ID HTH_TFE_IIE; MATRIX. AC PS51344; DT 01-DEC-2007 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE TFE/IIEalpha-type HTH domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=89; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=84; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7896526; R2=0.0077522; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=13692.6064453; R2=1.8483009; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=737; H_SCORE=15055; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=479; H_SCORE=14578; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-92; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; MA /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; MA /M: SY='M'; M=27,-14,14,-24,27,-91,-215,-8,-52,18,44,30,-64,-215,-94,-212,-62,4,-223,12; MA /M: SY='N'; M=-93,-228,35,1,-227,-218,-48,-6,62,-62,-216,63,-30,1,-12,-17,-207,-25,-235,-219; MA /M: SY='P'; M=-94,-229,35,26,-42,-219,-209,-227,23,-226,-3,-1,42,19,42,14,19,-224,-232,-219; MA /M: SY='L'; M=16,-220,-227,-14,-43,-229,-221,-10,-29,74,-46,-227,-53,-217,-221,-63,-211,13,-225,-208; MA /M: SY='V'; M=4,-221,-231,-225,-31,-231,-57,48,-32,32,-30,-225,-228,-222,-223,-217,-39,64,-225,2; MA /M: SY='R'; M=-96,-230,-212,-25,-34,-225,-27,-44,57,2,-207,-37,-222,48,76,-83,-212,-54,-222,-12; MA /M: SY='C'; M=-10,45,-7,14,22,-30,-210,-23,2,-10,38,-44,-222,28,-32,-2,-11,-74,-217,43; MA /M: SY='V'; M=-25,10,-229,-53,-29,-231,-219,27,-223,5,-8,-226,-30,-222,-224,-217,-207,74,-216,64; MA /M: SY='V'; M=40,-218,-228,-222,-42,-108,-225,23,-70,15,33,-221,-225,-219,-223,-82,7,66,-229,-211; MA /M: SY='R'; M=-216,-230,-213,-7,-28,-60,22,-100,0,-20,-208,-209,-224,-3,95,-55,-65,-17,-219,37; MA /M: SY='K'; M=19,-223,16,7,-224,36,-212,-28,37,-25,28,-8,-218,-29,-6,11,-22,-214,-229,-218; MA /M: SY='F'; M=-86,-221,-234,-228,102,-231,-219,19,-44,24,33,-225,-231,-226,-62,-23,-213,-25,-203,-183; MA /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71; MA /M: SY='Y'; M=-59,-227,-224,-225,29,-24,-17,7,-219,-27,-16,-47,-230,-216,-218,-216,-73,17,-192,115; MA /M: SY='D'; M=-206,-10,74,36,-233,70,-212,-235,-209,-91,-226,-197,-28,-206,-217,9,-72,-229,-234,-224; MA /M: SY='D'; M=-75,-224,66,42,-224,-48,-209,7,9,-38,-215,11,-13,-202,-66,24,29,-60,-235,-218; MA /M: SY='E'; M=-66,-230,35,81,-225,-221,-21,-36,15,-222,-217,-70,37,-23,-12,-17,-82,-21,-228,0; MA /I: I=-17; MI=0; MD=-44; IM=0; DM=-44; MA /M: SY='H'; M=50,-222,-34,1,-72,34,79,-214,-48,-215,-17,-56,-220,-32,-213,-72,-209,12,-221,47; MA /M: SY='I'; M=11,-221,-226,-43,2,-228,-224,60,-12,-13,23,-221,-224,-216,4,-49,-74,58,-225,-207; MA /M: SY='L'; M=-36,-223,-16,12,-208,-84,-24,15,22,40,31,-40,-6,-75,17,-214,-208,36,-227,-210; MA /M: SY='V'; M=-26,-219,-232,-227,-49,-232,-231,67,-224,-15,5,-225,-226,-224,-226,-216,-27,82,-17,-208; MA /M: SY='L'; M=-9,-219,-233,-226,24,-64,-222,40,-225,57,54,-227,-228,-221,-224,-219,-209,44,-221,-202; MA /M: SY='D'; M=-67,-229,98,48,-228,-78,-24,-230,6,-82,-49,-11,-215,-49,1,-35,-207,-227,-236,-8; MA /M: SY='A'; M=68,4,-217,-21,-45,-35,9,1,-32,-2,37,-43,-220,-74,-34,-31,-33,0,-225,-50; MA /M: SY='L'; M=-216,-220,-234,-227,24,-85,-219,26,-82,83,24,-230,-42,-221,-224,-225,-212,-30,-218,-200; MA /I: I=-15; MD=-38; MA /M: SY='T'; M=-56,-15,-229,-39,-27,-234,-223,39,-225,35,34,-224,-26,-222,-227,-217,45,11,-225,27; D=-15; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-38; IM=0; DM=-38; MA /M: SY='R'; M=-74,-227,-77,-4,9,-65,-208,2,28,-65,-42,-6,39,-11,79,-44,-1,-58,-222,-32; MA /M: SY='H'; M=-23,-226,23,27,-49,-12,84,-226,32,-104,-55,42,-217,-5,24,-85,-39,-223,-225,29; MA /M: SY='Q'; M=-57,-7,-204,27,-227,40,-209,-82,1,-74,-215,-9,24,57,-23,43,14,-56,-228,-218; MA /M: SY='W'; M=-12,72,1,67,-214,-71,-218,-17,-78,-42,-211,-81,-7,-204,-26,-55,-210,27,99,-210; MA /M: SY='V'; M=-21,-218,-229,-70,-23,-230,-18,32,-221,39,60,-224,-226,-219,-76,-216,-50,68,-224,-9; MA /M: SY='T'; M=-40,-218,-46,-204,-218,-215,0,-69,29,-66,-211,-40,-13,-201,48,42,79,-52,-229,-34; MA /M: SY='D'; M=-60,-229,100,82,-233,-218,-203,-231,-198,-67,-225,-193,-88,-194,-208,-205,-48,-226,-240,-220; MA /M: SY='E'; M=-74,-228,70,96,-230,-221,-204,-56,-1,-74,-221,-199,-209,-190,-48,-205,-5,-222,-234,-220; MA /M: SY='D'; M=-82,-229,97,63,-232,-217,19,-228,-67,-226,-222,-39,-213,26,-17,-55,-57,-37,-240,-217; MA /M: SY='L'; M=-214,-220,-233,-227,-193,-235,-221,65,-226,77,39,-229,-228,-220,-225,-224,-54,-31,-222,-204; MA /M: SY='A'; M=83,18,-215,-25,-220,4,-35,-55,-16,-30,-9,-209,-217,-208,-214,1,-37,-18,-226,-218; MA /M: SY='E'; M=-25,-225,-20,66,-53,-219,23,-24,41,-13,-209,4,-214,23,5,-8,-23,-214,-223,13; MA /M: SY='L'; M=-32,-222,17,34,-62,-222,-210,-19,27,54,-51,-32,-220,-1,18,5,-72,-95,-225,-210; MA /M: SY='L'; M=-66,-217,-226,-221,-197,-228,-218,7,-220,75,44,-220,-224,-216,-221,-22,51,-11,-225,-205; MA /M: SY='G'; M=-205,-225,-15,-17,-229,69,-10,-231,57,-229,-21,44,-216,4,-2,-12,-208,-227,-227,-219; MA /M: