ID   POTRA; MATRIX.
AC   PS51779;
DT   01-OCT-2015 CREATED; 01-OCT-2015 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   POTRA domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=72;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6020532; R2=0.0070103; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=949; N_SCORE=9.25; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=557; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-43; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='F'; M=6,-149,-85,-47,65,-69,-139,-43,-71,3,5,-36,16,-32,-36,37,-67,6,9,57;
MA   /M: SY='P'; M=-54,-153,-22,-20,-48,-89,-33,-18,48,-112,-4,-24,49,-92,47,-6,34,1,-151,25;
MA   /M: SY='I'; M=-41,-149,-161,-156,-8,-162,-157,72,-66,29,-55,-155,-155,-152,-154,-96,-135,67,27,-36;
MA   /M: SY='Q'; M=10,-151,-21,5,-156,-2,2,-154,39,-153,-143,24,-144,51,43,39,-1,-96,-157,-144;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-151,27,3,-50,-9,42,-100,33,-64,-67,37,-144,36,22,29,9,-104,-157,-37;
MA   /M: SY='I'; M=-45,-149,-161,-157,2,-70,-159,81,-154,-10,-12,-154,-154,-153,-156,-78,-75,72,-153,-69;
MA   /M: SY='H'; M=-26,-151,4,28,-47,-53,45,-12,10,-73,-138,27,-86,13,36,30,16,-1,-157,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-83,-148,-161,-81,57,-163,-156,68,-154,-9,-68,-154,-156,-154,-155,-147,-40,73,-147,-34;
MA   /M: SY='S'; M=-133,-149,25,48,-64,-100,-57,-40,11,-44,-71,11,-143,-1,-5,48,42,15,-160,-69;
MA   /I: I=-31; MI=0; MD=-79; IM=0; DM=-79;
MA   /M: SY='G'; M=-129,-155,-2,-11,-159,103,-27,-167,-105,-162,-152,-43,-97,-39,-151,-86,-144,-161,-153,-61;
MA   /M: SY='N'; M=7,-146,-45,2,-86,-66,-131,-57,-35,14,-75,99,-149,-35,-16,-15,7,-24,-161,-66;
MA   /M: SY='H'; M=-38,-151,18,15,-24,-9,45,-142,33,8,-29,-11,-19,41,-13,10,23,-32,-156,-138;
MA   /M: SY='H'; M=10,-151,-19,-11,-2,-57,48,6,-31,-25,-17,7,-21,26,44,2,16,-11,-152,1;
MA   /M: SY='V'; M=-51,-148,-6,-28,26,-14,-45,25,-65,20,18,-83,-72,-42,-90,-21,36,45,-148,18;
MA   /M: SY='T'; M=-14,-149,-2,-20,-147,-35,26,-95,33,-43,-21,-42,31,-19,-13,50,50,-20,-157,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-12,-152,60,21,-152,-78,-51,-41,8,-73,-61,-24,23,23,26,29,24,-41,-159,-33;
MA   /I: I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
MA   /M: SY='D'; M=23,-152,55,48,-155,-26,-135,-51,26,-59,-58,-14,-15,25,6,13,-23,-74,-159,-146;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-153,42,60,-73,-76,-135,-33,-2,-36,-45,-86,-22,56,-24,-48,19,1,4,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-26,-149,-32,-152,-127,-159,-151,70,-151,46,-52,2,-155,-63,-152,-145,-57,52,-153,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-31,-152,-50,21,-55,-79,-71,29,14,45,11,-35,-149,24,46,-71,-4,-49,-152,-86;
MA   /M: SY='R'; M=8,-51,25,37,-152,-42,12,-153,43,-51,-54,19,-144,22,45,14,-26,-148,-156,-22;
