ID   XTBD; MATRIX.
AC   PS51827;
DT   15-MAR-2017 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   XRN2-binding (XTBD) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=85;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=80;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1024818; R2=0.0114432; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8507.5146484; R2=5.9352160; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=647; H_SCORE=12348; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=385; H_SCORE=10793; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-30,31,51,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,33;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-10,-11,-6,-19,-3,-16,-14,-10,-18,-14,-1,-10,-6,-15,23,15,-4,-29,-19,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-15,-25,-12,5,2,-27,-5,0,-13,17,3,-18,-21,-5,-11,-18,-10,-7,-12,11,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,41,-25,-10,0,-15,10,49,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-7,17,-13,-11,-23,-7,-20,-27,1,-23,-15,-6,-20,-11,-5,-2,2,-15,-31,-19,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-25,8,17,-19,-22,10,-14,-6,-5,-7,-5,-14,1,-8,-8,-10,-12,-30,-8,8;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-23,-9,-25,-25,-2,2,-16,-23,-20,-18,-16,-21,-29,-20,-20,-19,-19,-22,39,13,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-9,-15,-15,-10,-21,-15,5,-10,-5,-10,31,34,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,61,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,27,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,18,-30,26,24,-33,-17,-5,-33,25,-28,-19,6,-8,9,11,-5,-10,-25,-29,-15,17;
MA   /M: SY='H'; M=4,-3,-24,-6,0,-24,-14,46,-22,-6,-17,-3,2,-15,13,-4,-2,-12,-21,-25,2,4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-17,8,-30,15,20,-19,-20,4,-27,10,-19,-16,1,-13,7,16,-6,-10,-24,-19,1,11;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-18,-21,-20,-13,-4,-22,14,0,-21,19,9,-15,-24,-10,-14,-17,-11,-3,-23,2,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,33,-22,-10,0,-18,10,63,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='E'; M=12,7,-19,10,19,-26,-8,-9,-23,-2,-21,-18,2,-7,3,-10,12,0,-16,-31,-20,11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-18,-30,-22,3,-25,-11,22,-17,27,40,-25,-25,-11,-15,-21,-8,17,-22,-2,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=18,-10,-19,-15,-5,-20,-9,-11,-19,9,-15,-10,-5,-15,-1,22,1,-5,-9,-20,-15,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-15,19,-25,9,0,-20,-11,58,-25,-5,-25,-9,33,-20,5,0,-1,-11,-30,-35,1,0;
MA   /M: SY='Y'; M=4,-13,-23,-17,-11,-3,-17,-2,-6,3,-6,6,-13,-18,-4,-4,-9,-7,-6,-4,17,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-13,26,-30,38,16,-35,11,-6,-38,-4,-28,-25,11,-11,-2,-11,0,-13,-30,-33,-23,7;
MA   /M: SY='D'; M=-7,26,-26,36,10,-32,-10,-4,-32,5,-24,-22,10,-12,0,6,0,-8,-22,-32,-18,4;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-23,-31,-24,44,-30,-7,6,-24,18,6,-23,-30,-25,-17,-23,-10,0,8,37,-24;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-4,-30,1,19,-31,-16,-5,-22,0,-25,-14,-4,24,18,-5,4,-5,-26,-29,-20,17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-12,-25,-9,7,-11,-25,-12,-7,4,9,2,-14,-17,-2,0,-17,-10,-8,-22,-8,3;
MA   /M: SY='D'; M=-14,11,-30,15,4,-27,-22,-7,-6,-7,-11,-6,2,-13,11,-11,-6,-10,-11,-28,-11,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-4,-30,-4,12,-32,-20,6,-24,18,-20,-4,0,-14,40,34,-4,-10,-26,-20,-10,24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-21,-21,-22,-12,-11,-28,-16,15,-14,9,10,-19,-22,2,-12,-12,-6,15,-24,-7,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-11,60,-16,-16,-20,-16,-21,-25,-21,-25,-20,-6,-26,-16,-21,13,4,-10,-45,-25,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,30,-30,-20,14,-30,39,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='S'; M=19,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,33,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-9,-25,-14,1,-21,-20,5,-1,1,-1,28,-9,-15,32,1,-9,-10,-11,-20,-5,17;
MA   /M: SY='L'; M=11,-18,-13,-23,-17,-5,-19,-22,7,-18,12,3,-18,-20,-17,-18,-4,8,12,-24,-10,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-34,-40,-30,48,-25,-25,-9,-25,-4,-9,-29,-30,-31,-20,-29,-19,-14,75,30,-25;
