ID   LCN_CSAB; MATRIX.
AC   PS51863;
DT   18-JUL-2018 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   LCN-type cysteine-stabilized alpha/beta (CS-alpha/beta) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8546877; R2=0.0062358; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4955.0063477; R2=2.3284039; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=906; H_SCORE=7065; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=425; H_SCORE=5945; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-137; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='K'; M=-43,-71,-54,-41,-100,-32,-307,-86,91,-92,-310,-115,-79,-293,63,-57,-306,8,-322,-61;
MA   /M: SY='D'; M=-312,-328,107,50,-333,-45,-45,-331,-129,-330,-326,23,31,-297,-308,-61,-304,-328,-341,-319;
MA   /M: SY='G'; M=20,-321,-49,-317,-328,100,-315,-331,-106,-329,-319,-14,-316,-311,-11,-90,-105,-83,-322,-323;
MA   /M: SY='Y'; M=-317,-326,-313,-318,19,-321,-78,-304,-63,-108,-298,36,-101,-308,-309,-310,-103,-87,-280,136;
MA   /M: SY='P'; M=-35,-325,-324,-317,3,-160,-314,63,-85,38,-44,-322,80,-316,-321,-90,-307,-71,-311,51;
MA   /M: SY='P'; M=31,-318,-321,-313,-73,-107,-317,20,-28,4,46,-317,56,-94,-15,-307,-3,56,-323,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-121,-323,71,20,-73,14,-19,0,-4,-4,-52,50,-315,36,-31,-19,-128,-83,-24,-44;
MA   /M: SY='D'; M=-81,-322,52,-11,-105,-23,38,-107,33,-64,-46,49,23,-69,9,43,-47,-125,-10,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-36,-321,43,38,-313,11,12,-107,24,-97,-313,47,-92,-296,-5,27,-39,-52,-47,49;
MA   /I: I=-33; MD=-84;
MA   /M: SY='N'; M=-306,-322,22,-69,-96,67,-46,-327,-70,-100,-319,81,-319,-94,-97,-31,29,-324,-328,10; D=-33;
MA   /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
MA   /M: SY='C'; M=-307,150,-17,-319,-92,-121,-319,-82,-12,-128,-315,13,-332,-320,-320,9,-304,-313,-341,-50;
MA   /I: I=-45; MD=-115;
MA   /M: SY='K'; M=-21,-320,-309,-300,-52,-189,-309,-150,91,-60,-35,-87,-18,-298,-47,-56,37,24,-318,30; D=-45;
MA   /I: I=-45; MI=-115; IM=-115; DM=-115;
MA   /M: SY='Y'; M=-117,-325,-93,-15,1,-326,-109,28,-97,-25,-6,-75,-30,-309,-45,-63,-108,0,-288,121;
MA   /M: SY='H'; M=-54,-322,0,26,-5,6,49,-65,-65,-21,-310,-35,4,-304,-70,43,32,-56,32,37;
MA   /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
MA   /M: SY='C'; M=-312,157,-331,-331,-322,-328,-331,-329,-326,-320,-320,-87,-343,-334,-65,-315,-312,-317,-352,-333;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='F'; M=8,-325,-28,-97,50,-12,-323,-37,-41,15,-19,-86,-97,-33,-323,-53,14,26,45,-6; D=-25;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='I'; M=-82,-333,-30,-73,21,-47,-321,38,26,-18,-26,-97,-5,-4,2,-102,-1,-18,23,19; D=-25;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='G'; M=-330,-351,-335,-97,-37,55,-72,-92,-42,-123,-342,-1,-139,-16,14,-102,-37,-350,-59,-25; D=-25;
MA   /I: I=-25; DM=-63;
MA   /M: SY='N'; M=-67,-336,32,23,-333,-6,-319,-142,-3,-34,-326,34,33,-314,-35,-44,8,-63,-51,-15; D=-25;
MA   /I: I=-25; DM=-63;
MA   /M: SY='N'; M=-49,-55,55,-115,-330,18,-59,-331,-162,-334,-325,101,-99,-41,-313,6,-88,-174,-4,-91; D=-25;
