ID   ZF_CCHC_NOA; MATRIX.
AC   PS51801;
DT   01-JUN-2016 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger CCHC NOA-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=31;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=28;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3267822; R2=0.0114355; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3317.8935547; R2=0.5922078; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1109; H_SCORE=3975; N_SCORE=15.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=365; H_SCORE=3534; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-102; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='Q'; M=21,-6,-208,-23,-46,-5,-19,-67,-21,-85,-209,-17,60,76,31,-17,-1,-40,3,-63;
MA   /M: SY='R'; M=-60,-227,-8,39,-68,-32,-48,-219,-105,-57,-211,-131,67,39,68,-31,16,-67,-78,17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-220,9,33,-223,49,-7,-220,-131,-39,-92,37,25,-17,-30,29,19,-66,-228,-217;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-223,-21,-12,-73,-39,-209,33,-27,11,7,-69,36,75,9,3,-13,-40,-223,-210;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-222,-17,-15,-226,36,-39,-222,-206,-140,-216,-49,81,-5,-47,61,10,-218,-227,-79;
MA   /M: SY='D'; M=-25,-222,68,57,-83,-78,-207,32,-37,-26,19,-18,-213,-3,-53,-35,18,-12,-230,-212;
MA   /M: SY='H'; M=-216,-220,-222,-218,38,-228,85,-58,-100,75,-56,-62,-228,-102,-81,-218,-212,-197,-209,56;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,41,-207,-32,-216,-214,-14,-12,-40,-37,-18,-15,-217,90,46,39,-63,-33,-12,4;
MA   /M: SY='C'; M=-208,162,-228,-228,-219,-224,-228,-225,-224,-216,-216,-214,-239,-232,-231,-211,-208,-213,-248,-229;
MA   /M: SY='P'; M=-214,-239,-214,-202,-233,-215,-217,-221,-210,-231,-218,-220,136,-214,-223,-211,-206,-226,-226,-231;
MA   /M: SY='K'; M=-66,-224,-210,-200,-212,-71,72,36,80,7,-199,-202,-217,0,38,-84,-207,-63,-222,-40;
MA   /M: SY='C'; M=-208,162,-228,-228,-219,-224,-228,-225,-224,-216,-216,-214,-239,-232,-231,-211,-208,-213,-248,-229;
MA   /M: SY='M'; M=-21,-218,-25,-19,9,17,3,-204,-62,36,59,47,-219,39,-209,32,-76,-206,-221,-41;
MA   /M: SY='Q'; M=11,-6,-100,38,-3,-29,-203,8,38,-88,-10,-18,-216,49,43,-203,-30,-209,-214,42;
MA   /M: SY='C'; M=-41,48,-214,-212,-9,15,-16,33,-16,-58,2,-112,-66,16,-2,35,42,20,-224,-59;
MA   /M: SY='F'; M=6,38,-229,-225,107,-225,-210,-196,-222,17,-195,-222,-230,-225,-220,-215,-57,-75,-194,61;
MA   /M: SY='P'; M=-206,26,11,-201,-225,-76,-73,-222,7,-226,-216,47,84,-201,38,48,6,-220,-229,-57;
MA   /M: SY='D'; M=-24,-224,114,0,-231,-209,-201,-229,-201,-229,-226,29,-213,-200,-209,10,-10,-224,-244,-218;
MA   /M: SY='M'; M=-81,-222,-24,37,-17,-82,-212,33,-12,53,63,-216,-221,-37,-55,-214,6,-93,-219,6;
MA   /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
MA   /M: SY='D'; M=18,-222,87,39,-228,-97,-30,-222,-45,-222,-18,-43,-213,-10,-208,25,25,-43,-237,-217;
MA   /M: SY='T'; M=-28,-217,-198,64,-221,-214,-210,-69,-94,-215,-18,-18,-40,-12,-209,45,78,1,-232,-216;
MA   /M: SY='L'; M=-68,25,-231,-225,33,-232,-213,-186,-225,87,-182,-229,-233,-220,-223,-223,-212,-79,-210,44;
MA   /M: SY='Q'; M=-210,-226,-206,36,4,-221,-203,-207,-58,35,9,-61,-218,111,-199,-66,-61,-63,-220,-205;
MA   /M: SY='I'; M=-93,-223,-55,23,-214,-80,-49,63,25,-32,-203,59,-218,-110,30,33,-202,-198,-228,-212;
MA   /M: SY='H'; M=-219,-231,-203,-203,-218,-221,157,-236,-208,-218,-203,-192,-220,-197,-202,-209,-218,-235,-253,-186;
MA   /M: SY='V'; M=8,54,-232,-226,-13,-229,-231,29,-224,-27,-18,-226,-228,-225,-226,-215,-205,86,24,-209;
MA   /M: SY='M'; M=24,-219,12,29,-218,-212,6,-208,-206,-65,90,54,-35,-42,-211,13,15,-33,-233,-213;
MA   /M: SY='D'; M=-213,-231,90,80,-59,-220,-34,-229,-198,-226,-35,-196,-213,18,-62,-58,-209,-63,-234,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-212,157,-230,-230,-44,-227,2,-228,-226,-218,-218,-217,-241,-233,-119,-214,-212,-216,-249,-228;
MA   /M: SY='C'; M=20,87,-231,-227,-37,-228,-226,70,-105,36,23,-223,-56,-222,-227,-216,-209,-42,-227,-210;
MA   /M: SY='Q'; M=-76,-34,69,-20,-229,6,-24,-3,-5,-60,-216,16,-219,73,1,-15,-52,-220,-234,-217;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=18(18); /POSITIVE=18(18); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=CCHC NOA-type;
CC   /VERSION=3;
DR   Q95KU9    , NEMO_BOVIN , T; Q9GYV5    , NEMO_DROME , T;
DR   Q9Y6K9    , NEMO_HUMAN , T; O88522    , NEMO_MOUSE , T;
DR   A9QT41    , NEMO_PIG   , T; Q6TMG5    , NEMO_RAT   , T;
DR   Q90Z16    , OPTN_CHICK , T; Q5RI56    , OPTN_DANRE , T;
DR   Q96CV9    , OPTN_HUMAN , T; Q95KA2    , OPTN_MACFA , T;
DR   Q861Q8    , OPTN_MACMU , T; Q8K3K8    , OPTN_MOUSE , T;
DR   Q7YS99    , OPTN_PIG   , T; Q5R923    , OPTN_PONAB , T;
DR   Q8R5M4    , OPTN_RAT   , T; Q5M7B7    , OPTN_XENLA , T;
DR   Q8NFZ5    , TNIP2_HUMAN, T; Q99JG7    , TNIP2_MOUSE, T;
3D   2JVX; 2JVY; 2LO4; 5AAY; 5AAZ;
PR   PRU01142;
DO   PDOC51801;
//