ID COV_E; MATRIX. AC PS51926; DT 07-OCT-2020 CREATED; 07-OCT-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Coronavirus envelope (CoV E) protein profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=95; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=90; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5550442; R2=0.0058566; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1016; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=333; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-48; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; MA /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; MA /M: SY='M'; M=-154,-162,-176,-166,-143,-168,-146,-128,-158,-121,53,-163,-163,-150,-157,-163,-152,-135,-167,-142; MA /M: SY='T'; M=-145,-154,-150,-153,-160,-161,-161,-151,-150,-156,-152,-139,-152,-155,-158,-128,23,-143,-181,-158; MA /M: SY='F'; M=-168,-164,-181,-176,30,-176,-160,-141,-172,-133,-143,-169,-179,-182,-169,-167,-160,-147,-133,-111; MA /M: SY='M'; M=-66,-76,-86,-75,-59,-79,-60,-43,-70,-37,135,-75,38,-63,-70,-74,-64,-50,-79,-57; MA /M: SY='Y'; M=-68,-74,-78,-72,52,-80,-53,-46,-62,35,75,-73,-80,-63,28,-70,-64,-52,-49,82; MA /M: SY='N'; M=15,-72,19,7,-80,-56,-55,-75,-53,-78,-69,68,49,31,-59,50,-48,-72,-84,-71; MA /M: SY='F'; M=7,-71,-82,-74,69,-78,-70,12,-75,60,-40,-78,25,-74,-75,-70,-62,-44,-61,-43; MA /M: SY='V'; M=-58,-68,-80,-76,25,-83,-78,42,-74,24,-40,-73,-76,-75,-76,-64,28,70,-76,-54; MA /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90; MA /M: SY='W'; M=-58,-79,-74,-70,-70,2,-74,-64,-70,-5,-66,-64,-78,23,-73,67,-57,16,81,-65; D=-36; MA /I: I=-36; DM=-90; MA /M: SY='F'; M=-68,-78,-65,46,53,-84,-67,43,-66,-2,-53,-69,-73,-64,-71,-65,35,-49,-65,32; D=-36; MA /I: I=-36; DM=-90; MA /M: SY='E'; M=-64,-77,55,71,-69,-66,-48,-79,-46,-76,-70,66,-65,-44,12,-54,-57,-76,-76,39; MA /M: SY='D'; M=9,-70,67,14,-72,-66,-62,4,-57,-65,-63,23,-65,-57,-65,-48,64,7,-89,-67; MA /M: SY='N'; M=-54,-68,-47,-62,-74,40,-54,-67,-56,-76,-67,95,-70,-55,-63,32,9,5,-87,-71; MA /M: SY='G'; M=-54,-75,-69,-75,-66,78,-74,7,-69,-10,-61,-57,-70,-68,-75,-53,34,-3,75,-64; MA /M: SY='M'; M=-64,-71,-78,-72,19,-77,-60,-41,-71,60,82,-73,26,-65,-70,7,-59,-47,-64,35; MA /M: SY='I'; M=2,-72,-84,-80,68,-82,-79,75,-76,-38,-42,-75,-77,-78,-78,-68,-58,42,-64,-44; MA /M: SY='V'; M=1,-68,-78,-75,29,4,-76,26,-73,23,-44,-71,-76,-73,-75,-62,8,63,-74,-55; MA /I: I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97; MA /M: SY='N'; M=-54,-67,-44,-55,-75,-54,-50,-72,-50,-77,-67,95,-67,32,-57,52,43,-69,-89,-68; MA /M: SY='C'; M=3,57,-76,-74,16,5,-76,55,-72,-48,-49,-66,-74,-70,-75,28,-53,47,-76,-59; MA /M: SY='I'; M=-65,-71,-85,-80,46,-87,-75,59,-78,57,-35,-80,-80,-75,-77,-74,-60,28,-67,-47; MA /M: SY='Y'; M=-68,-73,-81,-78,58,-83,-59,10,-74,52,-39,-78,-83,-72,-72,-72,-63,7,-49,80; MA /M: SY='W'; M=-68,-79,-90,-80,19,-83,-82,56,-76,42,-42,-84,-79,-74,-77,-76,-66,11,125,-42; MA /M: SY='F'; M=-65,-70,-83,-79,77,-84,-73,37,-76,41,-40,-76,-80,-77,-76,-69,10,30,-61,-40; MA /M: SY='L'; M=3,-70,-83,-77,24,-82,-74,50,-76,59,-36,-78,-79,-73,-76,-70,-59,31,-70,-52; MA /M: SY='G'; M=35,-70,-74,-74,-61,49,-76,35,-72,9,-49,-66,-73,-69,-75,-57,-58,46,-77,-65; MA /M: SY='C'; M=-65,92,-82,-79,73,-80,-72,23,-76,39,-46,-73,-83,-77,-77,0,-61,-47,-64,-44; MA /M: SY='I'; M=-4,-71,-84,-79,24,-83,-77,70,-77,47,-36,-78,-78,-74,-77,-70,-59,29,-70,-52; MA /M: SY='M'; M=30,-69,-79,-74,23,4,-73,42,-72,18,46,-71,-75,-70,-74,-62,-57,43,-72,-55; MA /M: SY='F'; M=-65,-69,-83,-78,70,-84,-72,22,-76,52,-39,-76,-80,-76,-75,-70,10,33,-63,-42; MA /M: SY='Y'; M=-64,-72,-77,-75,-37,-82,-60,26,-72,53,-38,-74,-79,-68,-71,-67,17,28,-57,79; MA /M: SY='I'; M=-66,-73,-85,-80,-44,-88,-75,73,-79,70,-31,-80,-80,-73,-78,-76,-61,-29,-72,-55; MA /M: SY='V'; M=-60,-69,-84,-78,22,-86,-78,41,-77,43,-37,-79,-80,-76,-77,-71,-56,72,-74,-53; MA /M: SY='G'; M=-50,43,-65,-69,-70,67,-69,-63,-66,-7,-62,-53,-69,-64,-72,44,35,6,-80,-70; MA /M: SY='C'; M=-63,71,-75,-67,-57,-81,-70,57,41,16,38,-67,-75,-62,16,-67,-59,12,-77,-61; MA /M: SY='A'; M=81,-63,-69,-64,-71,8,-72,-53,-65,-61,-58,-62,-68,-63,-69,-45,17,35,-78,-69; MA /M: SY='F'; M=-69,-71,-86,-80,76,-86,-70,31,-78,67,-35,-80,-83,-77,-76,-76,-64,-40,-59,-39; MA /M: SY='L'; M=-63,-70,-76,-69,-43,-81,-63,-37,-70,74,-35,-73,-79,28,-69,-66,22,10,-67,34; MA /M: SY='T'; M=43,-66,-61,-58,-66,-63,-63,-53,10,15,-53,37,-68,30,-59,-48,51,13,-80,-65; MA /M: SY='C'; M=35,72,-78,-74,67,-70,-72,42,-72,0,-50,-69,-77,-72,-74,11,-57,-45,-65,-47; MA /M: SY='I'; M=-59,48,-79,-76,-52,-83,-78,56,-73,32,-40,-71,-76,-73,-76,-63,40,51,-80,-60; MA /M: SY='Q'; M=-62,-80,-54,-41,-82,-68,-51,-78,59,-75,-62,26,-68,95,54,-53,-60,-76,-74,-63; MA /M: SY='L'; M=45,48,-79,-72,43,-72,-69,-44,-73,63,-41,-75,-79,-70,-73,-63,-60,-46,-68,-51; MA /M: SY='C'; M=27,124,-79,-76,-63,-73,-79,18,-74,-9,-55,-70,-82,-76,-78,-61,-58,30,-88,-71; MA /M: SY='D'; M=19,-72,64,-58,47,-72,-65,33,-67,-1,56,-59,-73,-66,-70,-62,-58,4,-72,-51; MA /M: SY='Q'; M=3,-71,-67,-62,-56,24,-61,-49,-61,-4,-53,-60,-72,54,-63,12,17,41,-67,52; MA /M: SY='C'; M=-5,137,-78,-77,-66,-75,-78,-61,-74,-2,-60,-67,-84,-78,-79,-60,14,4,-93,-75; MA /M: SY='C'; M=-63,130,-76,-74,-61,-77,72,-62,-73,25,37,-65,-84,-71,-73,-66,-62,-60,-92,-63; MA /M: SY='N'; M=-60,-72,-58,-65,-64,43,-58,-61,-53,38,-54,68,-74,-57,42,-54,10,-63,-79,-65; MA /M: SY='F'; M=0,40,-82,-78,78,-3,-71,30,-76,43,-43,-74,-81,-76,-76,-68,-63,-45,-59,-41; MA /M: SY='W'; M=-61,98,-83,-79,17,15,-80,-48,-75,16,-54,-74,-82,-77,-78,-67,-63,40,102,-53; MA /M: SY='N'; M=-6,-72,-49,-58,19,-60,-47,-70,20,-70,-62,93,-74,-52,30,-52,-54,-70,-65,60; MA /M: SY='T'; M=-52,-65,-58,-61,-68,11,-66,-55,9,-64,-60,17,-64,-60,-61,14,88,24,-85,-66; MA /M: SY='W'; M=3,-74,-79,-72,21,-70,-77,5,-69,19,-52,-71,-74,-67,-72,28,14,18,123,-45; MA /M: SY='V'; M=9,50,-82,-76,-52,-79,-78,27,-75,44,-40,-77,-79,-73,-76,-66,-56,65,-80,-61; MA /M: SY='C'; M=3,72,-79,-76,-47,-78,-70,26,-73,2,-45,-74,-80,-72,-74,-65,-56,65,-68,59; MA /M: SY='K'; M=-58,-72,26,-51,-67,-70,-63,10,57,-3,-55,-52,-67,24,-49,13,42,18,-80,-63; MA /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83; MA /I: I=-31; MI=0; MD=-79; IM=0; DM=-79; MA /M: SY='F'; M=16,-68,-69,-68,49,-68,-63,12,-66,16,-50,-61,-71,-64,-69,38,48,-49,-62,41; MA /M: SY='I'; M=9,-73,-76,-69,24,3,-73,62,-69,-3,-44,-69,-74,41,-71,-62,-58,42,-72,-55; MA /M: SY='Y'; M=-69,-80,-68,-66,-32,-78,60,2,10,-4,-49,-65,-78,-56,18,-65,-64,-59,-42,111; MA /M: SY='V'; M=14,-68,-70,-69,21,11,-69,-40,9,32,-47,24,-76,-66,-66,-60,-56,55,-74,-57; MA /M: SY='Y'; M=-68,-79,-67,-72,-24,-75,-40,-52,-64,-53,-50,24,-82,-61,-63,-64,-62,12,-34,126; MA /M: SY='N'; M=-59,-70,32,-54,-70,-63,-54,-68,-46,0,-62,65,-70,-51,56,30,43,-65,-85,-65; MA /M: SY='Y'; M=13,-76,-64,-54,-59,-70,-56,-63,33,-66,-59,-59,32,29,55,-56,10,5,-64,60; MA /M: SY='Y'; M=-59,-74,-69,-69,44,44,-57,-56,17,-58,-57,-61,-75,-63,-62,12,-60,23,-52,81; MA /M: SY='K'; M=-63,-80,-57,-42,-80,-71,-54,-79,88,-76,-64,-50,-66,61,58,-56,-60,-76,-73,-64; MA /M: SY='N'; M=-59,-74,-47,13,-71,-60,-50,-75,13,-77,-67,79,33,33,19,34,-51,-74,-76,23; MA /M: SY='F'; M=-66,-73,-65,32,55,-80,-61,-48,41,44,-46,-68,-74,-58,-56,-67,-62,2,-60,34; MA /M: SY='M'; M=-59,-69,-60,-66,-50,-65,-51,-51,-60,5,92,62,-72,-56,-63,30,18,-55,-67,58; MA /I: I=-25; MD=-63; MA /M: SY='N'; M=-70,-80,-62,-65,-64,-74,-58,-64,14,13,-60,70,-82,-58,50,-64,-63,-2,-79,30; D=-25; MA /I: I=-25; MD=-63; MA /M: SY='I'; M=-74,-85,-83,-76,29,-87,-74,56,2,16,-51,-80,52,-75,-75,-76,-67,-48,-68,34; D=-25; MA /I: I=-25; MD=-63; MA /M: SY='E'; M=-70,-84,21,68,14,-76,-57,-81,24,-78,-74,45,-71,-51,-57,-63,-64,-80,-75,33; D=-25; MA /I: I=-25; MD=-63; MA /M: SY='S'; M=12,-85,24,-69,-82,-76,-74,-76,-74,18,-71,25,-87,22,-78,27,-67,-75,-97,-80; D=-25; MA /I: I=-25; MD=-63; MA /M: SY='E'; M=-74,-93,12,54,-74,-86,-70,13,-70,-79,-77,-71,-81,-63,-76,26,-70,-74,-82,44; D=-25; MA /I: I=-25; MD=-63; MA /M: SY='E'; M=24,-98,-69,51,-107,-87,-83,-103,-76,-102,-96,34,-90,-72,-85,-76,-82,-95,-109,-100; D=-25; MA /I: I=-25; MI=-63; MD=-63; IM=-63; DM=-63; MA /M: SY='R'; M=-79,-97,-92,-84,-88,-20,-90,-65,-71,-79,-76,-88,37,-81,46,-83,-79,45,-102,-87; D=-25; MA /I: I=-25; DM=-63; MA /M: SY='V'; M=-74,-89,29,-77,-77,-92,-86,35,-76,-65,-66,-76,-89,-79,15,1,-69,44,-100,-78; D=-25; MA /I: I=-25; DM=-63; MA /M: SY='P'; M=-77,-98,-85,-78,-90,14,-88,8,2,-82,-77,-82,80,-81,-83,-78,-75,1,-94,-89; D=-25; MA /I: I=-25; DM=-63; MA /M: SY='P'; M=11,-89,37,-68,-88,-77,-77,-81,-76,-2,-77,22,50,-75,-83,9,-69,-81,-99,-86; D=-25; MA /I: I=-25; DM=-63; MA /M: SY='P'; M=-61,-79,-54,63,-68,-72,-62,-61,-57,35,-56,-66,80,-52,-65,16,-57,-63,-78,-69; MA /M: SY='L'; M=-69,-71,-81,-71,68,-83,-65,-41,-67,70,-37,-76,-83,19,13,-72,-64,-47,-61,-42; MA /M: SY='P'; M=-12,-81,-58,51,-76,-71,-68,-57,-59,-68,-63,-69,99,-58,-68,-61,-57,37,-81,-75; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='R'; M=-99,-116,-102,-90,-109,-112,-98,-95,7,-103,-96,-97,16,-86,46,-98,-96,1,-114,-102; D=-31; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='N'; M=-101,-108,42,-82,-117,-91,-83,-116,-87,-120,-111,69,-107,-88,-95,-84,-87,-116,-135,-108; D=-31; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='G'; M=-88,-111,17,2,-118,28,-97,-121,-94,-118,-112,-82,-101,-89,-102,13,-91,-114,-118,-109; D=-31; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='W'; M=-105,-124,-113,-100,-93,-111,-115,6,13,-99,-97,-108,23,-98,-94,-106,-103,-96,98,-85; D=-31; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='N'; M=-99,-108,23,-92,-104,-101,-94,7,-95,-95,-94,49,-109,-95,-102,-91,-88,-5,-127,-103; D=-31; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='N'; M=-103,-117,-95,-112,-114,7,-102,5,-104,-109,-104,49,-116,-104,-111,-96,-99,-100,-127,-113; D=-31; MA /I: I=-31; MI=-79; IM=-79; DM=-79; MA /M: SY='E'; M=-75,-95,11,56,-99,-85,-71,-98,36,-94,-87,-66,-78,32,-60,8,-73,-93,-96,-86; MA /M: SY='N'; M=-79,-86,-70,-82,-70,-82,-70,-1,-75,-10,-70,66,-89,-76,-81,-67,42,-71,-88,38; MA /M: SY='L'; M=-79,-89,-99,-92,-67,-101,-94,31,-92,36,-54,-96,22,-90,-94,-89,-75,35,-94,-76; MA /I: I=-23; MD=-58; MA /M: SY='C'; M=22,44,-132,-126,-135,-116,-133,-129,-127,-128,-124,-124,-133,-126,-132,-107,-115,-116,-143,-135; D=-23; MA /I: I=-23; MI=0; MD=-58; IM=0; DM=-58; MA /M: SY='D'; M=-127,-136,10,-118,-115,-140,-128,4,-130,-13,-103,-121,-135,-127,-134,-129,-120,-100,-141,-120; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='Y'; M=-128,-137,14,-110,-110,-123,-104,-132,-116,-132,-126,17,-135,-115,-121,-115,-117,-134,-121,27; D=-23; MA /I: I=-23; DM=-58; MA /M: SY='V'; M=-100,-117,-123,-121,-105,-122,-126,7,-119,-92,-94,-115,-122,-116,-122,3,-96,26,-131,-110; MA /I: I=-23; E1=0; IE=-380; DE=-58; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=46(46); /POSITIVE=46(46); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /VERSION=1; DR Q0Q4E8 , VEMP_BC133 , T; Q0Q473 , VEMP_BC279 , T; DR Q0Q464 , VEMP_BC512 , T; Q3LZW9 , VEMP_BCHK3 , T; DR A3EX99 , VEMP_BCHK4 , T; A3EXD5 , VEMP_BCHK5 , T; DR A3EXG8 , VEMP_BCHK9 , T; Q3I5J3 , VEMP_BCRP3 , T; DR P0C2Q1 , VEMP_CVBEN , T; P15775 , VEMP_CVBF , T; DR P0C2Q2 , VEMP_CVBLS , T; P0C2Q3 , VEMP_CVBLU , T; DR P0C2Q4 , VEMP_CVBLY , T; P15779 , VEMP_CVBM , T; DR P0C2Q5 , VEMP_CVBOK , T; P0C2Q6 , VEMP_CVBON , T; DR P0C2Q7 , VEMP_CVBQ , T; P36696 , VEMP_CVCAI , T; DR Q7T6T0 , VEMP_CVCBG , T; P19741 , VEMP_CVH22 , T; DR Q5MQC8 , VEMP_CVHN1 , T; Q14EA8 , VEMP_CVHN2 , T; DR Q0ZME5 , VEMP_CVHN5 , T; Q6Q1S0 , VEMP_CVHNL , T; DR Q04854 , VEMP_CVHOC , T; P0C2R0 , VEMP_CVMA5 , T; DR P06591 , VEMP_CVMJH , T; P29076 , VEMP_CVMS , T; DR P0C2Q8 , VEMP_CVP67 , T; P22655 , VEMP_CVPFS , T; DR P0C2Q9 , VEMP_CVPIA , T; P09048 , VEMP_CVPPU , T; DR P69611 , VEMP_CVPR8 , T; P69610 , VEMP_CVPRM , T; DR Q9IKC8 , VEMP_CVRSD , T; Q52PA5 , VEMP_FIPV , T; DR Q89894 , VEMP_IBVB , T; P19744 , VEMP_IBVK , T; DR P05139 , VEMP_IBVM , T; P30246 , VEMP_IBVP3 , T; DR P30247 , VEMP_IBVU4 , T; P30248 , VEMP_IBVU5 , T; DR K9N5R3 , VEMP_MERS1 , T; Q84706 , VEMP_PEDV7 , T; DR P59637 , VEMP_SARS , T; P0DTC4 , VEMP_SARS2 , T; 3D 2MM4; 5X29; 5XER; 5XES; 7K3G; 7M4R; 7NTJ; 7QCR; 7QCS; 7QCT; 7TV0; 8SUZ; 3D 8U1T; PR PRU01274; DO PDOC51926; //