ID RHO_RNA_BD; MATRIX. AC PS51856; DT 28-MAR-2018 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Rho RNA-binding domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=76; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=71; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7228487; R2=0.0280049; TEXT='-LogE'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2939.0803223; R2=2.9942694; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=242; H_SCORE=3664; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=135; H_SCORE=3343; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-11; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: M=-1,-14,-12,-13,-4,-17,-20,-15,-9,-11,-8,-3,-13,-13,-4,-13,-1,0,-7,-26,-15,-5; MA /M: SY='V'; M=-5,-10,-20,-8,-5,-16,-20,-18,-1,-10,-9,-6,-12,-19,-9,-14,-6,0,1,-28,-16,-6; MA /M: SY='T'; M=-6,-14,-19,-15,-7,-16,-19,-14,-12,-6,-13,-12,-9,-5,-7,-8,1,5,-9,-26,-13,-7; MA /M: SY='A'; M=3,-19,-6,-22,-16,-7,-15,-14,-4,-13,-11,-6,-17,-20,-13,-18,-4,-5,0,-21,-6,-14; MA /M: SY='T'; M=-2,-7,-19,-4,2,-18,-18,-9,-12,-7,-16,-12,-6,-15,-4,-9,3,8,-9,-27,-12,0; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,0,-20,-30,-30,-30,-20; MA /M: SY='I'; M=-10,-28,-14,-29,-24,1,-33,-19,18,-22,7,3,-26,-26,-21,-23,-19,-7,17,-13,3,-21; MA /M: SY='L'; M=-19,-38,-12,-39,-30,8,-38,-27,17,-29,32,18,-37,-31,-21,-22,-28,-11,9,-16,-4,-29; MA /M: SY='D'; M=-15,20,-37,33,28,-32,-15,-7,-29,0,-34,-25,3,-16,7,-10,0,-10,-29,-33,-23,19; MA /M: SY='I'; M=-10,-27,-11,-29,-23,-8,-31,-23,9,-21,2,-2,-26,-12,-17,-21,-17,-8,8,-14,-10,-21; MA /M: M=-6,-11,-21,-9,-6,-18,-21,-10,-7,-11,-8,-3,-11,-15,-5,-9,-5,-3,-6,-29,-15,-7; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='N'; M=-6,1,-24,-2,1,-26,-6,-8,-24,2,-27,-19,7,-1,0,-1,7,1,-20,-31,-21,0; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='D'; M=-13,17,-35,26,14,-34,-7,-10,-28,-4,-34,-24,3,-9,2,-13,0,-10,-25,-40,-26,9; MA /I: I=-14; MD=-29; MA /M: SY='G'; M=-7,0,-28,-6,-5,-26,13,-2,-31,1,-32,-22,7,-16,-2,0,2,-10,-25,-29,-20,-5; D=-14; MA /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; MA /M: SY='H'; M=-11,-8,-26,-10,1,-6,-11,5,-22,-3,-21,-15,-5,-19,-1,-5,-4,-10,-19,-14,5,-1; D=-14; MA /I: I=-14; DM=-29; MA /M: SY='G'; M=5,-14,-19,-15,-19,-24,36,-20,-31,-19,-33,-25,-14,-13,-19,-20,-1,-16,-23,-28,-25,-19; MA /M: SY='F'; M=-13,-24,-22,-30,-19,20,-22,-6,-9,-15,-9,-5,-21,-30,-15,-12,-15,-16,-11,1,18,-18; MA /M: SY='L'; M=-18,-39,-10,-39,-30,0,-40,-30,23,-30,37,19,-39,-30,-21,-21,-29,-10,13,-20,-10,-30; MA /M: SY='R'; M=-11,-15,-33,-23,-5,-24,-24,-6,-19,11,-9,-11,-8,-21,5,40,-13,-10,-20,-28,-18,-5; MA /M: SY='Q'; M=-5,-2,-24,-1,1,-24,-10,-9,-21,-2,-22,-13,-1,-12,5,-4,4,3,-15,-29,-18,1; MA /I: I=-9; MD=-18; MA /M: SY='P'; M=-3,-15,-13,-16,-10,-10,-14,-11,-10,-10,-11,-8,-13,11,-8,-13,-3,-3,-7,-14,-8,-10; D=-9; MA /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; MA /M: SY='B'; M=-7,4,-22,4,3,-18,-2,-4,-19,1,-21,-15,3,-12,-1,-1,-1,-7,-16,-22,-12,2; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-18; MA /M: SY='N'; M=-8,8,-26,5,6,-26,-13,-2,-24,7,-27,-18,11,-14,4,6,6,1,-21,-32,-19,4; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-18; MA /M: SY='G'; M=-4,1,-23,-5,-9,-23,11,-9,-26,-7,-30,-20,11,-14,-8,-10,8,-4,-22,-30,-21,-9; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-18; MA /M: SY='Y'; M=-16,-27,-19,-28,-21,14,-19,-1,-6,-21,-3,-5,-22,-24,-18,-20,-18,-16,-7,0,28,-20; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-18; MA /M: SY='R'; M=-6,-16,-21,-19,-9,-17,-21,-13,-7,0,-2,-4,-14,-18,0,10,-11,-7,-5,-25,-15,-7; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-18; MA /M: SY='P'; M=-4,-13,-21,-13,-4,-27,-17,-16,-18,-5,-19,-18,-11,25,-5,-11,-1,1,-12,-31,-22,-4; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-18; MA /M: SY='S'; M=2,-1,-15,-1,-3,-24,7,-12,-24,-4,-29,-20,2,-14,-5,-9,14,-1,-20,-30,-22,-4; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-18; MA /M: SY='P'; M=-3,-12,-25,-15,-9,-25,-6,-15,-23,-6,-25,-20,-9,13,-8,-8,-2,-6,-16,-32,-21,-8; MA /M: SY='D'; M=-8,7,-27,10,8,-28,-16,-10,-21,-1,-24,-18,5,-11,0,-6,1,2,-18,-36,-22,4; MA /M: SY='D'; M=-14,29,-29,43,15,-36,-10,-10,-27,-9,-36,-27,8,-19,-1,-18,3,-8,-27,-45,-27,7; MA /M: SY='V'; M=-2,-26,-16,-26,-22,-18,-26,-26,9,-18,-3,-5,-26,11,-18,-25,-14,-5,15,-31,-17,-18; MA /M: SY='Y'; M=-13,-29,-18,-32,-23,22,-28,-3,-2,-21,-2,-1,-24,-25,-20,-20,-18,-15,-3,0,29,-22; MA /M: SY='V'; M=-5,-31,-11,-32,-29,-4,-32,-28,26,-23,15,15,-31,-24,-20,-28,-21,-4,30,-25,-8,-23; MA /M: SY='P'; M=-4,-9,-23,-8,-5,-31,-10,-11,-27,-7,-30,-26,-6,34,-6,-15,8,-3,-21,-35,-24,-6; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='P'; M=-2,-12,-23,-15,-4,-26,-13,-8,-20,-3,-19,-14,-9,8,4,0,-3,-7,-15,-29,-20,-3; D=-12; MA /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; MA /M: SY='S'; M=2,4,-21,6,3,-25,0,-11,-21,-4,-28,-19,2,-14,-3,-11,10,-1,-17,-33,-22,1; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-25; MA /M: SY='L'; M=-13,-25,-16,-26,-16,-3,-31,-17,8,-17,14,9,-25,-24,-2,-12,-18,-10,5,-18,-9,-13; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-25; MA /M: SY='I'; M=-7,-28,-10,-28,-25,-5,-33,-27,25,-22,16,8,-28,-24,-22,-23,-17,-4,22,-22,-11,-23; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-25; MA /M: SY='R'; M=-8,-4,-32,-8,3,-28,-14,-6,-26,12,-22,-17,-1,-17,6,24,-4,-9,-23,-31,-21,2; MA /M: SY='R'; M=-11,-7,-33,-11,7,-26,-19,-2,-25,12,-18,-15,-5,-13,11,21,-8,-11,-23,-28,-18,6; MA /M: SY='Y'; M=-20,-28,-19,-33,-23,24,-31,1,-2,-24,3,1,-24,-32,-19,-21,-21,-17,-8,4,25,-23; MA /M: SY='N'; M=-8,4,-30,1,-2,-27,7,5,-31,-3,-34,-23,8,-18,0,-2,2,-11,-27,-32,-18,-3; MA /M: SY='L'; M=-18,-38,-11,-38,-29,-3,-39,-29,18,-29,33,16,-38,-22,-20,-21,-28,-10,10,-21,-11,-29; MA /M: SY='R'; M=-6,-5,-33,-12,5,-28,-18,-2,-26,16,-22,-16,2,-17,11,32,-4,-8,-23,-30,-20,5; MA /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; MA /M: SY='R'; M=-5,-7,-27,-8,2,-28,-15,-10,-22,2,-21,-17,-5,-1,3,6,-1,1,-17,-31,-22,1; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,58,-20,-39,-19,-40,-30,-9,-20,-19,-20,2,-19,-30,-30,-30,-19; MA /M: SY='D'; M=-11,16,-26,26,12,-31,-13,-4,-25,-6,-29,-19,2,-17,9,-12,2,-8,-23,-37,-23,8; MA /M: SY='Q'; M=-9,-13,-24,-14,0,-16,-25,-2,-9,-6,-8,-7,-10,-19,2,1,-9,-5,-9,-24,-9,-1; MA /M: SY='I'; M=-9,-32,-10,-32,-30,-3,-37,-30,33,-27,21,12,-32,-27,-25,-28,-22,-7,29,-23,-10,-27; MA /M: SY='T'; M=-4,-8,-21,-7,4,-20,-21,-12,-10,-3,-14,-9,-5,-14,0,-6,-1,9,-6,-28,-16,3; MA /M: SY='G'; M=10,-16,-18,-16,-18,-23,24,-22,-19,-17,-24,-17,-15,-17,-17,-18,0,-6,-9,-30,-23,-17; MA /M: SY='Q'; M=-4,-6,-23,-5,6,-23,-19,-9,-15,-2,-14,-6,-4,-14,9,-2,0,4,-10,-29,-18,6; MA /M: SY='V'; M=-1,-28,-6,-29,-25,-8,-27,-25,16,-21,9,5,-27,-22,-19,-23,-13,-1,18,-24,-10,-21; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='R'; M=-7,-4,-33,-9,5,-28,-13,-1,-28,16,-25,-19,-1,-16,9,27,-3,-10,-25,-30,-19,4; MA /M: SY='K'; M=-5,-4,-26,-10,1,-26,-14,-6,-26,14,-26,-18,-1,-5,4,8,0,-5,-19,-30,-18,1; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='P'; M=-7,-14,-26,-14,-8,-31,-13,-13,-25,-9,-25,-24,-14,43,-7,-14,-5,-9,-19,-34,-23,-8; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='R'; M=-12,1,-30,-6,2,-25,-14,-1,-24,12,-23,-17,8,-13,3,17,-4,-8,-22,-29,-17,1; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='P'; M=-7,-2,-28,-3,3,-28,-6,-9,-25,-2,-26,-21,-1,5,-1,0,0,-8,-22,-31,-22,1; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='N'; M=-10,2,-29,-4,0,-25,3,6,-30,5,-30,-20,8,-16,2,6,-1,-11,-25,-28,-15,-1; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='E'; M=-6,2,-25,4,11,-21,-6,-2,-19,3,-21,-14,-2,-12,6,-2,-1,-8,-17,-23,-15,9; D=-6; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='R'; M=-6,-5,-26,-11,1,-23,-8,-5,-24,19,-20,-16,0,-13,5,26,-2,-8,-20,-23,-16,1; D=-6; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; MA /M: SY='Y'; M=-12,-14,-15,-20,-12,4,-20,5,-12,-7,-9,-9,-7,-21,-8,1,-11,-11,-13,-6,14,-12; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='Y'; M=-11,-15,-20,-18,-10,1,-17,-5,-13,-11,-12,-10,-13,2,-8,-12,-10,-11,-12,-11,4,-10; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='A'; M=3,-14,-11,-15,-11,-12,-11,-14,-5,-9,-9,-6,-11,-9,-6,-10,2,2,-2,-22,-13,-9; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='L'; M=-8