MA   /M: SY='V'; M=20,-21,-16,-29,-21,-9,-19,-25,18,-19,4,4,-18,-18,-18,-23,-4,-3,21,-22,-11,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-14,-21,-16,-14,-9,-23,37,0,-13,-2,16,-9,-23,-5,-9,-12,-11,4,-28,6,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-12,-17,-11,-1,-13,-25,-19,1,-1,-6,-3,-14,-17,-10,-7,-3,5,14,-29,-12,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,58,-30,-20,6,-30,23,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,1,21,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,43,29,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-1,-30,2,21,-25,-20,-2,-30,28,-22,-13,0,-11,13,39,-7,-10,-23,-23,-13,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-31,-7,0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-11,59,-7,-17,6,-1,-24,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-26,3,21,-34,-16,4,-21,6,-22,-7,2,-9,41,4,9,-3,-26,-26,-14,31;
MA   /M: SY='K'; M=6,-4,-19,-8,-1,-21,-13,-12,-21,14,-20,-11,-1,-12,1,14,7,7,-11,-25,-14,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-13,-26,-22,1,-28,-25,18,-21,18,9,-23,-26,-22,-18,-10,8,26,-27,-7,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,17,-28,26,11,-29,-18,-1,-20,-4,-9,-9,3,-14,14,-6,-7,-10,-21,-29,-12,13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-7,-28,-7,3,-21,-22,-12,-19,32,-12,-3,-7,-14,3,19,-14,-10,-13,-20,-8,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-5,-21,-11,-5,-14,-15,-7,-8,-4,0,-2,0,-19,3,3,-6,-6,-10,-24,-11,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-18,5,21,-21,-14,-9,-21,-2,-20,-17,3,-6,5,-6,18,17,-15,-33,-17,13;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-4,20,-14,27,51,-22,-22,-4,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-16,-12,-11,-23,22,-18,-22,-13,-21,-15,-2,-13,-11,-18,14,-2,-12,-24,-23,-11;
MA   /M: SY='E'; M=9,1,-24,3,27,-27,-14,-9,-24,13,-19,-15,-3,-5,8,0,1,-7,-18,-25,-18,18;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-3,-2,-30,50,-16,-38,-13,-28,-20,0,-16,-11,-16,0,-18,-30,-22,-28,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=24,-5,-16,-13,-4,-21,-9,-17,-16,7,-16,-10,-5,-10,-4,-4,6,6,-6,-22,-15,-4;
MA   /M: SY='A'; M=27,-19,-10,-25,-19,-11,-14,-25,9,-15,-1,-1,-19,-19,-19,-20,1,0,23,-25,-15,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-6,12,-20,9,-4,-18,-15,-11,-9,-10,-15,-12,12,-13,-6,-12,10,13,-8,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-15,9,-28,15,13,-8,-19,-8,-26,11,-19,-15,1,-13,-2,2,-8,-10,-20,-21,-6,7;
MA   /M: SY='A'; M=12,9,-21,11,2,-26,-8,-9,-24,2,-19,-16,2,-12,-2,3,2,-5,-14,-26,-18,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-12,-35,-8,4,-29,-20,-7,-23,7,-25,-12,-9,33,12,15,-8,-10,-27,-25,-19,4;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-2,-21,-7,4,-17,-23,-16,-10,4,-12,-8,-3,-10,-2,-2,4,18,-6,-26,-10,1;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,0,-16,-21,14,-26,25,-20,-7,-1,-18,7,36,-11,-11,-20,-14,7,0;
MA   /I: I=-15; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-15,3,13,-17,-11,-7,-17,8,-16,-11,1,-5,5,2,7,7,-12,-21,-11,9; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-3,-21,-8,-6,-23,8,-13,-22,-9,-19,-11,0,-13,2,-9,9,15,-16,-25,-16,-2;
MA   /I: I=-10; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-17,-1,0,-14,-8,0,-18,10,-17,-10,10,-13,4,26,4,-1,-14,-21,-10,0; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-18,-20,-21,-17,11,-27,-7,5,-18,17,5,-18,-24,-14,-14,-13,7,1,-7,22,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-12,-24,-12,-5,-18,-23,-13,-11,22,-15,-4,-9,-19,-3,26,-10,-7,2,-23,-10,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-17,10,-30,16,9,-29,-17,-3,-33,28,-26,-16,6,-14,7,35,-7,-10,-23,-26,-13,6;
MA   /M: SY='E'; M=11,-4,-21,-5,12,-22,-14,-14,-17,-4,-16,-15,-7,11,-1,-12,6,6,-14,-27,-20,4;
MA   /M: SY='F'; M=5,-17,-15,-21,-14,11,-15,-17,-2,-20,5,-2,-12,-20,-16,-17,1,1,0,-20,-3,-14;
MA   /M: SY='V'; M=8,-27,-10,-28,-27,-3,-25,-28,23,-18,7,7,-27,-27,-27,-20,-7,0,42,-28,-12,-27;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,22,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='K'; M=14,-4,-22,-8,2,-26,-12,-14,-22,26,-22,-10,-4,-10,2,10,-2,-6,-12,-20,-14,2;
MA   /M: SY='K'; M=9,-7,-17,-9,-3,-20,-12,-15,-13,10,-19,-9,-4,-13,-3,1,7,2,-2,-27,-15,-3;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=10(10); /POSITIVE=10(10); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=XRN2-binding (XTBD);
CC   /VERSION=3;
DR   Q24JY8    , C2AIL_BOVIN, T; Q96HQ2    , C2AIL_HUMAN, T;
DR   Q9D211    , C2AIL_MOUSE, T; Q5RK03    , C2AIL_RAT  , T;
DR   Q7ZXV6    , CARFA_XENLA, T; Q6PAV5    , CARFB_XENLA, T;
DR   Q9NXV6    , CARF_HUMAN , T; Q8BI72    , CARF_MOUSE , T;
DR   Q5U2X0    , CARF_RAT   , T; Q21738    , PAXT1_CAEEL, T;
3D   5FIR;
PR   PRU01171;
DO   PDOC51827;
//