ID   HNH_CAS9; MATRIX.
AC   PS51749;
DT   01-MAR-2015 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Cas9-type HNH domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=156;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=151;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0493281; R2=0.0167008; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12884.3740234; R2=4.5284553; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=686; H_SCORE=15991; N_SCORE=13.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=267; H_SCORE=14093; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=1,5,-14,0,3,-17,-11,-11,-17,-6,-20,-16,9,-10,-2,-8,23,28,-10,-34,-16,1;
MA   /M: SY='E'; M=-13,9,-27,10,16,-10,-11,7,-24,-4,-18,-14,9,-14,3,-5,-3,-10,-25,-24,-7,10;
MA   /M: SY='K'; M=-8,5,-25,8,9,-29,-14,-4,-27,20,-27,-14,5,-12,14,18,5,-3,-20,-27,-14,10;
MA   /M: SY='G'; M=-8,6,-27,5,8,-26,11,-4,-24,-4,-19,-7,7,-14,4,-7,-2,-11,-24,-27,-19,6;
MA   /M: SY='R'; M=5,-6,-24,-9,1,-24,-14,-8,-23,22,-20,-9,-3,-13,8,27,-3,-7,-15,-20,-13,3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,4,-24,3,1,-11,-15,-8,-24,13,-21,-13,4,-15,-2,13,-3,-6,-17,-22,-8,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-2,15,-24,13,28,-26,-11,-1,-24,8,-23,-18,17,-8,9,0,3,-6,-25,-31,-19,19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-18,-23,-23,-16,3,-24,-18,9,-15,-3,1,-8,-19,-12,-7,-1,-1,6,-22,-3,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,9,-30,16,30,-34,-18,4,-28,11,-22,-13,3,-8,31,13,-1,-10,-29,-26,-15,29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-32,-1,13,-31,-20,-8,-26,28,-28,-11,-4,13,14,14,-8,-10,-24,-23,-15,12;
MA   /M: SY='R'; M=4,-10,-24,-13,1,-20,-17,-9,-13,6,-12,-6,-6,-14,6,17,-3,-7,-9,-21,-13,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-6,-25,-10,-1,-14,-21,1,-4,-6,4,7,-3,-20,17,-3,-10,-8,-14,-19,-1,8;
MA   /M: SY='K'; M=-3,3,-26,1,13,-26,-15,-6,-26,26,-24,-13,4,-11,8,21,-3,-8,-20,-24,-14,10;
MA   /M: SY='R'; M=-6,9,-26,14,13,-27,-7,-5,-30,8,-23,-18,4,-12,4,15,1,-7,-22,-28,-18,7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,1,-21,-8,-11,-9,-17,-7,0,-7,-1,-2,11,-24,-9,1,-7,-5,-3,-29,-11,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-4,-29,-3,11,-12,-22,1,-21,18,-17,-10,-5,-14,6,17,-8,-6,-18,-11,10,6;
MA   /I: I=-12; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-6,11,-18,10,0,-19,4,-5,-20,5,-19,-13,12,-10,-2,0,2,-1,-16,-21,-13,-1; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-2,12,-15,17,12,-18,-7,-3,-17,5,-13,-11,4,-4,3,-1,0,-5,-13,-17,-10,8; D=-12;
MA   /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-7,4,-15,1,2,-13,-8,-1,-15,17,-15,-7,9,-9,4,19,-2,-4,-13,-14,-7,2; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-17,13,17,-19,-10,1,-16,8,-13,-8,3,-4,14,3,-1,-6,-16,-15,-9,15; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-25,13,20,-29,-14,-7,-28,19,-25,-17,3,-8,7,6,1,-6,-20,-28,-16,13;
MA   /M: SY='A'; M=34,-7,-12,-13,-8,-21,5,-17,-15,-11,-17,-14,-3,-11,-8,-17,18,4,-5,-26,-21,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-22,-21,-27,-15,-2,-26,-16,20,-18,20,24,-21,-21,-11,-17,-17,-8,14,-22,-4,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-8,-26,-8,3,-21,-21,-11,-16,23,-9,-2,-8,-14,7,13,-12,-9,-13,-20,-9,5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-30,18,31,-31,-19,-5,-31,27,-26,-17,3,-6,12,12,-5,-10,-25,-27,-15,22;
