ID   LYSM; MATRIX.
AC   PS51782;
DT   01-NOV-2015 CREATED; 01-NOV-2015 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   LysM domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9349295; R2=0.0070080; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=937; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=652; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-25; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='M'; M=-41,-72,-24,-21,5,-53,14,4,30,6,35,-17,-36,22,-16,35,7,0,-73,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-71,-33,10,22,-69,-19,0,-2,-60,-59,-57,-24,-24,-26,19,62,-18,72,31;
MA   /M: SY='Y'; M=-68,-16,-65,-40,-36,-77,95,6,-37,-54,-50,-61,-77,-57,-33,-64,-64,8,-49,104;
MA   /M: SY='T'; M=-57,-69,-20,-11,-65,-49,-20,14,23,-14,-54,10,-10,-58,-21,-18,72,27,-83,-64;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-67,-82,-76,-19,-82,-82,30,-74,1,-41,-77,-78,-75,-76,-65,-31,89,-82,-59;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-12,-58,-5,-72,-20,-58,-63,57,-67,-16,-37,-67,62,11,11,4,13,-74,-5;
MA   /M: SY='P'; M=11,-74,-9,8,-34,-25,-59,-70,41,-47,-17,-3,42,25,-4,34,0,-50,-75,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-26,-76,0,1,-81,88,-65,-54,-17,-51,-71,-11,-67,5,-34,-33,-64,-78,-76,-74;
MA   /M: SY='D'; M=-64,-80,105,43,-83,-44,-53,-84,-52,-82,-79,-11,-65,-22,-60,-12,-57,-80,-93,-20;
MA   /I: I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
MA   /M: SY='T'; M=-49,-63,-55,-59,-44,-41,-62,-40,-57,-68,-63,18,-62,-29,-63,68,87,-57,-83,-31;
MA   /M: SY='C'; M=-39,83,-83,-77,-15,-83,-72,12,-77,68,-1,-77,-83,-73,-76,-71,-38,12,-75,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-29,-76,-8,-10,12,-13,-60,-67,-59,-67,-15,22,-70,31,-63,39,20,-47,110,42;
MA   /M: SY='S'; M=27,-69,-2,-13,-35,12,-61,-11,-2,-28,-62,-30,-67,-12,8,60,1,-39,-76,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-75,-86,-82,14,-88,-80,91,-78,31,0,-78,-77,-75,-80,-74,-59,11,-71,-52;
MA   /M: SY='A'; M=80,-12,-67,-61,-71,-22,-68,-60,-63,-14,-59,-60,-31,-59,-67,41,-49,-6,-77,-69;
MA   /M: SY='D'; M=10,-74,32,16,-71,-32,-32,-24,29,-11,-22,24,-68,22,31,-2,-12,-20,-15,-40;
MA   /M: SY='Q'; M=-24,-76,-14,0,-76,-66,-7,-54,57,-36,-16,11,-66,63,40,17,-2,-70,-77,-64;
MA   /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
MA   /M: SY='Y'; M=-28,-7,-69,-68,63,-73,44,-19,-20,-36,-53,-15,-42,-8,-63,-4,-33,-60,20,95;
MA   /M: SY='G'; M=-21,-15,-7,-9,-51,78,31,-84,16,-81,-71,35,-33,-35,-43,-34,-62,-79,-78,-70;
MA   /M: SY='I'; M=-17,10,-38,-23,-55,-18,-74,55,-69,6,-6,-43,-72,-68,-73,-5,28,48,-78,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-15,-69,12,-20,-19,1,-62,-68,5,-29,-64,-13,33,-21,-37,49,60,-63,-80,-66;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-68,-35,-44,-8,-53,-69,14,-16,16,50,-33,-23,-65,-68,-3,30,51,-77,-21;
