ID ZF_LTAG_D1; MATRIX. AC PS51341; DT 01-NOV-2007 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Zinc finger large T-antigen (T-ag) D1-type profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=93; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=88; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8921190; R2=0.0070282; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12150.4101562; R2=8.6914349; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1083; H_SCORE=21563; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=798; H_SCORE=19086; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='E'; M=12,-1,-11,2,27,-28,-14,-10,-17,12,-11,0,-4,3,19,-6,4,-1,-14,-26,-22,24; MA /M: SY='K'; M=1,5,-30,8,13,-20,1,-19,-21,23,-19,5,0,4,6,6,-1,-10,-23,-17,-13,9; MA /M: SY='Q'; M=9,-2,-21,-4,8,-23,-9,-4,-15,1,-20,-14,1,9,29,5,6,7,-21,-28,-20,12; MA /M: SY='F'; M=-1,-22,-21,-28,-31,38,-29,-28,26,-17,16,-3,-17,-39,-29,-11,-11,0,34,-17,18,-31; MA /M: SY='N'; M=3,27,-15,10,-7,-15,-4,-6,-4,3,-13,4,51,-27,-10,-15,2,8,-16,-56,-30,-9; MA /M: SY='W'; M=-39,-39,-30,-29,-10,4,-5,-9,-26,-15,-11,-16,-50,-20,-3,8,-23,-37,-22,116,42,-9; MA /M: SY='A'; M=14,-5,-27,-7,4,-12,-11,-18,0,11,-10,10,-3,-6,8,1,0,0,1,-30,-17,3; MA /M: SY='M'; M=8,-9,-11,-10,1,-7,-15,-3,6,0,17,24,-9,-23,-6,-11,-11,0,2,-28,-2,0; MA /M: SY='I'; M=-2,-16,-12,-23,-22,10,-19,-18,39,-20,26,12,-13,-32,-22,-21,-14,2,30,-26,11,-22; MA /M: SY='S'; M=-1,-2,-1,-5,-6,-9,-12,-16,-8,-7,-6,-10,5,-16,-8,-14,12,12,-5,-26,-12,-9; MA /M: SY='D'; M=1,23,-12,39,26,-39,-14,-9,-29,7,-13,-17,9,-4,12,-6,-1,-10,-25,-29,-17,21; MA /M: SY='F'; M=-31,-30,-46,-29,-29,63,-30,-14,-5,-10,25,-15,-26,-29,-19,-5,-15,-15,10,31,62,-29; MA /M: SY='A'; M=40,0,-30,0,0,-20,0,-20,0,0,-10,10,0,-10,10,-10,10,10,10,-50,-40,0; MA /M: SY='C'; M=-11,-8,41,-14,-8,1,-24,-24,10,-20,17,4,-4,-32,-20,-18,-16,-3,4,-28,-6,-10; MA /M: SY='E'; M=3,5,-13,13,30,-28,-14,-9,-25,17,-15,-6,-4,3,17,1,4,-8,-24,-19,-15,25; MA /M: SY='I'; M=7,-6,-18,-18,-14,-8,-12,-15,23,-11,7,6,5,-19,1,-17,-4,8,13,-35,-12,-10; MA /M: SY='N'; M=0,27,-22,17,-1,-19,5,-16,-12,9,-18,-2,40,-14,-9,-11,0,-2,-21,-43,-27,-5; MA /M: SY='C'; M=-16,-19,80,-32,-7,-14,-26,-34,15,-25,12,-4,-7,-30,-20,-24,-16,-10,6,-24,-32,-13; MA /M: SY='D'; M=6,16,-20,28,5,-30,-11,-15,-19,0,-10,-16,5,-5,-3,-16,16,14,-10,-36,-14,1; MA /M: SY='D'; M=0,50,-30,90,10,-50,-10,-20,-40,0,-10,-30,10,-10,-10,-10,0,-10,-20,-40,-10,0; MA /M: SY='V'; M=13,-14,-25,-14,-12,-11,-15,-17,15,-7,-4,-5,-14,4,-10,-12,-4,7,17,-36,-14,-14; MA /M: SY='Y'; M=-18,-17,-17,-15,-16,32,-24,-10,11,-16,35,8,-23,-29,-19,-14,-19,-5,10,0,44,-16; MA /M: SY='L'; M=-11,-13,-4,-16,-14,31,-21,-13,17,-19,37,14,-19,-31,-21,-19,-19,-3,10,-16,30,-14; MA /M: SY='L'; M=-9,-11,-2,-13,-12,18,-19,-11,24,-20,38,19,-18,-30,-20,-21,-19,0,13,-21,26,-12; MA /M: SY='M'; M=-1,-15,-9,-19,-10,2,-20,4,15,-2,31,38,-11,-35,-15,-11,-20,0,5,-25,12,-10; MA /M: SY='G'; M=17,0,-36,-6,-12,-26,46,-26,-6,-6,-16,-7,0,-10,-7,-16,4,-7,-13,-15,-34,-12; MA /M: SY='I'; M=-5,-17,-17,-22,-19,9,-20,-11,30,-14,27,16,-14,-32,-19,-17,-16,0,23,-19,17,-19; MA /M: SY='Y'; M=-40,-30,-60,-10,-20,30,-30,0,-10,-10,30,-10,-40,-20,-10,0,-20,-10,10,50,90,-20; MA /M: SY='M'; M=-5,-7,-15,-10,-1,5,-15,-15,9,4,13,19,-9,-14,-12,-9,-11,-4,2,-21,9,-5; MA /M: SY='D'; M=-2,11,-16,30,17,-34,-16,-10,-32,8,-14,-14,-6,-4,19,21,-4,-17,-21,-18,-9,17; MA /M: SY='F'; M=-13,-23,-20,-36,-28,62,-26,-18,7,-9,25,2,-11,-37,-24,-11,-14,-12,9,-4,24,-28; MA /M: SY='A'; M=21,-2,-24,-4,2,-20,-7,-13,-7,-1,-14,-4,-1,-6,20,-3,14,15,-4,-36,-24,5; MA /M: SY='I'; M=7,-9,-17,-12,-2,-12,-18,-16,8,-3,-3,-2,-7,-13,3,-7,1,8,8,-26,-7,-1; MA /M: SY='P'; M=3,5,-16,2,16,-26,-8,-5,-17,12,-19,-9,11,23,3,-10,-1,-2,-24,-37,-27,10; MA /M: SY='P'; M=0,-17,-25,-13,-8,-21,-18,-8,-3,-3,-12,-21,-21,45,-10,-13,-5,11,-3,-33,-9,-11; MA /M: SY='D'; M=-3,9,-18,24,16,-34,-2,-9,-24,3,-9,-20,-8,17,-3,-13,-5,-10,-24,-22,-12,9; MA /M: SY='E'; M=7,3,-15,2,23,-22,-10,-10,-17,16,-16,1,5,0,14,0,4,-4,-19,-26,-21,19; MA /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30,10,-30,-40,-50,-20,-30,0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,0; MA /M: SY='P'; M=0,-5,-25,-6,11,-20,2,-13,-13,16,-16,-3,-6,17,-3,-5,2,-7,-19,-19,-16,3; MA /M: SY='K'; M=1,4,-23,12,18,-18,-14,-18,-17,24,-13,6,-3,1,-2,2,-1,-9,-13,-23,-9,10; MA /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30,10,-30,-40,-50,-20,-30,0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,0; MA /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; MA /M: SY='E'; M=3,8,-11,13,20,-23,-15,-12,-14,10,-10,-7,4,-7,-1,-8,2,-5,-12,-27,-15,13; MA /M: SY='K'; M=1,9,-18,4,16,-14,-8,-14,-15,23,-19,6,18,-2,-1,-2,5,-3,-20,-32,-20,8; MA /M: SY='R'; M=-4,4,-21,11,10,-22,-12,-10,-25,16,-19,-5,1,10,7,17,-4,-13,-21,-24,-13,6; MA /M: SY='R'; M=0,-3,-16,6,16,-25,-17,-6,-24,15,-12,2,-8,-5,20,24,-6,-15,-19,-15,-9,16; MA /M: SY='Q'; M=-4,-5,-19,3,6,-22,-20,10,-20,0,-8,-1,-10,-5,18,17,-6,-10,-15,-21,-3,10; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='T'; M=6,1,-20,-3,1,-14,-9,-10,-7,3,-10,-3,5,4,3,-8,5,10,-11,-36,-15,0; MA /M: SY='N'; M=2,3,-15,-9,-8,-1,-13,-15,1,-3,-4,-6,19,-15,-7,-20,9,14,-2,-37,-14,-8; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; MA /M: SY='H'; M=-20,-20,-50,-20,0,-30,-30,140,-20,-20,-10,20,-10,10,0,-10,-10,-20,-30,-50,0,0; MA /M: SY='F'; M=-17,-18,-24,-24,-21,28,-17,-19,4,-10,10,-5,-10,-28,-12,-2,-13,-14,5,13,21,-20; MA /M: SY='N'; M=-2,13,-17,15,9,-20,-11,-12,-22,13,-17,-2,16,-8,6,14,-2,-11,-19,-29,-17,6; MA /M: SY='H'; M=-14,5,-33,14,-6,-6,-20,24,-16,-10,3,-5,0,-14,-11,-11,-9,-10,-12,-26,12,-9; MA /M: SY='H'; M=-20,-20,-50,-20,0,-30,-30,140,-20,-20,-10,20,-10,10,0,-10,-10,-20,-30,-50,0,0; MA /M: SY='K'; M=6,-7,-22,-6,9,-22,-13,-7,-15,16,-12,6,-7,13,6,2,-1,0,-13,-28,-16,6; MA /M: SY='K'; M=5,-3,-18,-1,16,-19,-14,-14,-18,19,-14,6,-4,3,10,8,3,-4,-13,-23,-15,13; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='H'; M=-20,-20,-50,-20,0,-30,-30,140,-20,-20,-10,20,-10,10,0,-10,-10,-20,-30,-50,0,0; MA /M: SY='H'; M=-5,-14,-37,-13,0,-20,-23,48,-14,-10,-6,5,-10,0,21,0,-5,-1,-16,-27,3,7; MA /M: SY='H'; M=-3,-11,-23,-8,10,-13,-19,18,-9,5,4,14,-11,-8,0,-6,-8,-8,-9,-19,3,6; MA /M: SY='N'; M=0,40,-10,10,-10,-10,0,-10,0,0,-20,0,80,-30,-10,-20,0,10,-20,-70,-40,-10; MA /M: SY='A'; M=40,0,-30,0,0,-20,0,-20,0,0,-10,10,0,-10,10,-10,10,10,10,-50,-40,0; MA /M: SY='C'; M=-5,-3,9,0,4,-8,-17,-16,-6,-5,5,0,-9,-16,-2,-7,-5,-2,-9,-22,-4,1; MA /M: SY='L'; M=-6,-13,-5,-17,-12,12,-19,-7,24,-14,35,24,-15,-31,-19,-18,-19,0,12,-23,19,-12; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-30,-50,-40,100,-30,-30,0,-10,20,-20,-10,-40,-30,-10,-10,-20,10,10,30,-40; MA /M: SY='L'; M=7,-6,-12,-6,-3,1,-13,-11,7,-10,14,9,-12,-19,1,-10,-5,5,2,-27,3,-1; MA /M: SY='D'; M=3,18,-25,31,13,-36,-14,11,-25,0,-12,-10,7,-5,10,-5,-2,-7,-21,-37,-16,11; MA /M: SY='C'; M=-3,-9,22,-14,-4,-8,-13,-20,3,-12,-1,-10,-5,-20,-15,-17,12,6,-2,-27,-20,-11; MA /M: SY='R'; M=-4,-8,-26,-4,9,-10,-14,-16,-24,29,-20,12,-8,2,11,36,-4,-18,-16,-12,-6,6; MA /M: SY='N'; M=12,17,-17,16,5,-24,-7,-14,-12,2,-12,-6,20,-11,0,-15,10,9,-10,-45,-26,2; MA /M: SY='Q'; M=10,-10,-20,-10,20,-30,-20,0,-20,0,-20,-10,-10,0,80,30,-10,0,-30,-10,-10,40; MA /M: SY='K'; M=0,0,-30,0,20,-10,-10,-20,-20,40,-20,20,0,10,0,10,0,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='N'; M=2,4,-18,-4,-12,-13,-13,-13,-10,0,-13,-2,17,-12,5,7,9,13,-6,-38,-16,-7; MA /M: SY='I'; M=5,-16,-18,-27,-23,1,-13,-20,43,-17,18,10,-5,-28,-17,-23,-9,3,32,-31,-6,-23; MA /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30,10,-30,-40,-50,-20,-30,0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,0; MA /M: SY='Q'; M=9,-4,-19,-7,16,-27,-17,-1,-17,0,-20,-9,2,-4,68,24,-9,1,-29,-18,-14,34; MA /M: SY='Q'; M=2,-10,13,-10,24,-31,-23,-8,-21,-2,-16,-12,-10,-3,56,17,-10,-6,-28,-12,-19,35; MA /M: SY='A'; M=40,0,-30,0,0,-20,0,-20,0,0,-10,10,0,-10,10,-10,10,10,10,-50,-40,0; MA /M: SY='V'; M=7,-18,4,-22,-22,1,-26,-30,31,-19,8,0,-14,-35,-24,-14,-9,5,36,-31,-6,-23; MA /M: SY='D'; M=4,45,-30,81,9,-47,-9,-20,-36,0,-10,-26,9,-10,-8,-10,1,-8,-17,-41,-13,0; MA /M: SY='A'; M=18,-4,-25,-7,-8,-18,-3,-19,0,-6,-8,-2,-1,-10,7,-11,9,17,3,-34,-20,-4; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='V'; M=9,-18,-18,-18,-27,9,-27,-27,36,-18,9,0,-18,-36,-27,-9,-9,9,45,-27,9,-27; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='L'; M=-2,-11,-8,-16,-13,10,-15,-14,27,-18,29,16,-13,-28,-16,-21,-14,1,17,-26,12,-13; MA /M: SY='A'; M=40,0,-30,0,0,-20,0,-20,0,0,-10,10,0,-10,10,-10,10,10,10,-50,-40,0; MA /M: SY='E'; M=7,-1,-16,2,27,-22,-12,-11,-19,21,-16,3,-4,4,15,2,4,-6,-19,-21,-18,22; MA /M: SY='R'; M=-5,-13,-23,-7,2,-12,-17,-12,-26,17,-20,4,-13,-3,28,54,-7,-21,-15,-7,-4,8; MA /M: SY='R'; M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30,10,-20,0,-20,-10,30,80,-10,-30,-10,0,0,0; MA /M: SY='F'; M=-6,-19,-16,-25,-26,40,-26,-23,21,-17,24,1,-17,-36,-26,-14,-14,-2,24,-15,23,-26; MA /M: SY='D'; M=-2,21,-28,42,11,-29,-12,-18,-31,16,-15,-7,2,-3,0,11,-2,-13,-18,-27,-8,4; MA /M: SY='T'; M=5,-7,-15,-11,-7,-7,-12,-4,3,-1,6,11,-3,-20,-11,-13,9,15,0,-31,-5,-10; MA /M: SY='I'; M=10,-10,-19,-12,-11,1,-15,-20,19,-7,10,12,-10,-22,-12,-12,-6,4,19,-31,-3,-12; MA /M: SY='T'; M=3,1,-16,-4,6,-26,-19,8,-11,-2,-8,-1,9,0,12,-15,6,15,-12,-39,-15,10; MA /M: SY='M'; M=-2,-19,26,-27,-5,-17,-25,0,4,3,18,37,-5,-36,-14,-7,-20,-5,-3,-26,-16,-8; MA /M: SY='T'; M=10,0,-20,-8,-15,-18,-15,-18,-2,-8,-5,-5,8,-2,-2,-25,25,43,5,-45,-12,-10; MA /M: SY='R'; M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30,10,-20,0,-20,-10,30,80,-10,-30,-10,0,0,0; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=20(20); /POSITIVE=20(20); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=T-ag D1-type; CC /VERSION=6; DR P13894 , LT_BFPYV , T; P14999 , LT_POVBA , T; DR P0DOJ4 , LT_POVBG , T; P03071 , LT_POVBK , T; DR P24851 , LT_POVBO , T; P03075 , LT_POVHA , T; DR P03072 , LT_POVJC , T; P0DOI7 , LT_POVK3 , T; DR P0DOI6 , LT_POVK6 , T; P0DOI5 , LT_POVKI , T; DR P04008 , LT_POVLY , T; P0DOJ6 , LT_POVM1 , T; DR P0DOJ5 , LT_POVM3 , T; P03073 , LT_POVMA , T; DR P12905 , LT_POVMC , T; P24597 , LT_POVMK , T; DR Q3L6L5 , LT_POVS1 , T; A8Y984 , LT_POVSM , T; DR A5HBG1 , LT_POVWU , T; P03070 , LT_SV40 , T; 3D 1N25; 1SVL; 1SVM; 1SVO; 2H1L; 4E2I; 4GDF; 5J40; 5J47; 5J4V; 5J4Y; PR PRU00671; PRU50000; DO PDOC51341; //