ID COX5B_2; MATRIX. AC PS51359; DT 01-JAN-2008 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=100; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=95; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8524109; R2=0.0047637; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=15732.1523438; R2=8.5646677; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1816; H_SCORE=31286; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=976; H_SCORE=24091; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-16; D=-80; I=-80; B1=-500; E1=-500; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; MA /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; MA /M: SY='A'; M=36,-44,-42,-37,-44,-12,-41,-38,-35,-43,-38,-35,13,-35,-11,15,-5,-10,-50,-2; MA /M: SY='H'; M=12,37,-25,-18,-35,-29,51,-33,29,1,-22,5,-35,29,3,18,-20,-30,-45,-25; MA /M: SY='P'; M=4,-38,15,13,-26,-6,-24,-27,3,-16,-26,-21,33,-20,-26,19,8,-2,-34,33; MA /M: SY='G'; M=-2,-36,-28,-27,-39,50,-30,-32,24,-34,24,-17,-32,-21,-22,36,-18,-4,-42,-33; MA /M: SY='T'; M=1,-34,-22,18,-33,-7,-26,-22,-19,-10,34,4,-30,19,-2,9,44,1,-46,-29; MA /M: SY='M'; M=-25,-35,5,-34,18,-43,-34,28,-35,25,47,-32,-40,-33,-37,-1,4,33,-40,-18; MA /M: SY='P'; M=-1,-44,-4,-25,31,-33,-34,-1,-30,-31,-28,-31,86,-32,-38,2,-2,-27,-36,-25; MA /M: SY='T'; M=0,-34,18,-1,-36,-29,32,1,-22,-31,-26,25,18,-22,-29,10,54,-22,-52,-29; MA /M: SY='D'; M=-29,-43,74,-7,-40,-32,-24,-35,6,2,-31,-11,36,-21,-26,3,-1,-35,-54,-33; MA /M: SY='P'; M=-13,-38,6,-4,-19,-41,-29,4,-31,37,30,-32,39,-28,-35,-28,15,0,-39,5; MA /I: I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='E'; M=0,-40,25,57,-36,-32,-17,-36,-14,-33,23,27,-28,21,-21,-17,8,-33,-42,10; MA /M: SY='Q'; M=-24,-43,-18,24,-40,-34,38,-11,-12,-8,-21,-17,-31,81,-14,8,6,-31,-42,-24; MA /M: SY='A'; M=60,-30,-26,7,-36,-22,-32,5,-25,-27,-23,14,-32,-23,-31,-10,9,5,-44,-34; MA /M: SY='T'; M=4,-28,-27,-28,20,-32,-33,-19,-26,-24,-23,-17,-29,-29,-32,14,76,5,-43,-23; MA /M: SY='G'; M=-21,-40,20,-31,7,67,-28,-40,-30,-11,-32,36,-36,-29,-36,-17,-27,-40,-40,-31; MA /M: SY='L'; M=-27,-37,-34,10,-16,-43,-33,21,-33,51,-4,-36,14,-28,-36,1,7,-9,-40,-24; MA /M: SY='E'; M=2,-41,37,59,-44,-33,-22,-33,10,-36,-32,-17,-27,21,-18,5,-21,3,-48,-34; MA /M: SY='R'; M=-1,-40,-21,-18,-38,-31,31,-39,31,-16,-26,35,-37,-10,64,-3,-23,-36,-45,-27; MA /I: I=-21; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; MA /M: SY='H'; M=-27,-40,-25,19,15,-37,42,-26,0,19,-17,-24,-37,-16,31,19,-23,-27,-31,29; MA /M: SY='E'; M=-24,-44,-1,82,-44,-38,33,-42,-10,-38,-34,-20,-23,-2,-18,4,-23,-15,-47,-33; MA /M: SY='M'; M=-31,-39,-48,-40,-9,-47,-30,27,-38,49,61,-44,13,-32,-38,-39,-28,-6,41,16; MA /M: SY='L'; M=-28,-35,-38,-35,-10,-42,-27,-3,-34,58,-1,10,-45,1,-34,-2,-23,9,-35,14; MA /M: SY='G'; M=44,-33,-32,-32,11,49,-33,-33,-31,-9,-27,-22,-34,-28,-36,18,-21,-26,-36,-29; MA /M: SY='K'; M=20,-36,-30,-3,-27,-35,-30,-1,52,24,-14,-26,-34,-18,-11,-24,-22,5,-39,-28; MA /M: SY='M'; M=-11,-39,-39,-29,15,-42,-25,11,6,18,53,-32,-40,5,35,-30,-26,10,-32,16; MA /M: SY='E'; M=5,-38,4,37,7,-31,-23,-31,4,-32,-28,4,-31,30,13,21,0,-3,-41,-26; MA /M: SY='G'; M=-16,-39,-26,-37,-36,76,-28,-47,-31,-45,-36,18,-34,-29,-37,1,5,-42,-35,16; MA /I: I=-19; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61; MA /M: SY='I'; M=-28,-43,-1,26,-21,-45,-26,38,-19,7,-13,-29,-36,32,19,-29,-25,11,-35,20; MA /M: SY='D'; M=-29,-43,81,19,-49,-30,-18,-46,10,-45,-41,26,-31,14,-20,-17,7,-43,-59,-34; MA /M: SY='P'; M=-11,-43,-39,-31,-23,-41,-34,21,-28,-1,-16,-38,69,-32,6,-30,-23,33,-37,19; MA /M: SY='F'; M=-37,-40,-43,0,83,-47,-28,-15,-37,18,-14,-41,-47,-39,-37,-38,-32,-20,60,41; MA /M: SY='D'; M=-28,-41,69,30,-48,3,-17,-48,10,-48,-41,54,-31,-14,-21,-17,-20,-45,-57,-37; MA /I: I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='M'; M=-2,-33,-44,-38,36,-39,-30,9,-35,32,68,-35,-40,-31,-35,1,-4,10,-33,-13; MA /I: I=-21; MD=-65; MA /M: SY='R'; M=-30,-46,23,-3,-47,13,-29,-47,18,-24,-38,14,-39,-21,29,10,-6,-43,-52,-39; D=-21; MA /I: I=-21; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; MA /M: SY='P'; M=-32,-49,-22,10,-39,-36,-24,-43,35,-45,-34,21,68,-17,24,-26,-26,-43,-39,14; D=-21; MA /I: I=-21; DM=-65; MA /M: SY='V'; M=-7,-36,-44,-38,17,-44,-41,28,-38,25,-8,-40,33,-38,-41,-31,-1,45,-40,-21; MA /I: I=-19; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61; MA /M: SY='D'; M=-37,-51,38,-22,-37,-47,-33,15,-28,12,-22,-29,2,34,5,-34,-32,-8,-52,-34; D=-19; MA /I: I=-19; DM=-61; MA /M: SY='T'; M=11,-35,-30,-24,4,-34,12,20,29,-22,-20,-21,-33,-21,10,9,32,7,-41,-23; MA /M: SY='S'; M=-1,-38,-24,1,-42,35,-27,-37,0,-40,-33,-18,17,-17,30,42,-17,-10,-43,-35; MA /M: SY='P'; M=2,-39,-25,-26,-41,33,-27,-36,-15,-40,-31,23,40,-21,37,0,20,-15,-45,-36; MA /M: SY='F'; M=-10,-36,-31,-27,61,-32,-26,-25,25,-1,-22,13,1,-25,-1,24,-20,-26,-26,-8; MA /M: SY='G'; M=-15,-41,-26,-39,-48,86,-33,-55,-33,-51,-40,17,-34,-31,-40,-14,-31,-49,-40,-43; MA /M: SY='T'; M=-17,-28,-23,-25,-34,-32,-31,-26,-19,-30,-26,-12,-25,-24,6,16,86,-18,-52,-30; MA /M: SY='M'; M=-28,-40,-32,5,-26,-42,-28,10,33,17,46,-30,19,-18,24,-30,-24,11,-41,-26; MA /M: SY='D'; M=-28,-43,56,53,-47,-33,-19,-47,40,-44,-38,18,-27,-8,-11,-19,-3,-42,-50,-35; MA /M: SY='D'; M=-1,44,61,-13,-44,-22,-18,-43,-20,-45,-39,61,-35,-19,-27,24,-15,-39,-60,-36; MA /M: SY='P'; M=-31,-57,-32,-20,-51,-33,-35,-39,-28,-49,-36,-38,113,-32,-41,-29,-24,-44,-44,-49; MA /M: SY='N'; M=-1,29,-28,-35,-21,-35,-30,39,-30,-4,-14,44,-39,-30,-35,-21,20,25,-43,11; MA /M: SY='I'; M=-26,-37,-42,-11,-15,-47,-38,41,-36,36,19,-40,-41,0,-37,-14,-23,34,38,-21; MA /M: SY='V'; M=-19,-33,-49,-43,-18,-50,-51,40,-41,-3,-6,-43,-43,-42,-42,-32,-17,75,-50,-26; MA /I: I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='P'; M=-28,-46,-21,20,-46,-34,-29,-38,17,-43,-33,-3,87,-20,-2,-21,24,-38,-45,-40; MA /M: SY='S'; M=7,-29,-22,-22,-39,-16,-25,-37,-22,-40,-34,-10,-28,-15,-27,79,24,-28,-48,-31; MA /M: SY='C'; M=22,44,1,-6,15,-11,-28,18,-30,-8,-18,-29,-39,14,-32,-23,-24,6,-29,39; MA /M: SY='F'; M=-26,-37,23,-27,49,14,32,-4,-30,-23,-24,-19,-36,-30,-33,6,33,-24,-29,24; MA /M: SY='D'; M=-28,-43,66,-11,-45,17,33,-38,-23,-42,-36,33,38,-23,-31,-20,-23,-7,-57,-33; MA /M: SY='E'; M=24,-38,-20,34,20,-30,24,-36,3,-32,-27,-22,-33,-14,29,16,-22,-30,-31,22; MA /M: SY='R'; M=-31,-49,-27,-14,-43,-41,-17,-47,10,-40,-28,-21,-39,36,92,-24,-30,-42,-40,-27; MA /M: SY='Y'; M=-31,-42,-43,-42,-1,-48,14,49,-37,16,31,-38,-43,-32,-36,-35,-26,15,-18,69; MA /M: SY='V'; M=6,-32,-47,-41,-19,-45,-48,27,-39,4,-7,-42,-43,-40,-41,-29,-17,73,-50,-27; MA /M: SY='G'; M=6,38,-31,-40,-46,82,-37,-52,-35,-48,-39,-17,-35,-33,-42,-15,-31,-44,-41,-43; MA /M: SY='C'; M=-52,280,-92,-93,-73,-84,-92,-87,-84,-68,-68,-65,-114,-100,-97,-58,-53,-62,-133,-94; MA /M: SY='T'; M=-23,-35,-28,5,-27,-39,-34,33,-24,-1,-16,-23,17,-26,-1,-1,57,3,-46,-29; MA /M: SY='C'; M=-36,189,-69,-86,-88,144,-79,-103,-74,-89,-76,-41,-80,-75,-89,-38,-62,-84,-93,-89; MA /M: SY='E'; M=-23,-39,-20,35,25,34,-26,-31,0,5,-24,3,-33,7,-25,6,-4,-31,-35,-23; MA /I: I=-19; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61; MA /M: SY='P'; M=-28,-47,50,44,-49,-5,-25,-44,-19,-45,-39,-18,69,-17,-29,-21,8,-42,-50,-40; MA /M: SY='G'; M=18,-40,43,8,-33,43,37,-44,-25,-40,-33,-14,-33,-21,-30,-2,-25,-38,-38,27; MA /I: I=-22; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71; MA /M: SY='D'; M=-43,-62,39,37,-67,10,-38,-68,-34,-65,-59,12,-46,-30,-43,-36,-42,-63,-70,-56; D=-22; MA /I: I=-22; DM=-71; MA /M: SY='E'; M=27,-36,-13,46,-44,-4,-22,-41,-14,-40,-33,7,-28,17,9,37,-16,-33,-44,-35; MA /M: SY='H'; M=-29,-41,13,-19,-32,-35,111,-39,-24,-9,-19,-10,-34,-16,-22,-1,21,-38,-62,-9; MA /M: SY='N'; M=-7,-36,34,26,-41,-28,-23,-31,3,-37,-32,38,16,-17,-24,9,32,-2,-52,-35; MA /I: I=-24; MD=-77; MA /M: SY='I'; M=-7,-41,-50,-44,-22,-50,-50,52,-43,9,-9,-45,16,-42,-46,-36,-24,47,-47,-29; D=-24; MA /I: I=-24; MI=-77; IM=-77; DM=-77; MA /M: SY='I'; M=-27,-38,-32,-28,-18,-40,23,29,1,27,15,11,-39,20,-26,-8,-2,8,-37,13; MA /M: SY='W'; M=-40,-56,-64,-46,48,-41,-56,-29,-39,-8,-29,-56,-46,-40,-41,-45,-46,-40,152,9; MA /M: SY='F'; M=-34,-36,-47,-41,64,-46,31,5,-39,37,60,-38,-45,-36,-36,-38,-29,-11,-24,-1; MA /M: SY='W'; M=-29,-44,2,5,-21,-38,11,-31,-5,-14,16,-27,-34,-23,9,-23,38,-32,119,-11; MA /M: SY='L'; M=-10,39,-47,-40,-14,-46,-38,18,-40,49,20,-43,-6,-37,-41,-35,-24,34,-42,-24; MA /M: SY='H'; M=0,-40,-18,25,-34,-10,75,-42,7,-36,-27,-16,-31,-12,36,-2,18,-36,-45,6; MA /M: SY='K'; M=-26,-44,-13,51,-43,-39,-21,-36,53,-37,-29,-19,-28,29,30,-22,-24,-4,-41,-32; MA /M: SY='G'; M=-22,-43,52,11,-49,59,-26,-52,17,-49,-41,7,-31,-20,-24,-17,-27,-47,-47,-38; MA /M: SY='Q'; M=-26,-43,15,36,8,-35,-21,-40,36,-37,-30,-17,11,43,19,-3,2,-37,-39,-26; MA /I: I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='P'; M=-9,-44,-38,-27,-30,-38,-36,1,-32,21,-16,-39,85,-4,-38,-30,-24,13,-43,-34; MA /M: SY='Q'; M=5,-40,-22,13,-32,-10,30,-31,20,-32,-25,-19,-33,40,28,-4,8,-3,-36,20; MA /M: SY='R'; M=-30,-47,-30,-18,-37,-43,-21,0,5,-31,-23,-24,-40,22,87,-26,-29,-3,-41,-27; MA /M: SY='C'; M=-52,280,-92,-93,-73,-84,-92,-87,-84,-68,-68,-65,-114,-100,-97,-58,-53,-62,-133,-94; MA /I: I=-24; MD=-77; MA /M: SY='W'; M=-42,-62,-13,-42,-44,-4,-49,-42,-46,-13,23,-47,59,-44,-52,-18,-41,-47,67,-40; D=-24; MA /I: I=-24; MI=-77; IM=-77; DM=-77; MA /M: SY='E'; M=-24,-42,20,61,-33,-11,19,-32,-15,-31,15,4,-28,17,-21,-2,-23,-6,-40,17; MA /M: SY='C'; M=-52,280,-92,-93,-73,-84,-92,-87,-84,-68,-68,-65,-114,-100,-97,-58,-53,-62,-133,-94; MA /M: SY='G'; M=-15,-41,11,-34,-48,82,-33,-54,-32,-50,-41,-13,-33,-29,-40,8,-29,-48,-41,-41; MA /M: SY='H'; M=-8,-40,-19,-13,-34,-29,67,-38,-15,-34,-24,21,-33,66,-16,18,17,-36,-40,21; MA /M: SY='W'; M=-26,-41,-44,-38,-14,-44,44,17,-36,-14,-15,-38,-42,-34,-36,-32,-7,53,100,23; MA /M: SY='F'; M=-38,-40,-46,-44,84,-46,-19,-15,-38,-10,-15,-40,-50,-41,-36,-36,-31,-6,-1,77; MA /M: SY='K'; M=-6,-41,-24,-11,-39,-35,-23,-3,70,-30,25,-17,-30,34,16,-22,-23,-28,-38,-28; MA /M: SY='L'; M=3,-35,-44,-37,-12,-43,31,16,-38,56,46,-39,-43,-31,-36,-34,-27,-6,-39,-18; MA /M: SY='V'; M=-24,-38,-1,17,-27,-41,9,6,37,-20,-18,-2,-35,-20,-16,-26,-20,48,-43,4; MA /M: SY='Y'; M=-31,-45,12,11,6,-38,35,-29,-15,-29,-24,11,21,-18,34,-26,-26,-5,-23,62; MA /M: SY='V'; M=-26,-36,-42,-34,16,-47,15,27,15,26,17,-35,-41,-31,-28,-33,-22,45,-40,-18; MA /M: SY='G'; M=-5,-43,-26,5,-42,52,-29,-40,-21,-12,-30,-22,42,8,15,7,-26,-38,-41,-37; MA /M: SY='P'; M=-11,-44,23,4,-31,-32,-24,-29,-24,-4,-26,1,72,10,-31,5,-21,-15,-39,17; MA /M: SY='P'; M=4,-40,1,28,-30,0,-26,-22,-22,-14,-24,-25,37,25,-28,6,-21,17,-38,16; MA /M: SY='G'; M=-35,-50,11,9,7,29,16,-45,-36,-13,-37,13,-45,-32,-41,-11,-36,-45,-46,3; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=14(14); /POSITIVE=14(14); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20; CC /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /VERSION=5; DR P06809 , COX4_NEUCR , T; P79010 , COX4_SCHPO , T; DR P04037 , COX4_YEAST , T; P00428 , COX5B_BOVIN, T; DR P10606 , COX5B_HUMAN, T; P19536 , COX5B_MOUSE, T; DR Q5S3G4 , COX5B_PIG , T; Q5REG2 , COX5B_PONAB, T; DR P12075 , COX5B_RAT , T; Q710D6 , COX5B_VULVU, T; DR P29505 , COX5_DICDI , T; Q9LW15 , CX5B1_ARATH, T; DR Q9SSB8 , CX5B2_ARATH, T; Q9SSS5 , CX5BL_ARATH, T; 3D 1OCC; 1OCO; 1OCR; 1OCZ; 1V54; 1V55; 2DYR; 2DYS; 2EIJ; 2EIK; 2EIL; 2EIM; 3D 2EIN; 2OCC; 2ODX; 2Y69; 2YBB; 2ZXW; 3ABK; 3ABL; 3ABM; 3AG1; 3AG2; 3AG3; 3D 3AG4; 3ASN; 3ASO; 3WG7; 3X2Q; 5B1A; 5B1B; 5B3S; 5GPN; 5IY5; 5LUF; 5W97; 3D 5WAU; 5X19; 5X1B; 5X1F; 5XDQ; 5XDX; 5XTH; 5XTI; 5Z62; 5Z84; 5Z85; 5Z86; 3D 5ZCO; 5ZCP; 5ZCQ; 6GIQ; 6HU9; 6J8M; 6JUW; 6JY3; 6JY4; 6NKN; 6NMF; 6NMP; 3D 6T0B; 6T15; 6YMX; 6YMY; 7COH; 7CP5; 7D5W; 7D5X; 7DGQ; 7DGR; 7DGS; 7DKF; 3D 7EV7; 7O37; 7O3C; 7O3E; 7THU; 7TIE; 7TIH; 7TII; 7VUW; 7VVR; 7W3E; 7XMA; 3D 7XMB; 7Y44; 7YPY; 7Z10; 8C8Q; 8D4T; 8DH6; 8E7S; 8EC0; 8GBT; 8GCQ; 8GVM; 3D 8H8R; 8H8S; 8IJN; 8Q1B; PR PRU00692; DO PDOC00663; //