ID TFIIE_BETA_C; MATRIX. AC PS51351; DT 01-DEC-2007 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE TFIIE beta central core DNA-binding domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=77; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=72; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.5422181; R2=0.0149058; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5198.2871094; R2=2.4616542; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=607; H_SCORE=6693; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=473; H_SCORE=6363; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-5; D=-30; I=-30; B1=-500; E1=-500; MI=-50; MD=-50; IM=-50; DM=-50; MA /I: B1=0; BI=-50; BD=-50; MA /M: SY='A'; M=12,-5,-28,2,0,-18,-8,-11,-14,2,-14,-8,-9,5,9,5,6,2,-7,-27,-16,-1; MA /M: SY='T'; M=8,-2,-18,-3,-7,-8,-14,-18,8,-5,1,1,-1,-17,-10,-14,4,10,10,-35,-9,-9; MA /M: SY='N'; M=3,9,-19,3,1,-22,-7,0,-12,-2,-14,-7,18,-8,7,-11,8,10,-16,-39,-20,3; MA /M: SY='G'; M=-3,-5,-33,-9,-8,-28,32,-6,-16,-3,-21,-18,-3,14,-4,-7,-1,-11,-29,-11,-23,-9; MA /I: I=-7; MD=-12; MA /M: SY='I'; M=6,-10,-15,-17,-13,1,-11,-10,18,-5,10,11,-3,-19,-9,-12,-5,4,15,-22,-5,-13; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-12; MA /M: SY='N'; M=-2,15,-14,15,0,-5,-6,-11,-10,5,-7,-4,16,-9,-6,-5,-1,-3,-10,-23,-8,-4; D=-7; MA /I: I=-7; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; MA /M: SY='I'; M=0,-4,-12,-8,-10,0,1,-14,10,-6,5,3,-3,-15,-13,-10,-6,-1,5,-14,0,-11; D=-7; MA /I: I=-7; DM=-12; MA /M: SY='T'; M=3,-6,-21,-3,-9,-9,-18,-16,-2,-5,-4,-8,-8,-14,-5,-1,8,10,8,-24,-1,-9; MA /M: SY='G'; M=6,5,-29,-3,-6,-20,30,-20,-10,1,-19,-9,11,-10,-5,-10,7,-4,-21,-19,-27,-7; MA /M: SY='S'; M=4,-2,-18,-4,-4,-14,-8,-14,-10,1,-9,-2,2,-8,3,1,10,9,-6,-28,-13,-3; MA /M: SY='H'; M=-9,-2,-33,-3,1,-24,-20,49,-16,-5,-10,3,5,7,-1,-13,-3,-2,-20,-41,-7,0; MA /M: SY='V'; M=7,-3,-21,-4,-10,-5,-12,-16,8,-6,6,7,-2,-19,-6,-9,-4,4,10,-31,-5,-10; MA /M: SY='F'; M=1,-11,-24,-18,-16,22,-14,-15,5,-6,8,0,-3,-25,-13,-12,0,0,6,-20,2,-17; MA /M: SY='T'; M=10,-4,-26,-7,-14,-13,-10,-18,-1,-7,-3,-4,0,-8,-4,-19,16,28,7,-34,-8,-11; MA /M: SY='Q'; M=6,-10,-25,-8,5,-15,-18,-11,-10,5,-11,0,-10,-5,32,16,-5,1,-9,-16,-3,13; MA /M: SY='I'; M=-1,-17,-14,-23,-17,10,-21,-13,26,-13,22,14,-12,-31,-13,-13,-15,1,19,-22,10,-16; MA /M: SY='M'; M=5,-7,-24,-10,-5,-11,-17,10,0,-3,3,15,-5,-9,-4,-12,-1,8,1,-37,-5,-5; MA /M: SY='Y'; M=-15,-15,-35,-15,-10,7,-17,4,-1,-3,5,4,-11,-14,-9,-7,-10,-9,-1,1,20,-11; MA /M: SY='A'; M=22,-8,-25,-13,-11,-11,-11,-20,17,-8,-1,6,-4,-18,1,-12,1,10,20,-39,-20,-9; MA /M: SY='I'; M=4,-17,-18,-26,-27,3,-20,-23,42,-19,15,6,-8,-30,-22,-21,-7,10,38,-32,1,-26; MA /M: SY='E'; M=3,15,-9,25,30,-33,-12,-9,-24,12,-13,-10,7,-2,6,-10,3,-9,-22,-28,-21,22; MA /M: SY='Y'; M=-25,-23,-38,-18,-15,21,-23,6,-7,-9,15,-2,-25,-17,-11,-7,-13,-9,0,20,44,-15; MA /M: SY='L'; M=-2,-14,-11,-20,-14,4,-16,-5,24,-9,26,24,-9,-31,-17,-17,-13,2,12,-25,8,-14; MA /M: SY='K'; M=-1,-8,-24,-8,12,-7,-16,-13,-18,24,-13,11,-5,-2,12,18,-5,-12,-17,-14,-6,10; MA /M: SY='K'; M=6,5,-22,5,11,-22,-5,-15,-16,12,-15,0,5,0,9,-3,5,2,-16,-27,-17,9; MA /M: SY='R'; M=-3,-11,-27,-10,2,-15,-17,4,-15,11,-14,8,-8,-1,17,25,-5,-11,-13,-19,-6,5; MA /I: I=-7; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; MA /M: SY='D'; M=1,13,-26,20,-6,-19,-1,-18,-18,-2,-11,-13,8,-14,0,3,-2,-7,-12,-26,-13,-6; MA /M: SY='W'; M=-9,-15,-15,-10,15,-13,-11,-8,-21,6,-13,-7,-19,-6,11,9,-8,-21,-19,19,0,13; MA /M: SY='P'; M=-7,-19,-26,-10,10,-33,-10,1,-24,7,-24,-31,-28,77,0,-9,-9,-4,-31,-14,-15,2; MA /M: SY='L'; M=-3,-8,-13,-6,-9,3,-19,-13,12,-6,18,14,-13,-25,-14,-6,-13,-2,10,-23,12,-11; MA /M: SY='T'; M=8,-4,-21,-7,-9,-19,-13,-12,-6,-4,-8,-9,-2,15,-2,-20,16,29,-3,-41,-14,-7; MA /M: SY='F'; M=-5,-15,-23,-25,-24,36,-20,-20,14,-12,16,-1,-6,-31,-19,-14,-9,-4,15,-15,13,-24; MA /M: SY='D'; M=0,15,-16,28,15,-22,-14,-12,-22,2,-7,-16,2,-9,6,-6,1,-7,-18,-25,-9,10; MA /M: SY='E'; M=-3,4,-5,14,37,-33,-15,-8,-28,12,-13,-12,-7,1,19,-3,-4,-16,-28,-1,-12,32; MA /M: SY='I'; M=-2,-18,-16,-34,-26,4,-12,-18,53,-20,24,12,-4,-30,-20,-28,-12,0,34,-28,-3,-26; MA /M: SY='Q'; M=0,-7,-11,-8,2,-6,-17,-7,-2,-1,6,11,-7,-17,12,6,-11,-4,-7,-21,2,6; MA /M: SY='D'; M=3,22,-20,35,7,-29,-3,-15,-19,0,-12,-19,10,-12,-8,-12,8,-2,-14,-33,-17,0; MA /I: I=-7; MD=-12; MA /M: SY='F'; M=-6,-9,-20,-9,1,9,-14,1,-9,3,1,-1,-8,-6,-2,-3,-4,-8,-5,-3,9,-1; D=-7; MA /I: I=-7; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; MA /M: SY='Y'; M=-11,-16,-29,-15,-19,13,-25,-5,5,-14,18,1,-16,-19,-13,-15,-6,10,13,-11,30,-17; MA /I: I=-9; MD=-15; MA /M: SY='D'; M=-6,2,-26,11,-1,-16,-5,9,-17,0,-8,-5,-5,-4,-1,5,-1,-10,-13,-13,0,-3; D=-9; MA /I: I=-9; MI=-15; IM=-15; DM=-15; MA /M: SY='I'; M=-7,-19,-15,-23,-17,13,-18,-18,20,-16,16,1,-19,-20,-15,-14,-15,-3,15,-6,14,-16; MA /M: SY='G'; M=3,8,-26,10,-1,-24,16,-5,-16,-3,-17,-17,5,-9,-10,-13,15,-1,-20,-24,-21,-7; MA /M: SY='L'; M=-6,-9,-5,-9,-3,-9,-18,-3,-3,-5,3,-1,-10,-1,-6,-11,-7,-1,-8,-26,-5,-5; MA /M: SY='P'; M=-3,7,-27,12,5,-26,-11,12,-22,4,-19,-11,5,14,1,-1,1,-4,-23,-36,-15,0; MA /M: SY='Q'; M=0,-3,-26,-2,1,-13,-7,-12,-7,3,-9,-6,-4,-2,5,-1,-2,-1,-11,-19,-5,0; MA /M: SY='N'; M=5,9,-23,8,-1,-18,-3,-16,-12,4,-11,-1,10,-9,3,-3,3,3,-11,-32,-16,-1; MA /M: SY='E'; M=0,0,-22,8,16,-23,-13,-6,-20,7,-11,-12,-6,10,11,-3,-1,-4,-18,-19,-7,12; MA /M: SY='W'; M=-3,-15,-15,-17,-1,3,-14,-17,-2,-3,3,-1,-15,-18,-3,-8,-6,-6,-2,5,4,-2; MA /M: SY='L'; M=-8,-16,-12,-20,-19,26,-23,-9,21,-18,27,10,-17,-31,-22,-17,-15,-2,17,-20,22,-19; MA /I: I=-7; MD=-12; MA /M: SY='I'; M=3,-12,-14,-15,-8,3,-15,-12,10,-6,8,6,-9,-19,-2,-3,-8,-2,10,-18,0,-6; D=-7; MA /I: I=-7; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; MA /M: SY='E'; M=-2,1,-9,8,27,-32,-15,-2,-26,11,-17,-14,-3,16,20,5,-4,-11,-27,-21,-18,24; MA /M: SY='I'; M=10,-9,-18,-12,-9,-5,-9,-13,12,-6,5,8,-6,-20,-6,-9,3,5,10,-31,-11,-11; MA /M: SY='L'; M=-8,-12,-4,-15,-9,18,-20,-9,17,-14,32,17,-16,-29,-17,-18,-17,-3,9,-18,21,-10; MA /M: SY='K'; M=0,-6,-27,-4,11,-12,-12,-15,-18,26,-19,8,-6,9,6,17,0,-8,-16,-19,-9,6; MA /M: SY='N'; M=2,10,-18,7,5,-18,-4,-13,-16,10,-17,-2,17,-10,4,7,1,-7,-17,-31,-21,3; MA /M: SY='N'; M=-5,7,-20,-7,-10,-10,-7,19,3,-9,-1,10,25,-19,-10,-18,-6,2,-11,-46,-13,-10; MA /M: SY='P'; M=-2,11,-21,24,13,-36,-10,-5,-27,7,-18,-22,0,29,2,-5,-3,-6,-25,-33,-19,7; MA /M: SY='R'; M=-4,-10,-22,-5,8,-13,-16,-13,-26,22,-19,7,-11,0,20,44,-5,-20,-16,-9,-6,9; MA /M: SY='I'; M=1,-19,-18,-29,-27,11,-20,-21,42,-18,19,8,-10,-35,-24,-19,-12,2,36,-26,5,-27; MA /M: SY='Q'; M=1,-7,-21,-3,10,-19,-17,3,-10,6,-6,3,-8,-7,12,5,-4,-8,-9,-19,-6,10; MA /M: SY='W'; M=-23,-31,-34,-32,-24,45,-19,-23,-6,-10,12,-11,-28,-31,-17,-5,-16,-19,3,49,40,-24; MA /I: I=-5; MD=-8; MA /M: SY='D'; M=0,22,-14,25,-3,-18,-4,-11,-4,-3,-5,-8,22,-14,-8,-12,-1,-1,-6,-33,-14,-6; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-8; MA /M: SY='P'; M=5,-6,-18,-2,8,-19,-5,-3,-13,7,-14,-10,-9,31,2,-5,2,1,-14,-22,-17,3; D=-5; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; MA /M: SY='A'; M=8,-4,-22,-2,2,-16,-10,-18,-2,4,-7,1,-5,-9,2,-2,-1,-1,1,-25,-13,1; MA /M: SY='N'; M=1,14,-23,15,7,-22,-2,-4,-17,7,-17,-6,16,-7,-2,-7,7,-2,-20,-34,-19,1; MA /M: SY='G'; M=-1,8,-24,3,-4,-25,30,-18,-15,-1,-18,-13,12,-11,-6,-5,1,-13,-24,-14,-25,-5; MA /M: SY='T'; M=5,-3,-20,-9,-12,-10,-14,-20,2,-3,2,6,1,-6,-6,-19,7,25,6,-36,-3,-8; MA /M: SY='F'; M=-21,-27,-29,-38,-32,76,-28,-22,2,-12,25,-12,-16,-36,-26,-10,-13,-15,10,10,38,-32; MA /M: SY='Q'; M=9,-5,-16,-4,9,-18,-14,-10,-11,8,-7,6,-5,-6,11,3,3,1,-8,-26,-14,9; MA /M: SY='Y'; M=-30,-29,-48,-26,-24,47,-30,8,-8,-11,21,-10,-25,-23,-16,-5,-15,-15,5,23,57,-24; MA /M: SY='R'; M=-2,-12,-22,-11,-4,-6,-16,-15,-6,12,-8,10,-10,-11,3,25,-5,-11,-1,-16,-3,-4; MA /M: SY='P'; M=-1,-14,-28,-7,7,-31,-7,3,-23,7,-26,-31,-20,72,-2,-10,4,6,-29,-32,-22,-2; MA /M: SY='K'; M=-2,-7,-20,-8,9,-10,-13,-13,-5,15,-5,8,-7,10,-4,-6,-5,-3,-9,-23,-5,3; MA /M: SY='Y'; M=-24,-23,-42,-17,-16,14,-27,27,0,-15,19,3,-25,-17,-12,-8,-16,-9,5,3,45,-16; MA /M: SY='D'; M=-1,21,-26,22,-2,-27,3,-6,-17,0,-16,-12,21,-3,-9,-14,3,0,-20,-40,-21,-6; MA /M: SY='I'; M=2,-17,-19,-27,-27,4,-12,-23,43,-19,16,6,-9,-32,-23,-21,-11,2,34,-26,0,-27; MA /M: SY='R'; M=-6,-11,-22,-9,-7,-9,-19,4,-14,3,-10,6,-7,-10,9,31,-7,-12,-7,-21,-2,-3; MA /I: E1=0; IE=-50; DE=-50; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=7(7); /POSITIVE=7(7); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DNA_BIND; /FT_DESC=TFIIE beta; CC /VERSION=5; DR Q2KJF9 , T2EB_BOVIN , T; Q54KJ8 , T2EB_DICDI , T; DR P29084 , T2EB_HUMAN , T; Q9D902 , T2EB_MOUSE , T; DR P79011 , T2EB_SCHPO , T; P29540 , T2EB_XENLA , T; DR P36145 , T2EB_YEAST , T; 3D 1D8J; 1D8K; 5FMF; 5FYW; 5FZ5; 5IY6; 5IY7; 5IY8; 5IY9; 5IYA; 5IYB; 5IYC; 3D 5IYD; 5OQJ; 5OQM; 5SVA; 6GYL; 6GYM; 6O9L; 7EG9; 7EGA; 7EGB; 7EGC; 7ENA; 3D 7ENC; 7LBM; 7ML0; 7ML1; 7ML2; 7ML4; 7NVR; 7NVS; 7NVT; 7NVU; 7NVY; 7NVZ; 3D 7NW0; 7O4I; 7O4J; 7O4K; 7O4L; 7O72; 7O73; 7O75; 7ZS9; 7ZSA; 7ZSB; 8BVW; 3D 8BYQ; 8CEN; 8CEO; 8GXQ; 8GXS; 8WAK; 8WAL; 8WAN; 8WAO; 8WAP; 8WAQ; 8WAR; 3D 8WAS; PR PRU00682; DO PDOC51351; //