ID   CLIP; MATRIX.
AC   PS51888;
DT   08-MAY-2019 CREATED; 08-MAY-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Clip domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0961080; R2=0.0063122; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1094; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=540; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-41; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-76,2,21,7,-16,-59,-70,-2,-20,-64,-57,61,-52,34,40,-55,-68,-71,10;
MA   /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130;
MA   /M: SY='T'; M=-57,-72,-56,-54,-74,9,-58,-18,1,-70,-62,33,-67,40,56,0,66,-63,-80,-65;
MA   /I: I=-33; MD=-84;
MA   /M: SY='T'; M=13,-67,-60,-63,-71,-67,-67,-58,-58,-66,-62,33,4,-62,2,-45,87,15,-88,-69; D=-33;
MA   /I: I=-33; MD=-84;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-84,-66,-58,-84,9,-66,-78,-54,-81,-70,-64,95,8,43,-2,0,-76,-80,-77; D=-33;
MA   /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-75,76,-49,3,-4,-54,-80,-57,-81,-76,77,-72,-56,-64,33,-53,-79,-91,-68; D=-33;
MA   /I: I=-33; DM=-84;
MA   /M: SY='G'; M=-57,-79,26,-7,-84,71,-63,-84,-58,-81,-72,2,-69,51,-10,-51,24,-79,-81,-74; D=-33;
MA   /I: I=-33; DM=-84;
MA   /M: SY='E'; M=-59,-75,4,53,-70,25,-59,-6,16,-1,26,4,-65,13,5,-55,22,-62,-78,-66;
MA   /M: SY='Q'; M=21,-74,-55,1,-79,-9,-58,-75,35,-75,-65,22,36,54,19,19,5,-70,-78,-68;
MA   /M: SY='G'; M=34,-73,-64,-68,-81,89,-69,-83,15,-81,-71,-52,-67,-62,-66,-48,-63,-75,-74,-75;
MA   /M: SY='Q'; M=-58,-71,-59,-57,-62,-69,-58,20,-9,-24,-54,43,-69,52,20,2,52,11,-75,18;
MA   /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-73,-74,-4,-53,-83,-72,59,22,31,27,-71,-74,-62,1,-68,-58,44,-76,-59;
MA   /M: SY='P'; M=-57,-74,-58,-59,-71,-17,46,-62,-57,-18,-61,47,71,-57,-4,43,3,9,-84,-66;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-71,-78,-75,8,-77,-70,59,-73,30,-41,-72,-76,-69,-74,18,-55,38,-66,38;
MA   /M: SY='Y'; M=-60,-75,-53,35,-58,-68,51,-3,-1,-18,-58,29,-69,-48,35,34,-3,-63,-69,53;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-74,64,42,-79,-62,-54,-74,-48,-76,-70,32,-65,18,22,44,-51,-21,-86,-68;
MA   /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130;
MA   /M: SY='P'; M=-60,-79,25,24,-77,8,-59,-74,41,-19,-65,-53,51,30,27,-3,1,-72,-78,-69;
MA   /I: I=-31; MI=0; MD=-79; IM=0; DM=-79;
MA   /M: SY='Y'; M=-26,-73,2,-65,-45,-70,-56,34,-64,-14,-51,9,-1,-62,-67,21,37,-3,-58,81;
MA   /M: SY='L'; M=-63,-72,-83,-76,11,-84,-75,48,-76,56,-37,-79,30,-74,-77,-72,-59,42,-73,-55;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-76,2,33,29,-77,-60,-53,-55,47,-48,-68,-75,-56,42,-66,-64,-57,59,34;
MA   /M: SY='E'; M=6,-77,43,61,-83,26,-56,-81,0,-77,-70,6,-63,55,-54,-3,-58,-75,-80,-70;
MA   /M: SY='Y'; M=-62,-73,-72,-67,-43,-78,-58,14,-4,33,19,-68,-76,13,0,-11,5,27,-59,72;
MA   /I: I=-17; MD=-44;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-74,-85,-78,-47,-89,-74,45,-74,70,-35,-82,-83,-72,1,-77,-63,18,-76,-58; D=-17;
MA   /I: I=-17; MD=-44;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-75,-59,-52,-73,-71,-59,-60,64,-24,20,40,-70,50,2,-56,19,16,-81,-66; D=-17;
MA   /I: I=-17; MD=-44;
MA   /M: SY='T'; M=-63,-77,8,-3,-81,-72,30,-73,-8,-76,-70,24,-72,38,-63,17,62,-17,-94,-71; D=-17;
MA   /I: I=-17; MD=-44;
MA   /M: SY='P'; M=-16,-91,-3,14,-97,13,-77,-94,-72,-94,-86,-68,33,23,-78,31,-12,-88,-97,-88; D=-17;
MA   /I: I=-17; MD=-44;
MA   /M: SY='N'; M=-86,-102,0,-12,-91,8,-78,-95,-78,-31,-87,30,24,9,-22,-79,-83,-97,-96,10; D=-17;
MA   /I: I=-17; MI=0; MD=-44; IM=0; DM=-44;