MA   /M: SY='D'; M=23,-1,50,4,-74,-18,-20,-71,-10,-32,0,35,-67,33,-11,27,2,-67,-82,-30;
MA   /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
MA   /M: SY='Q'; M=9,-76,56,37,-78,-66,-26,-27,26,-34,-64,1,-65,64,-18,-30,-9,-42,-81,-66;
MA   /M: SY='I'; M=-68,-72,-85,-80,60,-87,-74,66,-78,56,-35,-78,-80,-76,-78,-74,-33,-25,-63,-44;
MA   /M: SY='K'; M=14,-73,-67,-8,-57,-72,-63,26,34,26,27,-63,-71,23,4,-25,-2,-11,22,2;
MA   /M: SY='K'; M=7,-74,-5,20,-9,-50,-56,-74,49,-53,-64,1,-66,44,43,20,1,-69,-75,-63;
MA   /M: SY='W'; M=23,-74,-53,-49,-28,-45,-72,-37,-48,40,6,-75,-76,-32,-30,-39,-29,21,115,17;
MA   /M: SY='N'; M=-42,-67,-38,-58,-74,-52,-45,-33,-50,-77,-66,121,-73,-52,-58,-46,-47,-8,-95,-71;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='N'; M=8,-75,-11,-7,-79,25,31,-76,28,-77,-66,54,40,33,-19,-10,-24,-46,-81,-68;
MA   /M: SY='L'; M=-62,-72,-21,-15,-6,10,-70,45,-45,52,23,-12,-76,-67,-72,-67,-28,12,1,-56;
MA   /M: SY='N'; M=-18,-72,25,-45,-33,-21,-23,19,35,-45,-14,45,-14,-18,-13,27,-7,5,-79,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-18,-71,34,-7,-35,-9,-24,-33,-4,-42,-66,62,-9,-14,-5,49,7,-52,-84,-66;
MA   /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
MA   /M: SY='C'; M=-16,79,14,-29,-22,-62,-79,-79,-55,-25,-19,-10,59,-77,-83,-44,-5,-57,-96,-82; D=-33;
MA   /I: I=-33; DM=-84;
MA   /M: SY='N'; M=-24,-72,33,5,-27,-18,13,-55,-15,-50,-65,62,-19,27,-23,39,5,-52,-79,11;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-32,13,-16,-23,-27,11,-61,22,1,-29,66,-42,-12,-4,8,-5,1,-20,-63;
MA   /M: SY='I'; M=-41,-72,-84,-78,-8,-85,-77,72,-77,54,-35,-78,-21,-73,-78,-43,-59,26,-73,-55;
MA   /M: SY='W'; M=-41,-77,-15,-2,35,-45,27,-26,7,-27,-26,-11,-72,48,-8,-16,-2,-17,75,56;
MA   /M: SY='P'; M=42,-71,-69,-63,-32,-65,-70,32,-41,-10,-19,1,64,-21,-70,-3,-18,21,-78,-66;
MA   /M: SY='G'; M=-39,-75,-18,-44,-16,91,-66,-83,-15,-39,-71,16,-69,-63,-36,-34,-64,-79,-74,-71;
MA   /M: SY='Q'; M=-16,-78,30,-5,-27,-68,-51,-42,7,-67,-5,-51,-67,99,-7,-33,15,-69,-69,30;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-71,-39,7,-66,-67,-61,-9,40,-39,-58,-28,-11,9,13,29,38,12,-75,12;
MA   /M: SY='L'; M=-45,-73,-82,-78,-20,-84,-67,59,-76,61,-35,-78,-80,-71,-75,-48,-60,7,-63,51;
MA   /M: SY='C'; M=-35,83,4,-60,-60,-73,-65,-13,36,-10,-56,-9,-75,12,-29,-28,0,33,41,22;
MA   /M: SY='I'; M=-30,21,-83,-78,-24,-83,-81,70,-75,13,-14,-76,-34,-74,-78,-41,-31,60,3,-58;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=LysM;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU01118;
DO   PDOC51782;
//