MA   /I: I=-10; MD=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-15,-2,-20,-14,7,-17,-14,-1,-10,-1,-2,-10,-16,-13,-3,-8,-6,1,-12,-2,-14; D=-10;
MA   /I: I=-10; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-3,-18,-3,8,-19,-11,-2,-17,13,-14,-6,-1,-8,13,18,-2,-6,-14,-15,-9,10; D=-10;
MA   /I: I=-10; MD=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-9,5,-20,5,13,-18,-11,-1,-20,19,-18,-10,8,-8,7,18,-3,-6,-17,-18,-10,9; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,6,-17,7,3,-20,4,-2,-19,6,-17,-9,7,-8,6,2,-1,-7,-17,-16,-11,5; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-21,-21,-26,-17,24,-24,-13,-1,-12,10,2,-18,-24,-19,-11,-17,-9,-2,-4,15,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-24,-5,-4,-19,18,-13,-20,-13,-14,-12,2,-18,-10,-13,0,-9,-16,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-21,-4,0,-22,19,-13,-25,-13,-21,-16,1,-14,-6,-13,13,-2,-18,-29,-22,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-1,15,-21,-22,2,-23,22,-20,-8,-3,-13,19,20,-8,-10,-22,-14,2,16;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-26,-29,-32,-22,-8,-31,-27,30,-24,7,9,-19,1,-17,-27,-14,-9,16,-22,-8,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-20,-4,4,-14,-15,-10,-11,-2,-5,-6,0,-16,-2,-4,2,0,-10,-29,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-8,-25,-7,0,-21,-16,-11,-19,11,-18,-10,-4,1,0,11,1,-2,-15,-27,-14,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-31,6,26,-30,-6,-8,-30,14,-26,-17,-3,6,7,2,-4,-12,-27,-26,-20,16;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='H'; M=-9,9,-15,5,0,-11,-7,37,-15,-3,-14,-5,17,-11,3,0,-1,-7,-17,-20,2,0; D=-7;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-17,-11,-7,-9,-13,-12,5,-10,-6,-2,-8,14,-7,-12,-2,-2,-1,-16,-9,-9; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-13,-13,-15,-8,10,-16,-8,3,-12,14,6,-12,-15,-4,-8,-12,-6,-1,-7,3,-5; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-14,16,-28,20,10,-29,-16,-1,-24,8,-17,-11,8,-14,13,6,-5,-9,-23,-29,-13,11;
MA   /M: SY='N'; M=-4,5,-24,-3,-11,-14,-18,-12,8,-14,-6,-3,11,-17,-10,-17,-4,-6,-1,-29,-11,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-2,-21,-1,-2,-13,-21,-13,-5,-4,1,-3,-5,-18,-8,-7,-8,0,-1,-28,-10,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,2,-29,-1,5,-25,-17,-3,-29,35,-26,-11,9,-15,9,41,-7,-9,-21,-23,-11,5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-20,-21,-25,-19,11,-27,-17,16,-26,30,12,-14,-27,-19,-18,-22,-9,6,-20,0,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-4,-29,-2,-4,-5,-21,3,-23,12,-15,-10,-3,-21,0,33,-11,-10,-18,-10,12,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-27,-20,-30,-20,4,-27,-21,20,-27,36,15,-25,-25,-18,-21,-22,-8,11,-20,-3,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-30,-23,-18,20,-27,-1,-4,-7,2,-1,-21,-27,-13,-8,-23,-13,-10,29,43,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-1,-30,4,24,-11,-23,18,-21,5,-15,-11,-5,-12,9,0,-8,-11,-23,-11,16,14;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-17,-24,-18,-2,1,-26,-9,0,-14,16,7,-16,-21,5,-9,-16,-10,-8,-17,-1,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-1,-27,-3,16,-37,-17,6,-19,7,-19,-1,-1,-10,50,6,1,-9,-26,-20,-11,33;
