ID   CVC; MATRIX.
AC   PS51496;
DT   01-JUN-2010 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   CVC domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9688087; R2=0.0082100; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6134.7841797; R2=2.0229120; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=918; H_SCORE=7992; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=674; H_SCORE=7498; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-14; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-18,0,-67,0,-1,-68,-18,-11,-18,55,-38,8,9,-18,8,36,2,3,-28,-42,-48,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-18,-28,28,-35,-38,-50,-32,-18,-13,-18,-41,-24,-23,-21,-31,0,-3,-12,-11,-52,-25,-33;
MA   /M: SY='W'; M=-70,-60,-90,-80,-90,0,-80,-30,-60,-40,-20,-50,-50,-70,-60,20,-30,-60,-80,180,-10,-70;
MA   /M: SY='G'; M=10,0,-40,0,0,-60,60,-30,-30,-20,-50,-40,0,-10,-20,-40,10,0,-20,-80,-60,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-2,-45,-6,-6,-55,7,-1,-25,13,-43,-21,3,-8,-1,14,0,-5,-26,-37,-50,-2;
MA   /M: SY='S'; M=10,10,0,0,0,-40,10,-10,-20,0,-40,-20,10,10,-10,-10,20,20,-10,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=10,6,-13,0,-4,-40,6,-14,-11,0,-31,-16,6,6,-10,-10,20,29,-6,-43,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-28,-27,-22,-13,-24,-28,42,-18,15,19,-17,-24,-26,-20,-13,0,39,-69,-28,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-20,-30,-60,-40,-30,0,-40,-30,20,10,40,80,-20,-30,-10,-10,-20,-10,20,-50,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=30,0,-30,0,0,-40,10,-20,-10,-20,-20,-20,0,10,-10,-20,10,10,0,-70,-40,0;
MA   /M: SY='E'; M=0,30,-70,40,50,-70,0,0,-30,0,-40,-30,20,-10,30,-20,0,-10,-20,-90,-50,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-40,-40,0,-50,-50,70,-60,0,-20,-50,-20,-30,-20,-60,-50,-50,-30,-30,-30,-10,110,-50;
MA   /M: SY='G'; M=10,0,-40,0,0,-60,60,-30,-30,-20,-50,-40,0,-10,-20,-40,10,0,-20,-80,-60,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-20,-40,-70,-50,-40,20,-50,-30,20,-40,70,40,-40,-30,-20,-40,-40,-20,20,-20,-20,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-40,-40,0,-50,-50,70,-60,0,-20,-50,-20,-30,-20,-60,-50,-50,-30,-30,-30,-10,110,-50;
MA   /M: SY='G'; M=10,0,-40,0,0,-60,60,-30,-30,-20,-50,-40,0,-10,-20,-40,10,0,-20,-80,-60,-10;
MA   /M: SY='A'; M=30,0,-30,0,0,-40,10,-20,-10,-20,-20,-20,0,10,-10,-20,10,10,0,-70,-40,0;
MA   /M: SY='M'; M=-20,-30,-60,-40,-30,0,-40,-30,20,10,40,80,-20,-30,-10,-10,-20,-10,20,-50,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-20,-30,-20,-20,-20,-30,40,-30,20,20,-20,-20,-30,-30,-10,0,50,-80,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-40,-20,-20,-50,-40,20,-20,40,-40,-10,0,0,10,70,-10,-10,-30,20,-50,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,10,-40,0,0,-20,-30,80,-30,-10,-30,-30,20,-10,30,20,-10,-20,-30,-30,0,20;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-6,33,-16,-19,-45,-4,-18,-23,-19,-48,-31,-6,-4,-26,-18,15,6,-13,-46,-22,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-15,-35,-49,-39,-35,15,-39,-30,41,-29,44,29,-29,-30,-25,-29,-29,-9,31,-41,-20,-30;
MA   /M: SY='P'; M=10,-10,-40,-20,-10,-60,-10,-10,-30,-20,-30,-30,-10,70,0,0,10,0,-20,-70,-60,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-20,-40,-70,-50,-40,20,-50,-30,20,-40,70,40,-40,-30,-20,-40,-40,-20,20,-20,-20,-30;
MA   /M: SY='P'; M=10,-10,-40,-20,-10,-60,-10,-10,-30,-20,-30,-30,-10,70,0,0,10,0,-20,-70,-60,-10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-2,32,-66,41,42,-70,-2,-1,-29,5,-44,-31,23,-15,25,-15,0,-5,-25,-82,-50,33;