MA   /M: SY='T'; M=-20,-88,25,-73,-95,-81,-82,-90,-75,-93,-87,-67,5,-76,-15,33,52,-83,-106,-88; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='P'; M=-17,-97,-9,16,-95,7,66,-94,-72,-92,-81,-70,70,-7,-78,-71,-76,-92,-97,-80; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='E'; M=19,-78,4,55,-78,-67,-59,-79,-55,-78,-71,9,-69,48,-61,33,-9,-74,-80,14; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='D'; M=-21,-82,72,-56,-74,38,-64,-5,-66,-21,-69,7,-76,7,-72,-61,-65,-18,-84,13; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='T'; M=5,-76,-69,-21,-65,-77,-68,28,-57,-19,-58,10,-75,-62,46,-58,50,-7,-79,15; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='R'; M=-66,-76,-7,-66,26,-75,-66,-10,-19,15,-58,32,-78,-63,36,19,24,-13,-80,-60; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='F'; M=-73,-79,22,-71,68,-81,23,-58,-74,18,-55,-69,-84,-72,-73,-7,-1,-62,-56,67; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-71,-83,-78,-47,-87,-73,19,-78,76,-35,-79,-82,-73,-77,-71,26,-4,-77,-58; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='R'; M=-59,-77,5,-3,-78,-66,-53,-80,5,-76,-66,10,-69,38,86,43,-55,-74,-79,-64;
MA   /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
MA   /M: SY='A'; M=42,-71,-13,-1,-73,27,-65,-3,17,-66,-61,7,14,5,-8,-51,2,15,-79,-69;
MA   /M: SY='S'; M=-9,-68,6,-58,-67,-58,-61,-59,-60,16,-59,30,35,-55,-65,77,-45,-5,-82,-66;
MA   /M: SY='Q'; M=-58,-75,-60,19,-66,-72,28,22,-2,6,-50,-58,-69,82,-54,19,-56,28,-77,-60;
MA   /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-75,-59,17,-78,80,-65,-79,-11,-24,-68,-52,-67,11,3,2,2,-75,-75,-72;
MA   /I: I=-17; MD=-42;
MA   /M: SY='Y'; M=-66,-77,27,-5,48,-14,31,-63,-66,2,-58,-61,-76,-64,-69,14,13,-65,61,61; D=-17;
MA   /I: I=-17; MD=-42;
MA   /M: SY='R'; M=-73,-89,-3,33,0,27,-71,-85,-19,-24,-76,12,-81,-63,38,-68,-13,-83,-88,-75; D=-17;
MA   /I: I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
MA   /M: SY='N'; M=11,-74,1,-60,-80,31,-58,-77,-3,-23,-70,82,-74,17,-62,-4,-57,-75,-87,-74; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-42;
MA   /M: SY='W'; M=-63,-82,-62,-6,-78,51,-65,-10,-53,-80,-72,47,8,-58,52,-20,-65,-77,54,-71; D=-17;
MA   /I: I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
MA   /M: SY='Q'; M=-57,-74,-56,0,-63,11,-55,-4,-10,-63,-58,46,-70,66,-2,-3,2,24,-71,37;
MA   /M: SY='P'; M=-17,-82,-63,22,-66,-72,-64,-9,-58,0,-57,-69,94,11,-2,-62,-59,6,-73,18;
MA   /M: SY='I'; M=-26,-74,23,-61,-54,-76,26,46,19,34,-44,-62,-73,8,-61,-8,-57,20,-73,15;
MA   /M: SY='V'; M=-58,-70,-85,-80,31,-86,-82,61,-77,-7,-40,-78,-78,-78,-78,-70,-55,78,-75,-53;
MA   /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130;
MA   /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
PP   /PROMOTED_BY: PS50240;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=24(23); /POSITIVE=24(23); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=4; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Clip;
CC   /VERSION=1;
DR   Q27081    , CFB_TACTR  , T; Q7QBP4    , CLB10_ANOGA, T;
DR   Q9NAS8    , CLB14_ANOGA, T; Q9NAS9    , CLB15_ANOGA, T;
DR   Q7PEV7    , CLB4_ANOGA , T; F5HKX0    , CLB9_ANOGA , T;
DR   A0A1S4GMJ4, CLC9_ANOGA , T; P13582    , EAST_DROME , T;
DR   Q9VB68    , GRASS_DROME, T; A8JUP7    , HAYAN_DROME, T;
DR   Q2VG86    , HP8_BOMMO  , T; A0A126GUP6, MP1_DROME  , T;
DR   P21902    , PCE_TACTR  , T; Q49QW1    , PPAE1_SPOLT, T;
DR   Q9XXV0    , PPAE_BOMMO , T; O97366    , PPAF1_HOLDI, T;
DR   Q9GRW0    , PPAF2_HOLDI, T; Q8I6K0    , PPAF3_HOLDI, T;
DR   Q9VWU1    , PSH_DROME  , T; Q9V3Z2    , SER7_DROME , T;
DR   P05049    , SNAK_DROME , T; Q9VCJ8    , SPE_DROME  , T;
DR   B5U2W0    , VSP_BOMIG  , T;
DR   A0A1S4H5M5, CLA28_ANOGA, N; A0A1S4HE51, CLA30_ANOGA, N;
DR   A0A1S4H5S2, CLA8_ANOGA , N; Q8MZM7    , CLB8_ANOGA , N;
3D   2B9L; 2XXL;
PR   PRU01236;
DO   PDOC51888;
//