MA   /M: SY='N'; M=-9,9,-27,3,-3,-25,11,12,-30,5,-28,-14,20,-18,-1,2,-1,-12,-28,-28,-13,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-7,-6,-4,-28,34,-17,-36,-15,-26,-20,-3,-19,-13,-17,-2,-16,-27,-27,-28,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-12,-26,-16,-6,-11,-21,-13,-12,16,-13,-5,-6,-16,-2,20,-9,-8,-8,-17,-6,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,4,56,4,-11,-26,-20,-18,-31,-18,-24,-23,-4,-27,-17,-21,0,-6,-16,-46,-26,-14;
MA   /M: SY='L'; M=5,-22,-18,-28,-18,0,-20,-14,13,-19,27,25,-22,-22,-12,-17,-17,-8,8,-20,-5,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=3,-5,10,-10,-10,-15,-14,-18,-14,-14,-18,-14,-1,-16,-10,-14,21,24,-2,-37,-17,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-30,-4,-17,-31,64,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='K'; M=0,4,-24,4,14,-28,-16,-8,-23,15,-21,-12,0,-8,12,5,1,1,-18,-25,-14,13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,17,-23,17,20,-24,-16,-5,-24,5,-21,-18,12,-8,5,-2,6,9,-21,-32,-16,12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,37,-30,33,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,21,-20,0,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-7,20,-23,21,2,-27,3,-7,-29,-1,-27,-21,18,-13,-4,-6,9,3,-22,-34,-19,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-17,-29,-20,-20,-1,-33,-17,27,-22,12,10,-15,-21,-16,-23,-18,-10,13,-15,9,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-12,8,-27,10,-2,-25,5,41,-32,-10,-25,-12,13,-18,0,-7,0,-13,-28,-31,-4,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-16,17,-26,21,5,-23,-16,-1,-28,8,-22,-17,10,-15,1,17,-1,0,-21,-27,-8,1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,2,-31,-23,16,-30,-22,9,-30,33,11,-27,-32,-24,-22,-25,-10,5,-20,0,-23;
MA   /I: I=-10; MD=-21;
MA   /M: SY='B'; M=-7,11,-15,9,1,-13,-9,-1,-5,-3,-9,-5,11,-9,3,-4,-1,-4,-9,-17,-7,1; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-1,-14,0,5,-15,5,-6,-17,6,-16,-9,1,-6,1,1,3,-3,-12,-15,-11,3; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=8,2,-15,-2,-4,-20,10,-9,-20,-3,-22,-14,9,-12,-4,-7,14,1,-14,-25,-18,-4; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,5,-23,2,2,-13,-15,6,-13,7,-13,-1,5,-14,12,3,-5,-7,-17,-13,6,6; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-16,-20,-16,-8,16,-24,-4,3,-12,5,1,-17,-21,-12,-11,-13,-7,2,-1,23,-11; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-13,20,-30,32,42,-35,-17,2,-31,7,-23,-20,6,-5,20,-1,0,-10,-30,-31,-18,31;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,27,18,-25,-25,-22,-25,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=1,-26,-26,-36,-26,-4,-33,-28,39,-26,15,15,-18,-18,-18,-28,-15,-8,25,-20,-4,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-21,-32,-26,6,-33,-22,30,-25,24,15,-26,-27,-22,-22,-20,-7,26,-18,5,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-13,-27,-14,-1,-3,-24,0,-11,-1,-4,1,-9,-19,18,8,-11,-10,-16,-10,7,8;
