ID   CHCH; MATRIX.
AC   PS51808;
DT   01-AUG-2016 CREATED; 01-AUG-2016 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Coiled coil-helix-coiled coil-helix (CHCH) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5089412; R2=0.0082775; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=966; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=483; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-49; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='H'; M=-2,19,-4,-19,-4,14,40,-72,5,-56,7,-30,-105,26,35,2,35,-54,-1,10;
MA   /M: SY='D'; M=4,19,33,-6,-195,30,-13,-55,24,-192,-18,18,26,32,16,13,-26,-106,-198,-186;
MA   /M: SY='P'; M=1,-196,3,35,-188,-31,28,-185,-23,-80,-68,3,76,20,21,-38,-47,-3,-192,22;
MA   /M: SY='C'; M=-178,162,-198,-198,-189,-194,-198,-195,-194,-186,-186,-184,-209,-202,-201,-181,-178,-183,-218,-199;
MA   /I: I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115;
MA   /M: SY='W'; M=29,-190,6,-31,-8,14,5,-76,5,0,29,-7,0,26,-87,1,-16,-33,61,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-194,31,60,-17,-50,38,-63,27,-101,-25,-28,14,39,-32,-20,-38,-11,-193,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-15,-192,-169,74,19,-78,7,-85,-82,18,-37,-10,31,23,-46,-9,-16,-44,-189,-3;
MA   /M: SY='M'; M=0,-26,-183,-37,53,-25,-3,21,15,-14,55,33,-191,9,6,-47,-83,-35,19,8;
MA   /M: SY='K'; M=-9,31,25,16,-69,-186,-25,-7,60,-15,11,-11,-185,19,21,-12,-7,-34,-196,-181;
MA   /M: SY='A'; M=54,-189,23,44,-51,-179,-176,-37,10,-30,-20,6,-59,48,-6,8,-115,-81,-195,-183;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-191,-193,-188,70,-192,-25,15,-184,21,-16,-188,11,-43,-15,5,-178,-84,26,79;
MA   /M: SY='M'; M=-56,-192,22,-8,27,-25,38,-6,-18,32,56,-23,-190,43,-48,-47,-27,-25,47,-55;
MA   /M: SY='Q'; M=-33,-193,30,44,-192,-39,-81,-191,53,-21,-181,0,-182,54,30,3,-1,-187,-195,-41;
MA   /M: SY='C'; M=-178,162,-198,-198,-189,-194,-198,-195,-194,-186,-186,-184,-209,-202,-201,-181,-178,-183,-218,-199;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-38,-191,-87,31,-193,43,16,-9,41,49,-184,-193,-1,11,-28,-83,-13,46,23;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-192,17,-8,-73,-185,25,-65,59,-44,-18,-5,-185,34,27,-3,7,-3,64,-42;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='E'; M=3,-195,32,61,-47,-35,-26,-192,-8,-45,-71,20,-185,24,10,3,-28,-113,-192,35; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='N'; M=-65,-49,-24,-2,-24,-21,48,-40,24,-188,-1,87,-48,-169,-49,21,4,-67,29,-2; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='Q'; M=-41,-195,-24,19,-4,45,-177,-193,2,-85,-63,36,26,50,-21,-28,18,-190,-191,8; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,-195,26,38,-15,-1,30,-2,-63,-71,-16,17,-19,26,-42,5,-79,-65,-187,55; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='D'; M=-44,-196,61,39,-23,-34,-176,-64,-4,-14,7,26,29,22,-26,-2,-49,-91,22,-183; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='W'; M=-31,-196,-2,14,10,-28,-182,-37,28,-30,-40,10,28,-55,43,-28,-18,6,46,-179; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='W'; M=11,-198,5,-1,15,9,-28,-15,16,-22,-25,-40,-18,-49,-42,15,-38,-39,26,-64; D=-18;
MA   /I: I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
MA   /M: SY='K'; M=1,-192,27,25,-66,-185,33,-181,48,12,-3,21,5,19,11,-50,-51,-45,-194,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-178,162,-198,-198,-189,-194,-198,-195,-194,-186,-186,-184,-209,-202,-201,-181,-178,-183,-218,-199;
MA   /M: SY='R'; M=2,-190,-10,26,-52,-44,7,-16,24,4,-36,19,-185,3,42,18,17,-42,-196,-180;
MA   /M: SY='E'; M=1,-193,45,48,-188,0,13,-33,45,-51,-182,3,-20,-21,-14,-26,-32,-57,4,9;
MA   /M: SY='E'; M=-54,-79,-177,60,42,-106,1,-47,5,44,-17,-112,-189,31,-176,-181,-180,-33,34,37;
MA   /M: SY='F'; M=1,-191,-14,-60,54,2,-26,24,2,-65,40,11,-189,34,15,2,-175,-17,19,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-31,-194,40,39,-189,-72,7,-118,50,-88,24,-40,-183,32,41,-17,-2,-31,2,-4;
MA   /M: SY='A'; M=53,-35,35,32,-97,-70,-63,-43,6,-9,-176,-50,-184,13,-9,10,-22,0,-196,-40;
MA   /M: SY='Y'; M=-185,-191,-197,-193,71,-198,11,-39,-189,30,58,-192,-199,-187,-187,-188,-180,24,32,89;
MA   /M: SY='K'; M=-50,-193,-7,0,0,-96,-27,-38,52,5,17,27,-188,29,47,-96,-11,-58,3,15;
MA   /I: I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115;
MA   /M: SY='Q'; M=-47,-194,27,51,-190,-51,-2,-33,46,-10,-83,13,-183,54,16,-7,-63,-69,-195,-38;
MA   /M: SY='C'; M=-179,161,-199,-199,-189,-194,-199,-196,-195,-187,-187,-185,-210,-202,-201,-182,-179,-184,-219,-200;
MA   /M: SY='C'; M=9,41,-187,-25,-4,-190,-185,-72,34,17,25,-182,27,-77,24,-52,7,31,31,-177;
MA   /M: SY='R'; M=-22,-191,-89,15,-51,-78,15,-55,32,20,34,-15,-187,17,40,27,-2,-51,-190,10;
MA   /M: SY='K'; M=0,-193,39,36,-26,-20,-4,-194,48,-87,-81,-29,-183,37,22,35,-67,-189,-194,-26;
MA   /M: SY='W'; M=6,-194,-8,2,31,-188,48,-29,-19,-25,-3,14,-191,0,-15,-37,-34,-17,104,46;
MA   /M: SY='Y'; M=-27,-193,-186,-180,8,12,23,-5,2,20,-12,-16,26,39,-16,-95,-41,15,-184,46;
MA   /M: SY='K'; M=-30,-23,34,17,-16,-18,-179,-8,36,9,-15,9,-18,-4,10,-19,10,-46,-196,-76;
MA   /M: SY='M'; M=-22,-193,32,10,-25,-17,-29,-13,10,-55,65,-2,-1,21,-4,4,1,-66,33,6;
MA   /M: SY='W'; M=-53,-196,-56,-14,-19,-60,-180,12,25,-20,8,8,-62,-8,60,-19,-15,-12,61,13;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CHCH;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU01150;
DO   PDOC51808;
//