ID   RSGI_N; MATRIX.
AC   PS51849;
DT   31-JAN-2018 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   RsgI N-terminal anti-sigma domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1056739; R2=0.0090989; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4674.6215820; R2=3.0675676; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=978; H_SCORE=7675; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=593; H_SCORE=6494; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='M'; M=-25,-22,-16,-6,-10,-10,7,0,26,-15,37,30,-26,12,4,-8,-15,-9,-30,33;
MA   /M: SY='K'; M=-25,-39,-20,0,-30,-34,-5,-29,62,-25,-26,-2,-30,-4,46,-9,9,-24,-38,-17;
MA   /M: SY='G'; M=17,-37,-28,-36,-44,80,-34,-46,-29,-44,-35,-15,-31,-29,-38,-9,-24,-28,-38,-40;
MA   /M: SY='I'; M=-23,-2,-45,-41,-14,-48,-43,60,-32,15,24,-37,-39,-36,-27,-29,-1,43,-41,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-14,0,-47,-42,-16,-48,-48,49,-39,4,-4,-41,-41,-40,-41,-31,-17,65,-46,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-22,-14,-47,-40,-1,-46,-32,31,-37,36,69,-40,-40,-32,-36,-35,-19,34,-37,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-15,-41,24,63,-44,-32,-18,-43,32,-34,-33,2,-24,16,3,5,-20,-38,-43,-33;
MA   /M: SY='I'; M=-20,-25,-36,-23,-7,-42,-12,43,15,13,3,-25,-36,-7,-12,-10,1,32,-39,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-17,-39,18,27,-27,-8,24,-35,39,-31,-24,25,-29,15,11,-1,-2,-28,-42,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-18,-40,18,22,-37,30,-11,-44,41,-41,-33,22,-17,-6,19,-5,-12,-40,-42,-32;
MA   /M: SY='K'; M=-25,-40,28,6,-35,-2,9,-42,39,-37,-20,37,-18,3,35,-3,-12,-39,-44,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-21,-20,-14,-8,13,-22,36,-30,20,-20,-6,9,-35,4,15,13,0,-28,6,52;
MA   /M: SY='A'; M=40,23,-36,-32,-23,-18,-34,19,-31,2,22,-25,-35,-28,-34,0,5,21,7,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-14,-35,-41,-40,-10,-37,-26,57,-36,6,3,-29,-37,-35,-39,-25,16,38,-14,18;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-20,-47,-41,-1,-47,-43,42,-39,20,8,-41,-41,-38,-40,-32,-18,59,-41,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-17,-33,-46,-38,9,-44,-27,8,-36,52,68,-40,-42,-30,-28,-35,-21,7,-32,3;
MA   /M: SY='T'; M=-9,2,-9,-22,-31,-28,-29,-22,-8,-14,-7,2,-25,-12,-23,11,77,-13,-49,-29;
MA   /M: SY='P'; M=1,-21,27,29,-43,-9,-17,-40,9,-38,-32,5,40,10,7,21,-12,-33,-44,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-25,-28,71,25,-39,-4,-2,-44,7,-42,-26,14,-29,4,-9,6,-3,-37,-53,-31;
MA   /M: SY='G'; M=-8,30,-28,-37,-17,76,-32,-42,-30,-36,-27,-1,-33,-29,-16,-3,-25,-40,-38,-36;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-39,23,51,-42,-24,-18,-30,0,-33,-30,-3,-26,36,16,12,8,-28,-44,-31;
MA   /M: SY='F'; M=-36,-21,-49,-45,92,-46,-28,2,-40,3,-2,-40,-48,-47,-38,-36,-29,-6,5,37;
