ID IRF_2; MATRIX. AC PS51507; DT 01-AUG-2010 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE IRF tryptophan pentad repeat DNA-binding domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=107; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=102; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8007126; R2=0.0069866; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=18028.2734375; R2=1.6174334; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=816; H_SCORE=19348; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=530; H_SCORE=18886; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-49; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; MA /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; MA /M: SY='K'; M=-97,-114,-15,-18,-13,11,40,-110,65,-25,-99,-89,25,-84,52,13,-95,-108,-108,7; MA /M: SY='M'; M=-28,-110,-97,16,-102,-106,-95,-91,-34,16,70,-3,41,45,26,11,16,-13,-114,-99; MA /M: SY='W'; M=-20,-115,10,-93,-100,-24,47,-102,-31,-1,17,-8,-20,4,72,-20,-99,-23,98,-90; MA /M: SY='M'; M=-22,-106,-120,-113,36,-118,-104,35,-111,67,84,-114,-115,-106,-110,-109,-97,-22,-104,-84; MA /M: SY='R'; M=-31,-111,-98,-89,-108,-44,-96,-11,42,-45,-96,-90,-3,5,79,11,43,-36,-113,-100; MA /M: SY='P'; M=11,-114,63,42,-115,-102,1,-110,-34,-31,-104,-9,74,-19,-11,-15,-23,-108,-120,-107; MA /M: SY='W'; M=-112,-128,-135,-117,71,-112,-127,-102,-110,-97,-103,-127,-117,-112,-112,-116,-118,-113,171,-61; MA /M: SY='L'; M=-102,-107,-120,-114,-10,-123,-109,62,-113,80,-68,-115,-116,-108,-113,-110,-10,-69,-107,-89; MA /M: SY='I'; M=-98,-108,-108,16,-17,-119,-107,58,6,38,-77,-107,-110,-100,-31,-103,-5,47,-109,-9; MA /M: SY='E'; M=5,17,44,63,-1,-15,-93,-111,0,-108,-9,-22,22,33,-92,2,-94,-107,-111,6; MA /M: SY='Q'; M=42,47,-96,-85,-113,-101,58,-19,36,-105,-96,-3,-105,80,35,-88,-95,-102,-114,-98; MA /M: SY='L'; M=-20,22,-120,-114,-83,-120,-112,57,-113,66,-71,-115,-116,-109,-113,-107,-95,43,-112,-93; MA /M: SY='D'; M=-97,-113,77,76,-119,-6,-88,-119,-85,-117,-111,58,-99,-9,-93,-6,-92,-115,-125,-108; MA /M: SY='S'; M=-3,-105,-86,34,-111,-92,18,-111,-86,-112,-104,50,-101,-2,9,83,-15,-105,21,-101; MA /M: SY='G'; M=-93,-112,25,13,-118,69,-94,-120,23,-119,-109,65,17,-90,-19,-30,-95,-116,-117,-110; MA /M: SY='T'; M=6,-108,9,0,-106,-103,-10,-24,42,0,-94,15,-103,24,34,-13,51,-97,-116,-100; MA /M: SY='Y'; M=-105,-114,-111,-112,58,-117,20,27,-106,-83,-83,-108,-118,-104,-104,-104,-99,16,-75,116; MA /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='P'; M=-98,-120,8,13,-114,-103,1,-110,-92,-47,-104,-98,107,-10,0,25,-30,-111,47,-107; MA /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='G'; M=-89,-112,-8,-106,-108,93,17,-113,-101,-26,-103,-27,-106,-99,-12,-21,-101,-29,-109,9; MA /M: SY='L'; M=-100,-105,-121,-113,18,-121,-107,-11,-113,79,21,-117,-118,-109,-111,-110,-96,45,-107,-87; MA /M: SY='H'; M=-25,47,-92,39,-1,-5,67,-12,14,-101,-96,-90,-104,38,-11,27,-10,1,-115,-95; MA /M: