ID HTH_HARE; MATRIX. AC PS51913; DT 22-APR-2020 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE HARE-type HTH domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=70; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=65; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1870663; R2=0.0071568; TEXT='-LogE'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9651.2480469; R2=2.2973452; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1162; H_SCORE=12321; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=603; H_SCORE=11037; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-23; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; MA /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; MA /M: SY='M'; M=-41,-53,-52,-24,-8,-17,-58,-21,31,20,87,-15,-19,-44,12,-6,-23,-28,-69,21; MA /M: SY='S'; M=-2,-66,-29,-47,-52,-26,-22,-52,-32,-55,-64,1,-11,-9,-18,70,68,-60,-83,-66; MA /M: SY='W'; M=-24,-73,-55,-19,55,-76,-43,-4,-31,27,64,-1,-58,-25,-67,-56,-41,-1,76,33; MA /M: SY='I'; M=-7,-72,-73,-37,-31,-46,-11,46,11,38,10,-34,-45,-62,4,-38,-3,22,-74,-25; MA /M: SY='D'; M=-28,-79,79,74,-30,-57,-54,-64,-26,-77,-49,11,-50,1,-40,-23,-45,-67,-42,-69; MA /M: SY='A'; M=51,-68,-75,-68,-15,-51,-34,36,-31,32,20,-51,-49,-26,-54,-22,-15,5,25,-58; MA /M: SY='A'; M=84,-16,-51,-63,-54,-35,-71,23,-65,-54,-56,-44,-68,-62,-69,-16,-18,5,-77,-68; MA /M: SY='Y'; M=-33,-78,-49,35,25,-76,21,21,12,-29,-52,-28,-49,-6,-34,-52,-35,-9,0,84; MA /M: SY='E'; M=-1,-43,24,55,-56,-61,18,-2,27,-23,0,-14,-65,24,12,-34,-6,-20,-79,-47; MA /M: SY='V'; M=-14,-70,-81,-77,2,-82,-76,58,-61,12,-22,-75,-77,-73,-75,-35,-39,68,-72,16; MA /M: SY='L'; M=-22,-69,-82,-45,-19,-83,-68,6,-76,84,24,-81,-81,-69,-74,-74,-62,-33,-71,-53; MA /M: SY='K'; M=-4,-75,-25,45,-75,-53,-27,-35,54,-38,-63,-16,-65,28,38,13,-6,-39,-77,-48; MA /M: SY='E'; M=3,-76,29,66,-54,-56,-9,-40,17,-46,-65,20,-63,39,9,-13,-21,-44,-80,-67; MA /M: SY='K'; M=26,-27,-34,31,-26,-49,5,-25,34,-52,-62,28,-32,10,-4,23,-2,-16,-76,-12; MA /M: SY='G'; M=-41,-76,7,-7,-8,54,-2,-65,49,-77,-68,25,-17,13,7,-8,-27,-75,-76,-65; MA /I: I=-31; MI=0; MD=-79; IM=0; DM=-79; MA /M: SY='K'; M=-45,-34,-25,45,-43,-10,-10,-75,48,-73,-26,14,-34,37,38,-29,18,-42,-78,-46; D=-31; MA /I: I=-31; DM=-79; MA /M: SY='P'; M=7,-82,-49,-18,-43,-8,-67,-72,-27,-70,-68,-27,107,-32,-69,8,-29,-55,-17,-53; MA /M: SY='M'; M=-19,-69,-62,-72,18,-78,-63,6,-47,50,96,-72,-76,-17,-69,-45,-9,0,-69,-9; MA /M: SY='H'; M=-38,-71,1,-10,-69,-54,91,-72,-17,-58,-62,29,-4,-51,-19,41,50,-51,-85,0; MA /M: SY='F'; M=5,5,-76,-73,72,-66,7,14,-71,-10,-49,-71,8,-71,-71,-23,-33,11,-51,69; MA /M: