ID AGENET_LIKE; MATRIX. AC PS51641; DT 01-MAR-2012 CREATED; 01-MAR-2012 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Agenet-like domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=53; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.1074364; R2=0.0082990; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1072; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=301; N_SCORE=5.6; MODE=1; TEXT='RR'; MA /DEFAULT: M0=-100; D=-200; I=-200; B1=-1000; E1=-1000; MI=-505; MD=-505; IM=-505; DM=-505; MA /I: B1=0; BI=-505; BD=-505; MA /M: SY='D'; M=-36,-81,62,-33,-226,-234,-222,-83,-77,33,33,-28,-82,10,-57,-39,-116,-99,-245,-71; MA /M: SY='E'; M=-25,-238,-26,64,-132,-234,-223,-232,-5,-43,-48,-80,-26,-60,-11,-7,18,-40,-244,-73; MA /M: SY='V'; M=-77,-105,-246,-240,-218,-105,-247,6,-238,-66,-53,-241,-36,-93,-240,-113,-216,87,-249,-226; MA /I: I=-11; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='E'; M=-226,-245,8,95,-105,-239,-219,-122,-71,-45,-234,-220,-53,-60,-106,-114,-225,-238,-33,-235; D=-11; MA /I: I=-11; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='V'; M=1,-228,-239,-96,-219,-70,-80,-19,-233,-134,-207,-235,-8,-234,-236,-89,-107,87,-246,-225; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-29; MA /M: SY='Y'; M=-130,-3,-52,2,35,-100,-64,-82,-115,-25,-61,-224,-102,-215,53,-5,-222,-223,-212,78; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-29; MA /M: SY='S'; M=-70,-77,-8,-110,-56,25,-27,-225,-222,-25,-4,-30,-229,-13,-226,54,25,-47,24,-8; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-29; MA /M: SY='R'; M=-36,-255,-239,-70,-247,-248,-234,-69,18,-245,-238,-234,-14,-32,63,-39,-236,-22,-250,-30; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-29; MA /M: SY='A'; M=33,-59,-20,-16,-37,-52,-224,-29,-18,-37,-219,-5,-36,8,-221,32,6,-15,-239,-225; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-29; MA /M: SY='N'; M=-52,-231,23,-62,-236,-9,-3,-44,-39,-237,-227,92,-106,-7,-72,-37,-15,-72,-249,-78; D=-11; MA /I: I=-11; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='D'; M=-58,-59,43,28,-85,-94,-59,-260,-239,-61,-40,3,-58,-235,-246,-42,-242,-258,-273,-254; D=-11; MA /I: I=-11; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='Q'; M=-65,-251,13,-16,-85,-242,-8,-247,-6,-52,-239,0,-244,37,-21,-12,-5,-108,-256,-60; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-29; MA /M: SY='E'; M=-36,-256,-222,62,-87,-75,-3,-55,-41,-43,-240,-35,20,-222,-68,-235,-237,-244,-32,-73; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-29; MA /M: SY='P'; M=-16,-256,-242,-30,-249,-91,-246,-35,-240,-31,-236,-117,78,-240,-249,-234,1,-70,-32,-249; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-29; MA /M: SY='C'; M=-10,91,-74,-147,-15,51,-31,-234,-87,-60,-12,-83,3,-228,-58,-20,-115,-138,0,-46; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-29; MA /M: SY='A'; M=55,40,-85,-71,-37,44,-229,-33,-73,-48,-119,-217,-76,-49,-229,-1,-72,-85,-235,-228; MA /M: SY='W'; M=-232,-38,-251,-238,44,-83,-241,-62,-231,-80,-223,-53,-239,-232,-233,-99,-236,-61,156,26; MA /M: SY='W'; M=-64,-158,-242,-109,-4,-106,-77,-120,-108,-82,-221,-107,-99,-20,-54,-56,-126,-82,146,77; MA /M: SY='P'; M=-100,-51,-222,-35,-142,-130,-61,-92,54,10,-66,-176,73,10,-23,-80,-35,-43,-33,-225; MA /M: SY='A'; M=69,18,-225,-226,-237,64,-229,-234,-225,-233,-226,-215,-227,-222,-230,-95,-148,-186,-234,-233; MA /M: SY='F'; M=-222,-41,-224,-30,54,-175,-38,-21,46,-98,-69,-219,-231,-20,45,-25,-47,6,-222,-5; MA /M: SY='V'; M=-216,-230,-243,-239,-211,-104,-244,66,-235,-110,-115,-236,-236,-236,-238,-228,-213,81,-240,-72; MA /M: SY='K'; M=-214,-225,-46,-208,-213,-78,-13,-73,69,41,-202,-210,-223,-204,35,-42,18,1,-228,-213; MA /M: SY='M'; M=-37,-45,59,-23,-216,-219,-35,-208,32,21,82,-17,-220,-205,-65,18,-9,-121,-232,-213; MA /M: SY='I'; M=-212,8,-233,-228,54,-115,-226,58,-72,-19,33,-224,-229,-224,-25,-15,-99,56,-9,-200; MA /M: SY='H'; M=-67,-229,-33,-205,-16,-17,86,39,61,-67,-40,-26,-221,10,22,-74,-212,-210,-228,-66; MA /M: SY='G'; M=-17,-226,19,46,-231,68,-214,-233,-38,-231,-224,-123,-81,-70,-215,42,-35,-227,24,-222; MA /I: I=-39; MI=0; MD=-99; IM=0; DM=-99; MA /M: SY='D'; M=-71,-29,91,49,-237,8,-58,-235,-202,-231,-225,-100,-216,64,-208,-34,-210,-231,-238,-221; MA /I: I=-48; MI=0; MD=-120; IM=0; DM=-120; MA /M: SY='F'; M=-121,-25,-65,-24,98,-14,-216,-9,-220,-43,-31,-62,-227,-62,-222,40,-14,-47,-206,-16; MA /M: SY='Y'; M=25,20,-227,-224,19,-226,-24,29,-221,-3,-197,-223,-230,-58,-221,-82,-210,28,-203,93; MA /M: SY='V'; M=-11,-219,-222,-218,-15,-226,34,-4,-30,-23,-199,-215,-223,-53,-24,-45,52,71,-230,-22; MA /M: SY='V'; M=-105,-14,-234,-229,-202,-236,-234,76,-225,-76,-190,-227,-227,-226,-69,-218,-204,88,-231,-210; MA /M: SY='E'; M=17,-224,19,83,-37,-219,-69,-76,7,-48,-213,-50,-212,-50,-20,-31,-8,4,-229,-74; MA /M: SY='Y'; M=-218,-223,-226,-225,88,-228,-34,-196,-70,-20,-198,-64,-232,-220,-218,-26,-212,22,-191,101; MA /M: SY='A'; M=60,-1,0,56,-220,-71,-212,-42,-41,-23,-4,3,-66,-20,-211,-72,-8,-1,-229,-58; MA /M: SY='N'; M=61,11,-7,-40,-58,37,-44,-219,-210,-222,-215,74,-220,-208,-216,-42,-94,-17,-230,-30; MA /M: SY='C'; M=-211,99,20,-104,2,-43,-212,-217,-81,-35,-214,67,11,-213,-18,-6,-2,-33,70,-53; MA /I: I=-14; MD=-37; MA /M: SY='D'; M=-232,-247,76,21,-6,-36,11,-241,-224,-23,-235,-88,-8,-19,-230,-69,-227,-241,-252,-229; D=-14; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37; MA /M: SY='W'; M=53,-229,-68,13,-213,-215,-225,-223,-41,-111,-59,-6,6,-211,-218,-1,-4,-220,132,-55; D=-14; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37; MA /M: SY='Q'; M=3,-222,-72,-6,-225,-215,-26,-39,-69,-91,-211,-2,-22,82,-40,10,75,-212,-231,-69; D=-14; MA /I: I=-14; DM=-37; MA /M: SY='Y'; M=-85,-229,-211,19,16,-222,11,-30,-6,-95,-1,-34,64,5,-75,-37,-26,-45,-202,95; MA /M: SY='N'; M=-208,-31,25,51,-224,-212,-204,-103,-70,-221,-5,82,27,-200,-209,-25,55,-32,-18,-219; MA /M: SY='E'; M=-76,-228,49,79,-227,-221,24,-33,-43,-85,-41,-200,-213,-51,62,-10,-29,-220,-232,-215; MA /M: SY='I'; M=-212,-227,-220,-55,-81,-229,-218,86,10,4,-192,-62,-221,73,-42,-74,-78,-23,-8,-207; MA /M: SY='V'; M=-206,3,-63,-227,32,-233,-229,46,-224,-83,-86,-225,-228,-226,-226,-217,-60,91,-223,-2; MA /M: SY='P'; M=-36,-224,-62,42,-226,-24,-214,-219,-39,-70,-215,-53,88,-205,-213,5,69,-215,-231,-222; MA /M: SY='F'; M=-86,-223,-88,-221,87,-81,-216,47,-3,23,-33,-220,-25,-218,21,-59,-65,-84,-206,-12; MA /M: SY='E'; M=-29,-225,15,74,-60,26,70,-134,-12,-224,-217,28,-213,-33,-205,10,-206,-39,-232,-213; MA /M: SY='R'; M=-40,-228,48,18,-223,-218,-1,-32,-25,-103,-214,15,-219,31,83,-12,-62,-73,-228,-17; MA /M: SY='L'; M=-105,-1,-232,-226,-196,-233,-225,33,-225,68,-184,-227,-229,-222,-225,-25,-206,64,-226,-206; MA /M: SY='R'; M=-217,-232,-214,-202,-223,-227,-55,-228,-175,-48,-211,-207,-225,-191,122,-211,-215,-76,-54,-211; MA /M: SY='P'; M=-35,-222,-221,-214,35,-220,-214,-55,-82,47,18,-215,60,-16,-3,44,-19,-71,-220,-205; MA /M: SY='P'; M=-21,-227,-220,-91,-218,-72,-221,-42,1,-16,-205,-219,97,-214,-19,-31,-67,55,-230,-220; MA /I: E1=0; IE=-505; DE=-505; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=38(19); /POSITIVE=38(19); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Agenet-like; CC /VERSION=2; DR P51113 , FMR1A_XENLA, T; Q2KHP9 , FMR1B_XENLA, T; DR Q9NFU0 , FMR1_DROME , T; Q06787 , FMR1_HUMAN , T; DR P35922 , FMR1_MOUSE , T; Q5R9B4 , FMR1_PONAB , T; DR Q80WE1 , FMR1_RAT , T; Q6GLC9 , FMR1_XENTR , T; DR P51115 , FXR1A_XENLA, T; Q7ZTQ5 , FXR1B_XENLA, T; DR Q2TBT7 , FXR1_BOVIN , T; O70523 , FXR1_CRIGR , T; DR F1QLR3 , FXR1_DANRE , T; P51114 , FXR1_HUMAN , T; DR Q61584 , FXR1_MOUSE , T; Q5XI81 , FXR1_RAT , T; DR Q5BJ56 , FXR1_XENTR , T; P51116 , FXR2_HUMAN , T; DR Q9WVR4 , FXR2_MOUSE , T; 3D 2BKD; 3H8Z; 3KUF; 3O8V; 4OVA; 4QVZ; 4QW2; PR PRU00973; DO PDOC51641; //