MA   /M: SY='T'; M=10,5,-14,0,-5,-40,5,-15,-11,0,-31,-15,5,5,-10,-10,20,29,-5,-44,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-27,-30,-27,2,-27,-30,55,-23,20,20,-20,-27,-30,-23,-17,0,43,-65,-23,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-15,-35,-58,-42,-35,13,-42,-29,27,-32,52,32,-32,-27,-21,-33,-31,-11,23,-32,-21,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-11,11,-61,11,7,-58,-7,0,-21,36,-41,-4,17,-16,8,20,4,0,-26,-46,-40,3;
MA   /M: SY='S'; M=10,10,0,0,0,-40,10,-10,-20,0,-40,-20,10,10,-10,-10,20,20,-10,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=27,0,-31,0,-1,-41,13,-21,-11,-18,-22,-21,0,8,-11,-21,11,12,-1,-70,-41,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-13,9,-69,11,14,-63,-15,-8,-21,31,-33,-3,11,-18,14,13,-3,-4,-24,-55,-48,11;
MA   /I: I=-15; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=5,21,-46,25,23,-54,12,-6,-24,-4,-39,-30,16,-9,7,-19,5,0,-19,-68,-42,15; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=8,14,-40,14,10,-51,28,-10,-24,-7,-44,-30,13,-7,-6,-22,10,3,-18,-66,-43,0;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-39,-23,-19,0,-24,-15,10,-16,24,19,-16,-11,-10,-17,-16,-8,9,-26,-18,-15; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-9,-38,-10,-4,-17,-19,-8,4,-5,10,17,-7,-13,2,-10,-11,-6,6,-40,-25,0; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=4,17,-55,23,25,-65,24,-11,-30,-8,-45,-35,12,-11,8,-26,4,-4,-23,-81,-54,16;
MA   /M: SY='S'; M=10,5,1,-3,-4,-41,7,-13,-19,-6,-38,-22,5,7,-13,-13,18,17,-9,-39,-30,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-16,-39,63,-46,-48,-46,-29,-35,-6,-53,-37,-31,-36,-29,-52,-35,-2,-17,4,-85,-13,-48;
MA   /M: SY='A'; M=30,0,-30,0,0,-40,10,-20,-10,-20,-20,-20,0,10,-10,-20,10,10,0,-70,-40,0;
MA   /M: SY='P'; M=10,-10,-40,-20,-10,-60,-10,-10,-30,-20,-30,-30,-10,70,0,0,10,0,-20,-70,-60,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-70,-60,-90,-80,-90,0,-80,-30,-60,-40,-20,-50,-50,-70,-60,20,-30,-60,-80,180,-10,-70;
MA   /M: SY='L'; M=-20,-40,-70,-50,-40,20,-50,-30,20,-40,70,40,-40,-30,-20,-40,-40,-20,20,-20,-20,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-20,-40,-70,-50,-40,20,-50,-30,20,-40,70,40,-40,-30,-20,-40,-40,-20,20,-20,-20,-30;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='G'; M=9,0,-40,-1,-1,-60,56,-28,-30,-18,-50,-39,0,-10,-19,-35,9,0,-20,-76,-60,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-20,-30,-60,-40,-30,0,-40,-30,20,10,40,80,-20,-30,-10,-10,-20,-10,20,-50,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,10,-40,0,0,-20,-30,80,-30,-10,-30,-30,20,-10,30,20,-10,-20,-30,-30,0,20;
MA   /M: SY='K'; M=-20,-2,-64,-4,-4,-66,-24,-4,-20,56,-40,6,8,-16,10,46,-2,-2,-30,-28,-50,0;
MA   /M: SY='K'; M=-20,0,-70,0,0,-70,-20,-10,-20,60,-40,10,10,-20,10,40,0,0,-30,-40,-50,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,10,0,0,0,-40,10,-10,-20,0,-40,-20,10,10,-10,-10,20,20,-10,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-22,-45,-28,-24,-7,-26,-26,18,-14,24,28,-18,-19,-17,-21,-13,2,17,-46,-26,-20;
MA   /M: SY='E'; M=1,19,-62,25,32,-62,11,-9,-26,-4,-37,-25,13,-12,15,-24,1,-7,-18,-84,-51,23;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=13(13); /POSITIVE=13(13); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CVC;
CC   /VERSION=4;
DR   P41935    , HM10_CAEEL , T; Q9GMA3    , VSX1_BOVIN , T;
DR   Q90277    , VSX1_CARAU , T; Q9IAL2    , VSX1_CHICK , T;
DR   O42250    , VSX1_DANRE , T; Q9NZR4    , VSX1_HUMAN , T;
DR   Q91V10    , VSX1_MOUSE , T; Q0P031    , VSX1_XENLA , T;
DR   Q9IAL1    , VSX2_CHICK , T; O42477    , VSX2_DANRE , T;
DR   P58304    , VSX2_HUMAN , T; Q61412    , VSX2_MOUSE , T;
DR   Q9I9A3    , VSX2_ORYLA , T;
PR   PRU00829;
DO   PDOC51496;
//