MA   /I: I=-25; DM=-63;
MA   /M: SY='E'; M=14,-327,27,48,-332,-43,20,-328,9,-328,-320,16,41,32,-65,8,-23,-104,-334,-320; D=-25;
MA   /I: I=-25; DM=-63;
MA   /M: SY='Y'; M=-320,-331,17,-30,51,-17,-35,-314,-79,-109,-309,-8,-48,-315,-318,-16,-315,-107,29,108;
MA   /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
MA   /M: SY='C'; M=-101,155,-332,-70,-324,-329,-333,-331,-329,-322,-322,-320,-344,-336,-335,-316,-314,-319,-353,-335;
MA   /M: SY='N'; M=-44,-327,60,0,-325,-60,-89,2,8,-31,-316,77,-108,6,-53,-55,-70,-39,-24,-76;
MA   /M: SY='N'; M=-52,-328,43,-3,-330,-20,-46,-123,46,-136,-99,46,-37,-40,16,-18,21,-65,-6,-68;
MA   /M: SY='E'; M=-68,-329,-51,69,-113,-86,-318,25,-37,35,-23,-68,-322,-54,-317,-122,-29,6,-331,-65;
MA   /M: SY='C'; M=-316,153,-335,-88,-326,-331,-335,-333,-331,-324,-324,-322,-346,-338,-337,-66,-316,-321,-356,-337;
MA   /M: SY='K'; M=-84,-329,-312,-46,-330,-89,-108,-54,90,-78,-317,-101,-319,11,-11,-34,38,-48,-331,-320;
MA   /M: SY='K'; M=4,-330,-30,-6,-124,-48,-25,-29,52,8,-17,-14,-324,27,1,-12,-48,-74,-82,-40;
MA   /M: SY='H'; M=-38,-332,-126,-36,-88,-189,84,-104,37,-24,-104,40,-100,19,20,-77,-103,-11,-334,8;
MA   /I: I=-21; MI=0; MD=-53; IM=0; DM=-53;
MA   /M: SY='G'; M=-42,-332,-24,-316,-330,70,-319,-336,56,-55,-325,-35,-325,-312,-47,-24,-318,-332,-328,6; D=-21;
MA   /I: I=-21; DM=-53;
MA   /M: SY='A'; M=64,-325,-86,-322,-332,56,-328,-321,-22,-326,-320,-315,-325,-36,-324,-304,-56,11,-57,-329; D=-21;
MA   /I: I=-21; DM=-53;
MA   /M: SY='S'; M=-51,-329,11,25,-331,-88,-315,-331,42,-109,-324,-15,-73,-19,-15,47,32,-128,-336,-22; D=-21;
MA   /I: I=-21; DM=-53;
MA   /M: SY='Y'; M=-82,-331,38,-77,-65,-1,-311,-131,-9,-329,-323,7,-328,-313,-90,54,-26,-93,-59,72; D=-21;
MA   /I: I=-21; MI=0; MD=-53; IM=0; DM=-53;
MA   /M: SY='G'; M=-306,-334,-321,-333,-340,101,-328,-347,-326,-343,-332,-307,-325,-324,-334,-53,-324,-341,-331,-335;
MA   /M: SY='Y'; M=-138,-337,-28,-86,24,-333,-21,-130,-65,-95,-309,-324,-338,-318,-75,-25,-97,-319,-25,122;
MA   /M: SY='C'; M=-319,150,-339,-339,-117,-335,-338,-335,-334,-326,-54,-325,-349,-342,-110,-322,-319,-323,-358,-339;
MA   /I: I=-20; MD=-51;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,33,-24,-150,-31,-47,0,-57,-20,-111,-316,-81,-156,32,2,-51,-97,-144,57,91; D=-20;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-51; IM=0; DM=-51;
MA   /M: SY='W'; M=22,-334,-67,-79,29,-16,-325,-77,-20,-29,-318,-16,-331,32,-96,-28,-4,-93,101,-9; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-51;
MA   /M: SY='W'; M=-32,-338,-111,-108,50,-50,-330,-111,-60,-10,-110,-140,50,-34,-116,14,-135,-55,108,-39; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-51;
MA   /M: SY='G'; M=-68,-348,-114,-337,-349,49,-54,-349,18,-49,-78,8,-123,-331,-105,3,-107,-85,-351,-85; D=-20;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-51; IM=0; DM=-51;
MA   /M: SY='A'; M=62,-334,-130,-81,-94,-54,26,-333,-327,-38,-326,-326,-336,-35,-27,2,-45,-102,-343,-20; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-51;