MA   /M: SY='I'; M=-20,-12,-32,-19,-4,-43,3,32,12,26,10,-23,-38,-7,17,-28,-20,19,-35,1;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-12,-16,17,-32,-32,-6,-35,55,-34,-23,14,-29,2,41,-6,-1,-29,-38,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-44,-41,-1,-10,-43,55,-38,12,4,-36,-38,-36,-41,-20,-13,43,-40,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-22,-42,-15,-10,-31,-33,-7,-26,55,-32,-13,3,42,-2,34,-14,-11,-23,-36,1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-17,-20,-28,-28,-9,-13,30,3,-3,21,8,-16,34,-7,11,-7,-19,-8;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='K'; M=-16,-31,-6,1,-20,-5,-6,-17,30,-26,-21,12,-26,8,24,-1,7,-17,-43,-19; D=-24;
MA   /I: I=-24; DM=-61;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-30,18,22,-36,8,-1,-27,23,-34,-30,15,27,13,12,-2,-4,-29,-42,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-11,-38,24,9,-35,26,4,-18,0,-20,-24,34,19,1,-8,7,-8,-27,-45,-31;
MA   /M: SY='P'; M=3,11,-31,-22,-14,-29,-9,4,-29,8,41,-19,42,-17,-23,-17,-11,13,10,30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-38,7,31,-15,-29,-10,-15,16,-13,5,2,-21,29,15,6,-7,-11,-37,5;
MA   /M: SY='I'; M=-21,-36,-40,-12,-16,-47,-41,51,-15,17,-1,-37,-4,-32,-26,-31,-13,47,-42,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-12,-40,-27,-39,-46,87,-34,-54,-33,-49,-38,-8,-31,-30,-40,-9,-31,-47,-37,-41;
MA   /M: SY='Q'; M=-15,-42,31,52,-43,-33,-7,-37,6,-31,10,-11,-26,58,-3,-5,-15,-30,-42,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-17,-41,2,71,-38,-38,-12,-16,8,-24,-24,-16,-23,20,-8,-15,-4,-10,-42,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-19,-45,-42,-1,-41,-39,61,-35,5,4,-38,-28,-36,-40,-29,-11,40,-33,21;
MA   /M: SY='E'; M=-18,-8,7,31,-4,-32,-1,-4,-7,-6,-8,-18,-1,5,-7,11,14,-4,8,18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-43,-41,64,6,-32,23,-34,10,0,-32,-30,-39,-32,-26,-20,17,-6,26;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-38,18,22,-14,-21,-11,-17,14,-16,-25,8,29,2,0,4,20,-23,-40,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-40,20,36,-31,-31,-16,-22,2,-11,-21,4,43,2,-4,5,-6,-6,-43,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-38,-8,20,-7,-19,-18,-8,28,-5,-11,4,-13,8,11,8,-6,-1,10,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-11,-38,41,18,-26,-17,-21,-28,28,-26,-13,9,2,-1,11,6,2,-10,-44,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-37,-26,-3,0,-9,9,27,10,5,-6,-13,-14,-14,18,2,-10,9,-15,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-9,4,-17,-19,-3,-21,-3,15,2,1,-10,9,3,3,23,3,-10,-3,-2,18;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-26,-19,1,9,-22,-4,-11,25,-17,-16,19,3,10,24,13,-1,-11,3,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-38,-5,3,11,-10,15,-20,19,2,-20,8,7,-6,20,-5,-7,-11,-1,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-38,-21,-1,4,1,-9,-8,18,-8,-6,4,3,-3,19,9,0,-13,19,17;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=11(11); /POSITIVE=11(11); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=RsgI N-terminal anti-sigma;
CC   /VERSION=3;
DR   A3DBH1    , RSGI1_ACET2, T; A3DC27    , RSGI2_ACET2, T;
DR   A3DC75    , RSGI3_ACET2, T; A3DCG3    , RSGI4_ACET2, T;
DR   A3DEX6    , RSGI5_ACET2, T; A3DH97    , RSGI6_ACET2, T;
DR   A3DIE5    , RSGI7_ACET2, T; A3DJP2    , RSGI8_ACET2, T;
DR   A3DC20    , RSGI9_ACET2, T; P0DO99    , RSGI_BACAN , T;
DR   O31655    , RSGI_BACSU , T;
3D   6IVS; 6IVU;
PR   PRU01196;
DO   PDOC51849;
//