SY='W'; M=-111,-135,-135,-116,-74,-110,-126,-108,-108,-105,-107,-129,-116,-107,-110,-117,-121,-121,179,47; MA /M: SY='C'; M=-20,50,12,24,-1,-114,-105,23,-31,30,26,-104,-110,2,-104,-101,-94,50,-114,-95; MA /M: SY='D'; M=-100,-113,109,-21,-121,-23,-87,-120,-89,-120,-115,69,-104,-89,-98,-22,-90,-117,-135,-107; MA /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='E'; M=-97,-116,-82,80,-116,-25,-92,-117,38,-113,-104,-91,15,4,64,-28,-18,-111,-114,-105; MA /M: SY='D'; M=-25,-112,62,60,-119,-24,-89,-116,-3,-115,-107,49,-22,50,-90,24,-90,-112,-121,-106; MA /M: SY='K'; M=-98,5,-87,22,-112,-104,-91,-111,83,-41,-100,50,-102,-15,41,-90,18,-107,-114,-103; MA /I: I=-28; MD=-71; MA /M: SY='T'; M=-30,-108,-9,-96,-107,37,-100,-103,30,-11,28,-89,-104,-93,44,-87,71,-99,-116,-103; D=-28; MA /I: I=-28; MI=-71; MD=-71; IM=-71; DM=-71; MA /M: SY='I'; M=-96,-109,-110,-105,-6,-115,-108,59,-32,-3,-5,-101,-109,-12,29,10,42,37,-114,-95; D=-28; MA /I: I=-28; DM=-71; MA /M: SY='F'; M=-108,-107,-124,-119,121,-120,-106,-20,-115,-21,-84,-113,-121,-123,-112,-110,-101,12,-81,-60; MA /M: SY='R'; M=3,-111,-97,-87,-109,-104,13,-104,47,-25,-96,-90,-106,36,79,22,-8,-17,-113,-98; MA /M: SY='I'; M=7,-108,-119,-114,-87,-118,-116,83,-112,24,6,-112,-112,-109,-114,-104,-93,52,-113,-94; MA /M: SY='P'; M=-20,13,-102,-93,-117,-7,-104,-108,-16,-40,-103,-102,116,-17,-105,10,-93,-110,-115,-114; MA /M: SY='W'; M=23,-126,-129,-113,-82,-22,-131,-105,-107,-105,-106,-122,-113,-106,-111,-108,-114,-27,173,-70; MA /I: I=-5; MD=-14; MA /M: SY='K'; M=-101,-113,-98,-95,-106,-110,18,-33,63,-104,12,36,1,-91,19,-94,45,14,-117,5; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-14; MA /M: SY='H'; M=-107,-120,-95,-92,-111,-110,125,-118,20,-30,-97,24,27,-12,24,-98,-103,-118,-130,-88; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-14; MA /M: SY='A'; M=46,13,-104,-98,-35,24,-104,-105,28,-9,-100,10,30,21,-9,-92,-98,-32,-116,-108; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-14; MA /M: SY='A'; M=48,-107,-101,-99,-112,16,-102,-106,17,-24,16,19,-107,-95,-9,41,18,-101,-118,-107; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-14; MA /M: SY='R'; M=13,-115,13,-12,18,5,-97,-115,21,-111,-105,-2,-109,22,57,16,-97,-110,-111,-12; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-14; MA /M: SY='H'; M=8,-122,2,-91,-118,-108,58,-120,38,-118,-107,-96,48,52,-8,9,-101,-117,-120,0; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-14; MA /M: SY='D'; M=-33,17,60,-95,-122,30,1,-48,-98,-118,19,55,-114,3,7,-17,-101,-117,-131,-112; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-14; MA /M: SY='W'; M=-110,13,-122,-117,13,-26,-107,-14,-111,-103,-102,-117,13,-111,-30,-4,-109,-10,119,79; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-14; MA /M: SY='D'; M=-40,2,63,-18,-126,-113,-107,-114,-43,-121,-117,45,1,-7,-111,-24,6,8,-141,-119; D=-5; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; MA /M: