,-19,-34,-15,-12,-1,-55,-45,-27; MA /M: SY='Y'; M=-34,-59,-47,-56,-54,-5,-74,-30,-9,-41,-13,-2,-48,-60,-36,-37,-37,-17,-8,-29,10,-48; MA /M: SY='E'; M=-37,9,-81,33,59,-74,-57,-28,-58,-15,-64,-53,-16,-46,0,-34,-23,-33,-26,-55,-67,35; MA /M: SY='S'; M=-17,-5,-46,-13,-28,-50,-29,-30,-44,-30,-52,-43,4,-47,-28,-39,6,-4,-29,-52,-41,-29; MA /M: SY='L'; M=-40,-79,-49,-80,-69,7,-79,-58,16,-59,71,34,-69,-69,-49,-59,-58,-39,-2,-46,-35,-59; MA /M: SY='A'; M=43,-33,-27,-42,-31,-45,-21,-39,-37,-24,-35,-27,-29,-29,-23,-33,31,-2,-25,-63,-49,-24; MA /M: SY='E'; M=-31,-1,-67,13,33,-66,-56,-30,-45,-18,-54,-41,-9,-47,-7,-33,-17,-12,-22,-63,-61,17; MA /M: SY='L'; M=-33,-72,-40,-67,-63,-14,-77,-61,35,-55,39,14,-63,-65,-50,-60,-40,-28,16,-55,-42,-58; MA /M: SY='Y'; M=-48,-64,-52,-74,-71,55,-79,-10,-29,-52,-22,-21,-56,-68,-44,-52,-49,-47,-39,8,80,-61; MA /M: SY='S'; M=29,-27,-29,-36,-29,-45,-23,-36,-39,-24,-39,-29,-21,-31,-23,-33,47,4,-29,-65,-49,-24; MA /M: SY='I'; M=-38,-79,-35,-70,-68,-16,-86,-67,60,-59,33,14,-70,-69,-56,-66,-51,-30,35,-56,-41,-65; MA /M: SY='I'; M=-21,-67,-34,-55,-56,-22,-71,-60,31,-49,17,13,-59,-59,-46,-56,-31,-21,24,-55,-45,-53; MA /M: M=-25,-45,-49,-35,-40,-36,-65,-43,-13,-18,-24,-19,-36,-39,-30,-28,-27,-7,-2,-58,-36,-38; MA /M: SY='A'; M=29,-33,-31,-40,-31,-51,-32,-42,-36,-26,-43,-29,-29,-15,-27,-34,16,18,-17,-65,-52,-27; MA /M: SY='L'; M=-38,-74,-48,-76,-66,-1,-78,-52,15,-56,52,23,-63,-67,-47,-57,-52,-31,-3,-44,-25,-58; MA /M: SY='E'; M=-34,16,-82,32,66,-77,-51,-18,-71,-6,-71,-54,0,-43,16,-24,-18,-30,-42,-62,-66,45; MA /M: SY='Q'; M=-10,-38,-59,-47,-26,-36,-44,-5,-47,-3,-40,-16,-27,-44,6,-11,-24,-30,-42,-47,-20,-14; MA /M: SY='L'; M=-37,-76,-45,-62,-66,-4,-81,-56,22,-57,46,14,-68,-68,-50,-60,-54,-34,15,-43,-26,-58; MA /M: SY='E'; M=-29,-2,-89,15,90,-78,-59,-21,-69,10,-69,-49,-19,-39,20,-15,-20,-30,-50,-80,-68,63; MA /M: SY='K'; M=-24,-20,-78,-32,-7,-61,-50,-22,-64,72,-61,-41,-3,-37,12,45,-21,-28,-54,-77,-50,-4; MA /M: SY='A'; M=44,-34,-33,-44,-31,-49,-11,-23,-46,-25,-45,-29,-29,-29,-19,-31,13,-13,-32,-60,-46,-22; MA /M: SY='Y'; M=-45,-63,-50,-71,-69,37,-79,-18,-18,-52,-16,-27,-55,-68,-46,-53,-45,-36,-29,-5,61,-61; MA /M: SY='I'; M=-30,-69,-38,-52,-59,-19,-77,-62,30,-53,29,10,-62,-63,-49,-58,-38,-16,27,-55,-44,-55; MA /M: SY='K'; M=-18,-23,-72,-33,-8,-58,-48,-25,-61,64,-60,-40,-11,-35,9,38,-5,-22,-51,-76,-50,-6; MA /M: SY='D'; M=-41,33,-70,61,1,-72,-33,-37,-62,-34,-68,-67,-1,-51,-27,-51,-15,-35,-5,-17,-66,-13; MA /M: M=-17,-40,-33,-40,-45,-30,-45,-32,-27,-42,-30,-20,-34,-53,-34,-47,-10,-23,-21,-43,-25,-40; MA /M: SY='V'; M=-31,-76,-34,-29,-60,-23,-83,-68,44,-57,2,0,-71,-66,-54,-65,-47,-23,52,-31,-39,-59; MA /M: SY='S'; M=-7,-3,-39,-15,-19,-55,-32,-30,-49,-12,-57,-38,8,-36,-18,-25,45,28,-33,-67,-51,-20; MA /M: M=-7,-12,-56,-8,-9,-50,-34,-29,-57,-20,-54,-42,-20,-29,-1,-34,-6,-18,-31,-45,-49,-6; MA /M: SY='E'; M=-10,-3,-60,-3,11,-63,-39,-24,-59,10,-60,-43,-2,-36,8,-15,5,-12,-38,-62,-55,8; MA /M: SY='E'; M=-24,15,-72,34,37,-72,-43,-22,-68,-12,-68,-54,-7,-41,11,-30,-7,-27,-28,-44,-62,26; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='Y'; M=-49,-64,-54,-73,-72,45,-81,-6,-24,-53,-27,-37,-55,-70,-45,-54,-50,-48,-38,9,91,-63; MA /M: SY='T'; M=-12,-12,-47,-25,-8,-55,-45,-15,-46,-16,-51,-33,-1,-39,-14,-23,11,35,-31,-70,-47,-11; MA /M: SY='S'; M=11,-23,-42,-28,-18,-54,-34,-33,-45,-9,-51,-35,-14,-26,-17,-18,20,1,-30,-69,-52,-17; MA /M: SY='T'; M=15,-21,-39,-30,-4,-56,-38,-35,-42,-20,-47,-30,-20,-33,-16,-28,14,31,-23,-69,-54,-7; MA /M: SY='C'; M=-19,-63,78,-61,-73,-38,-68,-71,-13,-66,-38,-29,-48,-70,-60,-69,-20,-15,-9,-66,-56,-67; MA /M: M=-22,-22,-47,-24,-27,-32,-50,-32,-33,-32,-26,-26,-12,-50,-27,-40,-5,-11,-24,-51,-33,-27; MA /M: SY='K'; M=-25,-25,-73,-31,-13,-56,-53,-25,-58,43,-50,-37,-16,-42,1,37,-18,-27,-45,-67,-51,-10; MA /M: SY='L'; M=-40,-80,-50,-80,-70,0,-80,-60,20,-60,80,30,-70,-70,-50,-60,-60,-40,0,-50,-40,-60; MA /M: SY='L'; M=-39,-79,-41,-80,-69,-9,-83,-63,44,-59,52,28,-69,-69,-52,-63,-54,-34,17,-53,-41,-63; MA /M: SY='Q'; M=-14,-10,-54,-2,-13,-55,-43,-15,-44,-5,-49,-36,-2,-43,3,-23,-11,-20,-21,-54,-46,-9; MA /M: SY='Q'; M=-18,-19,-68,-22,14,-59,-48,1,-59,29,-52,-25,-9,-38,86,2,-11,-26,-49,-56,-42,37; MA /M: SY='Y'; M=-46,-60,-54,-62,-69,43,-74,-8,-38,-52,-34,-40,-52,-67,-43,-52,-40,-46,-45,21,82,-60; MA /M: SY='K'; M=-23,-12,-79,-17,20,-64,-50,-20,-62,63,-61,-40,-4,-35,31,13,-19,-29,-51,-76,-52,19; MA /M: SY='S'; M=5,-40,-30,-40,-38,-39,-45,-46,-10,-34,-23,-18,-33,-42,-33,-42,18,9,-3,-63,-48,-36; MA /M: M=-12,-58,-24,-65,-57,-19,-61,-46,-5,-47,0,-11,-49,-56,-42,-51,-24,-14,-11,-49,-23,-50; MA /M: SY='M'; M=-34,-63,-46,-64,-55,10,-71,-46,-4,-33,9,17,-53,-58,-36,-36,-37,-31,-10,-41,-24,-48; MA /M: SY='K'; M=-8,-21,-55,-32,-18,-53,-34,-29,-50,17,-47,-33,-8,-38,0,-6,7,-9,-42,-70,-50,-13; MA /M: M=-26,-21,-61,-16,-23,-48,-43,-26,-49,-21,-43,-36,-16,-37,-5,-27,-14,-27,-32,-48,-40,-17; MA /M: M=-31,-38,-56,-17,-17,-32,-66,-42,-15,-24,-12,-15,-35,-55,-19,-39,-35,-27,0,-53,-45,-19; MA /M: SY='Q'; M=-9,-20,-55,-22,-5,-54,-44,1,-50,-8,-51,-33,-9,-41,18,-10,-1,-12,-37,-61,-41,3; MA /M: M=-28,-20,-66,-6,-23,-54,-17,-39,-52,-28,-49,-46,-26,-55,-21,-44,-28,-38,-27,-44,-48,-22; MA /I: I=-5; MD=-11; MA /M: SY='A'; M=8,-5,-36,5,-5,-47,-27,-30,-37,-20,-42,-34,-16,-29,-16,-30,3,-6,-7,-37,-46,-9; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-11; MA /M: SY='Q'; M=-18,-15,-51,-13,22,-41,-39,-8,-39,5,-34,-12,-14,-29,28,5,-16,-20,-31,-43,-36,24; D=-5; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; MA /M: M=-6,-22,-23,-19,-15,-8,-28,-11,-12,-18,-9,-10,-21,-25,-14,-20,-8,-12,-8,-25,-14,-14; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='F'; M=-28,-49,-37,-38,-52,26,-63,-39,-9,-45,-14,-17,-50,-55,-43,-50,-28,-28,-1,-21,1,-48; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='S'; M=-13,-17,-50,-14,-30,-58,-2,-38,-51,-29,-55,-42,-9,-33,-23,-40,2,-15,-34,-57,-56,-26; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='S'; M=-18,-7,-41,-9,-24,-30,-32,-33,-45,-30,-46,-37,-12,-41,-28,-38,17,9,-22,-40,-38,-26; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-11; MA /M: SY='I'; M=-35,-72,-37,-63,-65,3,-79,-60,32,-56,25,7,-65,-66,-53,-61,-42,-30,18,-46,-29,-61; MA /M: SY='E'; M=-32,3,-83,22,50,-75,-54,-22,-71,-8,-69,-52,-16,-20,17,-28,-21,-34,-40,-57,-65,36; MA /M: SY='Q'; M=-16,-1,-65,5,-2,-64,-42,-21,-63,1,-61,-47,-9,-41,7,0,-8,-20,-30,-45,-55,0; MA /M: SY='F'; M=-49,-71,-41,-80,-79,103,-80,-41,-17,-60,5,-7,-70,-70,-59,-60,-51,-49,-28,-3,35,-69; MA /M: M=0,-58,-1,-55,-53,-26,-53,-50,-28,-36,-29,-7,-48,-52,-35,-37,-25,-26,-20,-38,-40,-44; MA /M: SY='E'; M=-29,3,-73,2,17,-68,-46,-16,-68,11,-66,-48,7,-43,8,9,-10,-24,-47,-63,-56,12; MA /M: SY='K'; M=-16,-12,-61,-22,-12,-59,-46,-28,-55,30,-56,-38,-2,-38,-4,9,-7,3,-36,-68,-52,-12; MA /M: SY='Y'; M=-51,-66,-57,-63,-73,50,-79,-8,-38,-56,-33,-40,-58,-71,-46,-55,-53,-53,-46,35,90,-63; MA /M: SY='N'; M=-25,-8,-69,-27,-28,-69,-4,-25,-74,7,-69,-52,19,-50,-14,9,-17,-30,-67,-74,-59,-23; MA /M: SY='L'; M=-26,-70,-42,-73,-60,-12,-70,-56,17,-51,44,31,-59,-60,-42,-54,-39,-29,1,-52,-43,-52; MA /M: SY='N'; M=-38,19,-69,19,1,-65,-43,12,-70,-15,-67,-54,25,-48,2,-16,-15,-22,-42,-47,-45,-1; MA /M: SY='C'; M=-2,-57,54,-62,-65,-30,-57,-53,-28,-57,-40,-32,-45,-61,-50,-59,-20,-17,-21,-60,-44,-57; MA /M: SY='P'; M=-16,-42,-72,-43,-32,-66,-54,-42,-66,-24,-67,-46,-40,86,-25,-43,-13,-31,-56,-76,-65,-30; MA /M: SY='A'; M=9,-33,-45,-45,-33,-44,-38,-33,-37,-11,-23,-22,-18,-41,-19,-13,-9,-19,-32,-64,-48,-26; MA /M: SY='A'; M=80,-40,-20,-50,-30,-50,-10,-40,-40,-20,-40,-30,-40,-20,-20,-30,10,-10,-20,-60,-50,-20; MA /M: SY='I'; M=-36,-70,-43,-73,-59,-23,-80,-56,33,-43,19,13,-58,-64,-44,-38,-45,-25,10,-58,-43,-54; MA /M: SY='K'; M=-18,-6,-67,-13,18,-64,-46,-16,-59,21,-60,-41,3,-38,5,-7,-10,-9,-46,-75,-52,10; MA /M: SY='R'; M=-30,-40,-80,-50,-20,-60,-60,-10,-70,30,-60,-40,-20,-50,0,100,-30,-30,-60,-70,-50,-10; MA /M: SY='L'; M=-40,-80,-41,-80,-70,-9,-85,-65,48,-60,52,21,-70,-70,-55,-65,-55,-35,19,-55,-40,-65; MA /M: SY='Q'; M=-16,-18,-66,-19,9,-60,-49,-16,-54,20,-53,-32,-8,-40,33,4,-16,-19,-40,-66,-50,16; MA /M: SY='E'; M=-26,-36,-60,-23,4,-51,-64,-36,-23,-18,-31,-23,-35,-50,-9,-19,-21,-16,-14,-66,-53,-1; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='G'; M=-11,-22,-68,-28,-51,-78,72,-55,-86,-46,-78,-68,-16,-57,-45,-57,-11,-44,-71,-65,-77,-44; MA /M: SY='V'; M=-29,-61,-44,-48,-49,-22,-72,-49,9,-32,-8,-1,-51,-58,-37,-22,-31,-22,10,-54,-40,-44; MA /M: SY='P'; M=-20,-38,-76,-36,-34,-69,-55,-47,-69,-29,-70,-52,-41,94,-37,-48,-19,-35,-54,-73,-68,-35; MA /M: SY='V'; M=-1,-32,-39,-15,-32,-46,-51,-51,-3,-38,-27,-26,-41,-48,-36,-51,-22,-23,16,-44,-52,-34; MA /M: SY='T'; M=-7,-14,-36,-32,-19,-54,-45,-35,-37,-25,-45,-26,-3,-39,-23,-28,14,64,-19,-71,-52,-20; MA /M: SY='V'; M=-15,-59,-41,-42,-45,-35,-68,-41,16,-29,-14,-12,-51,-54,-34,-35,-33,-22,19,-59,-42,-42; MA /M: SY='E'; M=-22,-9,-76,-3,50,-69,-53,-22,-62,20,-63,-42,-14,-37,20,-9,-8,-16,-46,-76,-60,37; MA /M: SY='H'; M=-32,-5,-71,0,-2,-53,-50,33,-62,-16,-53,-42,-5,-47,26,-21,-17,-32,-41,-40,-31,6; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; PP /PROMOTED_BY: PS51310; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=12(12); /POSITIVE=12(12); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=VPS28 N-terminal; CC /VERSION=6; DR O65421 , VP281_ARATH, T; Q9S9T7 , VP282_ARATH, T; DR Q3T178 , VPS28_BOVIN, T; A8XWB7 , VPS28_CAEBR, T; DR Q9NA26 , VPS28_CAEEL, T; Q54NF1 , VPS28_DICDI, T; DR Q9V359 , VPS28_DROME, T; Q9UK41 , VPS28_HUMAN, T; DR Q9D1C8 , VPS28_MOUSE, T; B5DEN9 , VPS28_RAT , T; DR O13872 , VPS28_SCHPO, T; Q02767 , VPS28_YEAST, T; 3D 2CAZ; 2F66; 2F6M; 2P22; 6VME; PR PRU00645; DO PDOC51312; //