ID BCOV_NSP3C_C; MATRIX. AC PS51942; DT 10-FEB-2021 CREATED; 10-FEB-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Betacoronavirus Nsp3c-C domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=73; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=68; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0526011; R2=0.0210648; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=473; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=212; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='T'; M=-6,18,-17,14,-1,-19,-13,-10,-19,-6,-18,-17,15,-12,-6,-8,13,26,-13,-34,-14,-4; MA /M: SY='P'; M=-5,4,-31,15,5,-31,-13,-13,-25,-7,-28,-22,-4,40,-6,-16,0,-6,-25,-33,-25,-3; MA /M: SY='E'; M=8,-3,-20,-1,21,-21,-16,-11,-13,-2,-12,-12,-8,-9,2,-9,3,-3,-6,-28,-18,11; MA /M: SY='R'; M=-13,0,-28,2,21,-25,-20,0,-23,13,-17,-7,-1,-11,19,23,-3,-5,-21,-25,-13,18; MA /M: SY='D'; M=-8,13,-22,18,1,-22,-15,17,-21,-8,-18,-13,5,-15,-3,-9,2,-1,-13,-32,-5,-2; MA /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,75,-30,-16,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,35,-29; MA /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-34,-28,1,-33,-27,36,-24,18,19,-25,-25,-23,-23,-17,-6,35,-24,-4,-28; MA /M: SY='E'; M=-9,0,-25,0,16,-21,-20,-3,-12,2,-7,-5,0,-14,14,-1,-5,-8,-14,-27,-12,15; MA /M: SY='T'; M=2,11,-16,8,-1,-20,-10,-3,-20,-7,-20,-16,10,-11,-4,-10,17,18,-12,-34,-14,-3; MA /M: SY='V'; M=-7,-11,-10,-18,-19,-9,-25,-15,12,-12,-3,1,-4,-23,-16,-14,-8,-4,13,-30,-10,-19; MA /M: SY='M'; M=-3,-16,-17,-20,-15,-7,-20,-14,8,-13,3,11,-11,-19,-9,-9,1,4,9,-28,-8,-13; MA /M: SY='L'; M=-5,3,-19,4,-5,-12,-17,-12,-7,-14,5,-5,-2,-18,-10,-14,-4,4,-6,-29,-11,-8; MA /M: SY='N'; M=10,9,-5,-3,-9,-17,-6,-8,-12,-8,-19,-13,19,-19,-9,-11,9,1,-8,-34,-19,-9; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='G'; M=0,-6,-17,-6,-11,-17,40,-11,-23,-11,-17,-11,0,-11,-11,-11,0,-11,-17,-11,-17,-11; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='G'; M=0,-14,-19,-14,-14,-13,12,-17,-11,-19,-5,-5,-7,-20,-14,-16,4,-3,-6,-27,-17,-14; MA /M: SY='Y'; M=-9,-19,-31,-17,-12,5,-24,3,-8,-10,-11,-8,-19,12,-10,-14,-14,-9,-16,5,33,-16; MA /M: SY='R'; M=-11,-1,-27,-2,7,-21,-19,7,-24,18,-18,-8,3,-14,6,21,-6,-6,-19,-25,-8,5; MA /M: SY='D'; M=-13,32,-18,45,10,-35,0,-5,-37,-5,-29,-27,14,-13,-4,-12,5,-7,-26,-38,-22,3; MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20; MA /M: