ID   YCGL; MATRIX.
AC   PS51648;
DT   01-JUN-2012 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   YcgL domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=85;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=80;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9341558; R2=0.0142341; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8030.1577148; R2=7.8421054; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=567; H_SCORE=12477; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=321; H_SCORE=10547; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-20,-21,-28,-18,-1,-21,-1,16,-8,19,52,-19,-21,0,-4,-20,-10,8,-20,-1,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-26,-23,-29,-21,14,-31,-7,16,-28,30,15,-22,-27,-19,-19,-24,-11,7,-17,7,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-17,96,-27,-26,-19,-26,-28,-26,-26,-18,-18,-17,-34,-26,-27,-6,-5,-8,-45,-27,-26;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-14,-12,-11,-13,-9,-14,-7,-11,-9,-8,-10,-15,-11,-17,5,0,2,-18,-6,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,34,-30,17,0,-12,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,28,76,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-29,-2,8,-28,-19,-8,-30,44,-28,-10,0,-12,10,35,-8,-9,-20,-21,-10,8;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-1,-11,-19,-10,-29,-19,9,-10,-1,-10,39,22,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-9,-25,-8,0,-22,-16,-11,-14,4,-19,-9,-5,3,5,4,3,-2,-13,-27,-15,1;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-5,-30,-5,5,-25,-20,-7,-28,40,-23,-9,-1,-14,9,40,-11,-10,-19,-20,-10,5;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,9,-29,-20,-7,-29,44,-28,-9,0,-12,13,35,-9,-10,-21,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=2,7,-22,11,10,-26,-11,-7,-20,-5,-17,-14,1,-6,6,-9,8,-1,-17,-31,-17,8;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-30,28,16,-37,0,0,-32,1,-26,-17,10,-11,18,-4,0,-11,-30,-29,-18,17;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-12,-11,-9,-11,-16,-15,-8,-10,-10,-2,-1,-12,-6,-10,18,35,-1,-31,-11,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,39,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,71,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23,44,-30,9,0,-15,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,25,66,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-31,-27,3,-31,-27,29,-24,22,14,-29,-29,-26,-21,-17,-4,37,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='E'; M=4,4,-25,7,19,-27,-12,-9,-23,-2,-22,-19,1,14,2,-10,4,-5,-22,-30,-22,10;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-26,-3,2,-23,-13,-10,-23,26,-20,-9,3,-14,2,17,-5,-2,-17,-23,-11,2;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-30,-8,1,-23,-13,-4,-31,30,-23,-11,0,-18,8,53,-9,-11,-21,-20,-12,1;
MA   /M: SY='D'; M=-15,36,-28,50,27,-35,-11,0,-35,2,-28,-26,16,-8,5,-7,4,-7,-28,-38,-20,16;
MA   /M: SY='D'; M=-12,38,-27,49,21,-35,-10,-1,-34,1,-27,-26,19,-10,2,-8,2,-8,-28,-37,-20,12;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,74,-30,-20,2,-30,13,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,8,28,-29;
MA   /M: SY='S'; M=7,3,-14,4,2,-19,-5,-8,-20,-8,-25,-18,7,-11,-1,-10,28,15,-11,-34,-14,0;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-26,4,5,-25,-4,-5,-30,12,-25,-16,4,-15,4,25,3,-5,-21,-27,-16,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,21,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,39,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=5,4,-24,8,35,-27,-14,-6,-25,7,-20,-17,-1,-4,11,-3,5,-5,-21,-28,-19,23;
MA   /M: SY='E'; M=8,-5,-22,-3,9,-23,-11,-14,-15,-6,-16,-14,-9,7,-4,-14,2,-4,-9,-28,-21,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-20,-26,-16,-2,-24,-8,16,-15,24,35,-22,-23,-2,-12,-20,-9,8,-21,-2,-9;
MA   /M: SY='E'; M=9,-1,-21,-3,12,-23,-13,-11,-18,11,-19,-12,-2,-10,2,0,3,-3,-10,-26,-16,7;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-7,-23,-10,-5,-18,-13,18,-12,-8,-11,8,-3,-7,6,-7,-1,-1,-14,-27,-4,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,71,-30,-20,2,-30,15,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,6,26,-29;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='K'; M=1,-6,-25,-8,2,-26,-17,-11,-20,10,-21,-10,-6,9,7,4,0,2,-17,-24,-16,4;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-21,-38,-14,-4,-16,-21,-20,-18,-12,-25,-18,-20,75,-14,-20,-11,-10,-26,-25,-23,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,1,-27,3,21,-29,-17,0,-22,12,-19,-8,2,-10,28,10,2,-6,-23,-25,-13,24;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-24,-23,-27,-19,29,-28,-5,3,-20,19,7,-20,-28,-20,-13,-22,-11,-1,-6,19,-19;
