ID   OMPR_PHOB; MATRIX.
AC   PS51755;
DT   01-MAY-2015 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   OmpR/PhoB-type DNA-binding domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=100;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=95;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4958348; R2=0.0087935; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=14139.7900391; R2=3.1975927; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=854; H_SCORE=16871; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=456; H_SCORE=15598; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-39; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='S'; M=4,-39,-11,29,-62,-16,-39,-60,5,-53,-97,14,16,30,-2,38,-9,-31,18,-56;
MA   /M: SY='N'; M=-21,-107,4,26,-109,-12,-90,-28,4,-106,-38,46,28,21,13,27,-1,-43,-114,-49;
MA   /M: SY='V'; M=-28,-32,-97,20,4,-54,-100,26,-13,-13,-17,-75,-61,19,-46,7,25,43,-109,-45;
MA   /M: SY='I'; M=-32,-48,-109,-58,14,-113,-39,51,-49,45,1,-28,-48,-100,-18,-99,5,-19,-17,35;
MA   /M: SY='Q'; M=-28,-50,-1,38,-106,-100,-28,-78,2,-50,-95,-1,-98,48,28,19,46,-17,-113,-35;
MA   /M: SY='F'; M=-27,-56,-109,-106,62,-110,-9,41,-100,0,3,-20,-109,-31,-16,-42,-3,27,50,20;
MA   /M: SY='G'; M=7,-45,20,-18,-112,68,-9,-43,-9,-96,-101,4,-11,25,-57,10,-65,-105,-111,-103;
MA   /M: SY='D'; M=-25,-61,69,-3,-23,34,27,-112,-9,-111,-103,28,25,1,-28,-19,-46,-109,-115,-48;
MA   /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
MA   /M: SY='L'; M=-23,-102,-64,-67,42,-113,-102,28,-106,64,19,-110,-111,-103,-106,-103,-93,18,58,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-45,-32,-21,19,-55,-103,-38,-14,2,-18,-22,-62,-99,21,34,-13,56,23,41,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-95,-103,-115,-110,46,-67,-105,51,-108,52,10,-110,-28,-106,-107,-104,-91,41,7,-40;
MA   /M: SY='D'; M=-67,-106,92,-31,0,-33,-7,-50,-65,-41,-101,75,-101,-86,-93,-42,-30,-104,-118,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-35,-106,-56,7,-18,-89,21,2,-23,34,18,-22,60,12,-52,-35,-5,11,-107,-52;
MA   /M: SY='D'; M=-42,-16,50,26,-99,-16,-90,-36,-53,21,-89,29,-16,-8,-15,32,-26,-2,-114,-97;
MA   /M: SY='R'; M=19,-102,-60,-4,-63,34,-22,-64,16,-92,-96,9,-97,-3,37,30,33,-98,-107,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-55,6,-19,-49,-7,-38,74,-102,11,-29,6,27,28,5,64,-29,-91,-72,-108,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-89,-105,-9,52,-100,-103,-91,-10,8,-13,-88,-68,-97,42,33,17,21,22,-110,-48;
MA   /M: SY='V'; M=1,-4,-108,-54,-33,-64,-18,15,-100,28,-26,-103,-36,-28,-31,-20,-86,75,-111,-90;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-31,-96,-9,9,-101,-24,24,-27,-10,27,-47,-101,16,-5,25,43,-14,37,24;
MA   /M: SY='W'; M=-50,-46,-1,-91,-10,-61,25,16,18,-3,-51,-1,-104,-45,47,-15,-18,29,62,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-104,38,17,-69,25,11,-48,-12,-69,-98,71,-25,12,3,-19,-6,-103,-115,-99;
MA   /I: I=-36; MD=-90;
MA   /M: SY='G'; M=-26,-107,58,22,-114,64,-90,-114,-63,-113,-105,41,-98,13,-48,5,-70,-78,-114,-104; D=-36;
