ID   LRR; MATRIX.
AC   PS51450;
DT   01-DEC-2009 CREATED; 01-DEC-2009 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Leucine-rich repeat profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=22;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=22;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.4886985; R2=0.0077007; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=846; N_SCORE=7.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=521; N_SCORE=4.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-18; D=-80; I=-80; B0=-55; E0=-55; B1=-200; E1=-200; MI=-55; MD=-55; IM=-55; DM=-55;
MA   /I: B1=0; BI=-55; BD=-55;
MA   /M: SY='N'; M=-22,-20,2,8,-34,-14,24,-49,30,-42,-29,61,-32,13,3,31,-2,-41,-47,-27;
MA   /I: B1=-50; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-63,-59,-88,-69,-39,-97,-81,13,-88,119,-20,-79,-92,-91,-90,-87,-57,-24,-79,-46;
MA   /I: B1=-140; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-31,-12,-4,40,-49,-39,2,-37,34,-37,-31,-5,-34,36,43,-11,21,-21,-53,-36;
MA   /M: SY='T'; M=-20,-3,-7,20,-8,-47,29,-1,8,-34,-26,6,-47,-2,-15,12,30,12,10,25;
MA   /M: SY='L'; M=-74,-83,-89,-74,-10,-98,-82,25,-88,116,-12,-90,-92,-92,-80,-87,-63,-14,-79,-48;
MA   /M: SY='D'; M=-42,-26,68,-9,-9,-37,8,-32,-28,-35,-34,60,-48,-21,-25,12,-14,-39,38,27;
MA   /M: SY='L'; M=-18,-60,-88,-83,8,-94,-82,28,-80,105,21,-88,-91,-91,-89,-75,-66,8,-80,-59;
MA   /M: SY='S'; M=4,-39,14,-6,-32,-5,21,-39,-25,-55,-45,11,-34,12,-1,66,-4,-29,-59,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-33,2,27,-4,-7,22,61,-57,-19,-39,-43,56,-47,5,-7,15,-38,-53,-23,19;
MA   /M: SY='N'; M=-63,7,-41,-43,-70,-45,-48,-78,-38,-86,-81,172,-74,-31,-65,-43,-35,-63,-100,-60;
MA   /M: SY='N'; M=-26,5,-4,2,-32,-15,28,-44,30,-14,-16,38,-3,37,36,-7,-29,-46,-39,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-78,-71,-86,-89,2,-98,-87,110,-88,71,-16,-84,-86,-85,-74,-79,-77,9,-60,-60;
MA   /M: SY='T'; M=-11,-22,-3,18,-26,-21,-8,-35,24,-31,-35,-5,-20,10,15,33,40,-27,-31,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-48,-9,57,33,-47,-33,29,-71,35,-75,-47,34,-54,14,6,56,9,-31,-85,-37;
MA   /M: SY='I'; M=-67,-62,-83,-69,14,-87,-78,95,-73,66,6,-68,-50,-73,-91,-70,-43,27,8,-53;
MA   /M: SY='P'; M=0,-10,18,41,-60,-5,-12,-39,-7,-46,-34,-8,60,-5,-17,26,0,-41,-39,-43;
MA   /M: SY='N'; M=-15,-25,37,20,-42,23,-5,-41,-7,-39,-40,46,22,-8,-27,17,-7,-20,-58,-34;
MA   /M: SY='L'; M=-47,-49,-16,-5,14,-40,-34,26,-34,73,-19,-26,-40,-37,-63,-9,-41,5,-39,11;
MA   /M: SY='E'; M=8,-13,13,28,-23,-21,-12,-2,-11,-9,-20,9,6,10,-8,23,3,-17,-40,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-9,0,3,9,27,-6,24,-36,11,-8,-29,19,1,-10,0,14,1,-23,-32,-10;
MA   /I: E1=-90; IE=-55; DE=-55;
MA   /M: SY='L'; M=-27,33,-49,-14,-16,-63,-3,-26,-27,79,15,-22,-51,6,-25,-7,-23,-21,2,-4;
MA   /I: E1=-30; IE=-55; DE=-55;
MA   /M: SY='P'; M=-13,4,-15,-5,-28,-13,-11,-23,23,7,-4,3,26,8,4,4,16,-9,-27,-8;
MA   /I: E1=0; IE=-55; DE=-55;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU00785;
DO   PDOC51450;
//