ID   TAT; MATRIX.
AC   PS51318;
DT   01-MAY-2007 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Twin arginine translocation (Tat) signal profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1003532; R2=0.0044078; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2985.9531250; R2=1.0537143; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=794; H_SCORE=3823; N_SCORE=7.6; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=545; H_SCORE=3560; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-28; D=-200; I=-200; B0=*; B1=*; E1=-300; MI=-205; MD=-205; IM=-205; DM=-205;
MA   /I: I=-50; B0=0; BI=-205; BD=-205;
MA   /M: SY='M'; M=-51,-59,-74,-63,-41,-66,-44,-25,-56,-18,142,-60,-61,-48,-54,-61,-50,-30,-64,-40; D=-50;
MA   /I: I=-50;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-22,-4,-8,-36,-17,-6,-26,16,-27,-13,22,12,-4,-2,40,37,-32,-47,-37; D=-5;
MA   /I: I=-4; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,-38,28,8,-27,-24,12,-15,18,-25,7,21,-11,19,13,6,6,-29,-41,-30; D=-1;
MA   /I: I=-4; MD=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-24,-60,10,4,-19,-29,19,-16,14,-18,-15,5,18,13,7,13,13,-24,-33,-30; D=-1;
MA   /I: I=-4; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-18,-36,14,0,-21,-26,9,-21,12,-25,-15,16,24,4,-3,5,7,-32,-38,-42; D=-1;
MA   /I: I=-4; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-21,-42,2,-1,-22,-19,-4,-22,4,-27,-31,12,22,6,-1,6,8,-30,-37,-35; D=-1;
MA   /I: I=-4; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-25,2,-13,-15,-27,-3,-26,-5,-25,-19,5,21,-8,-4,12,0,-38,-41,-38; D=-1;
MA   /I: I=-4; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-39,-4,-13,-31,-17,-4,-43,-12,-30,-35,2,18,-5,-2,6,-2,-36,-23,-51; D=-1;
MA   /I: I=-4; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-43,-15,-16,-44,-9,-13,-36,-23,-27,-26,-9,10,-1,-5,1,-16,-32,-41,-48; D=-1;
MA   /I: I=-4; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-42,-20,-19,-65,-16,-19,-41,-30,-26,-22,-16,-2,-19,-19,-11,-10,-39,-51,-67; D=-1;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-22,-67,-21,-44,-53,10,-37,-76,-25,-65,-33,-14,-16,-20,-12,-17,-20,-65,-47,-42; D=-1;
MA   /I: I=-4; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-38,-54,-63,-60,8,-60,-44,29,-59,36,38,-41,10,-28,-52,-38,-5,21,-25,-37; D=-1;
MA   /I: I=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-28,-57,13,-33,-65,0,-25,-62,-32,-61,-55,33,-28,-9,-36,73,48,-55,-75,-58;
MA   /M: SY='R'; M=-115,-131,-111,-99,-123,-125,-100,-130,-40,-123,-111,-104,-123,-87,124,-109,-113,-124,-123,-110;
MA   /M: SY='R'; M=-115,-131,-111,-99,-123,-113,-100,-130,-64,-123,-111,-104,-123,-87,124,-109,-113,-124,-78,-110;
MA   /M: SY='D'; M=-2,-55,43,-1,-62,8,18,-64,-4,-61,-50,14,-57,40,35,24,14,-53,-73,-54;