MA   /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
MA   /M: SY='E'; M=-48,0,1,63,-105,-41,22,-30,27,-42,-94,2,-95,40,-2,-12,27,-49,-111,-38;
MA   /M: SY='P'; M=-59,-108,-3,44,-107,-100,-66,-63,-6,-38,-40,-6,66,37,20,7,18,-9,-62,-100;
MA   /M: SY='V'; M=-51,-102,-113,-109,-19,-58,-106,61,-106,33,26,-107,-108,-104,-107,-68,-35,62,-104,4;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-104,-11,25,-33,-33,21,-55,24,-36,-16,30,37,-16,-1,14,22,-26,-109,-16;
MA   /I: I=-29; MI=0; MD=-75; IM=0; DM=-75;
MA   /M: SY='L'; M=-96,-36,-113,-106,-13,-14,-99,-5,-50,85,15,-109,-39,-100,-45,-105,-94,-52,-102,-85;
MA   /M: SY='T'; M=-15,-96,-90,-56,-102,-23,-97,-95,-49,-64,-94,-81,35,-89,-42,47,96,-88,-115,-99;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-33,-39,-66,-76,1,8,-27,26,-72,-95,3,75,-22,30,17,0,-55,-110,-100;
MA   /M: SY='K'; M=-39,-104,-89,-83,-34,-30,-90,-12,74,-44,4,12,-26,1,24,-23,48,-93,-106,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-27,-111,-47,109,-113,-105,-85,-110,-74,-58,-100,-88,-31,27,-83,-87,-91,-54,-110,-103;
MA   /M: SY='F'; M=-69,-105,-107,-103,92,-108,-88,-55,-93,-24,24,-100,-111,-51,32,-5,-20,-49,14,71;
MA   /M: SY='Q'; M=27,-38,33,19,-45,-43,-38,-29,17,-27,-92,-29,-98,47,44,-15,3,-72,-109,-95;
MA   /M: SY='L'; M=-45,-4,-115,-109,-76,-116,-103,48,-108,76,19,-111,-112,-103,-107,-105,-91,13,-105,-86;
MA   /M: SY='L'; M=-98,-28,-116,-108,-1,-116,-99,-64,-108,90,37,-113,-114,-102,-105,-107,-94,-41,-101,-82;
MA   /M: SY='E'; M=4,-15,-84,65,0,-49,34,-40,4,-10,-89,-51,-98,-27,-18,0,-33,8,48,-3;
MA   /M: SY='M'; M=5,1,-104,-25,21,-107,7,3,-98,43,52,-100,-107,-55,-31,-59,10,1,-94,52;
MA   /M: SY='L'; M=-100,-100,-116,-109,61,-116,-99,-66,-109,86,-16,-113,-115,-105,-106,-108,-95,-73,-94,-74;
MA   /M: SY='M'; M=42,45,-107,-101,-83,-80,-97,29,-99,32,78,-99,-104,-95,-59,0,-86,8,-103,5;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-105,-85,48,-98,-75,0,1,-2,11,-86,-13,-63,42,49,16,2,-90,-107,-47;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-12,-36,-42,-103,-92,81,-108,16,-105,-94,78,-101,1,56,-4,-46,-104,-114,-19;
MA   /M: SY='P'; M=34,-40,-91,-2,-31,-69,-4,-79,30,-33,-24,-29,73,14,34,-3,-39,-97,-106,-97;
MA   /M: SY='G'; M=-85,-105,-21,-22,-110,80,-16,-114,-3,-112,-101,56,-6,-31,18,-20,-35,-110,-109,-102;
MA   /M: SY='R'; M=-33,-107,2,43,-106,-101,40,-70,37,-101,-93,-32,-96,52,61,-31,9,-12,-109,-54;
MA   /I: I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
MA   /M: SY='V'; M=-20,-100,-108,-103,-86,-82,-110,53,-101,-45,-74,-103,28,-59,-43,-93,10,82,-111,-46;
MA   /M: SY='V'; M=-42,-16,-111,-74,42,-112,-44,6,-68,49,13,-106,-110,-21,-102,-99,-59,60,10,15;
MA   /M: SY='S'; M=-27,-98,-33,-87,-104,-12,-15,-100,-65,-69,-96,-21,38,-6,-19,79,62,-94,-113,-97;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-109,-91,-80,-102,-102,-4,-104,49,-61,-92,-34,-102,-5,99,-24,-91,-28,-104,-15;