SY='E'; M=-107,-124,57,57,-124,-113,-101,-123,-16,-121,-2,15,1,10,-14,-9,-18,-121,34,-112; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='D'; M=-42,21,47,19,-122,5,-102,-118,36,-119,-112,-12,-111,-16,37,-37,-21,-21,-126,-113; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='D'; M=-107,-122,90,2,-5,0,64,-120,-100,-114,9,-86,-110,-96,-105,-26,-103,-119,49,-1; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='C'; M=2,66,-7,-25,-13,46,4,-109,-104,-111,-106,8,-114,-104,-12,-5,-11,1,-118,9; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='C'; M=16,40,-6,29,-113,-25,-101,-104,37,-47,19,-2,-2,10,-16,2,-37,-1,-120,-108; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='I'; M=-26,-112,-122,-117,18,-122,24,69,-114,19,61,-114,-116,-111,-115,-110,-99,35,-113,-91; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='F'; M=-111,-115,-120,-117,104,-29,-97,-91,-112,-86,-91,-113,-123,1,-110,-109,-106,-21,-80,80; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='K'; M=-102,-116,32,20,-110,-114,23,-98,66,-7,-11,-95,-4,-89,16,-101,-98,28,-120,-103; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='A'; M=64,-110,49,27,-116,-8,-103,-105,-96,-53,-104,-95,-107,5,-11,-37,-96,2,-121,-110; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='W'; M=-114,-130,-131,-119,39,-116,-114,-102,-112,-100,-103,-127,-121,-112,-113,-117,-117,-25,159,72; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='C'; M=82,87,20,-99,-109,-96,-107,-21,-103,-30,18,-99,-109,-101,-108,-87,-93,-91,-119,-108; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='K'; M=-99,-114,-97,39,-102,-114,-99,2,42,-16,20,-13,-108,5,36,-24,-96,36,-113,5; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='H'; M=4,20,-94,46,11,-110,84,-97,-16,15,37,24,-109,-92,-98,-98,-99,-9,-118,-92; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='R'; M=-97,25,1,-92,-111,-107,-98,-110,33,-35,-102,-90,-107,-88,74,35,55,-105,-120,-104; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='G'; M=-96,-118,20,-20,-120,78,25,-120,-16,-120,-111,17,-110,-99,17,-93,-104,-15,-121,-111; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='R'; M=-105,-119,-105,-97,-112,-116,-104,39,62,-105,-100,-6,-112,-91,66,-8,-17,-28,-119,-106; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='Y'; M=-113,40,-11,-111,16,-121,38,-25,-109,-10,14,-112,47,-109,-12,-111,-29,-106,64,65; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='Q'; M=-106,-119,27,-34,-24,-114,30,-100,19,24,-96,9,-7,57,-97,-26,-31,-3,-122,-103; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='Q'; M=-11,-120,21,32,-121,-14,1,-112,6,-51,-107,-97,40,44,-100,-95,35,-27,-125,-112; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='G'; M=-95,20,-12,-25,-14,57,-103,-110,-104,-113,-108,7,-9,3,-109,42,-97,-3,-113,29; D=-5; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; MA /M: SY='D'; M=-121,-134,55,-107,-119,-2,-113,-121,-42,15,-114,-4,-130,-20,15,-116,-118,-123,-132,9; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='Q'; M=-48,-127,-9,0,-120,-22,28,-118,16,-34,-109,-18,34,37,29,-105,-32,-38,-124,-13; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='P'; M=-12,-118,-15,16,-25,-4,46,-108,-99,-34,-103,-99,89,-13,-106,26,-95,-29,-119,-106; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='D'; M=-98,-112,65,24,-108,-99,12,-116,-85,-115,-108,65,-106,-86,37,43,-90,-113,-118,29; D=-5; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; MA /M: SY='P'; M=-101,3,-112,-103,6,-5,-105,-14,-24,15,11,-109,82,-5,-107,-103,-99,21,45,31; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-14; MA /M: SY='S'; M=17,28,-100,-95,-106,-15,-100,-95,28,-32,17,-11,26,-92,24,38,28,18,-116,-103; MA /M: SY='E'; M=-43,-110,20,42,12,-107,-95,-96,32,-99,18,-90,-103,29,33,13,24,23,-113,-96; MA /M: SY='W'; M=16,67,-115,-105,-92,3,-115,-105,8,-18,4,-108,6,-101,-21,-100,-10,-106,144,-84; MA /M: SY='K'; M=-98,-114,-92,-10,-113,-107,-94,-10,102,-110,-100,-86,-101,10,36,-15,-94,-105,-109,-101; MA /M: SY='T'; M=18,-105,-97,-94,-106,-1,-99,19,-15,-98,7,-1,-102,28,36,2,75,-90,-116,-101; MA /M: SY='N'; M=-17,-110,-86,-93,-109,-21,-87,-109,-75,-112,-102,97,-110,-84,82,-88,-92,-20,46,-101; MA /M: SY='F'; M=-107,-108,-121,-115,103,-119,-101,-20,-109,43,41,-113,-119,-112,-10,-110,-101,-84,-86,14; MA /M: SY='R'; M=-25,-114,-104,-96,-102,35,-95,-102,-75,35,-90,-96,-112,-86,98,-97,-101,-101,-110,-99; MA /M: SY='C'; M=13,113,-100,-100,-104,-18,-98,-111,-7,-108,-102,33,-112,-96,34,31,-22,-103,-115,24; MA /M: SY='A'; M=87,-101,-19,-100,24,5,-107,9,-102,-36,-93,-99,-106,-100,-106,-84,-91,-20,-108,-98; MA /M: SY='L'; M=-24,31,-118,-113,-10,5,-108,45,-112,65,45,-111,-115,-107,-112,-105,-97,7,-109,-92; MA /M: SY='R'; M=-26,-110,-88,-91,-111,-24,-88,-109,-17,-111,-101,82,-109,-83,89,-21,-1,-22,-119,-103; MA /M: SY='K'; M=-38,-110,-91,13,-108,-102,43,-107,56,-5,-97,-8,-103,-20,55,48,-1,-104,-115,-98; MA /M: SY='S'; M=-92,8,-98,-99,-95,-102,56,-88,-6,45,-86,34,-108,-93,-98,59,23,6,-118,-95; MA /M: SY='R'; M=11,-114,3,-88,-109,-38,34,-112,20,-110,-100,-9,55,5,75,-91,7,-108,-112,7; MA /M: SY='D'; M=-97,-112,65,14,31,43,-93,-109,8,-105,-5,-86,-105,-92,-1,-25,17,-107,-103,47; MA /M: SY='F'; M=-7,-107,-115,-110,73,-26,4,39,-32,11,21,-106,-113,-107,-19,-101,-7,36,-100,-80; MA /M: SY='E'; M=-45,-114,-26,62,-14,-108,-92,-3,7,-54,51,28,-103,45,45,-95,-96,-37,45,-96; MA /M: SY='E'; M=-98,45,14,76,-109,-110,-92,-33,-17,-32,-100,0,-102,20,55,-93,-11,-39,-115,-15; MA /M: SY='L'; M=3,7,21,-101,-89,-112,-104,22,-105,58,34,-105,-113,21,-106,-32,-94,34,-114,-95; MA /M: SY='P'; M=-94,-111,34,4,-106,-27,5,-104,39,-108,-101,-88,44,-87,22,42,18,-2,-112,22; MA /M: SY='D'; M=-25,-112,57,9,-17,1,36,-106,19,-106,10,-86,19,38,10,-14,16,-19,-117,-99; MA /M: SY='R'; M=-97,21,-14,48,-1,9,-4,1,30,-104,-99,-91,-10,9,57,-28,-11,-35,-112,-99; MA /M: SY='N'; M=0,-108,13,18,-112,-96,6,-22,-15,-108,-101,60,30,24,-8,48,-11,-22,-120,-103; MA /I: I=-16; MD=-40; MA /M: SY='Q'; M=-25,3,29,-25,-104,-102,-93,-102,22,-39,-99,41,-107,46,-7,31,19,-3,-114,28; D=-16; MA /I: I=-16; MD=-40; MA /M: SY='Q'; M=-8,-2,-2,28,-109,-39,-99,-31,16,13,-96,15,-25,45,-9,-31,38,-100,-119,-105; D=-16; MA /I: I=-16; MD=-40; MA /M: SY='Q'; M=-15,-112,30,6,-7,19,-98,-105,1,-108,-103,11,-107,43,-6,3,25,5,-115,-5; D=-16; MA /I: I=-16; MD=-40; MA /M: SY='G'; M=1,-114,14,-101,-1,44,19,-17,-32,-45,-101,20,-112,7,-10,-23,-16,2,-114,10; D=-16; MA /I: I=-16; MD=-40; MA /M: SY='Q'; M=-97,-118,35,-14,-121,33,15,-115,-97,-118,-110,3,38,42,-21,40,-97,-14,-124,-110; D=-16; MA /I: I=-16; MD=-40; MA /M: SY='D'; M=-27,-123,34,15,-2,22,-5,-118,6,-36,-113,-23,-14,-26,-38,-6,-29,-37,-126,-111; D=-16; MA /I: I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40; MA /M: SY='P'; M=29,-111,-92,-23,-115,15,15,-111,-89,-114,-103,59,80,-92,27,-11,-4,-108,-118,-108; MA /M: SY='Y'; M=-21,71,-104,-17,59,-111,60,-95,-100,-92,-91,-1,-115,-100,-16,-98,-24,-6,-87,93; MA /M: SY='R'; M=-100,-113,-97,-88,-105,-110,-93,-102,67,8,-93,0,-108,-81,89,-95,-9,-19,-112,-99; MA /M: SY='V'; M=-95,-107,-118,-111,-5,-121,-115,57,-106,16,-76,-112,-114,-11,-3,-105,-92,81,-114,-93; MA /M: SY='Y'; M=-108,-116,-111,-108,71,-115,-87,-16,12,-88,-89,-108,-117,-101,-11,-105,-103,-96,83,111; MA /M: SY='R'; M=-45,-118,-94,2,-111,-108,-89,-115,50,-110,-99,-90,-2,73,87,-93,-98,-111,-107,5; MA /M: SY='F'; M=-102,-107,-117,-114,65,-24,-106,43,-112,62,20,-2,-117,-110,-111,-108,-98,-4,-100,-81; MA /M: SY='R'; M=-44,-9,-105,-97,-95,-112,-101,-5,40,36,19,-16,-19,-13,43,-36,-11,39,-113,-97; MA /M: SY='P'; M=-96,31,55,-87,-112,-7,-98,-110,21,-111,19,-8,73,-93,-6,29,7,-109,45,-105; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=34(34); /POSITIVE=34(34); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DNA_BIND; /FT_DESC=IRF tryptophan pentad repeat; CC /VERSION=4; DR Q3SZP0 , IRF1_BOVIN , T; Q90876 , IRF1_CHICK , T; DR P10914 , IRF1_HUMAN , T; P15314 , IRF1_MOUSE , T; DR A0FIN4 , IRF1_PIG , T; P23570 , IRF1_RAT , T; DR Q98925 , IRF2_CHICK , T; P14316 , IRF2_HUMAN , T; DR P23906 , IRF2_MOUSE , T; Q8R4E0 , IRF2_SIGHI , T; DR Q4JF28 , IRF3_BOVIN , T; Q90643 , IRF3_CHICK , T; DR Q14653 , IRF3_HUMAN , T; P70671 , IRF3_MOUSE , T; DR Q764M6 , IRF3_PIG , T; Q15306 , IRF4_HUMAN , T; DR Q64287 , IRF4_MOUSE , T; Q58DJ0 , IRF5_BOVIN , T; DR Q13568 , IRF5_HUMAN , T; P56477 , IRF5_MOUSE , T; DR Q08DD6 , IRF6_BOVIN , T; O14896 , IRF6_HUMAN , T; DR P97431 , IRF6_MOUSE , T; Q92985 , IRF7_HUMAN , T; DR P70434 , IRF7_MOUSE , T; Q90871 , IRF8_CHICK , T; DR Q02556 , IRF8_HUMAN , T; P23611 , IRF8_MOUSE , T; DR Q00978 , IRF9_HUMAN , T; Q61179 , IRF9_MOUSE , T; DR F5HF68 , VIRF1_HHV8P, T; Q2HR71 , VIRF2_HHV8P, T; DR F5HIC6 , VIRF3_HHV8P, T; Q2HR73 , VIRF4_HHV8P, T; 3D 1IF1; 1IRF; 1IRG; 1T2K; 2DLL; 2IRF; 2O61; 2O6G; 2PI0; 3QU3; 3QU6; 4HLY; 3D 4P55; 6TD4; 7JM4; 7O56; 7OGS; 7OOT; 7RH2; PR PRU00840; DO PDOC00522; //