SY='K'; M=-12,-75,-13,14,-48,-30,-5,-48,45,-37,-43,39,-36,26,32,11,-23,-47,-71,32; MA /M: SY='E'; M=-10,-78,56,79,-81,-56,-55,-77,0,-75,-41,-16,-61,33,-43,-26,-11,-34,-23,-69; MA /M: SY='I'; M=-65,-74,-85,-81,-25,-88,-78,87,-78,44,28,-78,-77,-73,-79,-74,-59,5,-73,-55; MA /M: SY='W'; M=10,-33,-79,-72,20,-58,-41,19,-37,21,20,-72,-75,-53,-62,-37,25,10,112,3; MA /M: SY='E'; M=-4,-76,48,55,-79,-34,6,-78,32,-63,-68,29,-64,37,-7,-5,-28,-60,-82,-42; MA /M: SY='E'; M=-4,-51,-32,45,-66,-72,13,8,34,-16,-10,-27,-67,32,34,-34,-38,1,-74,6; MA /M: SY='I'; M=35,-45,-78,-74,-46,-20,-77,66,-72,-9,19,-70,-73,-69,-75,-29,-17,44,-1,-60; MA /M: SY='Q'; M=13,15,-63,9,-26,-53,-41,13,20,12,-19,-12,-70,47,-44,-3,-5,16,6,-35; MA /M: SY='E'; M=10,-75,29,55,-79,-41,-56,-55,45,-60,-49,-6,-45,27,20,0,-16,-52,-79,-68; MA /M: SY='K'; M=-14,-45,-7,15,-13,-27,-6,-9,30,21,8,15,-70,11,25,-4,-27,-17,-75,-28; MA /M: SY='G'; M=-23,-74,-10,-22,-41,59,-22,-40,32,0,16,30,-69,-12,-7,-15,-51,-44,-75,-25; MA /M: SY='L'; M=-42,-34,-21,-13,1,27,-3,-27,-8,48,7,7,-23,15,-49,-36,-47,-31,-7,16; MA /M: SY='W'; M=-20,-74,24,-36,16,-65,-8,12,7,9,-8,-40,-73,-9,19,-14,-1,14,57,30; MA /M: SY='S'; M=-32,-21,34,16,-36,-49,-26,-37,27,-43,-65,16,14,14,-10,41,33,-42,-82,-66; MA /I: I=-19; MD=-49; MA /M: SY='W'; M=-72,-60,-17,-26,-25,-62,-8,-46,-3,-39,-45,-37,-24,-27,-23,9,-5,-40,33,-83; D=-19; MA /I: I=-19; MI=0; MD=-49; IM=0; DM=-49; MA /M: SY='G'; M=-47,-103,-61,-99,-45,52,-35,-104,-77,-78,-97,-31,-67,-93,-71,-12,-58,-51,-102,-31; D=-19; MA /I: I=-19; DM=-49; MA /M: SY='K'; M=-3,-75,3,24,-23,-47,-10,-40,63,-27,-24,-3,-1,20,-11,1,-4,-33,9,-36; MA /M: SY='T'; M=-13,-69,30,36,-74,-24,-10,-55,-3,-70,-24,29,-63,-2,-33,14,69,-41,-85,-67; MA /M: SY='P'; M=-29,-18,21,22,-57,-59,-62,-34,-25,-57,-66,-19,89,36,-15,-2,-11,-29,-25,-32; MA /M: SY='W'; M=4,-8,0,34,-30,-38,-8,4,5,5,-20,-26,-22,-4,10,-9,-20,11,59,-43; MA /M: SY='A'; M=43,-70,1,18,-76,-50,-16,-45,27,-54,-19,24,-4,24,3,10,16,-43,-80,-67; MA /M: SY='T'; M=-7,14,8,7,-69,-53,-22,-14,-15,-31,-17,-2,-65,22,-12,32,66,-19,-82,-37; MA /M: SY='L'; M=5,-71,-55,-44,-24,-74,-65,8,5,39,36,-14,-14,-9,15,-23,-40,30,7,-19; MA /M: SY='I'; M=15,-32,-52,-23,-50,1,-40,39,-14,-2,18,33,-71,16,3,2,-25,-13,-22,11; MA /I: I=-42; MD=-106; MA /M: SY='A'; M=63,-69,-65,-34,-75,12,-41,-29,-63,-52,-65,-15,-56,-2,-34,35,11,-27,-36,-46; D=-42; MA /I: I=-42; MD=-106; MA /M: SY='Q'; M=-3,-81,-20,13,-36,-44,-14,-37,-8,-34,20,-11,-74,55,40,2,-8,-33,-81,-29; D=-42; MA /I: I=-42; MI=-106; IM=-106; DM=-106; MA /M: SY='L'; M=-51,-71,-84,-78,53,-85,-18,48,-77,62,-8,-79,-81,-74,-58,-74,-62,6,-65,-27; MA /M: SY='Y'; M=-11,-42,-48,-56,3,-35,40,-36,-51,-20,-53,-3,-76,-37,-46,19,-20,-46,2,106; MA /M: SY='T'; M=-2,-42,-37,-14,-67,-35,-24,-37,-22,-23,13,-3,-66,2,30,8,73,9,-82,-64; MA /M: SY='D'; M=-30,-45,82,37,-54,-45,7,-45,-35,-23,-34,13,-66,20,-2,-2,-18,-62,-86,-34; MA /M: SY='M'; M=-27,-9,-79,-63,-29,-79,-71,61,-50,45,61,-42,-54,-68,-73,-1,-14,1,-75,-56; MA /I: I=-23; MI=0; MD=-58; IM=0; DM=-58; MA /M: SY='N'; M=-35,-73,-26,-64,-74,34,-37,-32,-14,-30,-8,72,-30,-26,-12,5,24,-12,-23,-70; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='E'; M=-13,-76,11,25,-67,-16,-13,2,-4,20,14,-24,12,24,-8,-41,-4,0,-81,-65; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='D'; M=-20,-40,92,13,-65,-26,-5,-82,-1,-68,-56,9,-31,-15,-35,13,-34,-78,-93,-70; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='S'; M=-1,-44,-13,-59,-58,43,-36,-63,-3,-76,-49,13,15,-17,-11,61,11,-45,-80,-70; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='R'; M=-23,-54,-28,-20,-69,-74,-58,-2,7,-7,-34,-27,13,-16,88,-23,-10,-33,-22,-44; MA /M: SY='F'; M=-73,-71,-87,-81,117,-70,-68,-36,-77,-17,-28,-76,-85,-37,-75,-73,-66,-13,-43,-9; MA /M: SY='V'; M=0,-26,-53,-18,4,-65,-48,45,-11,-2,14,-69,-74,-37,-14,-44,-8,52,-21,26; MA /M: SY='R'; M=-25,15,-63,-55,3,-71,13,-34,49,-13,-26,-22,-18,1,59,10,-18,-36,-69,25; MA /M: SY='V'; M=-9,2,-71,-39,-21,-65,-46,22,-52,25,4,-14,-57,-31,-47,-31,44,52,-78,-15; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='G'; M=15,-74,-3,6,-65,70,-10,-50,-18,-79,-71,-10,-25,-8,-37,24,-33,-74,-78,-72; D=-31; MA /I: I=-31; MI=0; MD=-79; IM=0; DM=-79; MA /M: SY='P'; M=-32,-79,45,31,-54,-44,-25,-77,13,-61,-41,24,69,-13,26,2,-22,-75,-82,-70; MA /M: SY='G'; M=-5,-73,10,-42,-60,69,-20,-61,-32,-69,-69,60,-68,-1,-32,-5,-5,-51,-79,-38; MA /M: SY='T'; M=-60,-41,-62,4,-25,-48,0,-10,27,10,12,-21,-70,16,38,-23,40,4,-7,8; MA /M: SY='W'; M=-60,-84,-89,-79,73,-77,-70,-40,-72,-46,-7,-83,-82,-51,-72,-75,-74,-51,144,67; MA /M: SY='G'; M=39,-3,0,-29,5,58,-67,-30,-20,-61,-25,-43,-69,-18,-26,1,-5,-65,43,-25; MA /M: SY='L'; M=-50,-26,-83,-76,-42,-84,-41,9,-77,85,-30,-81,-82,-70,-75,-45,-40,-12,-72,-38; MA /M: SY='R'; M=-24,-43,-27,-50,-51,-69,-56,-52,62,-56,-43,3,-69,-16,77,8,0,-35,-75,-28; MA /M: SY='E'; M=15,-72,22,56,-76,-12,-32,-33,13,-61,-66,1,-39,-17,-11,39,-5,-22,-81,-69; MA /M: SY='W'; M=-42,-47,-11,-11,4,-29,-67,-25,-14,-8,-5,17,-20,0,21,-4,-32,-68,130,3; MA /I: E1=0; IE=-380; DE=-380; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=98(98); /POSITIVE=98(98); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??EP?; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HTH HARE-type; CC /VERSION=2; DR Q8IXJ9 , ASXL1_HUMAN, T; P59598 , ASXL1_MOUSE, T; DR