MA   /M: SY='D'; M=6,-105,69,63,-110,-4,-87,-106,-46,-52,-100,-1,-17,20,-58,10,-13,-52,-114,-100;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-1,20,39,-32,-99,16,-47,-23,-19,7,-52,-97,86,-5,-24,7,-20,-108,-91;
MA   /M: SY='L'; M=-65,-102,-114,-108,8,-116,-102,62,-106,78,-62,-110,-111,-102,-33,-105,-92,-64,-99,-82;
MA   /M: SY='L'; M=-29,-102,-108,-18,28,-111,-4,53,-65,57,48,-104,-107,-97,-101,-38,-91,-25,-95,26;
MA   /M: SY='E'; M=-90,-106,55,62,-63,-83,-40,-54,17,-36,-97,26,-94,25,12,11,20,-100,-113,-97;
MA   /M: SY='Q'; M=27,-104,-16,42,-26,-56,30,-102,34,-38,-33,-31,-96,56,25,2,-9,-97,-105,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-22,-1,-112,-106,-41,-112,-106,33,-105,46,30,-107,-108,-103,-105,-51,-57,73,-109,-88;
MA   /M: SY='W'; M=-102,-123,-121,-106,-27,-69,-109,-98,-97,-57,-39,-115,-109,-98,-11,-45,-35,-74,169,58;
MA   /M: SY='G'; M=-29,-107,38,13,-110,77,-2,-65,-35,-110,-102,8,6,-23,-27,-7,-62,-58,-21,-102;
MA   /M: SY='Y'; M=-30,-107,45,31,14,-40,23,-29,-25,-19,-2,-29,-15,-49,19,-62,-7,-41,43,63;
MA   /I: I=-29; MD=-75;
MA   /M: SY='D'; M=-14,-107,67,49,-39,-29,-1,-107,-63,-105,-14,45,-20,15,1,-15,-10,-75,11,-23; D=-29;
MA   /I: I=-29; MI=0; MD=-75; IM=0; DM=-75;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-108,24,5,44,-64,-28,-33,-93,-22,-7,-27,37,-56,-14,7,-47,-28,13,62; D=-29;
MA   /I: I=-29; DM=-75;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-104,33,45,42,-53,-24,-4,-35,-32,-49,5,-14,-70,-13,3,-16,-19,-13,40;
MA   /M: SY='V'; M=3,-41,-61,-2,-51,32,-99,-13,-64,-80,-87,-35,37,-16,2,8,0,57,-110,-97;
MA   /M: SY='D'; M=4,-103,75,32,-25,-55,23,-101,-85,-35,-32,-3,-26,-44,-44,44,-3,-52,-113,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-37,-102,64,15,-53,-29,-89,-51,-86,0,-18,-7,-4,-49,-20,32,52,-52,-111,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-17,-103,-77,-6,-106,-66,26,-107,-12,-107,-96,91,-101,-76,74,-8,-3,-104,-115,-96;
MA   /M: SY='T'; M=13,-94,-93,-93,-92,-65,-97,2,-91,-53,-85,-84,-95,-41,-97,44,86,28,-109,7;
MA   /M: SY='V'; M=-90,-100,-114,-108,-78,-116,-109,54,-107,52,-23,-110,-109,-104,-107,-101,-86,73,-108,-87;
MA   /M: SY='D'; M=-93,-107,90,32,-107,-97,17,-107,-79,-105,-1,19,-36,12,17,-53,37,-103,-118,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-26,-97,-58,-37,-90,-104,-103,-45,-94,-51,-15,-23,-103,21,-30,6,23,89,-115,-93;
MA   /M: SY='H'; M=7,10,-90,-91,5,-69,109,-96,-91,-16,-83,21,-104,-8,-90,-56,-6,-96,-92,82;
MA   /M: SY='I'; M=-25,-103,-114,-110,-81,-115,-112,95,-106,-50,39,-106,-105,-104,-109,-100,-86,53,-107,-88;
MA   /M: SY='R'; M=-37,21,-89,-86,-72,8,42,-104,37,-46,-39,7,-100,-9,56,48,-23,-100,-103,26;
MA   /M: SY='R'; M=-61,-109,-88,-53,-49,-101,51,-42,18,-101,-91,36,-102,3,92,-51,-9,-101,-9,28;
MA   /M: SY='L'; M=-54,-99,-113,-106,-73,-115,-100,27,-107,88,-60,-110,-111,-101,-105,-104,-19,-23,-102,-84;
MA   /M: SY='R'; M=-97,-113,-93,-81,-106,-107,-82,-113,-54,-105,-94,-86,-105,-70,122,-91,-96,-106,-106,-92;
MA   /M: SY='K'; M=4,-26,14,12,-109,-54,1,-109,69,-106,-96,-25,-96,23,63,-9,-54,-103,-107,-95;