MA   /M: SY='A'; M=39,-149,-103,33,-52,-78,11,-3,-8,29,-65,-10,-148,19,-9,-14,-59,6,-150,17;
MA   /M: SY='M'; M=20,-145,-150,-147,9,-110,-145,19,-145,39,58,-58,-150,-92,-147,47,3,22,-151,-59;
MA   /M: SY='G'; M=8,-152,-1,-69,-85,44,1,-62,35,-27,-141,21,29,13,24,-1,-20,-57,-155,-145;
MA   /M: SY='I'; M=-57,-150,-35,-55,-13,-40,-61,55,-143,38,-35,-19,-11,37,-24,-41,-15,37,-152,-60;
MA   /M: SY='R'; M=-31,-9,7,8,-146,-79,3,-64,47,-56,26,9,21,30,49,-27,-23,-34,-26,18;
MA   /M: SY='P'; M=-42,-153,31,40,6,-51,-141,-1,15,2,-64,-25,49,-7,-54,-40,-13,23,-154,-51;
MA   /M: SY='G'; M=-62,-55,26,-34,-155,77,20,-159,6,-84,-38,29,-13,-29,-1,-1,-41,-155,-49,-51;
MA   /M: SY='D'; M=22,-28,56,31,-57,-13,-56,-35,1,-66,-22,2,-38,27,-36,14,15,-16,-160,-144;
MA   /I: I=-19; MD=-47;
MA   /M: SY='P'; M=-40,-6,-165,-55,-8,-61,-161,-21,-10,-17,-30,-161,41,-156,4,0,-36,-10,12,3; D=-19;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-156,-25,15,-18,-14,-17,-32,-34,-42,-146,31,-151,42,-143,33,29,-77,73,-142; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-47;
MA   /M: SY='Y'; M=-21,-151,0,-8,42,-34,-42,12,28,8,26,-48,-149,29,-73,-32,14,-18,-141,43;
MA   /M: SY='F'; M=-84,-149,-40,-45,59,-43,-146,24,-148,42,4,7,-98,-44,-92,-31,-18,34,51,-19;
MA   /M: SY='T'; M=20,-147,11,8,-3,-15,-61,-95,-58,-27,22,28,-51,-11,9,31,52,-94,-41,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-150,4,-7,-9,-7,-29,1,11,27,-65,11,-51,28,1,-12,-29,19,-152,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-38,-153,87,-40,-30,-144,-19,-10,15,6,20,30,-32,9,-58,-18,-45,-39,-46,-140;
MA   /M: SY='L'; M=3,-148,-143,25,-78,-57,-145,20,-2,41,1,-84,-24,-43,-45,-7,21,35,-155,-139;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-152,44,39,-61,-20,36,-151,39,-64,21,47,-143,32,-13,-16,-27,-103,-159,-142;
MA   /M: SY='Q'; M=34,-150,27,34,-66,-8,-13,-33,18,-23,-139,15,-84,36,-6,-21,15,-50,-156,-39;
MA   /M: SY='I'; M=20,-147,-53,-85,-24,-21,-149,57,-85,42,8,-147,-152,-145,-71,-19,-1,26,-150,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-152,-41,26,-83,-59,-61,2,53,-53,-137,-8,-144,37,51,7,5,-16,-154,-78;
MA   /M: SY='D'; M=5,-152,48,46,-97,-80,-53,-88,29,-104,-144,30,-143,44,35,8,-6,-72,-159,-144;
MA   /M: SY='R'; M=17,-151,-83,-26,33,-109,-37,-80,18,-14,-39,23,-45,20,61,-6,-18,-22,-23,20;
MA   /M: SY='Y'; M=-51,-53,-157,-61,-36,-161,-141,48,-151,68,-25,-155,-158,-146,-150,-98,-87,1,-137,72;
MA   /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
MA   /M: SY='E'; M=3,-151,-58,32,-4,-1,-19,-57,20,24,5,17,-147,22,3,-10,-27,-39,-29,23;
MA   /M: SY='R'; M=20,-151,33,22,-155,-29,-41,-153,27,-68,-143,27,-87,35,52,24,-28,-90,-157,-77;
MA   /M: SY='N'; M=-57,-150,-23,-81,-28,-149,34,4,-30,37,10,43,-152,-5,36,-14,12,-4,-150,30;
MA   /M: SY='G'; M=-79,-157,-11,-44,-157,81,-144,-71,-26,-159,-149,-133,78,-78,-17,-10,-67,-89,-153,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-61,-159,-90,-35,5,-78,-10,-9,0,-33,-47,-12,-45,-30,13,-55,-87,-51,122,94;
