ID   CSD_2; MATRIX.
AC   PS51857;
DT   28-MAR-2018 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Cold-shock (CSD) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=67;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0764334; R2=0.0093635; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8286.4355469; R2=2.9217715; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1221; H_SCORE=11854; N_SCORE=13.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=473; H_SCORE=9668; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-31; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='M'; M=-34,-79,-36,-13,-71,-48,0,-61,23,-29,71,19,7,-3,54,-45,-45,5,-82,-65;
MA   /M: SY='M'; M=4,-33,-66,23,2,-1,-62,-19,-38,6,54,-42,-13,-1,7,-26,-12,-11,-70,29;
MA   /M: SY='T'; M=-28,-18,-61,4,-41,-72,-5,-25,7,-11,-14,-7,-3,47,20,0,53,-33,-81,-43;
MA   /M: SY='G'; M=-34,-78,-67,-77,-84,96,-73,-90,-72,-54,-76,-53,-71,-69,-79,-3,-68,-83,-77,-79;
MA   /M: SY='T'; M=-61,-73,-68,-20,4,-77,24,19,15,-36,24,-48,-22,-17,-5,-10,49,32,-79,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-59,62,-83,-80,-58,-84,-84,56,-77,-21,-46,-26,-81,-77,-80,-12,-56,71,-87,-65;
MA   /I: I=-28; MD=-70;
MA   /M: SY='K'; M=-17,-24,-58,14,-26,-72,-64,-76,86,-77,-69,-24,-9,-48,-21,-26,2,-29,-78,-69; D=-28;
MA   /I: I=-28; MD=-70;
MA   /M: SY='W'; M=9,12,-80,-43,-28,-38,-83,-9,-15,-72,-71,-28,-77,-32,-41,5,19,-71,136,-50; D=-28;
MA   /I: I=-28; MD=-70;
MA   /M: SY='F'; M=-31,-76,-86,-80,90,-84,-69,-49,-7,4,21,-79,-85,-79,-72,-74,-68,8,48,33; D=-28;
MA   /I: I=-28; MD=-70;
MA   /M: SY='N'; M=-72,-12,22,1,-7,-68,-59,-86,-18,-88,-79,85,-12,-6,-12,-4,-61,-86,-95,-76; D=-28;
MA   /I: I=-28; MD=-70;
MA   /M: SY='P'; M=11,-29,-7,6,-83,-10,-74,-42,-13,-43,-72,-6,16,-25,12,-3,-20,11,-91,-79; D=-28;
MA   /I: I=-28; MI=-70; MD=-70; IM=-70; DM=-70;
MA   /M: SY='E'; M=-19,-79,30,42,-81,-7,-61,-79,35,-41,-16,-16,-68,8,20,4,11,-74,-84,-72; D=-28;
MA   /I: I=-28; DM=-70;
MA   /M: SY='K'; M=-25,-77,40,-3,-79,-44,-20,-77,71,-75,27,15,-67,-4,0,15,-30,-73,-82,-67; D=-28;
MA   /I: I=-28; DM=-70;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-77,-14,-32,-82,83,-9,-84,-65,-81,11,20,-10,-25,-46,-20,-64,-79,-79,-75; D=-28;
MA   /I: I=-28; DM=-70;
MA   /M: SY='F'; M=-70,-74,-29,-71,96,-78,31,-52,5,-48,-52,-21,-80,-71,-64,-67,-17,-7,-5,67;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-77,-8,-73,-83,102,-70,-91,-69,-86,-76,-49,-68,-67,-76,-49,-68,-84,-75,-78;
MA   /M: SY='F'; M=-71,-72,-81,-18,114,-80,-67,-8,-74,-25,-51,-73,-82,-26,-73,-11,-64,-53,-45,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-75,-85,-82,-49,-89,-84,96,-76,1,-36,-77,-75,-74,-36,-72,-57,36,-75,-57;
MA   /M: SY='T'; M=-18,25,-33,25,-67,-67,-11,2,0,-64,-60,5,-65,28,0,21,62,-18,-79,3;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='P'; M=-59,22,-35,-68,-77,-70,-72,-74,-58,-78,28,-77,85,12,5,-72,-21,-28,-81,28; D=-18;
MA   /I: I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