SY='M'; M=-212,-220,-231,-225,43,-232,-217,62,-55,35,76,-223,-226,-219,-62,-219,-27,25,-214,11; MA /M: SY='N'; M=-209,-224,42,7,-226,-82,29,-224,53,-44,-40,59,15,39,-16,27,-202,-223,-231,-214; MA /M: SY='L'; M=-20,-222,-46,-18,-27,-221,-211,12,26,32,-199,-58,19,28,32,-4,18,-14,-223,-44; MA /M: SY='N'; M=-34,-221,-196,-198,-226,-209,-201,-69,83,-226,-215,94,-23,-25,-10,-62,-9,-221,-230,-217; MA /M: SY='Q'; M=-64,-225,39,62,-59,-219,-17,-9,-6,-97,19,-38,-213,71,-18,-39,19,-16,-227,-39; MA /M: SY='V'; M=-74,-20,-230,-225,-197,-232,-225,32,-224,61,-185,-226,-227,-222,-224,-217,-4,73,-227,-206; MA /M: SY='R'; M=-215,13,-40,-202,-225,-26,20,-232,-177,-225,-214,-43,-224,-192,118,-209,-215,-226,-227,-212; MA /M: SY='K'; M=-29,-226,-40,-21,-49,-218,0,-224,77,-46,-212,-74,-24,27,64,12,-49,-221,-224,-212; MA /M: SY='I'; M=13,-8,-224,-220,-201,-226,-13,69,-36,33,-191,-217,-223,-59,-36,-94,34,4,-223,5; MA /M: SY='L'; M=-71,63,-233,-227,-194,-233,-221,30,-226,84,-16,-228,-232,-221,-226,-222,-52,-60,-224,-206; MA /M: SY='Y'; M=11,-223,-210,-26,25,9,3,-60,-204,-211,-26,33,-222,23,24,-20,-1,-74,-205,85; MA /M: SY='K'; M=-22,-222,-16,-205,20,-82,-30,7,55,-17,-55,-17,-219,-7,29,-18,39,-57,-217,28; MA /M: SY='L'; M=-217,-219,-234,-226,19,-235,-217,-182,-227,95,-3,-232,-233,-221,-224,-226,-213,-190,-217,-199; MA /M: SY='Y'; M=-35,-227,-204,50,-35,-71,36,-215,40,-51,15,-26,-218,-32,40,-49,-210,-30,-210,76; MA /M: SY='E'; M=-42,-32,50,85,-230,-12,-205,-230,20,-73,-220,-9,-211,-36,17,-39,-60,-224,-231,-220; MA /M: SY='D'; M=10,-226,79,25,-226,-214,48,-77,-9,-72,20,37,-216,46,-41,-203,-207,-76,-235,-54; MA /M: SY='R'; M=-74,-227,-48,-202,-225,43,-42,-227,64,-74,20,3,-218,-26,75,-37,-210,-223,-225,-215; MA /M: SY='L'; M=-217,-220,-235,-228,68,-234,-219,36,-227,71,46,-229,-231,-223,-225,-225,-212,-49,-212,-192; MA /M: SY='V'; M=41,-15,-229,-223,-204,-224,-228,58,-222,18,-191,-223,-225,-220,-225,-65,-204,68,-228,-210; MA /M: SY='K'; M=0,-220,9,-13,-220,-7,-211,-14,41,-98,23,-24,-216,-20,22,26,37,7,-229,-215; MA /M: SY='Y'; M=-211,44,-64,-20,-11,-77,-203,-23,-54,-207,-204,-37,-226,-46,54,9,-51,31,-205,92; MA /M: SY='H'; M=-55,13,6,-57,-39,-221,79,-22,26,-216,-209,-22,-221,-38,78,-35,-63,-15,-225,20; MA /M: SY='R'; M=-210,-224,-55,-12,-69,-220,52,-48,32,-44,23,-39,-218,19,69,8,40,-43,-227,-34; MA /M: SY='R'; M=-96,-226,-205,36,-221,-42,-30,1,29,-80,-208,-7,-217,52,65,-46,3,15,-28,-213; MA /M: SY='R'; M=-75,-226,-211,-52,-57,-222,-207,-215,64,-48,-5,-205,8,-3,78,-40,17,-8,-223,-23; MA /M: SY='E'; M=-39,-226,73,81,-230,-216,5,-225,-47,-225,-220,37,-212,-32,-62,-51,-17,-20,-237,-219; MA /M: SY='E'; M=-69,-224,11,47,-43,-72,-209,-31,45,-33,9,3,38,-50,-202,1,32,-28,-226,-14; MA /M: SY='D'; M=20,-223,51,48,-228,-20,-206,-60,-33,-224,-217,37,-24,24,23,-22,21,-218,-232,-219; MA /I: I=-13; MD=-32; MA /M: SY='E'; M=-9,-251,-11,31,-249,-10,-21,-56,-3,-74,-239,-35,22,-59,-63,-84,-79,-90,-252,-60; D=-13; MA /I: I=-13; MD=-32; MA /M: SY='W'; M=-64,-253,35,-230,-248,24,-236,-52,-47,-51,-243,31,-247,-33,-8,-230,-237,-248,44,-241; D=-13; MA /I: I=-13; MD=-32; MA /M: SY='Q'; M=-4,-246,-40,-229,-40,11,-232,-245,-46,-244,6,18,-15,34,-23,-9,-22,-242,-251,-239; D=-13; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='H'; M=-70,-247,-46,-234,-70,-248,46,-7,-80,-65,-226,-10,-247,16,-23,-231,13,21,-253,-12; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-32; MA /M: SY='T'; M=-231,-245,-224,-1,-247,-238,-22,-245,19,-78,-47,34,-239,-51,-1,3,37,-240,-257,-240; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-32; MA /M: SY='H'; M=-210,-224,-213,-209,-33,-221,63,-24,13,-218,-212,-204,-43,-204,54,43,56,-20,-229,8; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-32; MA /M: SY='N'; M=-204,-50,-204,-2,-218,53,-208,-23,-27,-220,-53,56,-217,13,-62,31,35,-29,-225,19; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-32; MA /M: SY='W'; M=-73,-231,-223,-217,-43,-222,44,-210,-34,-41,-205,-218,-226,-208,20,-10,-44,-20,134,98; MA /M: SY='Y'; M=-215,59,-46,-220,35,-226,-202,2,-217,20,-38,-21,1,-216,-217,-212,18,-64,-197,104; MA /M: SY='Y'; M=-208,48,-212,11,31,-222,11,-20,-18,-81,-202,-209,-220,-209,-56,5,55,23,-207,82; MA /M: SY='Y'; M=-215,-226,-223,-222,-51,-229,27,67,-218,13,-191,-219,-226,-46,-217,-55,-17,-58,38,105; MA /M: SY='Y'; M=-91,-222,61,-202,-51,-215,47,-211,-16,16,-205,57,-23,-204,-61,-23,11,-213,-214,77; MA /M: SY='W'; M=-69,13,-232,-225,8,-223,-212,-83,-218,-57,-208,-228,-229,-216,-218,-37,-79,-57,153,99; MA /M: SY='R'; M=10,37,-46,-37,-213,-54,48,-43,39,-76,-209,-203,-1,-28,69,-46,19,-214,-220,37; MA /M: SY='Q'; M=-25,-222,-217,-25,15,-224,13,46,-36,29,-44,-213,14,56,-14,-35,1,14,-221,-203; MA /M: SY='N'; M=16,-17,53,-10,13,-213,-74,-8,-27,-33,-207,58,-218,-48,-14,-36,23,16,-228,-40; MA /M: SY='Y'; M=-211,-22,5,-70,-24,-225,-209,50,-213,13,-44,-35,15,-25,-7,-16,-34,24,-15,76; MA /M: SY='D'; M=-39,-225,93,48,-77,-88,-12,-227,-2,-99,-10,47,-213,-49,-10,-33,-34,-223,-237,-216; MA /M: