ID COV_NSP3A_UBL; MATRIX. AC PS51943; DT 10-FEB-2021 CREATED; 25-MAY-2022 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Coronavirus Nsp3a Ubl domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=110; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=105; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0944257; R2=0.0097799; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1090; N_SCORE=12.75; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=451; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-24; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; MA /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; MA /M: SY='K'; M=-34,-52,-36,-30,-55,40,-39,-56,65,-55,-45,-27,-43,-26,32,3,28,-50,-53,-46; MA /M: SY='K'; M=-37,5,-2,-27,-53,9,29,-50,72,-51,-42,-26,-43,-26,9,-9,25,-16,-56,-42; MA /M: SY='V'; M=-30,-44,-61,-55,-32,-62,-64,19,-53,-17,-20,-56,-57,-55,-54,-44,-29,91,-65,-39; MA /M: SY='T'; M=-7,-42,-32,-4,-48,-41,-41,-41,9,-45,-40,9,-39,-33,-36,35,82,-20,-63,-44; MA /M: SY='F'; M=-52,-49,-66,-61,109,-61,-46,-1,-57,2,-26,-55,-63,-65,-54,-52,-45,-28,-21,1; MA /M: SY='G'; M=-26,-49,-34,-41,-57,66,-39,-60,6,-60,-50,34,-45,-33,-40,54,-29,-54,-56,-50; MA /M: SY='D'; M=-41,-59,90,58,-64,5,-32,-64,-29,-60,-57,-20,-41,-25,-38,-33,-37,-59,-70,-50; MA /M: SY='D'; M=-39,-55,67,56,-59,-47,-33,-52,23,-53,-48,2,-40,25,-29,-31,11,-16,-64,-47; MA /M: SY='P'; M=-34,-49,-39,2,-46,-50,-46,-23,-37,-36,-34,2,54,24,-44,-30,53,48,-62,-45; MA /M: SY='V'; M=-33,-47,-3,-6,-42,-52,-46,7,3,-30,-29,-5,-47,32,-38,-7,35,60,-62,-41; MA /M: SY='V'; M=-35,-49,-53,-45,-34,-59,47,31,-13,-13,-22,-46,-53,20,-44,-42,-33,72,12,-34; MA /M: SY='E'; M=-39,-55,-22,67,-55,-50,26,-54,42,-49,16,8,-40,13,25,-33,4,-50,-57,-43; MA /M: SY='E'; M=-36,-52,22,55,-43,-56,-45,35,-18,-30,-31,-39,-44,-32,-42,-37,14,45,-61,-43; MA /M: SY='I'; M=-13,-55,-49,-40,-40,-54,-49,66,-41,-25,-24,-43,41,53,-45,-37,14,12,-54,-40; MA /M: SY='P'; M=34,-52,18,25,-58,33,-41,-29,-36,-54,-47,12,55,-34,-45,3,-34,-46,-58,-52; MA /M: SY='P'; M=-36,-54,-44,-40,-30,-45,-36,-33,-41,-42,-37,-42,76,-40,-46,34,6,20,-39,66; MA /M: SY='V'; M=-37,-49,33,-31,-44,-52,-42,-26,37,-13,-1,-33,-47,-33,31,-34,37,42,-61,-41; MA /M: SY='S'; M=-32,-48,-38,-39,-36,-42,25,-37,-34,-41,18,11,19,-33,8,47,43,2,-49,42; MA /I: I=-42; MD=-106; MA /M: SY='K'; M=-59,-73,-62,-51,-70,-74,-62,-54,48,-63,-58,-55,-68,-47,26,-57,-9,14,-77,-63; D=-42; MA /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106; MA /M: SY='V'; M=-34,-47,-62,-57,12,-63,-62,48,-54,-16,-19,-56,-56,-56,-55,-46,-31,80,-58,-34; MA /M: SY='K'; M=-37,-51,-30,-27,-48,-41,-31,-53,68,-54,-43,51,-45,-22,30,22,-1,-50,-51,16; MA /M: SY='I'; M=-40,-49,-63,-57,14,-65,-56,56,-55,43,-13,-57,-57,-53,-56,-50,-36,49,-51,-31; MA /M: SY='T'; M=-34,20,25,41,13,-46,-39,3,-34,-39,17,-9,-42,-32,-41,25,52,-34,-57,-38; MA /M: SY='F'; M=-49,-53,-59,-57,87,-60,-34,12,-51,-21,-26,-53,-61,-54,-49,-49,-42,2,-17,82; MA /M: SY='E'; M=-1,-55,52,81,-60,-47,-32,-58,-24,-54,-51,7,-37,-19,-34,-31,6,-51,-63,-50; MA /M: SY='C'; M=-44,68,-63,-58,63,-62,-51,19,-56,45,-19,-55,-62,-57,-55,-50,-40,17,-42,-22; MA /M: SY='C'; M=-43,82,77,41,-58,-48,60,-62,-34,-55,-51,-23,-47,-31,-40,-36,-38,-56,-75,-44; MA /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90; MA /M: SY='E'; M=11,-61,-27,71,-66,-52,-43,-61,0,-60,-54,-14,27,-27,-39,-5,-41,-41,-65,-58; D=-36; MA /I: I=-36; DM=-90; MA /M: SY='P'; M=-44,-59,12,-44,-54,-7,-53,-7,-39,-47,-44,-43,43,-46,29,-40,35,26,-68,-53; D=-36; MA /I: I=-36; DM=-90; MA /M: SY='W'; M=-52,-60,-73,-65,51,-68,-63,23,-62,26,-28,-67,-66,-62,-62,-60,-49,23,92,-23; D=-36; MA /I: I=-36; DM=-90; MA /M: SY='D'; M=-42,-52,92,-17,-58,-40,-31,-53,-32,-54,9,47,-45,-32,-40,-28,32,-51,-76,-47; MA /M: SY='T'; M=30,-46,27,17,-54,-9,-40,-48,26,-49,-43,-27,-40,3,-32,10,54,-40,-59,-46; MA /M: SY='V'; M=-37,-48,-59,-53,-28,-62,-57,53,-13,29,-16,-53,-54,-50,-50,-45,-1,60,-57,-36; MA /M: SY='L'; M=-45,-47,-63,-55,42,-63,-47,-11,-56,74,-10,-60,-62,-51,-53,-54,-41,4,-43,-24; MA /M: SY='N'; M=6,-48,13,12,-52,-5,-34,-44,12,-50,-43,62,-45,-28,9,22,5,5,-63,-47; MA /M: SY='K'; M=-35,-52,3,30,-56,-12,-36,-56,70,-55,-46,-26,-40,-21,9,28,13,-50,-55,-45; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='V'; M=42,-46,-48,-41,-45,-43,-50,-23,23,-10,-33,-42,-50,-39,-39,25,-30,48,-59,-45; D=-31; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='C'; M=-41,118,-52,-13,-35,-55,-45,5,-9,-38,26,-45,-61,-48,-49,-9,-39,-37,-52,47; D=-31; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='S'; M=-2,-51,-37,14,-50,27,-42,-47,38,8,-40,-33,-46,-30,-32,46,-32,-44,-56,-46; D=-31; MA /I: I=-31; MD=-79; MA /M: SY='E'; M=23,-53,11,44,-55,-47,-42,-41,28,-47,-43,-36,15,-29,1,-33,13,14,-60,-49; D=-31; MA /I: I=-31; MI=0; MD=-79; IM=0; DM=-79; MA /M: SY='F'; M=-59,-63,-68,-64,78,-70,-49,25,-20,-31,-36,-60,-68,-60,-9,-58,-52,-35,-32,49; D=-31; MA /I: I=-31; DM=-79; MA /M: SY='E'; M=17,-49,13,54,-45,-45,-35,-43,-30,-45,-41,-31,-40,19,-37,3,48,-10,-52,26; MA /M: SY='V'; M=-33,-46,-58,-51,9,-61,-59,25,5,-19,-21,-52,-55,-51,-47,-44,-30,82,-58,-35; MA /M: SY='E'; M=-39,-57,65,65,14,32,-35,-60,-30,-54,-52,-26,-41,-26,-39,-34,-39,-55,-57,-43; MA /M: SY='K'; M=-36,-49,17,8,-49,-45,-38,-16,60,-8,-39,5,-42,-26,-22,22,38,-40,-57,-43; MA /M: SY='D'; M=-31,-52,55,-30,-58,54,-39,-59,13,-58,-51,-22,-44,-33,-4,32,12,-53,-60,-49; MA /M: SY='T'; M=-35,-45,-52,-50,-30,-58,-53,32,-48,36,-19,-45,-50,-48,-51,-36,55,46,-58,-37; MA /M: SY='T'; M=-36,-49,17,29,-48,-48,-40,-5,38,-17,-39,-28,4,-29,-30,-1,64,-36,-60,-44; MA /M: SY='V'; M=-36,-49,-60,-53,-26,-60,15,11,-51,18,37,-54,-56,-49,-51,-47,-35,69,68,17; MA /M: SY='E'; M=-37,-53,35,77,-57,-48,-33,-55,-1,-53,-48,21,-37,-20,-32,-28,43,-48,-63,-49; MA /M: SY='E'; M=-37,-58,51,74,-63,32,-34,-63,-26,-57,-52,-27,-39,28,-34,-32,-39,-57,-60,-50; MA /M: SY='F'; M=-48,-50,33,-46,85,-18,-43,-26,-51,38,-24,-45,-59,-53,-51,-48,-42,-31,-33,-12; MA /M: SY='W'; M=36,-51,-49,8,-29,-47,29,-28,-43,16,-30,-49,-51,-39,-46,-38,-40,21,103,28; MA /M: SY='C'; M=30,71,69,22,-58,-39,-39,-55,-36,-54,-50,-26,-46,-33,-43,25,-31,-47,-68,-50; MA /M: SY='V'; M=-29,-45,-5,-47,-38,-7,-53,-8,-47,-26,-27,3,-53,-46,-50,22,-27,78,-65,-42; MA /M: SY='V'; M=-35,-47,-62,-56,6,-63,-60,43,-54,14,-17,-56,-57,-55,-55,-47,-32,76,-57,-34; MA /M: SY='C'; M=5,53,-45,-39,-31,-48,28,4,26,10,-29,-39,-52,18,-34,9,-35,-2,-43,50; MA /M: SY='E'; M=-41,-58,70,77,-62,-49,-32,-62,23,-57,-53,-25,-38,-18,-28,-34,-37,-56,-64,-49; MA /M: SY='A'; M=55,-46,-36,28,-46,-39,-39,-39,21,-40,27,-36,-43,10,-33,-26,17,-4,-51,5; MA /M: SY='V'; M=-4,-46,-59,-54,-29,-59,-55,44,-51,25,38,-53,-54,-50,-53,-43,0,60,-57,-36; MA /M: SY='E'; M=-5,42,16,46,-41,-48,-38,20,-35,-15,-35,0,-45,6,-41,12,2,-3,-54,16; MA /M: SY='D'; M=6,-50,45,38,-56,-40,-35,-50,42,-52,-47,9,-41,-24,-27,30,1,-17,-61,-46; MA /M: SY='T'; M=40,-45,13,-36,-42,-44,-45,8,6,10,-30,-36,-46,-37,4,-28,44,1,-57,-42; MA /M: SY='L'; M=-8,-47,-61,-54,22,-59,-45,5,-54,70,46,-58,-59,-48,-51,-51,-40,-18,-46,-28; MA /M: SY='Q'; M=-32,-50,31,-1,-52,-39,-33,-45,10,-15,-40,30,-44,55,-31,50,2,-14,-60,-43; MA /M: SY='P'; M=-38,-54,6,-35,-48,-47,-45,-31,9,-6,-36,10,81,-40,-42,-5,12,27,-60,-48; MA /M: SY='C'; M=-40,81,-56,-9,21,-60,-50,8,-51,43,31,-53,-59,-50,-53,-48,-38,31,-53,-33; MA /M: SY='K'; M=2,-52,-40,-1,8,-6,-41,-42,45,9,-36,-36,44,-31,3,22,-34,-42,-50,-39; MA /M: SY='E'; M=-37,21,34,65,-59,-46,-31,-59,-20,-54,-48,6,-41,36,33,22,-34,-53,-61,-47; MA /M: SY='H'; M=1,-54,8,-34,11,21,86,-42,-39,17,-30,-32,-50,41,-38,-35,-42,-44,-51,12; MA /M: SY='P'; M=-40,35,26,24,-36,10,-40,0,-41,11,18,-40,40,-38,-47,-41,-38,6,-50,30; MA /M: SY='E'; M=-35,-52,23,36,-51,22,-41,-35,0,-45,-41,23,34,-33,-40,-32,15,32,-62,-48; MA /M: SY='V'; M=-4,-52,0,9,-39,-53,-47,34,-39,6,-27,0,37,-40,4,-40,-34,44,-59,-42; MA /I: I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45; MA /M: SY='V'; M=-66,-80,13,-65,-69,-83,-73,-45,-65,-36,21,-69,-3,-69,-3,-71,-63,28,-92,-69; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='C'; M=-61,37,-10,-68,-86,26,-72,-89,-65,-87,-79,-59,9,-67,-10,-1,-65,-83,-88,-81; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='F'; M=25,-75,-85,-79,33,-74,-80,22,-78,-53,-56,-77,-80,-78,-81,-64,-65,-46,-69,-53; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='D'; M=-68,-74,49,-52,30,-70,-60,-63,-63,-15,-61,8,-74,-64,-68,-58,-2,-64,-75,-51; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='L'; M=-67,-71,-86,-79,-44,-88,-73,3,-79,51,-31,-84,-84,-73,-77,-77,-63,-9,-74,-56; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='D'; M=-64,-79,38,35,-78,-69,-54,-74,-50,-22,-66,14,-67,20,-57,-56,-59,-74,-86,-69; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='D'; M=-67,-81,46,10,2,-72,-57,-79,20,-74,-71,-49,-68,-49,7,-60,-61,-76,-78,-60; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='W'; M=-66,-73,-78,-68,49,-74,-67,-45,-69,22,-43,-76,41,-70,-71,-69,-62,-52,70,-35; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='P'; M=0,-69,-55,4,-63,-61,-61,7,-56,-17,-51,0,42,-53,-63,5,-49,-28,-74,-64; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='D'; M=-54,-64,53,6,36,-34,-52,-46,-52,-7,-4,-44,-61,-51,-57,-50,1,-9,-64,-41; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='P'; M=16,-54,16,45,-59,-43,-39,-50,-34,-54,-48,36,54,-31,-42,3,-3,-14,-64,-53; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='P'; M=-38,-56,3,25,-49,4,-38,-48,-7,-52,-45,20,48,13,-40,-1,28,-12,-55,21; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='C'; M=-43,81,-58,-56,34,-60,-42,-25,-52,0,-30,-52,-62,-53,-53,-44,5,34,-37,68; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='Y'; M=-17,-55,-55,-55,65,-57,-29,-31,-49,-29,-30,-52,-62,-49,-48,-45,-12,-2,-17,97; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='L'; M=-43,24,-65,-59,-27,-66,-57,45,-58,54,-14,-60,-61,-54,-58,-53,-39,38,-56,-37; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-45; MA /M: SY='Y'; M=-47,-53,-56,-55,73,-59,-31,-22,-50,-4,-25,-53,-62,-50,-47,-47,-41,23,-17,92; MA /M: SY='D'; M=-42,-55,101,-13,-63,-39,-30,-62,-32,-62,-58,42,-45,-31,-40,4,-32,-59,-78,-48; MA /M: SY='E'; M=4,-54,31,69,-59,-47,-34,-56,42,-53,-47,-29,-38,16,-24,-30,13,-49,-58,-48; MA /M: SY='E'; M=34,42,40,51,-57,1,-37,-55,-32,-54,-49,20,-43,-28,-40,16,-32,-47,-62,-50; MA /M: SY='G'; M=-28,-54,-42,-53,-52,91,-45,-65,-47,-61,-51,-29,-47,-44,-53,-1,-44,-59,-47,13; MA /M: SY='D'; M=-37,-58,59,59,-62,43,-35,-64,10,-59,-53,-25,-41,12,-34,-32,-39,-58,-60,-50; MA /M: SY='C'; M=-14,55,17,48,41,-50,-36,-45,2,-19,-39,1,-47,10,-36,-34,13,-42,-46,15; MA /M: SY='D'; M=16,-49,56,-30,-44,-46,-43,21,20,-3,-33,-12,-47,-37,-38,-6,0,22,-61,-43; MA /M: SY='W'; M=-44,-53,9,-49,6,-59,-51,30,-51,48,24,-53,-3,-48,-53,-51,-41,16,87,-27; MA /M: SY='S'; M=42,43,-37,-37,-51,-4,-38,-47,16,-47,23,33,-46,-32,-36,50,-26,-40,-59,-46; MA /M: SY='S'; M=-31,-49,-39,-37,-44,-40,-40,6,-3,8,-34,18,46,9,-40,59,-25,-2,-57,-43; MA /M: SY='P'; M=-40,-57,-33,6,-56,-47,41,-53,36,-53,-42,5,58,36,37,-32,26,-51,-58,-43; MA /M: SY='M'; M=-37,-48,42,-39,-35,-50,-37,3,-43,5,102,-38,-49,-38,-44,4,-33,22,-58,-34; MA /M: SY='Y'; M=-40,65,-50,-52,-17,16,-30,-6,-45,-29,65,-43,-54,-42,-46,-38,13,-34,-29,87; MA /M: SY='C'; M=-6,102,-55,-53,48,-53,35,25,-51,-29,-32,-45,-59,-53,-53,-8,-37,17,-52,-29; MA /M: SY='S'; M=5,-43,-38,-4,-43,-35,-38,-38,-37,10,33,-30,-44,-30,-41,77,6,-35,-57,-41; MA /M: SY='F'; M=-8,-52,-4,-9,70,-56,-44,38,-44,10,-25,-45,-54,40,-45,-43,-39,-4,-38,-19; MA /M: SY='W'; M=-11,-53,-38,0,-25,-43,20,-43,-38,-12,-38,36,-50,-34,-41,26,10,-44,100,64; MA /M: SY='P'; M=17,-59,5,-30,4,-44,-42,-10,-33,-49,-41,-41,88,38,11,-35,-37,-44,-52,-45; MA /M: SY='P'; M=-7,-55,13,19,-38,-51,-42,0,-41,9,-32,-44,70,-39,-47,-39,-2,18,-51,23; MA /M: SY='D'; M=-37,-53,74,43,-48,-43,-32,-49,-31,-51,-48,6,-43,-28,-38,25,1,-9,-59,23; MA /M: SY='E'; M=-39,21,50,53,-45,-49,-36,-10,-33,-24,-41,8,13,-29,-40,-7,-1,5,-57,15; MA /I: E1=0; IE=-380; DE=-380; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=59(59); /POSITIVE=59(59); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Ubiquitin-like; CC /VERSION=2; DR P0C6W1 , R1AB_BC133 , T; P0C6V9 , R1AB_BC279 , T; DR P0C6W0 , R1AB_BC512 , T; P0C6W2 , R1AB_BCHK3 , T; DR P0C6W3 , R1AB_BCHK4 , T; P0C6W4 , R1AB_BCHK5 , T; DR P0C6W5 , R1AB_BCHK9 , T; P0C6W6 , R1AB_BCRP3 , T; DR P0C6W7 , R1AB_CVBEN , T; P0C6W8 , R1AB_CVBLU , T; DR P0C6W9 , R1AB_CVBM , T; P0C6X0 , R1AB_CVBQ , T; DR P0C6X1 , R1AB_CVH22 , T; P0C6X2 , R1AB_CVHN1 , T; DR P0C6X3 , R1AB_CVHN2 , T; P0C6X4 , R1AB_CVHN5 , T; DR P0C6X5 , R1AB_CVHNL , T; P0C6X6 , R1AB_CVHOC , T; DR P0C6X8 , R1AB_CVM2 , T; P0C6X9 , R1AB_CVMA5 , T; DR P0C6Y0 , R1AB_CVMJH , T; P0C6Y5 , R1AB_CVPPU , T; DR Q98VG9 , R1AB_FIPV , T; P0C6Y1 , R1AB_IBVB , T; DR P0C6Y2 , R1AB_IBVBC , T; P0C6Y3 , R1AB_IBVM , T; DR K9N7C7 , R1AB_MERS1 , T; P0C6Y4 , R1AB_PEDV7 , T; DR P0C6X7 , R1AB_SARS , T; P0DTD1 , R1AB_SARS2 , T; DR P0C6F7 , R1A_BC133 , T; P0C6F5 , R1A_BC279 , T; DR P0C6F6 , R1A_BC512 , T; P0C6F8 , R1A_BCHK3 , T; DR P0C6T4 , R1A_BCHK4 , T; P0C6T5 , R1A_BCHK5 , T; DR P0C6T6 , R1A_BCHK9 , T; P0C6T7 , R1A_BCRP3 , T; DR P0C6T8 , R1A_CVBEN , T; P0C6T9 , R1A_CVBLU , T; DR P0C6U0 , R1A_CVBM , T; P0C6U1 , R1A_CVBQ , T; DR P0C6U2 , R1A_CVH22 , T; P0C6U3 , R1A_CVHN1 , T; DR P0C6U4 , R1A_CVHN2 , T; P0C6U5 , R1A_CVHN5 , T; DR P0C6U6 , R1A_CVHNL , T; P0C6U7 , R1A_CVHOC , T; DR P0C6U9 , R1A_CVM2 , T; P0C6V0 , R1A_CVMA5 , T; DR P0C6V1 , R1A_CVMJH , T; P0C6V2 , R1A_CVPPU , T; DR P0C6V3 , R1A_IBVB , T; P0C6V4 , R1A_IBVBC , T; DR P0C6V5 , R1A_IBVM , T; K9N638 , R1A_MERS1 , T; DR P0C6V6 , R1A_PEDV7 , T; P0C6U8 , R1A_SARS , T; DR P0DTC1 , R1A_SARS2 , T; 3D 2GRI; 2IDY; 2M0A; 7KAG; 7PKU; 7TI9; 7WZO; 8HDA; PR PRU00214; DO PDOC51943; //