ID ALPHAVIRUS_MT; MATRIX. AC PS51743; DT 01-JAN-2015 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Alphavirus-like methyltransferase (MT) domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=181; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=176; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0275860; R2=0.0065701; TEXT='-LogE'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=22681.8007812; R2=7.9028573; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.1%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1138; H_SCORE=31675; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=681; H_SCORE=28064; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-23; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; MA /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; MA /M: SY='N'; M=-17,-39,-42,4,-27,-49,1,-15,7,-50,-59,44,-45,-22,23,43,9,28,-5,-39; MA /M: SY='F'; M=-9,-75,-68,-16,72,-34,3,-58,-44,-28,-57,-41,63,2,-12,14,-44,-11,-61,12; MA /M: SY='T'; M=-46,-71,-3,14,19,-8,19,-19,-3,-28,-9,16,-68,-11,-21,25,47,-34,-69,35; MA /M: SY='S'; M=17,-12,11,-32,-49,8,29,-74,-17,-75,-66,30,26,37,-32,48,-1,-52,-81,-45; MA /M: SY='S'; M=-12,-11,-32,-24,17,-7,-14,-22,-6,-34,13,-2,-40,-4,22,42,23,-1,-16,9; MA /M: SY='Q'; M=-7,-38,6,17,-22,-40,-28,-41,2,-9,-5,-16,-24,26,3,22,24,20,-17,1; MA /M: SY='P'; M=6,-24,-10,-47,-6,-37,46,-32,-58,-3,-57,20,56,-39,9,19,-13,2,-75,11; MA /M: SY='H'; M=-24,-73,-55,-58,-70,15,108,-76,-57,-55,-34,37,-40,-51,-20,49,-14,-41,16,-53; MA /M: SY='P'; M=-7,-72,28,-29,-77,-46,-62,-68,-57,-75,-68,10,71,-19,-46,59,31,-20,-84,-71; MA /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37; MA /M: SY='P'; M=37,-75,-63,-41,-78,12,-25,-22,-62,-59,-29,6,90,-61,-70,24,-40,-48,-79,-74; MA /M: SY='M'; M=30,-19,-74,-42,42,-72,-64,2,-37,7,64,-7,-26,-66,-68,-62,-58,34,-63,38; MA /M: SY='C'; M=63,66,-51,-38,-3,-60,39,-39,-64,6,-56,-23,-72,-9,-66,22,-54,-56,-75,-8; MA /M: SY='K'; M=54,-70,-58,-53,-74,-11,17,-73,62,-73,-63,23,-67,-49,27,-38,-2,-65,-75,-19; MA /M: SY='A'; M=66,-8,-37,-24,-68,-1,-26,-6,-63,-59,32,-60,-48,-32,-68,-8,32,12,-78,-36; MA /M: SY='I'; M=-45,10,-48,-37,18,-76,30,44,-69,33,39,-36,-75,-44,-49,21,-21,18,-24,-26; MA /M: SY='R'; M=-46,-80,-50,61,-77,-73,-3,-81,-26,-59,-66,-10,-67,-22,91,-1,-39,-75,-78,-65; MA /M: SY='N'; M=-6,-31,-24,8,-46,-31,31,-17,14,-2,-10,68,-70,-34,27,-20,8,-23,-81,-39; MA /M: SY='H'; M=3,56,-20,-46,-15,-75,68,10,-42,33,12,-30,-77,-38,-7,-48,-47,12,-17,19; MA /M: SY='E'; M=16,-12,-33,58,20,-55,-26,10,-59,30,34,-48,-69,-36,-42,-21,-23,-27,-72,-35; MA /M: SY='N'; M=-38,-69,-58,-4,-36,-69,-28,-24,-55,42,-49,56,-71,-17,19,-21,52,-54,-76,8; MA /M: SY='Y'; M=-19,-76,12,30,31,-40,27,-62,11,-8,-57,15,-71,18,-6,-29,-60,-20,19,61; MA /M: SY='Y'; M=-27,-31,11,6,-8,-73,0,5,-9,23,5,24,-73,-21,1,-26,-6,5,33,41; MA /M: SY='C'; M=-11,44,-79,-54,16,-79,-6,27,-44,39,37,-47,-79,-70,-50,-68,-45,42,9,9; MA /M: SY='Y'; M=3,-24,-36,-12,-27,-1,20,9,-12,30,18,-32,-73,-59,20,-15,-21,-1,20,32; MA /M: SY='P'; M=6,-15,35,-19,-46,-13,25,-70,7,-26,6,14,37,-53,21,27,-14,-48,-6,-15; MA /M: SY='H'; M=-17,-12,-21,-6,-21,-32,39,-20,21,-6,31,34,-36,6,25,16,-33,-63,28,19; MA /M: SY='Y'; M=-12,37,-74,-73,35,-34,29,12,-59,32,1,-12,-79,-45,-70,-23,-60,21,-61,59; MA /M: SY='P'; M=-39,15,-35,-46,-43,28,-33,-4,27,-5,-59,-15,70,-38,9,-20,-31,-7,-77,-42; MA /I: I=-9; MD=-23; MA /M: SY='N'; M=-39,-34,11,-57,-7,18,-24,-35,33,-40,-33,33,-25,-15,18,22,6,-35,-75,15; D=-9; MA /I: I=-9; MD=-23; MA /M: SY='R'; M=-75,-89,-8,27,-53,-33,12,-80,-2,-21,-74,26,-57,-42,31,-12,-29,-25,-91,-15; D=-9; MA /I: I=-9; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; MA /M: SY='P'; M=-41,-93,39,-21,-57,-29,-33,-61,7,-57,-81,-28,39,23,-36,-3,-31,-38,-96,-52; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-23; MA /M: SY='V'; M=16,-15,-18,-37,18,-46,-16,-4,-74,-24,-17,-49,-47,-28,-77,9,-1,39,-16,-17; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-23; MA /M: SY='P'; M=-16,-75,-6,-16,-22,-56,17,-2,4,-5,-57,-19,41,-24,-8,-11,40,2,-16,13; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-23; MA /M: SY='F'; M=-45,35,-80,-77,62,-57,-70,27,-73,3,0,-45,-79,-75,-74,-36,1,52,-62,35; MA /M: SY='I'; M=-42,-31,-53,-70,0,-78,-26,47,15,24,20,-69,-75,-64,-64,4,-37,31,27,44; MA /M: SY='D'; M=-47,-76,90,26,12,-6,-57,-75,-39,-74,-73,-44,-67,-25,-62,35,-54,-27,0,-25; MA /M: SY='I'; M=-24,-9,-83,-78,32,-83,-77,75,-75,-2,42,-75,-11,-48,-77,-69,-28,40,-71,-52; MA /M: SY='G'; M=-42,-76,-61,-62,-81,85,-66,-85,59,-63,-71,-50,-67,-56,-27,-29,-64,-79,-73,-73; MA /M: SY='G'; M=8,-32,-5,7,-82,74,-39,-82,-5,-81,-71,-53,43,-17,-7,-20,-47,-77,-77,-74; MA /M: SY='N'; M=18,28,15,-10,-76,-7,-3,-40,-37,-76,-68,80,-69,-34,-30,48,-48,-53,-87,-69; MA /M: SY='W'; M=-64,-79,-69,-26,26,-40,-68,10,59,-15,-57,-65,53,-58,-38,-27,-61,-1,88,-5; MA /M: SY='L'; M=6,-10,-4,-46,28,-45,-6,-12,-50,39,-9,-35,-47,-37,5,10,-7,23,-15,-31; MA /M: SY='R'; M=1,-39,-12,-3,20,-25,23,-66,2,-38,-61,13,-69,19,35,32,21,-25,-72,11; MA /M: SY='H'; M=-19,-41,-38,-33,15,-35,103,-5,0,-2,-25,-16,-73,-55,0,-20,-45,4,-19,28; MA /M: SY='L'; M=-2,-9,-77,-73,22,-77,-67,25,-68,47,47,6,-78,-45,-10,-52,-59,27,10,-9; MA /M: SY='R'; M=-5,-9,2,-42,-24,-22,3,-38,40,-2,-2,17,-32,12,55,-4,-44,-54,-14,-10; MA /M: SY='R'; M=22,-74,-40,-21,-23,-65,19,-69,22,-43,8,28,-50,20,56,7,-15,-54,-8,33; MA /M: SY='G'; M=-32,-75,-9,2,-76,55,-12,-55,15,-40,-34,26,-6,-3,27,19,-57,-16,-79,-69; MA /M: SY='H'; M=-28,13,1,6,-13,-22,69,-50,-8,-27,-62,44,12,-17,43,6,-14,-43,-82,-59; MA /I: I=-23; MD=-58; MA /M: SY='K'; M=-32,-37,20,-40,-18,-14,9,-46,31,-42,-63,31,1,11,6,24,23,-5,-78,-1; D=-23; MA /I: I=-23; MD=-58; MA /M: SY='N'; M=-42,-86,31,-65,-43,-13,7,-63,-24,-29,-13,53,-20,-9,21,-22,-48,-20,-96,-76; D=-23; MA /I: I=-23; MI=0; MD=-58; IM=0; DM=-58; MA /M: SY='W'; M=-49,-93,-31,-41,14,-44,15,-65,-19,-43,5,5,-91,-30,-17,-3,4,-48,20,5; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='V'; M=-20,4,28,-51,-11,-77,-13,8,-50,-10,-21,-46,-75,-68,-22,-34,-6,72,-9,18; MA /M: SY='H'; M=-26,-77,-30,4,-68,-54,128,-58,-20,-56,-56,-21,-68,-23,-19,-21,6,-4,-93,-25; MA /M: SY='C'; M=-31,80,-39,-70,29,-40,17,6,-67,4,-1,-63,-77,-37,-22,29,-8,20,-70,32; MA /M: SY='C'; M=-35,124,-24,-75,-30,-28,-21,24,-58,-15,-14,-67,-83,-47,-50,-48,-60,12,3,13; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='C'; M=-18,86,-55,-66,17,-46,-57,-55,-58,-32,8,85,-78,-61,0,-7,-4,-67,-82,-12; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='P'; M=-11,-28,-66,-40,-53,-70,-28,-71,-37,-46,-39,-49,98,-39,48,-21,-3,-43,-77,-5; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='I'; M=-28,33,3,-68,-5,-78,-15,36,-19,26,19,11,-30,-66,2,-66,-10,16,-22,0; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='L'; M=-40,-36,-78,-49,-25,-57,-1,30,-16,52,2,-42,-25,-68,-32,-33,-42,29,-72,18; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='D'; M=-39,9,79,15,-81,-22,21,-76,-58,-77,-73,-12,-68,-30,-65,22,39,-25,-95,-70; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='P'; M=27,-39,-32,-66,-29,-8,-6,14,-42,-32,-12,-28,50,-65,-72,27,-19,17,11,-15; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='R'; M=-15,-81,-26,-18,-77,-74,-3,-80,70,-56,-66,-11,-71,-45,76,-60,-63,-54,-77,-24; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='D'; M=-71,-84,115,-35,-91,-68,-23,-89,-58,-88,-86,-22,-70,-57,-67,-59,-61,-86,-107,-73; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='A'; M=31,-1,-9,-44,-11,-1,30,-18,-1,-5,-60,3,-76,-15,-31,-3,-19,12,-83,-65; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='A'; M=38,-37,-69,-10,-7,-36,19,-10,-16,-10,-6,-30,-74,31,-49,-5,5,4,-79,-15; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='R'; M=-72,-88,-68,-56,-81,-82,-24,-88,-29,-80,-69,-61,-81,-45,111,-66,-71,-81,-81,-67; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-4; MA /M: SY='Y'; M=-48,-88,-73,-54,13,-58,73,-51,-19,-45,-62,-30,-85,0,-2,-70,-26,-59,20,88; D=-2; MA /I: I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4; MA /M: SY='P'; M=-12,-89,10,22,-54,-83,-32,12,-19,-76,-18,-70,50,-4,-75,-66,31,-52,-93,-80; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='E'; M=-69,-43,21,48,-83,-58,-11,-43,-15,-23,-38,-14,-76,11,-9,3,7,-5,-93,-76; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='R'; M=13,-83,33,6,-83,-74,-62,-52,-29,-68,-72,6,-77,-6,72,-32,-24,-41,-87,-46; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='M'; M=9,-39,-36,2,-28,-53,-71,-7,-49,-1,40,-69,29,2,-54,2,21,-6,28,-14; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='L'; M=-10,-32,-27,-13,-57,-62,-69,5,-22,43,22,-51,-76,-64,13,-29,20,27,-80,-39; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='H'; M=-5,-37,7,-32,-9,-63,56,-53,5,-53,29,17,-30,-35,19,56,-52,-8,-22,-36; D=-2; MA /I: I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4; MA /M: SY='R'; M=-60,-100,-76,-3,-39,-93,38,-102,-33,-98,-89,30,-95,-72,44,-56,6,-97,-108,-85; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='N'; M=-80,-90,-48,-71,-41,-78,31,-89,8,-49,-17,72,-89,-64,36,-29,-71,-89,-97,-18; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='P'; M=-45,-10,-12,7,-24,-34,-75,-32,-58,12,5,-78,35,7,-79,-17,-40,-30,-83,18; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='H'; M=-21,-85,5,-17,-49,-38,34,8,-17,19,-61,-33,-83,-17,-13,15,-68,-50,-85,8; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='N'; M=-86,-42,0,-27,-30,-27,-86,-22,-6,-19,-83,12,-48,-50,-26,-20,-6,-55,-25,-43; D=-2; MA /I: I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4; MA /M: SY='H'; M=-76,-92,-15,-18,-59,-1,22,-74,-10,-67,-25,-48,7,0,-18,-53,14,17,-96,-21; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='S'; M=40,-7,-10,-64,-85,-44,-71,-61,-34,-83,-75,-61,32,1,-71,63,-55,-72,-88,-47; D=-2; MA /I: I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4; MA /M: SY='C'; M=-90,124,-107,-109,-100,-104,-108,-107,-104,-98,-98,-45,-120,-112,-111,-92,-89,-95,-130,-110; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='F'; M=-56,4,-41,-33,12,-44,-1,-87,-88,-17,-84,-12,-34,-7,-56,-23,7,-48,-101,-49; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='H'; M=-68,-101,7,-18,-100,-68,53,-102,-13,-47,-26,52,-97,-76,-37,-54,-83,-102,-117,-87; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='R'; M=-83,-99,-13,-60,-98,11,-88,-64,3,-55,-88,-40,-57,-79,26,-40,19,-26,-105,-92; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='F'; M=3,-45,-12,-92,40,-17,-92,-34,-93,-40,-79,-87,-99,-93,-96,-18,-24,-1,-89,-22; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='Q'; M=-44,-100,-72,36,-99,-8,-79,-54,-49,-46,-83,-26,-51,56,-40,-16,-80,-32,-100,-89; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='N'; M=-40,-92,27,19,-43,-16,10,-91,-27,-93,-87,39,-86,-41,-55,-30,4,-34,-105,-85; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='C'; M=-74,134,-89,-86,-51,-87,-89,-88,-18,-65,-79,-78,8,-89,-46,-75,-73,-78,-106,-90; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='S'; M=-26,-38,7,6,-18,-13,14,-59,13,-62,-71,12,-8,-33,-2,23,9,-5,-86,-24; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='H'; M=-66,39,-48,-47,23,-83,62,23,-35,-45,-53,-44,-81,-37,-35,-68,-8,51,-16,36; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-4; MA /M: SY='K'; M=-13,-5,-26,8,-76,-56,-6,-28,53,-70,7,-13,8,49,44,0,9,-67,-77,-65; MA /I: I=-26; MI=0; MD=-67; IM=0; DM=-67; MA /M: SY='S'; M=41,14,-20,-25,-72,7,-63,-44,1,-70,-64,-6,-2,-38,-21,52,22,-14,-78,-15; MA /M: SY='D'; M=-24,-41,50,26,-49,-18,-15,-76,32,-56,-35,-1,36,5,16,13,5,-72,-80,-33; MA /M: SY='Y'; M=8,5,-51,-48,0,-69,24,-4,-24,-10,-22,17,-73,-39,19,-1,29,24,11,44; MA /M: SY='A'; M=50,13,-50,-70,-7,26,-71,26,-69,19,8,-65,-33,-66,-73,-9,-57,0,6,-37; MA /M: SY='F'; M=-63,-71,-53,-33,72,-81,-70,40,-55,0,16,-71,-77,-73,-73,-33,14,42,-60,20; MA /I: I=-29; MD=-75; MA /M: SY='M'; M=-20,-35,-35,-89,37,-93,-82,23,-86,1,58,-86,-92,-84,-43,-38,-30,-17,-80,-6; D=-29; MA /I: I=-29; MD=-75; MA /M: SY='H'; M=-87,-103,-10,-78,-21,-14,81,-99,-37,-90,2,-74,-95,20,-39,-16,-87,-99,-100,2; D=-29; MA /I: I=-29; MD=-75; MA /M: SY='D'; M=-31,-104,77,-65,-56,-60,-83,-65,-81,-102,-44,-50,-94,-82,-30,-25,-58,-74,-119,-94; D=-29; MA /I: I=-29; MI=0; MD=-75; IM=0; DM=-75; MA /M: SY='E'; M=33,10,-68,37,-86,-34,-77,-80,-71,-57,-78,-36,-79,-66,-77,32,1,-26,-93,-36; D=-29; MA /I: I=-29; DM=-75; MA /M: SY='L'; M=-7,-9,-79,-50,-34,-61,-70,37,-73,55,54,-27,-78,-69,-73,-68,-37,37,-75,-27; MA /M: SY='H'; M=-65,-77,28,-20,-63,-72,122,-43,-43,-30,-14,-26,-71,9,-57,-38,-62,26,-88,10; MA /M: SY='Y'; M=-11,-27,16,6,29,-31,44,-67,-58,-65,-61,-53,-70,9,-42,56,-11,-46,-61,67; MA /M: SY='W'; M=-3,-74,-81,-74,-16,-28,-76,17,-71,26,20,-75,-2,-70,-74,-48,6,41,108,-6; MA /M: SY='Y'; M=-59,-74,-34,-45,-14,-15,-1,-63,-18,-62,-57,-31,-34,-24,-42,44,23,-44,0,102; MA /M: SY='D'; M=-65,-80,92,-31,-46,-67,0,-73,-8,-14,-40,-46,55,-56,-22,-11,-8,-55,-14,-44; MA /M: SY='M'; M=-10,-27,-12,-2,-27,-38,-20,57,-21,3,79,-21,-45,-38,-40,-14,-29,-10,-25,-16; MA /M: SY='D'; M=-25,-75,51,2,-26,-22,-13,-52,-11,-58,-66,-50,41,34,-16,33,29,-37,-77,10; MA /M: SY='L'; M=-12,-30,-78,-50,13,-59,3,11,-71,56,40,-46,29,-68,-49,-68,-42,22,-71,-10; MA /M: SY='Q'; M=3,4,9,19,-7,-42,-8,-26,11,-7,4,-7,-69,28,5,16,6,1,-22,-1; MA /M: SY='D'; M=7,-74,58,44,-51,-12,-1,-58,-7,-64,-22,15,-40,11,-38,5,23,-39,-14,-44; MA /I: I=-23; MD=-58; MA /M: SY='M'; M=-56,-78,-45,-82,16,-89,-77,26,-81,48,53,-82,-86,-77,-51,-25,-36,17,-79,-59; D=-23; MA /I: I=-23; MD=-58; MA /M: SY='C'; M=31,52,-96,-91,-22,-7,-93,-17,-90,-12,-8,-88,-96,-38,-93,-76,-78,4,-97,-84; D=-23; MA /I: I=-23; MD=-58; MA /M: SY='D'; M=-17,7,23,-13,-99,-31,-16,-97,5,-96,-39,23,-24,-1,-8,-16,-31,-93,-105,-89; D=-23; MA /I: I=-23; MI=0; MD=-58; IM=0; DM=-58; MA /M: SY='F'; M=48,7,-78,-75,71,-2,-41,-14,-45,-37,-26,-70,-79,-73,-75,-16,-26,-45,-63,14; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='M'; M=-29,9,-50,-9,-10,-79,-35,2,-42,36,104,-72,-76,-45,-37,-36,-21,-47,-74,-10; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='D'; M=-11,-35,34,21,-18,-21,3,-9,-14,3,-59,16,-72,-20,27,-6,-9,1,-81,-38; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='R'; M=-2,27,-10,-11,-73,-42,3,-24,16,-27,-63,36,-43,-2,45,37,-6,-32,-83,-66; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='H'; M=7,-41,-59,-38,-20,-67,79,-27,53,-59,-28,-7,45,-35,9,-14,-2,-24,-79,-39; MA /M: SY='G'; M=-58,-76,29,1,-79,51,-5,-54,48,-62,-69,47,-48,-32,13,-25,-18,-76,-80,-69; MA /M: SY='V'; M=31,10,-53,-68,-35,-51,-72,31,-69,15,28,-68,32,-67,-72,-1,12,36,-78,-63; MA /M: SY='H'; M=-43,-75,-3,23,-69,-70,44,-14,42,-19,-16,2,-31,14,34,-5,22,-11,-79,-18; MA /M: SY='T'; M=-59,-19,-47,-1,-42,-74,11,10,23,-5,2,-10,-69,9,33,-10,41,31,-80,-61; MA /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63; MA /M: SY='L'; M=18,14,-80,-75,34,-18,-69,-8,-72,47,32,-74,-79,-71,-41,-65,-22,27,-68,9; D=-25; MA /I: I=-25; DM=-63; MA /M: SY='Y'; M=-65,-19,0,-38,6,-76,34,21,3,6,-8,-41,-52,-38,-17,-10,-29,5,51,75; MA /M: SY='A'; M=54,27,-71,-45,16,37,10,5,-68,-12,2,-63,-73,-36,-71,-54,-60,-9,-68,21; MA /M: SY='T'; M=28,50,-63,-64,-10,-16,-30,-24,-62,-65,-62,-21,-67,-62,-68,40,71,-24,21,-22; MA /M: SY='M'; M=-49,5,-38,-76,60,-80,-38,31,-73,33,81,-43,-78,-71,-73,-42,-27,14,-65,-26; MA /M: SY='H'; M=-59,-33,-21,-29,-34,-78,66,44,-68,12,48,-65,-74,-64,-43,-6,-12,51,-82,-54; MA /M: SY='F'; M=-34,-20,-77,-74,69,-60,-10,22,-70,28,19,-44,-1,-36,-44,-66,14,-19,12,43; MA /M: SY='P'; M=-20,-12,20,-39,-40,-65,-1,-73,-60,-79,-69,-36,106,-37,-38,20,-3,-74,-80,-28; MA /M: SY='P'; M=-19,-35,-2,12,-46,12,-67,-4,-23,-67,-62,-26,79,-14,-67,11,-11,25,-80,-71; MA /M: SY='E'; M=6,-77,13,90,-6,-51,-56,-25,-6,-60,-67,9,-44,-42,-32,-43,-58,-32,-77,-40; MA /M: SY='M'; M=12,-70,-48,-56,-50,-75,-18,49,-43,43,72,-33,-74,-29,-70,-21,-44,0,-72,-1; MA /M: SY='L'; M=-15,-3,-56,-37,30,-78,-6,-4,-71,61,35,-72,-77,-67,-46,-14,9,-3,21,-50; MA /M: SY='D'; M=11,-73,32,6,16,-58,16,8,-37,8,-2,-37,-23,-30,-14,11,-7,-6,15,27; MA /I: I=-22; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55; MA /M: SY='K'; M=4,-35,27,19,-72,36,-11,-76,39,-75,-31,-4,-10,-1,0,-20,-1,-57,-74,19; D=-22; MA /I: I=-22; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55; MA /M: SY='D'; M=-19,-18,49,9,-49,-32,9,-63,18,-8,33,13,-1,-13,6,-3,23,-18,-83,-64; MA /M: SY='E'; M=7,13,-17,46,-32,6,-4,-71,5,-37,-64,-11,8,-9,-7,32,11,-36,-76,-3; MA /M: SY='S'; M=-11,-32,-4,-37,-12,59,-65,-11,-42,-69,-20,-16,-68,-40,-68,62,-51,3,-77,-66; MA /M: SY='L'; M=-32,-12,6,-17,24,-55,2,0,3,32,-16,-39,-11,1,-41,12,-10,4,-67,32; MA /M: SY='N'; M=-44,-5,-16,-21,13,-73,20,26,-50,33,-11,50,-77,-62,-27,-24,-45,-10,28,46; MA /M: SY='P'; M=-20,-82,1,-3,8,-68,-1,-54,-18,-21,-37,0,99,-35,-2,-26,-42,-50,-9,-66; MA /M: SY='W'; M=-12,-76,40,36,11,-10,27,-50,-13,-23,-64,1,-6,-33,-14,15,-8,-25,66,-16; MA /M: SY='L'; M=-2,22,-28,-41,12,-18,-24,24,-54,43,16,2,-76,-67,-71,-19,-13,19,-71,8; MA /M: SY='Y'; M=-29,-75,24,6,-28,20,-48,-69,-24,-42,-61,54,-72,-16,-31,-4,-26,-69,-56,88; MA /M: SY='C'; M=-5,61,-12,9,-45,21,-22,-38,-34,-39,-8,-6,-69,22,-5,6,40,-18,16,3; MA /M: SY='F'; M=-31,-17,-46,-5,53,-46,28,7,-17,6,-51,11,-74,-24,25,-34,19,-5,-64,31; MA /M: SY='W'; M=-34,-26,-10,26,9,-73,-13,0,16,-19,-59,-22,-72,-27,-11,-22,-33,0,121,24; MA /M: SY='Y'; M=-16,0,-30,15,7,-74,4,27,8,-18,-9,-36,-72,-13,12,-7,-16,22,-64,56; MA /M: SY='H'; M=-42,-75,17,-22,-26,-72,45,21,43,-18,-55,-3,-70,-13,28,-20,8,13,12,-11; MA /M: SY='D'; M=-48,-76,54,29,-9,5,-7,-32,14,-39,-65,6,1,-34,19,5,7,-18,-80,-33; MA /M: SY='D'; M=-40,-35,48,2,-27,34,13,-57,24,-53,-68,42,-19,-23,10,1,1,-55,-82,-66; MA /M: SY='D'; M=-47,-41,50,0,-52,48,17,-56,5,-73,-67,18,-42,-26,23,-6,-33,6,-28,-43; MA /I: I=-8; MD=-21; MA /M: SY='D'; M=-37,-29,29,-11,-29,-10,-72,-83,22,-18,-76,-7,-34,-40,20,-2,-11,-61,-91,-45; D=-8; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; MA /M: SY='I'; M=-39,-36,-39,-51,43,-25,-78,54,-44,23,-47,-51,-82,-77,-79,-52,-64,25,23,-1; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-21; MA /M: SY='H'; M=-28,19,-66,-22,-19,-52,43,14,13,3,7,-17,-34,4,-3,10,12,27,27,-12; MA /M: SY='F'; M=-68,-75,-50,-53,82,-78,-29,-24,-37,-32,-8,-49,-79,-12,-12,-34,8,-15,54,79; MA /M: SY='Y'; M=-12,-33,3,-40,35,-9,2,-8,-13,-24,-2,-59,-72,-41,-22,22,29,-20,40,63; MA /M: SY='F'; M=-42,-77,-72,-35,80,-41,-32,-42,-66,-33,-56,-28,76,-5,-52,-26,-30,-15,-55,37; MA /M: SY='D'; M=-37,-76,54,8,-9,24,-24,-6,-25,12,-57,-23,-25,-20,12,-34,-43,-6,-72,29; MA /I: I=-38; MD=-97; MA /M: SY='G'; M=-18,-76,39,-16,-82,67,-63,-80,-36,-57,-74,54,-71,-61,-45,-17,-18,-36,-85,-75; D=-38; MA /I: I=-38; MD=-97; MA /M: SY='D'; M=-27,29,63,17,-78,0,47,-70,-13,-49,-69,23,-72,-20,-45,2,-59,11,-92,-68; D=-38; MA /I: I=-38; MD=-97; MA /M: SY='S'; M=15,-10,-45,7,-9,-9,-38,-73,-7,-60,-27,-17,28,-45,-15,41,22,-41,20,-20; D=-38; MA /I: I=-38; MI=-97; IM=-97; DM=-97; MA /M: SY='S'; M=4,-4,-8,-14,-76,44,-61,-73,-58,-75,-68,24,-65,14,-64,58,40,-50,-82,-70; MA /M: SY='E'; M=9,0,12,50,-22,7,1,-46,-43,3,24,2,-2,-53,-42,1,-7,-12,9,-63; MA /M: SY='S'; M=38,16,-61,-37,-73,45,6,-52,-41,-38,-65,-6,-8,-58,-48,56,-26,-24,-78,-35; MA /M: SY='Y'; M=-70,-81,-70,-73,-1,-77,-38,-35,-46,-53,-27,-49,-82,-61,-62,-49,-44,-60,-29,131; MA /M: SY='T'; M=-58,3,-5,46,-12,-71,-21,-5,-18,-32,-6,9,-23,0,-5,-2,51,18,-22,-29; MA /M: SY='H'; M=-41,-80,-52,-6,-21,-69,125,-60,-50,-69,-56,9,-69,73,-11,-40,-64,-79,-87,-45; MA /M: SY='D'; M=-58,-31,55,-5,-79,-48,14,-77,19,-53,-70,29,55,-51,-4,50,-23,-74,-86,-69; MA /M: SY='W'; M=-33,2,-75,-42,32,-78,-33,2,-11,38,-22,-71,-21,-42,17,-17,-34,15,52,47; MA /M: SY='N'; M=15,-72,45,30,-39,-60,-6,-75,13,-58,-68,46,-29,5,0,35,-12,-70,-16,-66; MA /I: I=-26; MD=-67; MA /M: SY='T'; M=-7,21,22,-32,-71,-68,-15,-19,-16,-26,-18,45,-48,-5,-65,7,51,-6,-88,-19; D=-26; MA /I: I=-26; MD=-67; MA /M: SY='W'; M=-42,-83,-90,-84,-49,-69,-75,11,-62,46,-50,-86,-88,-78,-81,-78,-6,4,77,53; D=-26; MA /I: I=-26; MI=0; MD=-67; IM=0; DM=-67; MA /M: SY='R'; M=-13,-36,-17,-67,-11,-22,-29,-22,9,24,16,-68,-81,11,25,12,-30,-49,-83,-67; D=-26; MA /I: I=-26; DM=-67; MA /M: SY='S'; M=-4,-74,20,17,-38,1,18,-33,28,-45,-1,0,-4,33,-25,44,-24,-56,-18,-37; MA /M: SY='W'; M=-56,-85,-85,-77,31,-78,-65,20,-70,-12,-54,-81,-80,-42,-52,-74,-72,-40,138,85; MA /M: SY='L'; M=-30,-70,-77,-71,35,-79,18,15,-71,58,56,-49,-48,-7,-70,-24,1,-3,-70,-49; MA /I: E1=0; IE=-380; DE=-380; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=131(131); /POSITIVE=131(131); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Alphavirus-like MT; CC /VERSION=3; DR P05080 , 194K_TRVSY , T; P03589 , 1A_AMVLE , T; DR Q00020 , 1A_BBMV , T; P03588 , 1A_BMV , T; DR P27752 , 1A_CCMV , T; P17769 , 1A_CMVFN , T; DR Q83270 , 1A_CMVII , T; Q66121 , 1A_CMVIX , T; DR O40976 , 1A_CMVNT , T; P20122 , 1A_CMVO , T; DR P06011 , 1A_CMVQ , T; Q83264 , 1A_CMVY , T; DR Q83943 , 1A_OLV2I , T; P28726 , 1A_PSVJ , T; DR Q9DUT3 , 1A_PZSVT , T; P28931 , 1A_TAV , T; DR P89680 , 1A_TOBSV , T; P17595 , ALPHA_BSMV , T; DR Q6PLS1 , POLG_ASGVK , T; P36309 , POLG_ASGVP , T; DR Q1KZ59 , POLG_CILVC , T; Q91TW9 , POLG_MRFVC , T; DR Q6QLN1 , POLN_AHEV , T; Q86924 , POLN_AURAV , T; DR P87515 , POLN_BFV , T; Q5XXP4 , POLN_CHIK3 , T; DR Q8JUX6 , POLN_CHIKS , T; Q306W6 , POLN_EEEV1 , T; DR Q306W8 , POLN_EEEV8 , T; Q4QXJ8 , POLN_EEEVF , T; DR P36327 , POLN_EEVV3 , T; Q8V294 , POLN_EEVVC , T; DR Q9WJC7 , POLN_EEVVM , T; P36328 , POLN_EEVVP , T; DR P27282 , POLN_EEVVT , T; Q5Y389 , POLN_GETV , T; DR P29324 , POLN_HEVBU , T; Q81862 , POLN_HEVCH , T; DR Q9IVZ9 , POLN_HEVCT , T; Q9WC28 , POLN_HEVHY , T; DR Q03495 , POLN_HEVME , T; Q6J8G2 , POLN_HEVMG , T; DR Q04610 , POLN_HEVMY , T; P33424 , POLN_HEVPA , T; DR Q9YLR1 , POLN_HEVUS , T; Q8QZ73 , POLN_MAYAB , T; DR P13886 , POLN_ONNVG , T; O90370 , POLN_ONNVI , T; DR O90368 , POLN_ONNVS , T; P13887 , POLN_RRVN , T; DR Q6X2U4 , POLN_RUBVB , T; Q6X2U2 , POLN_RUBVC , T; DR Q9J6K9 , POLN_RUBVD , T; Q86500 , POLN_RUBVM , T; DR Q8BCR0 , POLN_RUBVN , T; Q99IE7 , POLN_RUBVO , T; DR O40955 , POLN_RUBVR , T; P13889 , POLN_RUBVT , T; DR Q99IE5 , POLN_RUBVV , T; Q9JGL0 , POLN_SAGV , T; DR P08411 , POLN_SFV , T; P27283 , POLN_SINDO , T; DR P03317 , POLN_SINDV , T; Q8QL53 , POLN_SLDV , T; DR Q8JJX1 , POLN_SPDV , T; P13896 , POLN_WEEV , T; DR P35928 , POLR_ELV , T; P20126 , POLR_EPMV , T; DR P36304 , POLR_KYMVJ , T; P20127 , POLR_OYMV , T; DR P10358 , POLR_TYMV , T; P20128 , POLR_TYMVA , T; DR P28477 , POLR_TYMVC , T; Q08534 , R1AB_BYVU , T; DR O71189 , R1AB_GLRV3 , T; Q83045 , R1AB_LIYV9 , T; DR O71188 , R1A_GLRV3 , T; Q83044 , R1A_LIYV9 , T; DR P54891 , RDRP_ACLSA , T; P27738 , RDRP_ACLSP , T; DR Q64962 , RDRP_ASPVP , T; Q65652 , RDRP_BBSCV , T; DR Q65667 , RDRP_BNYVS , T; Q9DRA1 , RDRP_BOTVF , T; DR Q6YNQ7 , RDRP_BOTVX , T; P69514 , RDRP_CGMVS , T; DR Q91QZ3 , RDRP_CLBVS , T; P22168 , RDRP_FXMV , T; DR Q8UZB6 , RDRP_GFKVM , T; Q67704 , RDRP_GVAIS , T; DR Q67724 , RDRP_HASV , T; Q918W3 , RDRP_ICRSV , T; DR B1PS76 , RDRP_LOLV , T; Q9YRB3 , RDRP_NCBVS , T; DR P15095 , RDRP_NMV , T; P89659 , RDRP_ORSVC , T; DR Q84133 , RDRP_ORSVS , T; Q07518 , RDRP_P1AMV , T; DR Q84687 , RDRP_PCV87 , T; P89657 , RDRP_PMMVJ , T; DR P29098 , RDRP_PMMVS , T; Q9QBU0 , RDRP_PMTVS , T; DR P20951 , RDRP_PMV , T; P17965 , RDRP_PVMR , T; DR P09395 , RDRP_PVX , T; P22591 , RDRP_PVXCP , T; DR Q07630 , RDRP_PVXHB , T; P17779 , RDRP_PVXX3 , T; DR Q05983 , RDRP_RBDVR , T; Q89249 , RDRP_SBWMN , T; DR P89202 , RDRP_SHMV , T; Q04575 , RDRP_SHVX , T; DR P28897 , RDRP_SMYEA , T; Q6YI57 , RDRP_SSDRV , T; DR A0A0S2T050, RDRP_TBRFV , T; P18339 , RDRP_TMGMV , T; DR P90211 , RDRP_TMOB , T; P03586 , RDRP_TMV , T; DR Q9YQ08 , RDRP_TMVB , T; P30738 , RDRP_TMVKR , T; DR O93058 , RDRP_TMVOM , T; Q98745 , RDRP_TMVRA , T; DR Q9Q1T8 , RDRP_TOMK1 , T; P89676 , RDRP_TOMK2 , T; DR P03587 , RDRP_TOML , T; Q9YKD6 , RDRP_TOMS1 , T; DR Q9J942 , RDRP_TRVPP , T; Q88920 , RDRP_TVCV , T; DR P09498 , RDRP_WCMVM , T; P15402 , RDRP_WCMVO , T; DR Q66220 , RDRP_YOMV , T; 3D 6Z0U; 6Z0V; 7DOP; 7FGG; 7FGH; 7FGI; 7X01; 7Y38; 8AOV; 8AOW; 8AOX; 8APX; 3D 8AXV; 8JCE; PR PRU01079; DO PDOC51743; //