ID ZF_UBZ3; MATRIX. AC PS51907; DT 13-NOV-2019 CREATED; 03-AUG-2022 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Zinc finger UBZ3-type profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=35; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7665536; R2=0.0088976; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1094; N_SCORE=12.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=420; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-76; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; MA /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; MA /M: SY='S'; M=9,-41,26,15,-25,-39,24,-55,-15,-28,-72,-11,18,23,-59,38,17,5,-24,-43; MA /M: SY='W'; M=1,-62,25,16,-46,-24,-17,-41,-5,-22,-28,11,29,30,-67,26,7,-16,64,-53; MA /M: SY='E'; M=1,-221,10,46,-31,-10,-44,27,-53,-13,-48,-23,17,-9,-34,12,0,9,-58,-27; MA /M: SY='D'; M=-16,-58,67,21,-32,-27,-39,-70,-5,-22,-60,19,39,-11,-36,-2,19,-35,-51,-68; MA /M: SY='T'; M=-22,-11,14,-30,-16,-8,19,-45,-22,-5,23,-13,-17,18,-27,16,56,-23,26,-14; MA /M: SY='Y'; M=-75,-102,-41,4,44,-225,-21,9,-17,7,-40,-41,-129,-1,-66,-81,-24,16,22,92; MA /M: SY='T'; M=-41,-28,-55,-10,12,-112,-8,8,35,3,-23,-25,1,10,12,-8,42,7,-221,-15; MA /M: SY='C'; M=-208,161,-228,-228,-218,-224,-35,-226,-224,-216,-216,-214,-239,-231,-230,-211,-208,-213,-248,-228; MA /I: I=-28; MD=-71; MA /M: SY='P'; M=-15,-121,59,45,-105,-66,-30,-109,-16,-104,-217,-9,63,-31,-102,48,-3,-77,-232,-218; D=-28; MA /I: I=-28; MD=-71; MA /M: SY='R'; M=-89,-121,9,48,-120,-221,-27,-9,42,-30,-128,-63,-23,46,71,-90,-27,-77,-224,-60; D=-28; MA /I: I=-28; MI=-71; IM=-71; DM=-71; MA /M: SY='C'; M=-208,162,-228,-228,-219,-224,-228,-225,-224,-216,-216,-214,-239,-232,-231,-211,-208,-213,-248,-229; MA /M: SY='G'; M=-86,-222,6,-62,-226,73,34,-230,33,-227,-81,56,-92,15,-14,0,-73,-226,-226,-54; MA /M: SY='K'; M=25,-124,-59,29,-52,-121,-48,0,61,-36,-4,-35,-63,53,-22,5,-15,-37,-222,-51; MA /M: SY='S'; M=-20,-74,-22,24,-17,-98,5,-42,7,-20,36,21,-6,21,21,36,13,-26,-33,-2; MA /M: SY='I'; M=-210,-121,-231,-227,49,-233,-224,77,-223,30,13,-131,-84,-222,-102,-72,-113,51,-216,-90; MA /M: SY='P'; M=6,-224,15,19,-70,-61,-1,-78,-10,4,-65,-35,88,-26,-73,21,-5,-87,-226,-99; MA /M: SY='V'; M=-10,-13,25,30,-17,-60,-57,13,-34,-7,-6,-19,30,-22,-33,20,-12,32,-53,-210; MA /M: SY='W'; M=1,-40,38,32,-42,-53,39,-91,-43,-40,-64,-9,2,1,-65,23,28,-43,97,-37; MA /I: I=-19; MD=-47; MA /M: SY='E'; M=-24,-118,58,73,6,-53,-63,-161,14,-52,-26,-24,-72,17,-30,-12,-41,-26,-71,-62; D=-19; MA /I: I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; MA /M: SY='M'; M=-67,-221,-146,-47,41,-142,-60,5,13,36,73,-215,-223,-4,40,-97,-104,7,-5,25; MA /M: SY='Q'; M=-7,-226,17,10,-225,-24,-65,-64,-55,-25,-35,-22,59,96,-41,-21,-11,-53,-225,-214; MA /M: SY='E'; M=-86,-57,-100,109,-227,-217,-202,-107,-56,-78,-217,-33,-205,-24,-200,31,-5,-105,-228,-218; MA /M: SY='H'; M=-217,-228,-200,-201,-215,-218,160,-233,-205,-216,-201,-190,-217,-194,-199,-206,-215,-233,-251,-184; MA /M: SY='Q'; M=-11,-39,21,27,-89,-154,-63,-55,5,21,38,26,-215,49,-8,30,-1,-48,-226,-210; MA /M: SY='D'; M=-215,-228,128,-179,-234,-211,-200,-232,-82,-97,-229,-50,-214,-201,-210,-203,-204,-229,-250,-217; MA /M: SY='W'; M=-130,-230,-228,-106,79,-128,33,-78,-98,-96,-203,-223,-229,-103,-115,-219,-218,-212,132,99; MA /M: SY='H'; M=-217,-228,-200,-201,-215,-218,160,-233,-205,-216,-201,-190,-217,-194,-199,-206,-215,-233,-251,-184; MA /M: SY='F'; M=-25,-217,-230,-108,93,-228,-214,-10,-222,30,33,-223,-228,-117,-221,-217,-69,41,-202,33; MA /M: SY='A'; M=108,-209,-215,-207,-222,-197,-216,-210,-210,-85,-207,-68,-214,-206,-214,-84,-199,-59,-223,-218; MA /M: SY='K'; M=-57,-55,-144,13,-72,-221,-35,-41,66,39,51,-207,-217,58,7,-56,-100,-27,-221,-207; MA /M: SY='D'; M=-55,-225,84,43,-228,-106,-21,-227,40,-166,-23,14,-212,12,29,5,-69,-223,-233,-215; MA /M: SY='L'; M=-213,-217,-102,-224,-189,-233,-217,16,-225,95,-2,-229,-230,-218,-222,-224,-209,-32,-219,-96; MA /M: SY='Q'; M=-14,-223,-33,0,-114,-106,26,-95,-76,-147,-74,-26,-213,112,-41,55,-201,-74,-222,-14; MA /M: SY='Q'; M=-4,-118,31,48,-144,-94,-13,-70,42,-58,-65,21,-213,56,40,-1,-46,-107,-69,-213; MA /M: SY='E'; M=-42,-224,-22,82,-228,-39,-108,-226,-6,-153,-66,-17,-67,72,-19,45,-69,-221,-226,-99; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; PP /COMPETES_HIT_WITH: PS50157; PS51801; PS51905; PS51906; PS51908; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=7(6); /POSITIVE=7(6); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2; CC /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=UBZ3-type; CC /VERSION=4; DR O42917 , ESO1_SCHPO , T; Q9VNX1 , POLH_DROME , T; DR Q9Y253 , POLH_HUMAN , T; Q9JJN0 , POLH_MOUSE , T; DR Q04049 , POLH_YEAST , T; Q6JDV7 , POLK_ARATH , T; 3D 2I5O; 3WUP; PR PRU01255; DO PDOC51905; //