MA   /M: SY='V'; M=4,-25,-14,-28,-25,-4,-26,-27,25,-20,7,7,-22,-23,-23,-21,-6,1,34,-27,-10,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-19,-18,-27,-18,5,-21,-7,12,-14,16,37,-17,-20,-7,-12,-13,-2,7,-20,0,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-13,-23,-16,-9,-6,-26,-14,13,-15,13,17,-15,-18,-8,-16,-14,-4,8,-24,-6,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-34,-25,12,-31,-21,27,-26,29,22,-25,-26,-21,-21,-23,-9,19,-18,2,-24;
MA   /M: SY='N'; M=5,4,-23,-3,-4,-20,-8,-9,-15,-6,-19,-14,12,10,-6,-10,2,-3,-18,-30,-20,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,11,-20,0,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-2,14,-21,14,4,-22,-13,-9,-20,1,-15,-14,8,-13,-3,-5,2,5,-14,-30,-15,0;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-3,-30,0,1,-29,5,-14,-30,8,-29,-17,-2,9,-4,-1,-2,-8,-24,-26,-21,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-1,-29,2,13,-24,-12,-2,-31,19,-22,-15,2,-14,9,38,-4,-9,-23,-24,-15,8;
MA   /M: SY='R'; M=-9,4,-27,6,12,-27,-16,-6,-29,26,-25,-14,2,-12,8,27,-3,-7,-20,-25,-14,9;
MA   /I: I=-15; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-24,-7,5,-25,-17,-3,-19,17,-17,-2,-2,-12,19,19,-2,-3,-16,-20,-10,11; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=31,-10,-16,-17,-12,-21,10,-9,-16,-12,-14,-10,-7,-14,-11,-18,5,-6,-6,-22,-17,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-22,-8,-3,-16,-13,-3,-11,-1,-6,1,4,-18,8,7,-2,-1,-14,-26,-11,1;
MA   /M: SY='A'; M=24,-16,-15,-22,-12,-13,-15,-22,7,-14,-2,-2,-15,-15,-14,-20,0,-2,14,-23,-15,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-17,42,-28,59,22,-37,-10,-1,-37,0,-29,-28,17,-9,2,-9,3,-8,-28,-39,-20,12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-4,-28,-24,-5,-29,-26,18,-18,9,6,-22,-25,-21,-19,-11,-2,24,-27,-9,-24;
MA   /M: SY='E'; M=2,9,-25,11,27,-29,-8,-3,-25,2,-20,-16,5,-7,13,-5,3,-7,-24,-28,-19,20;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-25,1,14,-25,-20,-11,-25,28,-23,-12,0,-8,7,15,-1,5,-17,-24,-12,10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,18,12,-30,-30,-28,-20,-14,-2,42,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-11,-28,-13,-3,-17,-25,-13,-10,21,-7,0,-8,-17,0,20,-15,-10,-8,-20,-7,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-27,13,27,-28,-18,-4,-20,7,-17,-13,1,-8,14,-1,-2,-8,-19,-28,-16,20;
MA   /M: SY='A'; M=16,1,-17,-5,4,-19,-9,-3,-15,-6,-12,-11,2,-11,-2,-11,7,2,-11,-27,-15,1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-33,-23,11,-33,-23,26,-30,40,19,-27,-27,-21,-23,-27,-10,15,-18,2,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-21,-12,-5,-16,-11,-17,-7,-3,-9,-5,-6,-15,-6,-7,-1,4,-3,-25,-12,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-28,7,32,-25,-21,-5,-26,19,-17,-13,-2,-7,12,13,-5,-7,-22,-26,-14,21;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-29,-1,9,-30,-19,19,-22,11,-22,-5,3,-5,26,8,-5,-11,-24,-24,-6,16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,64,-30,-7,0,-24,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,16,46,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-18,-30,-18,-18,26,-29,27,-2,-10,-2,0,-18,-29,-8,-9,-19,-11,-12,25,75,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-32,-24,5,-31,-21,28,-25,33,24,-26,-26,-19,-21,-23,-8,21,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,80,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /I: I=-14; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-34,-8,1,-26,-18,-17,-18,-3,-26,-17,-16,69,-7,-13,-9,-9,-25,-25,-24,-7; D=-14;
MA   /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-32,-6,3,-28,-10,-11,-20,-2,-24,-13,-11,45,4,-9,-6,-10,-26,-23,-21,1; D=-14;
MA   /I: I=-14; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-29,4,14,-27,-21,-10,-18,8,-20,-12,-7,10,5,-1,-6,-8,-14,-28,-17,8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-26,13,33,-24,-21,-7,-19,1,-15,-15,-1,-6,8,-6,1,1,-17,-30,-16,20;
MA   /M: SY='N'; M=-8,20,-23,17,6,-25,1,-1,-27,1,-28,-20,25,-15,1,3,10,-2,-25,-35,-20,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-20,-26,-20,7,-27,-14,17,-23,33,17,-22,-28,-17,-17,-23,-8,10,-19,4,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22,16,-30,-20,21,-29,42,20,-28,-29,-21,-20,-28,-10,11,-17,3,-21;
MA   /M: SY='E'; M=3,9,-23,7,15,-26,-11,-7,-24,13,-23,-15,9,-9,5,3,4,-3,-19,-28,-17,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-24,-1,11,-27,-5,5,-22,-2,-19,-7,1,-11,18,-3,5,-2,-22,-26,-13,14;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-9,-28,-8,1,-9,-24,43,-13,-13,0,2,-6,-18,1,-7,-15,-15,-17,-21,14,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-13,-6,-14,-6,-17,-22,-14,-15,3,-8,-6,-11,-11,-3,5,-8,-7,-11,-27,-13,-6;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=YcgL;
CC   /VERSION=4;
PR   PRU00980;
DO   PDOC51648;
//