,-30,-9,-30,-25,-4,-30,-25,20,-22,21,17,-29,-23,-16,-21,-20,-6,18,-21,-9,-22; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='V'; M=-2,-13,-15,-13,-8,-16,-19,-17,-1,-4,-6,-5,-12,-15,-7,-7,-4,2,3,-26,-15,-7; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='K'; M=-5,1,-19,0,4,-24,-13,-8,-20,8,-23,-18,1,-14,2,7,6,-4,-18,-29,-19,3; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='I'; M=-7,-31,-10,-31,-30,-4,-36,-30,35,-26,17,11,-31,-26,-25,-29,-21,-6,33,-24,-10,-26; MA /M: SY='E'; M=-10,-4,-24,-2,3,-17,-22,-8,-11,-6,-13,-10,-4,-18,-1,-9,-3,0,-10,-28,-14,1; MA /M: SY='S'; M=1,-4,-20,-6,1,-22,-12,-7,-21,3,-25,-17,0,-10,2,1,9,1,-17,-28,-14,0; MA /M: SY='I'; M=-6,-28,-12,-29,-27,-6,-33,-23,26,-23,13,8,-28,-25,-21,-23,-19,-6,25,-24,-9,-23; MA /M: SY='N'; M=-15,19,-34,14,16,-29,-10,2,-28,0,-34,-17,28,-17,5,-4,4,-6,-28,-36,-21,12; MA /M: SY='G'; M=-5,-4,-31,-1,-14,-24,40,-16,-35,-19,-37,-27,-8,-22,-17,-21,-2,-18,-28,-29,-23,-16; MA /M: SY='M'; M=-10,-18,-23,-20,-11,-15,-23,-15,-3,-9,1,2,-15,-23,-5,1,-13,-9,-6,-26,-16,-11; MA /M: SY='D'; M=-11,11,-31,17,12,-27,-15,-3,-26,-3,-29,-20,1,-9,7,-7,0,-5,-23,-34,-20,8; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=47(47); /POSITIVE=47(47); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Rho RNA-binding; CC /VERSION=3; DR P0CH92 , RHO1_EHRCR , T; P0CH93 , RHO2_EHRCR , T; DR B2UR37 , RHO_AKKM8 , T; P52152 , RHO_ALLVD , T; DR O67031 , RHO_AQUAE , T; Q03222 , RHO_BACSU , T; DR P33561 , RHO_BORBU , T; P57652 , RHO_BUCAI , T; DR O51891 , RHO_BUCAP , T; Q89A22 , RHO_BUCBP , T; DR P52156 , RHO_CERS4 , T; Q7NXP1 , RHO_CHRVO , T; DR P52153 , RHO_DEIRA , T; P0AG32 , RHO_ECO57 , T; DR P0AG31 , RHO_ECOL6 , T; P0AG30 , RHO_ECOLI , T; DR C9RLJ9 , RHO_FIBSS , T; Q8RG42 , RHO_FUSNN , T; DR C1A5H8 , RHO_GEMAT , T; P44619 , RHO_HAEIN , T; DR Q9ZLS9 , RHO_HELPJ , T; P56466 , RHO_HELPY , T; DR C7LJY3 , RHO_KARMS , T; P52154 , RHO_MICLU , T; DR P66029 , RHO_MYCBO , T; P45835 , RHO_MYCLE , T; DR P9WHF2 , RHO_MYCTO , T; P9WHF3 , RHO_MYCTU , T; DR Q06447 , RHO_NEIGO , T; Q9HTV1 , RHO_PSEAE , T; DR P52155 , RHO_PSEFC , T; Q7UGV0 , RHO_RHOBA , T; DR Q1RIJ6 , RHO_RICBR , T; Q92HL2 , RHO_RICCN , T; DR Q4ULF7 , RHO_RICFE , T; Q9ZD24 , RHO_RICPR , T; DR Q68WL0 , RHO_RICTY , T; P0A296 , RHO_SALTI , T; DR P0A295 , RHO_SALTY , T; P0AG33 , RHO_SHIFL , T; DR Q9FC33 , RHO_STRCO , T; P52157 , RHO_STRLI , T; DR D1AWS1 , RHO_STRM9 , T; D2B129 , RHO_STRRD , T; DR P38527 , RHO_THEMA , T; O83281 , RHO_TREPA , T; DR Q9PA21 , RHO_XYLFA , T; 3D 1A62; 1A63; 1A8V; 1PV4; 1PVO; 1XPO; 1XPR; 1XPU; 2A8V; 2HT1; 3ICE; 3L0O; 3D 5JJI; 5JJK; 5JJL; 6DUQ; 6WA8; 6XAS; 6XAV; 6Z9P; 6Z9Q; 6Z9R; 6Z9S; 6Z9T; 3D 7ADB; 7ADC; 7ADD; 7ADE; 7OQH; 7X2R; 8E3H; 8E5L; 8E5P; 8E6W; 8E70; PR PRU01203; DO PDOC51856; //