SY='R'; M=-9,2,-22,3,1,-21,-13,15,-26,3,-24,-13,7,-15,4,17,9,2,-18,-31,-8,0; MA /M: SY='Y'; M=-10,-27,-20,-27,-23,14,-30,-10,16,-21,22,11,-27,-30,-20,-17,-21,-7,15,-7,23,-23; MA /M: SY='V'; M=1,-20,-13,-21,-19,-6,-21,-23,14,-19,2,2,-16,-23,-18,-18,4,5,25,-31,-11,-19; MA /M: SY='N'; M=-5,15,-23,7,1,-25,12,-2,-25,-4,-27,-17,26,-16,3,-5,9,-2,-26,-31,-21,2; MA /M: SY='K'; M=-7,-2,-28,-3,4,-30,0,-8,-28,18,-25,-10,0,-12,13,10,-2,-6,-22,-21,-14,9; MA /I: I=-13; MD=-27; MA /M: SY='F'; M=-11,-6,-20,-8,-1,14,-19,-10,-15,-7,-9,-10,-4,-16,-11,0,-2,1,-10,-14,1,-5; D=-13; MA /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; MA /M: SY='T'; M=-10,-1,-4,0,-8,-7,-21,-10,-10,-14,0,-7,-7,-20,-11,-14,-5,5,-7,-22,0,-11; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-27; MA /M: SY='Q'; M=-5,-8,-20,-9,3,-16,-21,-10,-1,-7,-4,-1,-7,-13,9,-8,1,2,-2,-24,-10,5; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-27; MA /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-32,-28,2,-32,-28,32,-25,22,15,-28,-28,-25,-22,-17,-5,36,-25,-5,-28; MA /M: SY='D'; M=-10,19,-28,20,7,-31,9,-3,-32,4,-28,-19,18,-14,3,-2,1,-10,-29,-30,-20,5; MA /M: SY='G'; M=-6,-6,-27,-4,-14,-23,22,-17,-20,-13,-18,-12,-3,-20,-15,-10,-5,-14,-12,-24,-20,-16; MA /M: SY='V'; M=-5,-11,-19,-11,0,-11,-24,-17,4,-4,-2,-1,-12,-20,-10,-8,-8,-4,13,-29,-12,-5; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='R'; M=-8,-8,-7,-9,-4,-12,-14,-6,-14,11,-12,-6,-4,-14,-1,23,-4,-4,-5,-18,-9,-4; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='T'; M=-6,-7,-13,-10,-9,3,-16,-4,-3,-8,-1,-3,-7,-9,-7,-8,0,14,-3,-6,14,-10; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='V'; M=-4,-9,-13,-11,-10,-8,-17,-12,5,2,-4,1,-7,-15,-8,1,-6,-3,11,-18,-7,-10; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='K'; M=-5,0,-16,-1,4,-16,-12,-7,-16,24,-16,-6,0,-6,4,14,-3,0,-10,-13,-6,4; D=-12; MA /I: I=-12; MI=-25; IM=-25; DM=-25; MA /M: SY='F'; M=-17,-27,-25,-31,-24,39,-31,-7,10,-23,17,7,-22,-29,-23,-18,-22,-10,2,7,37,-24; MA /M: SY='L'; M=-13,-29,-6,-33,-24,29,-30,-21,9,-30,31,10,-26,-31,-27,-21,-25,-10,5,-14,6,-24; MA /M: SY='E'; M=-12,6,-29,8,26,-29,-19,14,-29,20,-24,-12,6,-9,17,11,-4,-11,-26,-26,-9,21; MA /M: SY='C'; M=-17,-20,17,-24,-17,-13,-23,-17,-28,-2,-20,-16,-16,-29,-10,15,-17,-14,-19,7,-8,-15; MA /M: SY='G'; M=-1,-10,-28,-8,-9,-27,23,-18,-28,-14,-29,-20,-4,16,-12,-17,7,-5,-24,-28,-27,-12; MA /M: SY='D'; M=-10,23,-28,27,3,-32,17,-5,-35,-2,-30,-23,20,-15,-5,-8,1,-11,-29,-32,-22,-1; MA /M: SY='Q'; M=-4,-1,-24,-2,6,-27,-3,-8,-25,9,-23,-11,1,-11,12,3,5,2,-20,-25,-15,9; MA /M: SY='I'; M=-5,-17,-20,-24,-20,-2,-28,-19,17,-19,3,4,-11,-18,-14,-19,-1,12,14,-21,3,-20; MA /M: SY='V'; M=-10,-19,-21,-19,-21,8,-30,-19,18,-21,10,6,-19,-25,-22,-20,-15,-7,19,-17,5,-23; MA /M: SY='C'; M=-12,-23,22,-29,-27,3,-32,-14,5,-22,-1,-1,-21,-31,-21,-22,-16,-9,6,-15,15,-27; MA /M: SY='Y'; M=-14,-16,8,-19,-18,11,-25,11,-13,-17,-10,-7,-12,-29,-14,-14,-9,-8,-12,-7,30,-18; MA /M: SY='S'; M=6,8,-15,8,1,-22,-8,-12,-21,-3,-22,-17,6,-10,-3,-8,19,17,-11,-33,-17,-1; MA /M: SY='D'; M=-11,13,-26,20,11,-30,-16,7,-23,-2,-18,-11,5,-13,19,-3,2,-5,-21,-30,-11,14; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='D'; M=-8,11,-27,14,2,-28,-3,-10,-27,-3,-28,-20,9,12,-5,-9,3,-1,-24,-33,-22,-3; MA /M: SY='K'; M=-8,-5,-23,-10,-6,-10,-22,-14,-10,15,-15,-5,-1,-17,-6,6,-6,-1,-3,-22,-7,-6; MA /M: SY='F'; M=-7,-14,-20,-17,-9,5,-14,-17,-8,-8,-4,-4,-11,-20,-13,-8,-5,-1,-2,-18,-3,-10; MA /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-26,59,-30,-3,0,-21,6,0,-20,-30,-27,-16,-20,-10,-4,19,51,-26; MA /M: SY='H'; M=1,-13,-20,-15,-16,-15,1,6,-10,-16,-11,-4,-8,-21,-14,-14,-3,-6,1,-26,-9,-16; MA /M: SY='L'; M=-10,-27,-9,-29,-24,9,-31,-15,16,-24,22,10,-26,-30,-21,-20,-21,-8,14,-14,13,-24; MA /M: SY='D'; M=-12,18,-24,26,4,-26,-17,-11,-20,5,-19,-15,3,-14,-6,-4,-2,-2,-7,-33,-15,-1; MA /M: SY='G'; M=-4,0,-27,-4,-8,-29,34,-9,-31,-10,-26,-15,8,-17,1,-10,3,-10,-28,-23,-23,-3; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='D'; M=-7,16,-15,19,8,-20,-6,2,-16,1,-16,-11,12,-7,11,-1,4,-3,-16,-20,-10,9; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='E'; M=-4,-7,-23,-6,6,-19,-1,-13,-12,-9,-12,-6,-7,-14,-5,-12,1,-4,-6,-27,-17,0; MA /M: SY='V'; M=10,-21,-12,-24,-21,-1,-19,-24,11,-17,-1,0,-18,-22,-21,-19,2,2,24,-26,-10,-21; MA /M: SY='F'; M=-14,-29,-23,-35,-26,35,-32,-19,17,-28,25,11,-23,-28,-26,-21,-23,-10,9,-5,18,-26; MA /M: SY='P'; M=-6,-1,-25,-3,0,-22,-16,-13,-20,8,-23,-14,2,13,-2,0,3,7,-18,-29,-17,-2; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='F'; M=-5,-7,-15,-8,-4,13,-14,-10,-8,-4,-5,-5,-6,-13,-11,-6,-7,-6,-5,-7,3,-6; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='A'; M=15,-2,-8,-3,0,-12,-4,-9,-7,-5,-8,-7,-3,-7,-4,-9,5,0,-1,-16,-11,-2; D=-12; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='V'; M=-1,-8,-8,-8,-12,-6,-15,-15,6,-10,-2,-1,-10,-15,-13,-11,2,8,17,-21,-8,-13; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-25; MA /M: SY='L'; M=0,-22,-16,-25,-18,14,-20,-19,5,-23,15,3,-18,-24,-20,-18,-7,-2,6,-19,-1,-18; MA /M: SY='D'; M=-12,21,-28,27,20,-34,-14,1,-29,11,-26,-17,12,-10,18,3,2,-7,-27,-31,-16,19; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='C'; M=-3,-3,6,-13,-11,-17,-19,-13,-5,-7,-12,-6,3,-20,-5,-10,-5,-6,-7,-29,-14,-9; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-27; MA /M: SY='R'; M=-12,-16,-23,-16,-8,-8,-23,-10,-6,6,6,2,-12,-22,-4,23,-16,-8,-3,-19,-6,-8; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-27; MA /M: SY='A'; M=17,-7,-7,-13,-5,-23,-12,-16,-20,11,-18,-11,-6,-13,-4,2,1,-2,-9,-23,-16,-5; MA /M: SY='Y'; M=-8,-17,-19,-20,-17,12,-24,-8,3,-17,7,1,-15,-23,-15,-14,-6,7,2,-8,20,-17; MA /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,18,-30,-20,18,-30,45,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-16,4,-21; MA /M: SY='L'; M=-2,-15,-19,-15,-8,-4,-23,-17,5,-19,21,5,-18,-21,-13,-16,-13,-1,4,-24,-7,-10; MA /M: SY='S'; M=5,9,-15,8,1,-22,-5,-9,-21,-4,-26,-19,13,-11,-1,-7,24,13,-13,-36,-18,0; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=42(42); /POSITIVE=42(42); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=DPUP; CC /VERSION=1; DR P0C6W1 , R1AB_BC133 , T; P0C6V9 , R1AB_BC279 , T; DR P0C6W2 , R1AB_BCHK3 , T; P0C6W3 , R1AB_BCHK4 , T; DR P0C6W4 , R1AB_BCHK5 , T; P0C6W5 , R1AB_BCHK9 , T; DR P0C6W6 , R1AB_BCRP3 , T; P0C6W7 , R1AB_CVBEN , T; DR P0C6W8 , R1AB_CVBLU , T; P0C6W9 , R1AB_CVBM , T; DR P0C6X0 , R1AB_CVBQ , T; P0C6X2 , R1AB_CVHN1 , T; DR P0C6X3 , R1AB_CVHN2 , T; P0C6X4 , R1AB_CVHN5 , T; DR P0C6X6 , R1AB_CVHOC , T; P0C6X8 , R1AB_CVM2 , T; DR P0C6X9 , R1AB_CVMA5 , T; P0C6Y0 , R1AB_CVMJH , T; DR K9N7C7 , R1AB_MERS1 , T; P0C6X7 , R1AB_SARS , T; DR P0DTD1 , R1AB_SARS2 , T; P0C6F7 , R1A_BC133 , T; DR P0C6F5 , R1A_BC279 , T; P0C6F8 , R1A_BCHK3 , T; DR P0C6T4 , R1A_BCHK4 , T; P0C6T5 , R1A_BCHK5 , T; DR P0C6T6 , R1A_BCHK9 , T; P0C6T7 , R1A_BCRP3 , T; DR P0C6T8 , R1A_CVBEN , T; P0C6T9 , R1A_CVBLU , T; DR P0C6U0 , R1A_CVBM , T; P0C6U1 , R1A_CVBQ , T; DR P0C6U3 , R1A_CVHN1 , T; P0C6U4 , R1A_CVHN2 , T; DR P0C6U5 , R1A_CVHN5 , T; P0C6U7 , R1A_CVHOC , T; DR P0C6U9 , R1A_CVM2 , T; P0C6V0 , R1A_CVMA5 , T; DR P0C6V1 , R1A_CVMJH , T; K9N638 , R1A_MERS1 , T; DR P0C6U8 , R1A_SARS , T; P0DTC1 , R1A_SARS2 , T; 3D 2KAF; 2KQV; 2KQW; 4YPT; 5UTV; 6MWM; 7P2O; 7THH; PR PRU01289; DO PDOC51942; //