MA   /M: SY='F'; M=-22,-88,-133,-127,108,-116,-102,-27,-124,30,9,-125,-108,-110,-122,-106,-95,4,2,-67;
MA   /M: SY='L'; M=-101,-66,-132,-125,-18,-120,-95,26,-124,84,48,-102,-129,-118,-122,-113,-84,1,-119,-100;
MA   /M: SY='K'; M=5,-58,-48,-25,-52,12,-22,-42,63,-33,-21,-22,-57,39,33,-7,0,-35,-52,-39;
MA   /M: SY='G'; M=29,-43,-44,-53,-7,41,-33,-29,-24,4,2,-17,-60,-8,-4,1,28,-16,-6,-15;
MA   /M: SY='A'; M=46,18,-58,-56,-34,20,-58,-19,-55,6,15,-46,-53,-52,-58,34,29,-4,-68,-56;
MA   /M: SY='A'; M=58,-25,-57,-56,-51,48,-59,-39,-54,-1,-15,-47,-48,-51,-60,10,13,-14,-67,-59;
MA   /M: SY='A'; M=56,-38,-59,-57,-23,20,-54,-1,-35,12,10,-51,-61,-40,-41,-5,3,12,-23,-41;
MA   /M: SY='A'; M=46,-38,-60,-58,-21,34,-60,-17,-54,20,2,-52,-56,-55,-61,2,23,12,-66,-48;
MA   /M: SY='A'; M=52,-38,-56,-57,-41,46,-60,-16,-56,-6,-18,-49,-38,-54,-60,10,21,3,-56,-58;
MA   /M: SY='A'; M=55,-31,-61,-59,-34,36,-61,-11,-58,18,-11,-53,-37,-55,-59,-15,-3,17,-66,-56;
MA   /M: SY='A'; M=53,-35,-59,-57,-27,34,-59,-30,-56,11,1,-48,-53,-51,-60,16,16,5,-50,-42;
MA   /M: SY='A'; M=47,-26,-62,-58,-23,20,-55,-6,-57,26,15,-52,-21,-49,-60,-2,8,15,-43,-45;
MA   /M: SY='A'; M=53,-26,-60,-54,-22,25,-60,-23,-56,9,9,-47,-7,-49,-58,7,7,14,-21,-42;
MA   /M: SY='L'; M=36,-28,-61,-57,11,-4,-60,8,-60,38,23,-55,-43,-52,-62,-9,14,14,-26,-38;
MA   /I: I=-23; MD=-24;
MA   /M: SY='G'; M=40,-53,-49,-54,-38,47,-46,-32,-57,-13,-21,-40,22,-39,-55,18,-4,-20,-35,-46; D=-23;
MA   /I: I=-23; MD=-24;
MA   /M: SY='G'; M=25,-21,-48,-54,-27,34,-45,-40,-52,-12,-19,-36,13,-29,-29,26,8,-27,-32,-37; D=-23;
MA   /I: I=-23; MD=-24;
MA   /M: SY='A'; M=22,6,-66,-62,-25,7,-24,-33,-54,8,-8,-32,-34,-40,-54,11,-3,-11,14,-36; D=-23;
MA   /I: I=-23; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
MA   /M: SY='M'; M=8,-27,-58,-63,13,3,-53,-26,-71,0,17,-58,-40,-52,-68,-5,-7,-23,-4,-58; D=-23;
MA   /I: I=-23; DM=-24;
MA   /M: SY='A'; M=27,-62,-47,-44,-19,-9,-43,-19,-39,19,9,-10,-43,-8,-6,-1,2,-6,-18,-44; D=-23;
MA   /I: I=-23; DM=-24;
MA   /M: SY='P'; M=-41,-75,-38,-28,-71,1,-31,-66,-28,-67,-58,-34,100,-23,-6,18,0,-59,-73,-66; D=-23;
MA   /I: I=-23; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
MA   /M: SY='A'; M=20,-55,-29,-8,-43,-11,-30,-13,-11,-15,-21,-26,-20,5,11,3,7,1,-38,-36; D=-23;
MA   /I: I=-23; DM=-24;
MA   /M: SY='A'; M=94,-93,-110,-85,-120,-60,-116,-88,-97,-54,-66,-109,-58,-30,-51,7,-34,6,-125,-117;
MA   /M: SY='W'; M=7,-49,-10,5,10,-29,27,-41,-11,-1,0,-8,3,36,16,9,1,-27,45,-15;
MA   /M: SY='A'; M=105,-109,-100,-93,-123,-72,-117,-109,-84,-110,-109,-109,-96,-81,-83,-51,-66,-94,-123,-109;
MA   /I: E1=0; IE=-205; DE=-205;
PP   /COMPETES_HIT_WITH: PS51257;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /FT_KEY=SIGNAL; /FT_DESC=Tat-type signal (Potential);
CC   /VERSION=6;
PR   PRU00648;
DO   PDOC51318;
//