Q5ZM88 , ASXL2_CHICK, T; Q76L83 , ASXL2_HUMAN, T; DR Q8BZ32 , ASXL2_MOUSE, T; Q9C0F0 , ASXL3_HUMAN, T; DR Q8C4A5 , ASXL3_MOUSE, T; F4HY56 , RLT1_ARATH , T; DR Q9FFH1 , RLT2_ARATH , T; A0RLC4 , RPOE_BACAH , T; DR Q81JW0 , RPOE_BACAN , T; Q72XA8 , RPOE_BACC1 , T; DR B7IQZ2 , RPOE_BACC2 , T; B7HFN7 , RPOE_BACC4 , T; DR B7HY99 , RPOE_BACC7 , T; B9IRX2 , RPOE_BACCQ , T; DR Q814T1 , RPOE_BACCR , T; Q630Q9 , RPOE_BACCZ , T; DR Q6HAU4 , RPOE_BACHK , T; Q65DT6 , RPOE_BACLD , T; DR A8FIE6 , RPOE_BACP2 , T; P12464 , RPOE_BACSU , T; DR A7Z9T5 , RPOE_BACVZ , T; Q9K6D6 , RPOE_HALH5 , T; DR Q5FME7 , RPOE_LACAC , T; Q1GBQ3 , RPOE_LACDA , T; DR Q04C52 , RPOE_LACDB , T; Q74LG3 , RPOE_LACJO , T; DR Q9CHT4 , RPOE_LACLA , T; A2RIW1 , RPOE_LACLM , T; DR Q030Z9 , RPOE_LACLS , T; Q88Z77 , RPOE_LACPL , T; DR B1MXM6 , RPOE_LEUCK , T; Q03YU3 , RPOE_LEUMM , T; DR Q1WV31 , RPOE_LIGS1 , T; B2GA55 , RPOE_LIMF3 , T; DR A5VI25 , RPOE_LIMRD , T; B2G5K4 , RPOE_LIMRJ , T; DR Q927T3 , RPOE_LISIN , T; Q71WL9 , RPOE_LISMF , T; DR Q8Y494 , RPOE_LISMO , T; A0ALP6 , RPOE_LISW6 , T; DR B9E8H2 , RPOE_MACCJ , T; P47268 , RPOE_MYCGE , T; DR P75090 , RPOE_MYCPN , T; Q8EM52 , RPOE_OCEIH , T; DR Q04D45 , RPOE_OENOB , T; Q03DX9 , RPOE_PEDPA , T; DR Q5WB42 , RPOE_SHOC1 , T; A7X4Y0 , RPOE_STAA1 , T; DR A6U3L3 , RPOE_STAA2 , T; Q2FF00 , RPOE_STAA3 , T; DR Q2FWD0 , RPOE_STAA8 , T; A5IUS3 , RPOE_STAA9 , T; DR Q2YUM5 , RPOE_STAAB , T; Q5HE72 , RPOE_STAAC , T; DR A6QIX2 , RPOE_STAAE , T; P66714 , RPOE_STAAM , T; DR P66715 , RPOE_STAAN , T; Q6GEU7 , RPOE_STAAR , T; DR Q6G7I2 , RPOE_STAAS , T; A8YY93 , RPOE_STAAT , T; DR P66716 , RPOE_STAAW , T; B9DMC7 , RPOE_STACT , T; DR Q5HM94 , RPOE_STAEQ , T; Q8CRM5 , RPOE_STAES , T; DR Q49Z74 , RPOE_STAS1 , T; Q3K3S3 , RPOE_STRA1 , T; DR Q8E7P9 , RPOE_STRA3 , T; Q8E291 , RPOE_STRA5 , T; DR C0M8K7 , RPOE_STRE4 , T; A8AVB9 , RPOE_STRGC , T; DR Q8DWG2 , RPOE_STRMU , T; P66719 , RPOE_STRP1 , T; DR Q04LZ9 , RPOE_STRP2 , T; P0DF34 , RPOE_STRP3 , T; DR B5E1U3 , RPOE_STRP4 , T; Q5XA09 , RPOE_STRP6 , T; DR C1C5L8 , RPOE_STRP7 , T; Q8NZF7 , RPOE_STRP8 , T; DR A2RCL2 , RPOE_STRPG , T; B1IA31 , RPOE_STRPI , T; DR B8ZLX1 , RPOE_STRPJ , T; P66717 , RPOE_STRPN , T; DR P0DF35 , RPOE_STRPQ , T; B2IM97 , RPOE_STRPS , T; DR P66718 , RPOE_STRR6 , T; A4VZE7 , RPOE_STRS2 , T; DR C0MFQ8 , RPOE_STRS7 , T; A4VT63 , RPOE_STRSY , T; DR Q5M1S8 , RPOE_STRT1 , T; Q5M6C1 , RPOE_STRT2 , T; DR Q03MQ8 , RPOE_STRTD , T; B9DTJ7 , RPOE_STRU0 , T; DR C1CCN9 , RPOE_STRZJ , T; C1CIY6 , RPOE_STRZP , T; DR C1CQ00 , RPOE_STRZT , T; Q9PPP2 , RPOE_UREPA , T; 3D 2KRC; 2M4K; 4NC7; 4NC8; 6ZCA; 6ZFB; 7F75; 8H1T; 8SVF; PR PRU01261; DO PDOC51913; //