MA   /M: SY='S'; M=22,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,31,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-17,-27,-21,-16,11,-12,2,-12,-9,-7,-3,-7,-23,-13,6,-13,-13,-11,-13,5,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-12,-22,-15,-9,-12,-22,-19,-2,-7,-4,-4,-10,1,-9,-10,-1,11,-3,-26,-11,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-15,-30,-18,-12,3,-8,-18,-22,5,-18,-11,-12,-20,-13,-1,-14,-11,-17,16,3,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,32,-27,46,11,-27,-11,1,-31,-3,-26,-24,13,-13,-1,-10,3,-5,-24,-30,-5,4;
MA   /M: SY='D'; M=-13,37,-26,39,7,-31,6,1,-33,-3,-30,-25,32,-15,-3,-8,4,-8,-30,-37,-21,2;
MA   /M: SY='S'; M=5,6,-12,2,-1,-19,-3,-8,-19,-8,-27,-19,16,-12,-1,-8,32,21,-12,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-26,-25,-31,-22,17,-31,-16,16,-19,19,10,-20,-25,-18,-8,-21,-10,8,-10,11,-22;
MA   /M: SY='B'; M=-7,23,-23,20,3,-24,-8,1,-22,2,-21,-13,22,-16,0,4,1,-5,-21,-32,-17,1;
MA   /M: SY='N'; M=-10,34,-23,23,0,-24,9,4,-26,-3,-30,-21,45,-19,-3,-5,7,-5,-30,-37,-22,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,5,-28,3,13,-25,-18,-5,-25,29,-22,-11,7,-12,8,20,-7,-8,-21,-25,-12,10;
MA   /M: SY='V'; M=6,-27,-12,-29,-26,-1,-26,-27,23,-20,13,9,-27,-27,-26,-20,-10,-2,36,-27,-10,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-18,-23,-19,4,-26,-17,16,-24,32,13,-17,-29,-19,-17,-21,-7,10,-24,-4,-19;
MA   /M: SY='V'; M=6,-20,-11,-24,-21,-4,-23,-25,14,-18,9,4,-20,-23,-21,-18,-3,9,26,-27,-10,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-20,-23,-18,7,-24,-14,9,-17,6,3,-15,-23,-15,-11,-6,-2,9,-17,7,-18;
MA   /M: SY='C'; M=11,-9,28,-15,-14,-20,-6,-20,-21,-17,-21,-17,-5,-20,-14,-19,13,6,-8,-36,-23,-14;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-18,0,5,-20,-14,-13,-14,2,-17,-12,-3,-11,-3,-5,8,6,-5,-29,-16,1;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-23,-1,13,-24,-9,-8,-23,7,-20,-13,0,-10,9,8,5,2,-18,-26,-16,10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,23,0,8,-5,-20,-8,2,-23,0,-27,-19,39,-23,-3,6,4,-3,-25,-39,-20,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,2,-28,-1,5,-29,-4,3,-26,10,-23,-9,9,-16,24,22,-1,-10,-27,-23,-14,13;
MA   /M: SY='D'; M=-11,14,-28,16,16,-28,5,-3,-32,3,-25,-20,14,-13,3,5,0,-10,-28,-29,-21,9;
MA   /M: SY='K'; M=-7,6,-25,3,7,-27,-14,-7,-27,33,-30,-13,10,-11,7,19,1,-4,-20,-26,-13,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-25,-7,-6,-24,18,-15,-27,2,-22,-13,-1,-16,-6,-3,3,-7,-19,-25,-19,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,32,-23,29,9,-29,-6,4,-26,0,-29,-20,33,-14,8,-3,10,-1,-27,-37,-19,8;
MA   /M: SY='B'; M=-14,19,-28,19,11,-31,-13,4,-27,14,-26,-14,18,-14,19,14,0,-8,-27,-29,-15,15;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-13,-16,-17,-6,-10,-23,-4,-15,-7,-6,-8,-17,-18,-14,8,24,8,-27,-11,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-37,-6,0,-29,-17,-16,-20,-9,-30,-20,-8,74,-9,-17,-7,-9,-30,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-17,-24,-18,-14,19,-21,-3,-10,-9,-9,-7,-10,-15,-12,-1,-4,-3,-10,-2,24,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-7,-25,-7,15,-19,-21,-10,-6,-2,-2,-3,-9,-11,8,-7,-7,-8,-10,-23,-12,11;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-15,-29,-16,-3,16,-20,-17,-16,-14,-10,-13,-16,-19,-15,-15,-15,-14,-17,29,9,-6;