MA   /M: SY='C'; M=-320,151,-339,-340,-330,-335,-339,-337,-335,-327,-328,-326,-350,-343,-342,-322,-320,-324,-360,-341;
MA   /M: SY='W'; M=-138,-346,-340,-79,10,-334,-319,-80,-53,-163,-318,-338,-338,-324,-326,-87,-83,-328,140,96;
MA   /M: SY='C'; M=-320,150,-340,-340,-330,-335,-340,-337,-335,-327,-328,-326,-350,-343,-342,-322,-320,-324,-360,-341;
MA   /M: SY='Y'; M=-114,-335,-29,53,-3,-334,-314,6,-3,-51,-314,-57,-29,-17,-118,-316,22,-32,-319,66;
MA   /I: I=-42; MD=-106;
MA   /M: SY='G'; M=-39,-335,41,-50,-112,58,3,-101,12,-136,-328,37,-327,-62,-318,-102,-105,-335,-333,21; D=-42;
MA   /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
MA   /M: SY='L'; M=-63,-328,-342,-334,-14,-342,-327,-18,-90,75,47,-339,-340,-105,-332,-333,-320,-12,-329,-311;
MA   /M: SY='P'; M=-58,-344,-11,-9,-337,-48,-53,-333,-71,-165,-328,-26,106,-318,-48,-21,-78,-335,-336,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-58,-338,93,32,-338,-73,-313,-341,-29,-135,-335,2,-58,-55,-72,-55,-106,-337,-25,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-117,-334,47,-18,-332,-78,-2,-68,34,-118,-328,62,-112,-19,-51,16,-69,-333,38,-25;
MA   /M: SY='V'; M=11,-329,-6,-10,-323,-326,-321,-56,17,-319,-316,28,-329,-64,-37,-24,7,45,-337,8;
MA   /I: I=-19; MD=-47;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-337,-100,-39,-334,-54,-326,-50,37,-74,-110,-36,68,-24,-16,-31,-28,15,-339,-330; D=-19;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47;
MA   /M: SY='W'; M=-320,-331,-336,-333,16,-339,-89,51,-55,-77,0,-327,-332,-330,-332,-96,52,34,59,-22; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-47;
MA   /M: SY='W'; M=-99,-343,-75,-144,-25,-81,-106,-324,39,-6,-7,-329,-336,-318,21,-25,-327,-65,120,20; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-47;
MA   /M: SY='D'; M=-66,-23,47,-20,-338,-17,-95,-23,-70,-336,-107,12,45,-26,-68,-3,-54,-25,-346,-21; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-47;
MA   /M: SY='P'; M=1,-345,12,-4,-46,-338,-331,-26,-153,-24,-327,-140,27,-327,-9,-1,-57,-38,-341,15; D=-19;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-352,-48,-62,-344,-92,-21,-54,-29,-35,32,-56,21,-338,-62,-25,-11,-50,-357,-39; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-47;
MA   /M: SY='T'; M=-329,-344,-107,0,-347,-6,-334,-68,28,-135,-339,17,-337,-106,-63,-13,45,-339,-21,-341; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-47;
MA   /M: SY='N'; M=-323,-338,-48,-15,-111,25,-78,-87,35,-179,-334,71,-333,-316,-118,-15,-22,-97,-348,-336; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-47;
MA   /M: SY='K'; M=-171,-340,-137,-57,-87,-335,13,-101,60,-335,-85,-60,-28,10,15,-36,35,-333,-336,17;
MA   /I: I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
MA   /M: SY='C'; M=-326,144,-346,-347,-337,-342,-346,-344,-342,-334,-334,-333,-357,-350,-349,-329,-327,-331,-367,-347;
MA   /M: SY='H'; M=-74,-346,-13,-61,-339,17,39,-117,0,-138,-32,18,-4,-23,8,-42,-46,-95,-28,0;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=LCN-type CS-alpha/beta;
CC   /VERSION=3;
PR   PRU01210;
DO   PDOC51863;
//