ID CSPG; MATRIX. AC PS51854; DT 28-FEB-2018 CREATED; 28-FEB-2018 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE CSPG repeat profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=92; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=87; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8655000; R2=0.0086952; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1511; N_SCORE=15.0; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=821; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='R?'; MA /DEFAULT: M0=-17; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; MA /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; MA /M: SY='P'; M=24,-55,-36,4,-29,-20,-24,-34,-2,-18,-41,-30,52,15,-28,-24,23,-14,-58,-25; MA /M: SY='P'; M=-14,-63,-34,-19,-33,-44,-14,-11,-29,-11,-40,-50,90,-13,-29,-27,-24,2,-60,-52; MA /M: SY='P'; M=-23,-60,-44,-4,-20,-51,18,2,-13,-45,-15,-15,53,36,6,4,-21,6,12,-24; MA /M: SY='V'; M=-32,-54,-26,-5,-14,-42,-51,25,-35,30,18,-52,6,3,-25,-27,-26,32,-58,-41; MA /M: SY='T'; M=-2,-51,-41,-37,3,-24,0,6,-40,13,12,-24,-33,-3,-50,1,30,22,-4,-25; MA /M: SY='T'; M=5,-53,-35,-38,-1,-30,-10,15,-8,-2,-23,-26,3,-8,5,-25,32,12,-8,-20; MA /M: SY='N'; M=-5,-52,-26,-19,-27,7,16,-21,-23,-26,-9,66,-52,-10,-7,16,-6,-22,-64,-37; MA /M: SY='T'; M=-1,-23,-9,-4,-41,-12,-12,-35,11,-38,8,-9,-17,12,28,6,31,-11,-62,-46; MA /M: SY='G'; M=-27,-57,-25,-8,-45,45,-14,-29,-21,-17,3,-6,34,-19,-14,13,-7,-21,-59,-32; MA /M: SY='L'; M=-27,-52,-66,-59,30,-66,-52,19,-59,62,22,-62,-64,-54,-57,-56,-44,1,-49,-30; MA /M: SY='H'; M=-19,-55,-18,16,-33,-46,43,-6,-23,-34,19,-31,-15,12,8,3,21,11,19,-10; MA /M: SY='V'; M=-30,-50,-63,-57,-33,-64,-59,14,-41,22,40,-58,-59,-54,-55,-48,-5,67,-12,-40; MA /M: SY='W'; M=-1,-3,4,-3,-1,-42,-45,-16,-23,3,2,-14,26,15,-39,-3,13,-19,35,-3; MA /I: I=-31; MI=0; MD=-79; IM=0; DM=-79; MA /M: SY='E'; M=-20,-61,-24,74,-62,-6,-38,-27,-11,-44,-30,-16,-1,34,-2,-27,-35,-44,-60,-52; MA /M: SY='G'; M=-31,-23,-26,-27,-17,72,16,-61,-21,-37,-50,1,-34,-23,-39,-12,-20,-47,-56,-21; MA /M: SY='G'; M=-6,-35,7,12,-44,39,7,-43,-29,-32,4,-26,-48,37,-43,20,-10,-28,-59,-28; MA /M: SY='R'; M=-3,-53,-44,-18,-41,-11,-17,-19,-10,-9,14,-23,-51,29,29,16,25,0,-60,-34; MA /M: SY='T'; M=18,-29,-46,-14,-1,-10,-19,-19,6,-14,-8,-17,-35,-14,18,-4,24,8,-58,-42; MA /M: SY='P'; M=-2,-56,-48,-4,-36,-53,-27,10,-24,0,-11,-30,50,-15,-14,-7,17,8,5,-10; MA /M: SY='I'; M=-48,-55,-67,-63,-12,-70,-59,67,-61,49,-14,-61,-61,-56,-61,-57,-42,4,-54,-36; MA /M: SY='T'; M=-24,-49,19,-23,-54,-7,-44,-49,-37,-29,-46,-9,-13,2,-14,35,66,-43,-67,-49; MA /M: SY='P'; M=-18,-56,-31,-11,-24,-22,-44,-48,-4,-26,-10,16,55,-8,7,14,27,-32,22,-47; MA /M: SY='Q'; M=8,-55,19,15,-10,-34,10,-52,8,-29,-45,1,-2,33,3,11,7,-43,-60,-44; MA /M: SY='H'; M=-15,-55,-25,-3,-30,-54,63,19,-43,2,6,-5,-53,23,-44,-9,-13,18,-10,1; MA /M: SY='L'; M=-47,-51,-65,-59,6,-49,-52,13,-59,68,-14,-62,-64,-54,-57,-40,-26,4,-52,-34; MA /M: SY='Q'; M=-8,-25,6,-8,-7,-33,32,-43,7,-23,-13,10,-50,35,11,32,-13,-34,-60,-41; MA /M: SY='A'; M=50,-26,-54,-49,4,-5,-52,2,-48,-19,-35,-38,-19,-34,-31,-23,-14,29,-53,2; MA /M: SY='T'; M=-14,-51,-8,22,-48,-42,-45,-1,-21,-31,-30,-28,-20,-3,-23,25,46,13,-62,-11; MA /I: I=-26; MD=-67; MA /M: SY='D'; M=-37,-61,89,-2,-64,-32,-12,-62,-26,-33,-57,-4,-50,-5,-36,-6,-11,-59,-77,-39; D=-26; MA /I: I=-26; MI=0; MD=-67; IM=0; DM=-67; MA /M: SY='P'; M=17,-61,9,-15,-54,-28,-51,-14,-31,-11,0,-48,31,13,-16,-18,-29,-4,-25,-24; D=-26; MA /I: I=-26; DM=-67; MA /M: SY='D'; M=-24,-59,80,28,-43,-5,-24,-36,-25,-54,-55,15,-48,-11,-43,-11,-33,-35,-72,-51; MA /M: SY='S'; M=-24,-50,19,-38,-52,-13,-44,-26,-30,-27,-45,-10,-9,-37,4,50,45,-8,-66,-48; MA /M: SY='P'; M=-5,-58,39,13,-44,-20,-28,-53,-20,-26,-48,14,52,-7,-5,7,-10,-37,-64,-31; MA /M: SY='D'; M=-10,0,54,-8,-31,-8,-6,-34,-5,-17,-47,-16,44,-8,-9,-8,-39,-28,-65,-49; MA /M: SY='D'; M=-12,-58,41,26,-51,-5,4,-49,-8,-25,-48,4,21,6,2,13,-26,-33,-65,-49; MA /M: SY='D'; M=-17,-57,43,42,-45,-16,-2,-46,-10,-15,10,4,-34,20,-39,8,-13,-43,-63,-32; MA /M: SY='L'; M=-18,-53,-33,-57,-11,-65,-36,42,-48,50,-17,-59,-27,-53,-57,-53,-41,25,-55,-18; MA /M: SY='H'; M=-24,-54,-42,-25,-8,-58,35,13,-13,25,0,-46,-55,-9,2,-9,8,16,26,-23; MA /M: SY='F'; M=-53,11,-63,-61,80,-64,-39,1,-56,-1,-20,-57,-66,-58,-54,-53,-47,-14,-23,72; MA /M: SY='T'; M=-29,-53,-39,11,-33,-52,11,0,-3,-27,-25,15,-50,22,13,4,30,18,-61,-16; MA /M: SY='I'; M=-33,-52,-65,-60,-15,-67,-59,48,-58,41,-4,-60,-41,-55,-59,-52,-14,44,-58,-38; MA /M: SY='T'; M=-20,-49,-38,-2,-44,-55,-24,-2,-16,5,-5,-31,-49,-12,-9,-12,60,23,-64,-44; MA /M: SY='Q'; M=-10,-57,-4,15,-56,-5,-24,-41,-2,-41,-45,-8,-39,48,38,14,0,-29,-23,-15; MA /M: SY='P'; M=13,-57,-26,-18,-12,31,-47,-41,-7,-10,-42,-41,47,25,-22,-14,-12,-24,-56,-48; MA /M: SY='P'; M=-34,-68,-28,-39,-31,-51,-27,-49,-45,-10,-45,-53,106,-48,-46,-22,-33,-53,-59,-43; MA /M: SY='Q'; M=-31,-27,-28,-15,-41,-30,17,-34,0,2,-11,-19,-19,58,28,12,14,-35,-59,-42; MA /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63; MA /M: SY='H'; M=-10,-58,-23,-26,12,-32,91,-49,-17,-14,-25,13,-54,15,-13,-18,-32,-38,0,31; MA /M: SY='G'; M=-31,-59,-47,-58,-63,90,-53,-69,-51,-53,-55,-33,-51,-49,-45,-32,-50,-47,-56,-59; MA /M: SY='H'; M=-33,-15,-24,9,-12,-45,53,-33,-10,-22,-5,2,-16,36,20,-22,-6,-27,-23,41; MA /M: SY='L'; M=-45,-53,-64,-38,-21,-68,-31,39,-58,57,6,-62,-62,-53,-58,-56,-42,28,-56,-37; MA /M: SY='E'; M=-24,-55,-33,40,-6,-58,-44,-16,-38,18,4,-34,-52,37,-17,-27,-8,28,-58,-32; MA /M: SY='H'; M=-31,-31,-28,-27,-25,-53,34,-16,7,20,15,27,-56,-9,19,-11,-40,6,13,3; MA /M: SY='R'; M=-3,-53,-12,-25,-25,-24,-11,-11,-10,-9,-5,11,-39,19,28,-2,25,1,-28,-30; MA /M: SY='G'; M=-12,-57,41,-15,-56,42,-7,-23,-15,-14,-31,-14,-18,4,-15,4,-16,-34,-63,-50; MA /I: I=-15; MD=-38; MA /M: SY='Q'; M=-4,-67,0,-16,-39,-11,1,-30,-22,-35,-53,-2,13,24,-9,-13,-8,-50,-26,-32; D=-15; MA /I: I=-15; MD=-38; MA /M: SY='P'; M=-12,-45,-27,-23,-56,17,-4,-39,-34,-56,-43,-15,53,-43,-19,-11,-31,-63,-72,-48; D=-15; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-38; IM=0; DM=-38; MA /M: SY='G'; M=-20,-64,-4,-15,-29,36,-5,-63,-24,-32,-19,3,-59,-49,-32,3,4,-52,2,-55; D=-15; MA /I: I=-15; DM=-38; MA /M: SY='E'; M=-8,-55,-13,23,-34,-5,0,-11,-25,-17,-19,-2,-50,10,22,-3,12,11,-19,-30; MA /M: SY='P'; M=-20,-64,-42,8,-41,-43,-13,-52,-23,-53,-24,-19,91,13,-17,-1,-11,-29,-61,-55; MA /M: SY='I'; M=7,-52,-33,-44,-36,-15,-57,44,-53,24,2,-52,-37,-51,-45,-38,1,33,-59,-42; MA /M: SY='T'; M=3,-51,-3,2,-35,-18,32,-47,-23,-37,-31,-14,-30,-6,-1,35,38,-13,-62,-12; MA /M: SY='M'; M=7,-14,-11,24,-30,-24,10,-41,-8,-22,43,4,-20,15,2,36,8,-18,-56,-19; MA /I: I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40; MA /M: SY='F'; M=-53,-10,-66,-61,111,-60,-47,-27,-57,-19,-29,-55,-64,-67,-54,-52,-45,-27,29,3; MA /M: SY='T'; M=-24,-42,-36,-37,-37,-42,13,-39,-35,-22,-17,-20,-19,-10,-35,37,87,-32,-63,-41; MA /M: SY='Q'; M=-40,0,-43,-26,-40,-50,-34,-14,-19,23,12,-22,-39,93,-30,-29,-40,-16,62,-2; MA /M: SY='Q'; M=22,-52,14,31,-35,-28,-16,-44,17,10,-17,-34,-45,37,29,-13,-19,-41,-4,-41; MA /M: SY='D'; M=-27,-58,95,34,-63,-44,-8,-60,-29,-45,-38,-18,-43,37,-36,-33,-36,-57,-71,-46; MA /M: SY='V'; M=-31,-47,-62,-56,-25,-64,-56,47,-55,46,0,-57,-57,-52,-55,-49,-35,58,-56,-35; MA /M: SY='N'; M=-4,-50,33,19,-33,-44,-22,-4,-10,-7,-11,43,-47,13,7,-2,-15,16,-59,-21; MA /M: SY='N'; M=16,-50,10,34,-53,-13,21,-49,-3,-25,-41,49,-44,33,2,7,-12,-32,-60,-33; MA /M: SY='G'; M=-25,48,-39,-37,-43,66,3,-53,-4,-25,21,28,-36,3,-10,-8,-39,-51,-56,-47; MA /I: I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115; MA /M: SY='K'; M=-12,-34,-14,-18,-45,-43,21,-30,50,5,-34,1,-48,23,42,-3,-14,-24,-53,-10; MA /M: SY='I'; M=9,-48,-60,-55,-29,-59,-58,59,-53,23,-17,-54,-41,-51,-55,-44,-33,57,-56,-37; MA /M: SY='R'; M=14,0,-44,-28,-9,-21,-15,-20,-19,2,-10,-2,-51,4,47,7,-3,15,12,6; MA /M: SY='Y'; M=-50,-57,-52,-53,56,-57,-20,-32,-46,-19,-27,-51,-62,-43,-43,-46,-44,-37,-8,114; MA /M: SY='V'; M=-3,-32,-44,0,-22,-40,-8,30,-10,-14,-1,-40,-49,36,19,4,-17,40,-25,-38; MA /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84; MA /M: SY='H'; M=-29,-58,-33,-22,-21,-47,125,-58,-34,-47,-16,2,27,2,-15,-20,-37,-58,-69,-8; MA /M: SY='D'; M=-27,-32,63,13,-32,-9,-35,-44,-3,-32,-46,15,18,-23,-2,14,30,-47,-62,-19; MA /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90; MA /M: SY='G'; M=-12,-53,35,-34,-59,73,-42,-62,-11,-60,-51,-2,-35,-28,-6,15,-21,-49,-57,-51; MA /M: SY='P'; M=2,-50,-13,-2,-17,14,-42,-4,-31,-38,-29,-20,51,-12,-14,46,6,-12,-56,-45; MA /M: SY='E'; M=-19,-55,35,66,-55,-14,32,-54,-14,-30,-28,-1,14,6,-29,8,-25,-36,-61,-35; MA /M: SY='P'; M=10,-29,29,-6,-49,-11,11,-11,-18,-27,-18,-24,33,-29,-27,32,33,-2,-61,-44; MA /M: SY='T'; M=-11,-50,-24,-18,-17,16,-3,-17,-18,-12,-27,-27,2,35,8,5,44,-4,20,-10; MA /M: SY='S'; M=-11,-51,9,25,-38,-8,15,-37,3,-26,-10,-30,-13,26,-5,44,10,-15,30,-40; MA /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90; MA /M: SY='D'; M=-30,-57,98,-1,-5,-31,-22,-42,-34,-21,-50,-19,-47,-34,-13,-35,-36,-21,-68,-30; MA /M: SY='Q'; M=-10,-33,-1,-6,-33,-23,27,-17,-25,-22,-22,6,-45,62,1,37,22,-22,-56,-14; MA /M: SY='F'; M=-43,-17,-64,-59,88,-62,-47,23,-56,35,10,-56,-61,-58,-54,-52,-42,-8,-30,-2; MA /M: SY='T'; M=-7,-29,-19,14,-18,-37,3,-10,-5,-30,-10,-18,-24,21,17,17,33,25,-55,-5; MA /M: SY='F'; M=-46,-48,-63,-57,77,-62,-47,4,-55,47,9,-57,-61,-56,-53,-52,-41,20,-34,1; MA /M: SY='E'; M=-32,-53,4,46,-44,-46,0,-21,1,-15,-18,-32,-44,34,21,33,-3,-14,-1,13; MA /M: SY='V'; M=6,6,9,-47,-11,-55,-53,14,-50,24,13,-39,-55,-49,-52,-42,-32,65,-59,-37; MA /M: SY='S'; M=-9,-46,-34,13,-32,6,-15,-37,-26,-32,-21,-5,-42,10,-31,56,42,-15,35,-28; MA /I: E1=0; IE=-380; DE=-380; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=153(12); /POSITIVE=153(12); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=15; CC /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=CSPG; CC /VERSION=1; DR Q6UVK1 , CSPG4_HUMAN, T; Q8VHY0 , CSPG4_MOUSE, T; DR Q00657 , CSPG4_RAT , T; Q86XX4 , FRAS1_HUMAN, T; DR Q80T14 , FRAS1_MOUSE, T; Q5H8C1 , FREM1_HUMAN, T; DR Q684R7 , FREM1_MOUSE, T; Q5SZK8 , FREM2_HUMAN, T; DR Q9GV77 , FREM2_LYTVA, T; Q6NVD0 , FREM2_MOUSE, T; DR P0C091 , FREM3_HUMAN, T; Q5H8B9 , FREM3_MOUSE, T; 3D 7ML7; 7N8X; 7N9Y; PR PRU01201; DO PDOC51854; //