MA   /M: SY='V'; M=2,-18,3,-23,-21,-8,-14,-22,4,-21,5,0,-15,-26,-21,-21,-10,-6,9,-28,-14,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-4,-22,-3,-6,-18,-14,-10,-3,-9,-4,-1,-5,-21,2,-9,-6,-7,0,-27,-12,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-27,3,4,-27,-8,-7,-31,25,-27,-14,3,-14,5,28,-2,-7,-21,-24,-14,3;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,8,0,11,4,-24,-15,-9,-26,15,-22,-14,1,-12,-1,5,-6,-8,-16,-25,-13,2; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-2,-18,-8,-5,-10,-12,2,-7,6,-6,10,5,-15,3,19,-7,-6,-9,-19,-7,-3; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-3,-20,0,-2,-18,-16,-13,-12,5,-12,-8,-4,-16,-5,-1,2,0,-3,-30,-13,-3;
MA   /M: SY='R'; M=4,4,-20,2,3,-21,-12,-9,-19,3,-17,-14,3,-14,-1,7,4,1,-11,-28,-16,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-3,-26,-2,-3,-4,-5,-7,-21,-2,-15,-12,-4,-18,-8,-2,-7,-10,-17,-12,2,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-28,-46,-31,-26,6,-17,-24,-20,-17,-21,-20,-25,-29,-17,-17,-33,-26,-30,122,23,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-26,-5,4,-14,-18,3,-19,10,-18,-9,-3,-16,13,17,0,-4,-18,-13,8,6;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-28,-2,9,-16,-19,-5,-24,25,-22,-9,3,-13,11,15,-7,-9,-21,-19,-7,11;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-23,-24,-25,-14,10,-28,-14,7,-16,20,10,-19,-25,-7,-5,-20,-10,0,-15,2,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-9,-23,-8,5,-11,-24,-11,-8,2,-1,-3,-11,-16,-3,-2,-8,0,-5,-21,-4,1;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-9,-23,-10,-2,-21,-16,-11,-9,-4,-10,-5,-6,0,5,-7,-2,-4,-10,-25,-15,1;
MA   /I: I=-14; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=0,-4,-19,-10,-8,-2,-6,-10,-13,-2,-10,-8,3,-17,-9,-1,-2,-4,-11,-18,-7,-8; D=-14;
MA   /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=2,-2,-17,-5,3,-17,-16,-12,-10,6,-13,-8,-2,-12,-3,-1,1,4,-2,-24,-13,0; D=-14;
MA   /I: I=-14; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-18,-20,-11,8,-23,-17,3,-21,18,4,-16,-22,-15,-15,-8,3,1,-21,-2,-12;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=2,-11,-15,-17,-14,11,-7,-17,-13,-17,-12,-11,-4,-17,-17,-15,11,12,-6,-19,-4,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-26,34,20,-33,-12,-4,-33,11,-28,-22,11,-8,5,1,5,-5,-24,-34,-18,13;
MA   /M: SY='B'; M=-13,26,-24,24,5,-23,-11,3,-24,1,-23,-18,24,-15,5,1,4,1,-24,-30,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-6,-31,-22,12,-30,-21,14,-30,40,14,-28,-31,-23,-21,-27,-10,7,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-18,-3,4,-19,-15,-15,-17,-7,-19,-15,-1,9,-3,-10,16,24,-12,-32,-17,0;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-25,-9,-3,-19,-18,-10,-13,15,-16,-7,4,-15,0,18,-4,-2,-10,-24,-11,-3;
MA   /M: SY='A'; M=15,-7,-19,-10,4,-19,-12,-14,-14,3,-8,-8,-8,-12,-2,-5,0,-4,-8,-23,-15,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,6,25,-30,-20,-7,-30,38,-27,-13,0,-7,13,21,-7,-10,-23,-23,-13,19;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,8,-28,-20,-5,-29,40,-26,-9,0,-13,15,40,-9,-10,-21,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-30,-3,11,-27,4,-10,-19,-1,-18,-10,-3,-12,8,-6,-4,-13,-20,-23,-17,9;
MA   /I: I=-10; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-10,-14,-10,-7,-2,-14,-2,-4,4,-4,-1,-7,-14,-3,15,-7,-4,1,-6,6,-7; D=-10;