SY='V'; M=24,-218,0,10,-216,-72,-4,-11,31,-70,-204,33,-71,14,-33,-13,-11,53,-230,-213; MA /M: SY='I'; M=-54,-15,-228,-226,-1,-230,-226,85,-223,7,-19,-6,-224,-221,-225,-55,-38,55,-224,-204; MA /M: SY='K'; M=-25,33,-15,10,-220,-217,-51,-16,70,-37,-210,35,34,-63,41,-60,-73,-85,-225,-32; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=60(60); /POSITIVE=60(60); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=A?E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HTH TFE/IIEalpha-type; CC /VERSION=5; DR A0A2Z4HPY1, EFUD_HORCR , T; A6QLI8 , T2EA_BOVIN , T; DR Q557M8 , T2EA_DICDI , T; P29083 , T2EA_HUMAN , T; DR Q9D0D5 , T2EA_MOUSE , T; Q5R8H5 , T2EA_PONAB , T; DR Q9P3W1 , T2EA_SCHPO , T; P36100 , T2EA_YEAST , T; DR Q9YAD5 , TFE_AERPE , T; O29501 , TFE_ARCFU , T; DR A8M8Z5 , TFE_CALMQ , T; A0RYF4 , TFE_CENSY , T; DR Q5V3R0 , TFE_HALMA , T; Q9HRC7 , TFE_HALSA , T; DR Q18HD8 , TFE_HALWD , T; A2BLW2 , TFE_HYPBU , T; DR A8ABJ9 , TFE_IGNH4 , T; A6UW55 , TFE_META3 , T; DR Q8TJB7 , TFE_METAC , T; Q0W8N8 , TFE_METAR , T; DR A7I7T6 , TFE_METB6 , T; Q46G12 , TFE_METBF , T; DR Q12YV9 , TFE_METBU , T; Q2FT22 , TFE_METHJ , T; DR Q58187 , TFE_METJA , T; Q8TY11 , TFE_METKA , T; DR A2SQM6 , TFE_METLZ , T; A4G0F7 , TFE_METM5 , T; DR A6VI24 , TFE_METM7 , T; Q8PZ06 , TFE_METMA , T; DR A3CVQ3 , TFE_METMJ , T; Q6M181 , TFE_METMP , T; DR A5UKV8 , TFE_METS3 , T; A4YJ15 , TFE_METS5 , T; DR Q2NEV4 , TFE_METST , T; O27705 , TFE_METTH , T; DR A0B9P3 , TFE_METTP , T; A6UR14 , TFE_METVS , T; DR Q74MZ3 , TFE_NANEQ , T; Q3IP08 , TFE_NATPD , T; DR Q9UYS6 , TFE_PYRAB , T; Q8ZYH0 , TFE_PYRAE , T; DR A4WGY5 , TFE_PYRAR , T; A3MY45 , TFE_PYRCJ , T; DR Q8U3H5 , TFE_PYRFU , T; O58353 , TFE_PYRHO , T; DR A1RTG5 , TFE_PYRIL , T; B1YA16 , TFE_PYRNV , T; DR Q980M5 , TFE_SACS2 , T; A3DN07 , TFE_STAMF , T; DR Q4JAZ3 , TFE_SULAC , T; C3MZJ0 , TFE_SULIA , T; DR C4KIS0 , TFE_SULIK , T; C3MRF5 , TFE_SULIL , T; DR C3MY51 , TFE_SULIM , T; C3NFW2 , TFE_SULIN , T; DR C3N7L2 , TFE_SULIY , T; Q975T8 , TFE_SULTO , T; DR Q5JDD5 , TFE_THEKO , T; A1RY32 , TFE_THEPD , T; 3D 1Q1H; 5FMF; 5FYW; 5FZ5; 5GPY; 5IY6; 5IY7; 5IY8; 5IY9; 5IYA; 5IYB; 5IYC; 3D 5IYD; 5OQJ; 5OQM; 5SVA; 6GYL; 6GYM; 6KF4; 6KF9; 6O9L; 6PLN; 6XJF; 7EG9; 3D 7EGA; 7EGB; 7EGC; 7ENA; 7ENC; 7LBM; 7ML0; 7ML1; 7ML2; 7ML4; 7NVR; 7NVS; 3D 7NVT; 7NVU; 7NVV; 7NVW; 7NVX; 7NVY; 7NVZ; 7NW0; 7O4I; 7O4J; 7O4K; 7O4L; 3D 7O72; 7O73; 7O75; 7ZS9; 7ZSA; 7ZSB; 8BVW; 8BYQ; 8CEN; 8CEO; 8GXQ; 8GXS; 3D 8WAK; 8WAL; 8WAN; 8WAO; 8WAP; 8WAQ; 8WAR; 8WAS; PR PRU00676; DO PDOC51344; //