MA   /M: SY='D'; M=-4,-24,62,41,-78,-22,-8,-39,-40,-19,-69,10,-56,-35,-66,-2,-16,-1,-91,-72; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='D'; M=-38,-80,72,21,-47,16,-61,-15,-25,-55,-22,29,-34,-57,-3,-10,-15,-74,-90,-73; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='G'; M=-43,-4,27,-36,-36,64,-15,-64,-59,-81,-73,25,-16,-40,25,-9,-4,-43,-83,-73; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='G'; M=-19,-84,-1,-19,-89,57,-72,-88,4,-88,-79,-48,24,-10,-8,26,-65,-57,-86,-81; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='K'; M=8,-76,18,40,-77,-16,-62,-43,45,-65,-66,4,0,-8,4,-5,-35,12,-82,-70; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='D'; M=-66,-80,92,36,-85,-67,-56,-81,-5,-82,-78,35,-68,-51,-5,-9,-58,-31,-96,-72; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='V'; M=-28,-7,-84,-78,-8,-84,-76,29,-74,36,-7,-79,-81,-74,-22,-71,-58,68,4,4; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='F'; M=-75,-76,-82,-77,107,-82,-62,-54,-73,-47,-53,-75,-6,-5,-33,-71,-29,-59,-43,57; D=-18;
MA   /I: I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-11,-84,-78,82,-80,-75,-33,-76,8,-45,-77,-81,-79,-75,-67,-58,68,-62,-40;
MA   /M: SY='H'; M=-65,-79,-55,-54,-69,1,138,-84,-26,-70,-56,-44,-69,-12,-26,-10,-18,-82,-94,-21;
MA   /I: I=-20; MD=-51;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-14,-10,-20,64,-77,-46,25,-38,-25,-51,-67,-77,52,-15,-64,-62,11,8,51; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-51;
MA   /M: SY='S'; M=-33,-68,-15,-56,-73,-30,-62,-26,26,-72,-66,-40,-65,-27,-3,82,33,-19,-82,-66; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-51;
MA   /M: SY='A'; M=52,-71,45,28,-80,-16,-61,-73,13,-75,-68,0,-9,9,-57,17,-30,-41,-82,-71; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-51;
MA   /M: SY='I'; M=-28,-26,-80,-24,21,-55,-76,71,-74,18,28,-74,-76,-72,-76,-69,-10,36,-72,-19; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-51;
MA   /M: SY='Q'; M=9,-76,7,30,-55,-65,4,-71,21,-49,-64,27,-10,64,-19,9,-9,-22,-79,-12; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-51;
MA   /M: SY='M'; M=-17,-73,23,-37,-74,45,-63,-67,-36,-50,56,23,-37,-19,-31,36,0,-15,-83,-69; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-51;
MA   /M: SY='D'; M=-16,-78,48,45,-72,13,-23,-53,11,-80,-73,43,-8,-11,-8,-2,-18,-76,-86,-72; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-51;
MA   /M: SY='G'; M=-53,-101,3,-44,-107,66,-90,-113,-89,-110,-100,-3,-93,-87,-97,-53,-88,-107,-103,-101; D=-20;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-51; IM=0; DM=-51;
MA   /M: SY='F'; M=-39,-81,-88,-86,81,-88,-71,-6,-81,18,-35,-15,-91,-83,-47,-42,-47,-32,-58,42; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-51;
MA   /M: SY='R'; M=-55,-78,24,22,-77,-49,-16,-68,41,-72,-66,13,-70,-18,63,-11,-12,14,-83,-67; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-51;
MA   /M: SY='S'; M=-39,22,17,1,-76,-56,1,-70,-60,-27,-67,-28,13,10,-66,59,54,-46,-88,-70; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-51;