MA   /I: I=-10; MD=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-17,-14,-20,-14,2,-20,-14,21,-17,18,11,-13,-13,-11,-14,-13,-6,12,-11,0,-14; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=12,3,-11,2,6,-15,-6,-8,-12,-3,-9,-9,-1,-5,-1,-8,5,3,-7,-17,-12,2; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-11,12,-19,18,8,-21,-10,0,-21,10,-16,-11,6,-8,8,12,-2,-6,-16,-18,-9,8; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-13,-22,-18,-19,-10,3,-19,-1,-20,2,-1,-7,-22,-18,-18,-7,-2,-1,-24,-13,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-24,-25,-17,1,-27,-14,13,-16,17,8,-17,-23,-12,-6,-14,-6,6,-18,3,-17;
MA   /I: I=-13; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-24,-10,-3,-15,-16,-11,-19,10,-17,-9,-6,-14,3,12,-4,0,-15,3,-4,0; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-12,11,-23,17,10,-13,-16,-8,-22,-1,-17,-16,2,-2,-4,-7,-1,0,-18,-24,-10,4; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=1,4,-21,6,7,-17,-13,-7,-17,0,-11,-9,-2,-11,5,-5,-3,-7,-14,-20,-10,6; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-26,37,21,-29,-14,-2,-25,0,-22,-21,14,-12,1,-7,0,-7,-20,-36,-19,11;
MA   /M: SY='K'; M=-14,12,-30,18,16,-32,-17,-4,-32,28,-27,-15,5,-11,13,21,-6,-10,-24,-26,-13,14;
MA   /M: SY='K'; M=7,2,-25,0,2,-27,-11,-12,-22,14,-24,-14,1,4,-1,1,-1,-6,-17,-25,-18,0;
MA   /M: SY='D'; M=-9,9,-29,12,8,-30,11,-7,-34,9,-28,-18,9,-13,0,4,-2,-12,-27,-26,-20,4;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,68,-32,-22,8,-30,12,3,-20,-28,-37,-22,-20,-10,5,5,25,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-8,-30,-10,-10,-16,-29,-19,11,0,-4,3,-7,-15,-7,-8,-14,-10,5,-23,-6,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-14,9,-29,15,24,-16,-20,4,-27,6,-19,-14,2,-10,8,0,-5,-11,-24,-24,-7,17;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10,-3,-21,-7,-3,-31,23,-21,-11,0,-20,6,57,-9,-11,-21,-20,-13,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,22,-21,11,6,-26,-6,7,-20,1,-27,-14,34,-15,18,1,12,0,-27,-34,-17,12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-29,-20,11,-28,-11,17,-24,38,23,-27,-28,-15,-17,-27,-10,7,-13,12,-18;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=14(14); /POSITIVE=14(14); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HNH Cas9-type;
CC   /VERSION=4;
DR   Q03LF7    , CAS9A_STRTD, T; Q03JI6    , CAS9B_STRTD, T;
DR   J3F2B0    , CAS9_ACTNH , T; Q0P897    , CAS9_CAMJE , T;
DR   Q6NKI3    , CAS9_CORDI , T; A0Q5Y3    , CAS9_FRATN , T;
DR   Q927P4    , CAS9_LISIN , T; C9X1G5    , CAS9_NEIM8 , T;
DR   A1IQ68    , CAS9_NEIMA , T; Q9CLT2    , CAS9_PASMU , T;
DR   J7RUA5    , CAS9_STAAU , T; Q8DTE3    , CAS9_STRMU , T;
DR   Q99ZW2    , CAS9_STRP1 , T; G3ECR1    , CAS9_STRTR , T;
3D   4CMP; 4CMQ; 4OGC; 4OGE; 4OO8; 4UN3; 4UN4; 4UN5; 4ZT0; 4ZT9; 5AXW; 5B2O;
3D   5B2P; 5B2Q; 5B2R; 5B2S; 5B2T; 5CZZ; 5F9R; 5FQ5; 5FW1; 5FW2; 5FW3; 5VW1;
3D   5VZL; 5XBL; 5Y36; 6AEB; 6AEG; 6AI6; 6IFO; 6JDQ; 6JDV; 6JE4; 6JE9; 6JHW;
3D   6K3Z; 6K4P; 6K4Q; 6K4S; 6K4U; 6K57; 6KC7; 6KC8; 6M0V; 6M0W; 6M0X; 6O0X;
3D   6O0Y; 6O0Z; 6O56; 6RJ9; 6RJA; 6RJD; 6RJG; 6VPC; 7EL1; 7ENH; 7ENI; 7ENR;
3D   7OX7; 7OX8; 7OX9; 7OXA; 7QQO; 7QQP; 7QQQ; 7QQR; 7QQS; 7QQT; 7QQU; 7QQV;
3D   7QQW; 7QQX; 7QQZ; 7QR0; 7QR1; 7QR5; 7QR7; 7QR8; 7S36; 7S37; 7S38; 7S3H;
3D   7S4U; 7S4V; 7S4X; 7V59; 7VK9; 7VW3; 7Z4C; 7Z4D; 7Z4E; 7Z4G; 7Z4H; 7Z4I;
3D   7Z4J; 7Z4K; 7Z4L; 7ZO1; 8FZT; 8G1I; 8HJ4; 8JA0;
PR   PRU01085;
DO   PDOC51749;
//