MA   /M: SY='K'; M=-42,-105,-89,-78,-41,-26,10,-22,99,-38,2,-56,-96,-75,-9,-40,-46,-19,-103,-47;
MA   /M: SY='L'; M=-96,-28,-114,-108,30,-116,-102,48,-107,77,-10,-110,-111,-103,-106,-104,-37,-9,-99,-80;
MA   /I: I=-29; MD=-75;
MA   /M: SY='E'; M=-56,-120,-48,66,-123,-25,-99,-123,25,-90,-113,23,-107,-85,19,-11,-42,-78,-124,-114; D=-29;
MA   /I: I=-29; MI=0; MD=-75; IM=0; DM=-75;
MA   /M: SY='D'; M=-9,-131,61,-20,-134,-20,-113,-128,-33,-51,-47,-72,-60,-8,-21,-42,-91,-65,-141,-124; D=-29;
MA   /I: I=-29; DM=-75;
MA   /M: SY='D'; M=1,-17,67,-56,-120,-15,-12,-110,-17,-83,-110,16,-64,5,-67,-30,-36,-1,-130,-61; D=-29;
MA   /I: I=-29; DM=-75;
MA   /M: SY='P'; M=10,-114,27,-11,-42,-9,-101,-11,-38,-82,-101,-70,85,-6,-102,-19,11,-101,-114,-57; D=-29;
MA   /I: I=-29; DM=-75;
MA   /M: SY='S'; M=6,-105,-10,19,13,15,-12,-22,-19,-15,-93,-24,-102,-24,-27,38,7,-36,-105,8; D=-29;
MA   /I: I=-29; DM=-75;
MA   /M: SY='H'; M=-64,-37,30,33,-45,23,63,-63,-32,-52,-33,45,-39,-9,27,10,-14,-103,-110,-4;
MA   /I: I=-33; MD=-84;
MA   /M: SY='P'; M=8,-51,5,-51,-17,-97,-14,-45,18,-66,-19,-23,89,8,-33,17,-26,-59,-110,-100; D=-33;
MA   /I: I=-33; MD=-84;
MA   /M: SY='D'; M=-59,-111,53,22,-109,-3,-11,-81,6,-76,-100,-9,-13,22,42,-21,7,-17,-114,-17; D=-33;
MA   /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
MA   /M: SY='Y'; M=-40,0,-39,-4,5,-55,34,-26,-50,27,37,-18,1,-34,3,-32,-6,9,18,59;
MA   /M: SY='I'; M=-94,-105,-115,-112,3,-119,-112,101,-108,16,-66,-61,-106,-105,-110,-103,-88,17,-102,-84;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-105,-28,47,-96,-83,41,11,31,6,-35,-58,-97,42,10,-63,-7,12,-108,-63;
MA   /M: SY='T'; M=-20,-92,-87,-90,-98,-96,-95,-89,-86,-58,-90,7,-91,-90,-18,-11,113,-51,-117,-96;
MA   /M: SY='V'; M=-16,-51,-100,12,-87,-108,-50,26,-1,-2,-35,-99,-103,-44,-45,-24,-6,78,-110,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-51,-14,-95,-48,-93,-103,47,-74,-9,-99,-91,-89,10,-26,90,-23,-20,-12,82,29;
MA   /I: I=-45; MD=-115;
MA   /M: SY='G'; M=-83,-108,-95,-102,-39,96,-98,-114,-21,-43,-101,-16,4,-95,-19,-46,-97,-110,-103,-28; D=-45;
MA   /I: I=-45; MI=-115; IM=-115; DM=-115;
MA   /M: SY='V'; M=-18,-103,-96,7,8,-12,-95,7,4,9,16,-94,3,40,20,-48,-15,40,-104,-89;
MA   /M: SY='G'; M=-79,-107,-94,-106,-113,108,-101,-121,-100,-116,-105,-80,-98,-97,-107,-79,-98,-114,-104,-108;
MA   /M: SY='Y'; M=-101,-112,-101,-104,-3,-108,-67,-86,-96,-83,-80,-102,-113,-91,-93,-96,-96,-91,-57,140;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-13,-98,-87,3,-104,-90,-61,41,15,41,-91,-103,5,68,-13,-31,17,-102,-34;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-52,-114,-108,74,-111,-100,24,-106,62,-11,-109,-111,-105,-105,-102,-93,-14,33,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-23,-4,7,49,-102,-10,36,-16,5,-33,26,13,-98,11,36,-4,-42,-9,-111,-94;
MA   /M: SY='E'; M=15,-40,-16,32,-101,3,-96,25,-7,-18,-30,-4,16,-7,-4,-16,12,-7,-111,-99;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DNA_BIND; /FT_DESC=OmpR/PhoB-type;
CC   /VERSION=4;
PR   PRU01091;
DO   PDOC51755;
//