MA   /M: SY='L'; M=-65,-70,-84,-76,2,-85,-70,7,-77,80,-7,-82,-10,-72,-75,-75,-61,16,-71,-53;
MA   /I: I=-45; MD=-115;
MA   /M: SY='K'; M=-16,-78,10,28,-65,-15,-12,-34,52,-15,-63,-13,-67,51,16,-38,4,-58,-79,-66; D=-45;
MA   /I: I=-45; MI=-115; IM=-115; DM=-115;
MA   /M: SY='E'; M=4,-75,3,76,-73,-71,-60,5,8,-28,-61,-57,5,3,-55,-12,4,-2,-80,-68;
MA   /M: SY='G'; M=-33,-76,-3,-49,-83,97,-67,-89,-66,-85,-75,10,-68,-40,-60,-49,-66,-83,-76,-77;
MA   /M: SY='Q'; M=-25,-79,75,45,-81,-67,-53,-52,-21,-27,-21,-5,-65,78,-53,-53,-14,-72,-84,-66;
MA   /M: SY='R'; M=2,-11,-7,42,-75,-45,19,-24,39,-71,-17,-37,12,-21,45,9,-6,-49,3,-54;
MA   /M: SY='V'; M=-53,-67,-83,-77,-53,-85,-85,22,-75,-26,-41,-78,-79,-77,-77,-67,-51,99,-86,-61;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-74,-44,76,-78,-66,-56,-40,-1,-73,-67,12,-16,25,-6,28,31,-67,-80,-69;
MA   /M: SY='F'; M=-52,-73,-84,-81,112,-54,-62,-50,-76,-43,-51,-75,-33,-82,-73,-71,-66,-28,-40,59;
MA   /M: SY='D'; M=-51,15,51,42,-72,-61,-59,-4,-8,-67,-64,0,-65,9,4,11,45,-5,-83,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-34,-31,-80,-39,20,-51,-76,60,-71,11,17,-75,-1,-71,-16,-68,-39,55,10,-44;
MA   /M: SY='E'; M=-39,48,-11,51,-71,-22,-30,-7,11,-53,-61,-56,-66,4,-16,30,20,27,-82,-67;
MA   /I: I=-14; MD=-34;
MA   /M: SY='E'; M=-40,-75,14,37,-12,-40,-14,-56,4,-33,-35,26,8,34,2,12,18,-9,-78,-8; D=-14;
MA   /I: I=-14; MD=-34;
MA   /M: SY='G'; M=-57,-76,35,-27,-76,64,-63,1,-13,-31,-67,41,-70,-60,-18,10,-21,-44,-82,-72; D=-14;
MA   /I: I=-14; MD=-34;
MA   /M: SY='Q'; M=-53,-106,-85,-36,-107,-25,-83,-101,-11,-100,-22,-49,26,49,14,-11,-39,-100,-103,-94; D=-14;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-34; IM=0; DM=-34;
MA   /M: SY='N'; M=-24,-80,21,8,-83,-4,-17,-80,14,-30,-72,48,-4,16,-7,-16,20,-77,-90,-75; D=-14;
MA   /I: I=-14; DM=-34;
MA   /M: SY='K'; M=-16,-79,-22,-4,-82,44,3,-84,63,-73,-49,-1,-69,-4,35,-32,-63,-79,-79,-70; D=-14;
MA   /I: I=-14; DM=-34;
MA   /M: SY='G'; M=-25,-78,-26,-60,-78,62,-64,-50,39,-32,-34,11,-71,28,-1,-9,-26,-75,-77,-28; D=-14;
MA   /I: I=-14; DM=-34;
MA   /M: SY='P'; M=1,3,-37,15,-39,-72,-31,-31,-7,6,-30,-24,72,15,-65,-20,9,-14,-80,-48; D=-14;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-34; IM=0; DM=-34;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,13,-52,10,-72,-47,21,4,10,-65,13,-57,-70,57,21,35,-23,-3,-80,-27;
MA   /M: SY='A'; M=88,-66,-69,-26,-74,-23,-23,-32,-65,-42,-62,-64,-69,-39,-69,-26,-29,-55,-77,-22;
MA   /M: SY='V'; M=25,4,-37,-26,-33,-33,-69,1,-11,-18,-56,-63,-73,-19,-6,7,33,35,-77,15;
MA   /M: SY='N'; M=-27,5,-9,11,-80,-46,-4,-56,10,-79,-69,87,-72,20,16,2,-26,-43,-89,-71;
MA   /M: SY='V'; M=-47,-72,-84,-79,-56,-85,-85,43,-46,-6,-45,-78,-80,-77,-78,-12,-55,83,-86,-64;
MA   /M: SY='T'; M=-13,-11,-65,-2,-63,-42,-55,-7,11,-64,21,-28,-44,9,29,13,36,10,25,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-18,-3,-34,-64,-22,-23,8,24,29,-52,-68,14,-64,3,-31,-48,26,-82,-67;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CSD;
CC   /VERSION=3;
PR   PRU01204;
DO   PDOC00304;
//