MA   /M: SY='I'; M=19,-48,-158,-82,58,-75,-150,59,-151,-41,18,-151,-154,-151,-152,-143,-135,59,-141,29;
MA   /M: SY='K'; M=0,-152,36,37,-10,-60,-59,-150,45,-82,-143,11,-144,-21,34,15,11,-94,-150,29;
MA   /M: SY='S'; M=22,-148,48,4,0,-99,13,-80,-6,-114,-143,-20,13,7,-29,50,35,-45,-157,-65;
MA   /M: SY='V'; M=48,-145,-53,-51,-141,-145,-20,-20,-56,-61,-129,17,-150,-29,23,-41,-24,76,-160,-142;
MA   /M: SY='V'; M=-65,-149,23,8,-141,-149,-55,35,-1,-94,-57,-24,-146,13,13,21,34,50,-158,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-31,-147,-28,-38,-32,-90,-56,34,-9,7,-17,-8,-151,-3,-144,-17,10,73,-157,-63;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-150,-17,6,-24,-92,4,-12,-2,-14,-42,-28,12,8,47,43,15,-2,-154,-36;
MA   /M: SY='R'; M=-59,-71,-46,-27,-30,-152,-60,11,36,-12,-66,-137,20,29,66,-79,20,11,-150,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-70,-155,20,19,-68,-77,-2,-21,19,-41,-28,-47,32,69,14,-1,-15,19,-49,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-80,-155,-29,10,33,16,-10,-35,-36,3,-134,-28,25,20,-24,-50,4,1,100,6;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='P'; M=-47,-21,6,-93,-13,-22,-147,20,-10,-34,-33,-12,94,-33,-57,-3,-39,-28,-158,-148; D=-25;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='N'; M=-97,-180,9,-22,-37,-55,-26,-60,-62,6,-160,19,-27,-21,-52,-25,-53,-43,-185,-69; D=-25;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='T'; M=-165,-182,-15,-47,-182,7,-57,-106,-4,-71,-170,-31,-44,13,8,-46,21,-60,-187,-174; D=-25;
MA   /I: I=-25; DM=-63;
MA   /M: SY='N'; M=-32,-149,39,-84,-144,34,-7,16,-50,-19,-33,60,-94,-13,-60,-41,-57,48,-161,-143;
MA   /M: SY='D'; M=-8,-150,62,-7,-147,-30,-29,-15,17,-90,-140,-18,-34,-1,-5,-25,58,8,-159,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-51,-148,-162,-155,-1,-163,-152,51,-154,70,-112,-157,-158,-151,-154,-150,-136,50,-149,-35;
MA   /M: SY='T'; M=-20,-150,-17,25,-146,-47,37,-14,38,-31,-75,4,-144,12,12,-19,51,15,-41,-48;
MA   /M: SY='I'; M=-74,-150,-159,-76,28,-70,-150,72,-152,16,13,-154,-155,-151,-153,-148,-136,58,-143,44;
MA   /M: SY='N'; M=-36,-150,-5,-4,-58,-94,51,-68,39,-56,-137,52,-146,32,4,-10,34,16,-42,1;
MA   /M: SY='V'; M=-74,-52,-161,-86,7,-163,-158,60,-153,18,-64,-155,-156,-153,-155,-147,-82,85,-155,-133;
MA   /M: SY='T'; M=-61,-150,33,37,-61,-147,-12,-23,51,-52,-30,-8,-142,3,-37,-18,53,21,-159,-142;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-157,-115,109,-157,-85,-134,-84,-33,-151,-52,-81,4,-116,-131,-42,-137,-46,30,-148;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-156,-63,-67,-32,58,16,-92,-23,-61,-141,7,-92,26,75,-85,-41,-151,-17,44;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=POTRA;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU01115;
DO   PDOC51779;
//