ID   HNF_P1; MATRIX.
AC   PS51937;
DT   02-DEC-2020 CREATED; 02-DEC-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   HNF-1 dimerization (HNF-p1) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=32;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=29;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6413412; R2=0.0088844; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1054; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=435; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-39; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='M'; M=-45,-75,12,-1,-80,-27,-52,-69,-40,-44,87,-36,-26,-57,14,-22,-16,-34,-95,-76;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-83,-36,39,-78,-50,-68,-48,-67,-67,51,-73,23,-56,-21,1,-17,31,-44,-76;
MA   /M: SY='P'; M=-28,-70,-71,-69,-81,-14,-72,-30,-46,-26,3,2,62,-66,-8,53,-19,-48,-89,-78;
MA   /M: SY='R'; M=-62,-85,-54,-16,-42,-75,-45,-34,35,20,5,-67,-39,19,65,-40,-69,-69,-81,-68;
MA   /M: SY='F'; M=-77,-78,-90,-85,77,-90,-26,-47,-83,48,0,-85,-48,-83,-80,-81,-71,-13,-59,33;
MA   /M: SY='T'; M=-57,-69,-64,-67,-76,-56,-73,-68,-38,-73,-69,-23,-68,-66,-71,32,97,-39,-94,-73;
MA   /M: SY='I'; M=19,-63,-46,-28,-66,-61,-12,50,-73,-39,-36,-51,-1,-9,-55,-9,-36,42,-72,-31;
MA   /M: SY='E'; M=-55,-82,-55,76,-68,-85,-66,-42,-55,45,-56,-47,-72,10,-66,-52,-37,-64,-83,-70;
MA   /M: SY='Q'; M=-66,-91,-61,-41,-96,-74,-54,-83,-14,-78,-65,-57,-73,123,-46,-56,-69,-84,-79,-68;
MA   /M: SY='I'; M=-57,-47,-71,22,-66,-86,-20,54,-21,10,-21,-49,-77,41,7,-68,-26,5,-82,-66;
MA   /M: SY='E'; M=-68,-88,47,80,-86,-54,-41,-87,-23,-66,-38,-57,-67,49,-58,-62,-67,-83,3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-73,-76,-91,-83,-47,-93,-75,-18,-84,84,-25,-90,-90,-77,-81,-84,-69,-45,-77,-60;
MA   /M: SY='L'; M=-70,-78,-91,-85,-51,-94,-82,56,-84,61,-38,-87,-86,-79,-84,-81,-66,21,-80,-62;
MA   /M: SY='W'; M=-28,-87,-62,-47,-76,-29,-64,-80,-25,-59,-70,0,-78,71,59,0,-62,-46,95,-61;
MA   /M: SY='R'; M=51,-79,-41,-25,-83,-68,-50,-81,1,-79,-70,-63,-76,-19,76,-2,-63,-72,-83,-73;
MA   /M: SY='L'; M=-73,-75,-91,-83,-47,-92,-75,-38,-84,84,-35,-90,-91,-77,-81,-83,-69,-23,-78,-60;
MA   /M: SY='R'; M=-71,-79,-77,-66,-19,-85,-27,-40,-14,55,-8,-72,-83,-33,75,-72,-68,-48,-76,-60;
MA   /M: SY='D'; M=-52,-25,38,28,-78,14,-8,-63,-32,-11,-55,14,-72,19,36,9,-25,-45,-61,-70;
MA   /M: SY='S'; M=-48,-67,-60,-62,-76,-58,-66,-73,-61,-77,-71,-49,-66,-56,-67,89,62,-65,-88,-70;
MA   /M: SY='G'; M=-53,-81,-69,-80,-87,98,-75,-95,-73,-90,-79,-54,-73,-71,-41,-54,-72,-88,-78,-82;
MA   /M: SY='M'; M=-43,-71,-84,-78,-47,-83,-70,60,-74,49,87,-77,-77,-69,-74,-73,-59,21,-74,-54;
MA   /M: SY='T'; M=-41,-63,-55,-42,-71,-48,-63,-66,-54,-70,-65,-5,-61,-55,-55,75,87,-58,-85,-66;
MA   /M: SY='K'; M=-21,-78,-58,-46,-76,-49,-58,-75,82,-29,-63,-22,20,21,51,-15,-49,-72,-40,-65;
MA   /M: SY='D'; M=1,-79,68,62,-83,-67,-15,-78,-47,-67,-71,-26,43,31,-24,-40,-6,-57,-85,-71;
MA   /M: SY='Q'; M=21,-73,5,42,-71,-41,-61,-18,-53,-18,-55,-34,-67,74,-57,-53,-3,38,-79,-65;
MA   /M: SY='L'; M=-62,-71,-84,-78,-46,-86,-76,59,-77,60,11,-79,-79,-73,-77,-51,-58,44,-75,-56;
MA   /M: SY='I'; M=0,-70,-82,-76,-44,-82,-78,65,-47,38,-12,-76,-76,-72,-75,-55,-31,54,-77,-58;
MA   /M: SY='H'; M=-26,-60,-34,42,-78,-69,90,-65,12,-56,-38,-50,-65,87,11,-30,-62,-76,-80,-56;
MA   /M: SY='A'; M=91,-63,-69,-62,-24,-16,-70,-2,-64,-62,-12,-63,-67,-61,-51,-31,-48,-33,-25,-67;
MA   /M: SY='L'; M=-58,-38,-83,-75,47,-83,-65,-15,-74,69,48,-79,-21,-41,-49,-74,-63,-9,-62,21;
MA   /M: SY='D'; M=-33,-38,66,56,-82,40,-8,-83,-23,-79,-67,-12,-39,-21,11,-30,-10,-77,-84,-71;
MA   /M: SY='E'; M=1,-72,56,56,-77,-64,-58,-58,-47,-73,-33,-34,-37,-9,-16,33,50,-66,-23,-68;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=18(18); /POSITIVE=18(18); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HNF-p1;
CC   /VERSION=1;
DR   Q9TYT0    , HMBX1_CAEEL, T; Q6NT76    , HMBX1_HUMAN, T;
DR   Q8BJA3    , HMBX1_MOUSE, T; A1L1N5    , HN1BA_DANRE, T;
DR   Q8UW00    , HN1BB_DANRE, T; Q90867    , HNF1A_CHICK, T;
DR   P20823    , HNF1A_HUMAN, T; P22361    , HNF1A_MOUSE, T;
DR   P15257    , HNF1A_RAT  , T; Q91474    , HNF1A_SALSA, T;
DR   P35680    , HNF1B_HUMAN, T; P27889    , HNF1B_MOUSE, T;
DR   Q03365    , HNF1B_PIG  , T; Q5RER5    , HNF1B_PONAB, T;
DR   P23899    , HNF1B_RAT  , T; Q91910    , HNF1B_XENLA, T;
DR   Q05041    , HNFAA_XENLA, T; Q91739    , HNFAB_XENLA, T;
3D   1F93; 1G2Y; 1G2Z; 1G39; 1JB6; 2GYP;
PR   PRU01286;
DO   PDOC51937;
//